C. Elegans Codon Usage
Tables based on 414661 codons in 712 cDNAs
Markov 0
t t t t t t t t t t t t t t t t c c c c c c c c c c c c c c c c a a a a a a a a a a a a a a a a g g g g g g g g g g g g g g g g
t t t t c c c c a a a a g g g g t t t t c c c c a a a a g g g g t t t t c c c c a a a a g g g g t t t t c c c c a a a a g g g g
t c a g t c a g t c a g t c a g t c a g t c a g t c a g t c a g t c a g t c a g t c a g t c a g t c a g t c a g t c a g t c a g
172 234 84 191 160 99 208 128 163 137 0 0 110 86 0 115 224 159 67 110 86 39 271 101 154 98 292 155 133 55 136 50 292 192 68 274 181 106 198 91 299 183 339 273 117 78 155 36 240 148 92 134 243 142 205 84 381 185 415 260 118 65 352 37
Markov 1
t t t t t t t t t t t t t t t t c c c c c c c c c c c c c c c c a a a a a a a a a a a a a a a a g g g g g g g g g g g g g g g g
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t c a g t c a g t c a g t c a g t c a g t c a g t c a g t c a g t c a g t c a g t c a g t c a g t c a g t c a g t c a g t c a g
ttt 122 268 99 274 133 95 196 144 161 103 0 0 99 67 0 110 180 137 101 137 81 52 193 73 161 85 278 110 59 24 110 45 242 145 85 263 84 52 94 60 168 82 148 96 61 15 61 15 286 217 197 310 337 212 370 106 527 240 483 288 193 122 655 89
ttc 144 367 65 193 143 121 204 156 160 232 0 0 149 95 0 144 226 157 66 127 69 40 264 83 142 126 309 163 200 61 146 50 283 207 63 246 195 145 254 69 431 270 368 285 112 64 140 31 139 116 60 91 110 109 137 58 314 190 285 204 127 83 368 43
tta 269 362 178 249 133 164 421 221 147 122 0 0 167 119 0 209 255 122 91 201 110 71 226 74 127 82 371 105 59 37 130 88 280 150 82 376 158 130 300 88 243 144 368 150 107 105 133 62 195 99 79 96 158 85 204 85 218 150 345 195 62 45 184 14
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tct 114 142 60 175 296 154 398 169 136 40 0 0 123 60 0 75 286 108 97 121 139 48 431 144 207 111 406 153 229 63 195 54 148 99 34 111 124 76 213 81 112 73 130 49 78 45 76 12 222 150 139 163 311 166 353 100 458 187 445 154 210 102 586 55
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tca 259 273 89 214 309 155 419 239 142 91 0 0 89 66 0 138 244 84 66 124 74 29 281 126 139 75 282 121 50 31 76 28 391 187 109 316 254 87 349 139 386 180 445 226 138 90 178 52 231 90 89 123 223 77 204 86 206 104 286 109 46 35 217 32
tcg 188 194 75 257 211 63 215 254 155 118 0 0 175 86 0 108 155 112 30 131 65 30 157 149 82 41 155 76 41 26 60 22 390 205 91 328 149 82 308 170 420 173 483 312 149 91 168 71 237 65 54 172 304 101 237 166 507 153 366 244 67 58 222 26
tat 168 273 122 299 181 96 192 137 257 115 0 0 130 93 0 118 271 178 90 130 62 30 372 97 212 145 413 217 164 59 181 55 319 140 50 186 90 58 143 63 230 109 167 162 60 30 106 21 192 125 94 232 218 91 237 100 469 186 370 220 161 65 398 49
tac 243 236 35 169 148 54 168 175 197 215 0 0 147 89 0 136 138 126 63 103 47 26 128 70 114 84 171 122 155 72 98 47 293 213 59 327 231 185 297 148 356 257 447 419 166 66 171 19 136 105 68 157 148 124 126 94 348 189 358 334 141 61 325 54
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cgt 137 180 74 126 130 83 184 92 122 72 0 0 79 43 0 81 346 239 97 157 99 50 259 108 196 144 436 196 326 95 149 85 146 182 40 133 139 112 108 47 97 137 133 90 86 29 81 16 270 319 124 158 320 185 207 92 472 221 475 236 205 131 592 31
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cga 220 296 135 204 151 128 236 151 197 127 0 0 102 118 0 99 195 125 69 97 67 26 141 90 137 95 292 137 151 60 176 63 325 181 111 369 178 84 208 106 368 130 491 202 164 100 178 70 236 123 118 107 174 102 215 44 310 141 496 236 60 49 208 32
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