# TARGET 2tscA_1:529 # Using neural net fssp-12345-IDaa1-9-6-11-9-3-8-7-ehl-seeded6-trained.net # This is a 4-layer network, with # window units # 9 6 # 11 9 # 3 8 # 7 3 (1 EHL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment /projects/compbio/experiments/models.97/pdb/2t/2tscA/nostruct-align/2tscA.target98.a2m # with weighted counts, using HenikoffWeight(1 bits/column, 0.5) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 13.5988 # # MODEL 1 Pos AA E H C 10N 1S 5N 5N 5N 1 M 0.03 0.32 0.65 2 K 0.02 0.72 0.26 3 Q 0.02 0.80 0.17 4 Y 0.01 0.94 0.05 5 L 0.00 0.98 0.01 6 E 0.00 0.99 0.00 7 L 0.00 0.99 0.01 8 M 0.00 0.99 0.01 9 Q 0.00 0.99 0.01 10 K 0.01 0.97 0.02 11 V 0.02 0.93 0.05 12 L 0.05 0.82 0.13 13 D 0.09 0.61 0.30 14 E 0.11 0.35 0.54 15 G 0.06 0.08 0.86 16 T 0.11 0.08 0.81 17 Q 0.22 0.10 0.68 18 K 0.16 0.09 0.74 19 N 0.09 0.08 0.83 20 D 0.09 0.09 0.82 21 R 0.16 0.10 0.73 22 T 0.22 0.08 0.70 23 G 0.23 0.10 0.68 24 T 0.17 0.08 0.75 25 G 0.24 0.09 0.68 26 T 0.46 0.09 0.45 27 L 0.61 0.09 0.30 28 S 0.67 0.08 0.25 29 I 0.61 0.08 0.31 30 F 0.37 0.06 0.57 31 G 0.17 0.05 0.78 32 H 0.22 0.11 0.67 33 Q 0.33 0.12 0.55 34 M 0.45 0.11 0.45 35 R 0.56 0.10 0.34 36 F 0.50 0.11 0.40 37 N 0.41 0.09 0.50 38 L 0.27 0.17 0.56 39 Q 0.11 0.15 0.74 40 D 0.08 0.18 0.74 41 G 0.06 0.11 0.83 42 F 0.04 0.04 0.91 43 P 0.08 0.05 0.87 44 L 0.34 0.10 0.56 45 V 0.53 0.07 0.40 46 T 0.46 0.07 0.48 47 T 0.24 0.04 0.72 48 K 0.32 0.06 0.62 49 R 0.47 0.07 0.46 50 C 0.44 0.11 0.46 51 H 0.43 0.14 0.43 52 L 0.28 0.43 0.29 53 R 0.12 0.68 0.19 54 S 0.09 0.73 0.18 55 I 0.05 0.80 0.15 56 I 0.02 0.90 0.08 57 H 0.01 0.93 0.06 58 E 0.01 0.92 0.07 59 L 0.02 0.91 0.07 60 L 0.04 0.88 0.09 61 W 0.08 0.82 0.10 62 F 0.14 0.71 0.15 63 L 0.14 0.56 0.31 64 Q 0.08 0.16 0.76 65 G 0.05 0.07 0.88 66 D 0.06 0.12 0.83 67 T 0.06 0.10 0.84 68 N 0.08 0.15 0.77 69 I 0.13 0.51 0.36 70 A 0.16 0.60 0.24 71 Y 0.21 0.57 0.23 72 L 0.16 0.64 0.21 73 H 0.11 0.63 0.26 74 E 0.09 0.42 0.48 75 N 0.04 0.20 0.76 76 N 0.03 0.25 0.72 77 V 0.05 0.19 0.76 78 T 0.10 0.16 0.74 79 I 0.13 0.26 0.60 80 W 0.08 0.43 0.49 81 D 0.04 0.66 0.30 82 E 0.03 0.72 0.25 83 W 0.03 0.71 0.26 84 A 0.03 0.71 0.26 85 D 0.04 0.72 0.24 86 E 0.05 0.70 0.25 87 N 0.07 0.50 0.43 88 G 0.09 0.26 0.65 89 D 0.11 0.20 0.69 90 L 0.10 0.14 0.76 91 G 0.06 0.07 0.87 92 P 0.10 0.13 0.77 93 V 0.16 0.18 0.66 94 Y 0.15 0.20 0.66 95 G 0.10 0.21 0.69 96 K 0.10 0.28 0.62 97 Q 0.13 0.30 0.57 98 W 0.16 0.28 0.56 99 R 0.17 0.29 0.54 100 A 0.14 0.23 0.63 101 W 0.13 0.16 0.72 102 P 0.11 0.12 0.77 103 T 0.06 0.09 0.85 104 P 0.04 0.06 0.91 105 D 0.05 0.11 0.84 106 G 0.08 0.21 0.71 107 R 0.10 0.13 0.76 108 H 0.12 0.12 0.77 109 I 0.08 0.20 0.72 110 D 0.04 0.27 0.70 111 Q 0.05 0.51 0.44 112 I 0.03 0.78 0.19 113 T 0.02 0.85 0.13 114 T 0.02 0.87 0.11 115 V 0.03 0.82 0.15 116 L 0.03 0.78 0.19 117 N 0.04 0.72 0.24 118 Q 0.06 0.68 0.26 119 L 0.07 0.50 0.43 120 K 0.06 0.28 0.66 121 N 0.04 0.17 0.79 122 D 0.02 0.11 0.87 123 P 0.02 0.43 0.55 124 D 0.02 0.71 0.27 125 S 0.02 0.80 0.19 126 R 0.01 0.89 0.10 127 R 0.02 0.90 0.08 128 I 0.03 0.84 0.13 129 I 0.04 0.75 0.20 130 V 0.04 0.73 0.23 131 S 0.05 0.72 0.23 132 A 0.06 0.71 0.23 133 W 0.10 0.57 0.33 134 N 0.15 0.40 0.44 135 V 0.18 0.33 0.49 136 G 0.15 0.29 0.56 137 E 0.12 0.28 0.60 138 L 0.11 0.37 0.52 139 D 0.11 0.35 0.54 140 K 0.10 0.35 0.55 141 M 0.09 0.34 0.58 142 A 0.08 0.35 0.57 143 L 0.09 0.32 0.59 144 A 0.09 0.23 0.68 145 P 0.08 0.19 0.73 146 C 0.08 0.24 0.68 147 H 0.10 0.27 0.63 148 A 0.14 0.29 0.57 149 F 0.17 0.26 0.57 150 F 0.16 0.27 0.57 151 Q 0.15 0.32 0.53 152 F 0.15 0.34 0.51 153 Y 0.14 0.31 0.55 154 V 0.12 0.32 0.56 155 A 0.09 0.32 0.59 156 D 0.07 0.22 0.70 157 G 0.09 0.23 0.68 158 K 0.13 0.21 0.65 159 L 0.18 0.21 0.61 160 S 0.19 0.20 0.61 161 C 0.19 0.24 0.58 162 Q 0.20 0.25 0.55 163 L 0.22 0.26 0.52 164 Y 0.23 0.24 0.53 165 Q 0.20 0.21 0.59 166 R 0.14 0.13 0.73 167 S 0.13 0.13 0.74 168 C 0.14 0.13 0.73 169 D 0.16 0.12 0.72 170 V 0.24 0.20 0.56 171 F 0.30 0.18 0.52 172 L 0.32 0.18 0.50 173 G 0.31 0.18 0.51 174 L 0.26 0.20 0.55 175 P 0.24 0.21 0.55 176 F 0.23 0.22 0.55 177 N 0.19 0.19 0.62 178 I 0.14 0.21 0.66 179 A 0.10 0.27 0.63 180 S 0.09 0.33 0.58 181 Y 0.09 0.44 0.47 182 A 0.10 0.50 0.40 183 L 0.09 0.64 0.27 184 L 0.08 0.71 0.21 185 V 0.09 0.70 0.21 186 H 0.10 0.63 0.26 187 M 0.10 0.57 0.33 188 M 0.10 0.47 0.43 189 A 0.08 0.40 0.52 190 Q 0.08 0.43 0.50 191 Q 0.08 0.38 0.54 192 C 0.09 0.41 0.50 193 D 0.11 0.39 0.50 194 L 0.14 0.30 0.55 195 E 0.15 0.21 0.65 196 V 0.11 0.15 0.75 197 G 0.07 0.07 0.86 198 D 0.13 0.08 0.79 199 F 0.34 0.09 0.57 200 V 0.51 0.06 0.42 201 W 0.47 0.07 0.46 202 T 0.27 0.08 0.66 203 G 0.09 0.05 0.85 204 G 0.06 0.07 0.87 205 D 0.10 0.20 0.70 206 T 0.12 0.24 0.63 207 H 0.13 0.23 0.64 208 L 0.14 0.22 0.64 209 Y 0.12 0.21 0.67 210 S 0.08 0.32 0.60 211 N 0.06 0.47 0.47 212 H 0.06 0.45 0.48 213 M 0.07 0.36 0.57 214 D 0.08 0.31 0.61 215 Q 0.08 0.25 0.67 216 T 0.07 0.16 0.77 217 H 0.06 0.14 0.80 218 L 0.07 0.16 0.78 219 Q 0.08 0.14 0.78 220 L 0.12 0.17 0.71 221 S 0.19 0.19 0.62 222 R 0.21 0.16 0.62 223 E 0.19 0.16 0.64 224 P 0.15 0.16 0.69 225 R 0.09 0.10 0.80 226 P 0.09 0.09 0.82 227 L 0.08 0.12 0.80 228 P 0.05 0.22 0.73 229 K 0.04 0.46 0.50 230 L 0.04 0.51 0.45 231 I 0.04 0.49 0.47 232 I 0.04 0.52 0.44 233 K 0.05 0.52 0.43 234 R 0.06 0.41 0.53 235 A 0.07 0.33 0.61 236 P 0.07 0.29 0.63 237 E 0.07 0.18 0.74 238 S 0.09 0.22 0.68 239 I 0.11 0.20 0.69 240 F 0.12 0.16 0.72 241 D 0.12 0.16 0.72 242 Y 0.10 0.13 0.77 243 R 0.12 0.15 0.74 244 F 0.17 0.17 0.66 245 E 0.22 0.16 0.62 246 D 0.24 0.20 0.56 247 F 0.19 0.20 0.61 248 E 0.17 0.23 0.60 249 I 0.17 0.28 0.55 250 E 0.14 0.23 0.63 251 G 0.13 0.19 0.68 252 Y 0.15 0.24 0.61 253 D 0.15 0.20 0.65 254 P 0.18 0.20 0.62 255 H 0.21 0.21 0.58 256 P 0.22 0.23 0.55 257 G 0.22 0.23 0.55 258 I 0.27 0.23 0.50 259 K 0.30 0.18 0.52 260 A 0.22 0.15 0.63 261 P 0.12 0.14 0.74 262 V 0.08 0.14 0.78 263 A 0.05 0.27 0.68 264 I 0.03 0.58 0.40 265 X 0.02 0.78 0.20 266 M 0.01 0.93 0.06 267 K 0.01 0.96 0.03 268 Q 0.01 0.98 0.02 269 Y 0.01 0.98 0.02 270 L 0.00 0.99 0.01 271 E 0.00 0.99 0.01 272 L 0.00 0.98 0.01 273 M 0.00 0.99 0.01 274 Q 0.00 0.99 0.01 275 K 0.00 0.98 0.02 276 V 0.01 0.95 0.04 277 L 0.03 0.85 0.12 278 D 0.06 0.59 0.35 279 E 0.07 0.34 0.59 280 G 0.04 0.08 0.88 281 T 0.07 0.06 0.87 282 Q 0.24 0.08 0.68 283 K 0.22 0.08 0.70 284 N 0.08 0.05 0.88 285 D 0.07 0.05 0.87 286 R 0.15 0.07 0.78 287 T 0.14 0.04 0.82 288 G 0.19 0.05 0.76 289 T 0.29 0.06 0.65 290 G 0.42 0.09 0.49 291 T 0.60 0.11 0.29 292 L 0.59 0.20 0.22 293 S 0.60 0.20 0.20 294 I 0.60 0.17 0.22 295 F 0.46 0.14 0.40 296 G 0.28 0.08 0.64 297 H 0.38 0.08 0.54 298 Q 0.55 0.05 0.40 299 M 0.68 0.05 0.27 300 R 0.77 0.04 0.19 301 F 0.61 0.05 0.34 302 N 0.30 0.03 0.67 303 L 0.20 0.13 0.67 304 Q 0.07 0.25 0.69 305 D 0.05 0.37 0.58 306 G 0.05 0.23 0.71 307 F 0.05 0.10 0.85 308 P 0.07 0.08 0.85 309 L 0.28 0.19 0.53 310 V 0.44 0.14 0.42 311 T 0.38 0.10 0.52 312 T 0.26 0.09 0.65 313 K 0.37 0.15 0.48 314 R 0.47 0.24 0.29 315 C 0.35 0.44 0.21 316 H 0.26 0.56 0.19 317 L 0.10 0.80 0.10 318 R 0.04 0.91 0.06 319 S 0.02 0.94 0.05 320 I 0.01 0.92 0.07 321 I 0.00 0.98 0.02 322 H 0.00 0.99 0.01 323 E 0.00 0.99 0.01 324 L 0.00 0.98 0.02 325 L 0.00 0.97 0.03 326 W 0.01 0.95 0.04 327 F 0.02 0.91 0.06 328 L 0.04 0.77 0.19 329 Q 0.05 0.28 0.67 330 G 0.04 0.12 0.84 331 D 0.05 0.12 0.83 332 T 0.06 0.09 0.86 333 N 0.09 0.19 0.72 334 I 0.11 0.54 0.35 335 A 0.13 0.58 0.29 336 Y 0.16 0.56 0.27 337 L 0.17 0.50 0.33 338 H 0.13 0.41 0.47 339 E 0.09 0.23 0.68 340 N 0.04 0.05 0.91 341 N 0.06 0.03 0.91 342 V 0.36 0.03 0.61 343 T 0.76 0.02 0.22 344 I 0.85 0.02 0.13 345 W 0.77 0.07 0.17 346 D 0.55 0.12 0.33 347 E 0.30 0.14 0.57 348 W 0.10 0.11 0.79 349 A 0.06 0.11 0.83 350 D 0.05 0.08 0.87 351 E 0.12 0.12 0.77 352 N 0.11 0.11 0.78 353 G 0.06 0.05 0.89 354 D 0.09 0.09 0.82 355 L 0.11 0.14 0.75 356 G 0.05 0.09 0.86 357 P 0.05 0.39 0.56 358 V 0.05 0.55 0.39 359 Y 0.05 0.52 0.43 360 G 0.05 0.40 0.55 361 K 0.09 0.41 0.50 362 Q 0.22 0.44 0.34 363 W 0.40 0.31 0.29 364 R 0.49 0.24 0.28 365 A 0.40 0.21 0.39 366 W 0.20 0.10 0.70 367 P 0.15 0.07 0.78 368 T 0.15 0.11 0.74 369 P 0.07 0.06 0.87 370 D 0.05 0.07 0.88 371 G 0.05 0.10 0.84 372 R 0.05 0.08 0.88 373 H 0.08 0.16 0.75 374 I 0.07 0.62 0.31 375 D 0.02 0.89 0.09 376 Q 0.01 0.90 0.09 377 I 0.00 0.97 0.02 378 T 0.00 0.99 0.01 379 T 0.00 0.99 0.00 380 V 0.00 0.99 0.01 381 L 0.00 0.99 0.01 382 N 0.00 0.98 0.01 383 Q 0.01 0.98 0.02 384 L 0.01 0.93 0.06 385 K 0.03 0.73 0.24 386 N 0.03 0.33 0.64 387 D 0.01 0.08 0.90 388 P 0.02 0.11 0.88 389 D 0.03 0.11 0.86 390 S 0.08 0.09 0.83 391 R 0.33 0.11 0.56 392 R 0.70 0.04 0.26 393 I 0.88 0.03 0.09 394 I 0.92 0.02 0.06 395 V 0.87 0.03 0.10 396 S 0.76 0.04 0.20 397 A 0.52 0.07 0.41 398 W 0.14 0.05 0.81 399 N 0.03 0.04 0.93 400 V 0.01 0.22 0.77 401 G 0.01 0.70 0.29 402 E 0.01 0.59 0.40 403 L 0.01 0.56 0.43 404 D 0.01 0.72 0.27 405 K 0.01 0.81 0.18 406 M 0.02 0.63 0.34 407 A 0.05 0.37 0.57 408 L 0.05 0.21 0.74 409 A 0.03 0.09 0.88 410 P 0.04 0.07 0.89 411 C 0.18 0.15 0.67 412 H 0.45 0.10 0.45 413 A 0.67 0.05 0.28 414 F 0.81 0.02 0.16 415 F 0.85 0.01 0.13 416 Q 0.91 0.00 0.08 417 F 0.94 0.00 0.06 418 Y 0.93 0.01 0.07 419 V 0.86 0.01 0.13 420 A 0.60 0.02 0.38 421 D 0.19 0.02 0.79 422 G 0.11 0.02 0.87 423 K 0.31 0.04 0.65 424 L 0.47 0.04 0.49 425 S 0.57 0.03 0.40 426 C 0.75 0.04 0.22 427 Q 0.83 0.04 0.13 428 L 0.81 0.05 0.14 429 Y 0.71 0.09 0.20 430 Q 0.58 0.09 0.33 431 R 0.36 0.10 0.55 432 S 0.15 0.09 0.76 433 C 0.14 0.10 0.77 434 D 0.23 0.17 0.60 435 V 0.29 0.22 0.48 436 F 0.28 0.19 0.54 437 L 0.24 0.22 0.54 438 G 0.09 0.10 0.81 439 L 0.03 0.05 0.92 440 P 0.07 0.30 0.63 441 F 0.04 0.74 0.23 442 N 0.02 0.91 0.08 443 I 0.01 0.98 0.02 444 A 0.00 0.99 0.01 445 S 0.00 0.99 0.00 446 Y 0.00 0.99 0.00 447 A 0.00 1.00 0.00 448 L 0.00 1.00 0.00 449 L 0.00 0.99 0.00 450 V 0.00 0.99 0.00 451 H 0.00 0.99 0.00 452 M 0.00 0.98 0.01 453 M 0.00 0.98 0.01 454 A 0.01 0.97 0.02 455 Q 0.01 0.94 0.04 456 Q 0.03 0.78 0.19 457 C 0.03 0.25 0.72 458 D 0.05 0.11 0.84 459 L 0.20 0.15 0.66 460 E 0.34 0.09 0.56 461 V 0.38 0.07 0.54 462 G 0.41 0.06 0.53 463 D 0.67 0.04 0.29 464 F 0.87 0.02 0.11 465 V 0.90 0.02 0.08 466 W 0.89 0.02 0.09 467 T 0.81 0.02 0.17 468 G 0.51 0.02 0.47 469 G 0.19 0.02 0.79 470 D 0.29 0.05 0.66 471 T 0.61 0.08 0.31 472 H 0.69 0.10 0.21 473 L 0.71 0.09 0.19 474 Y 0.49 0.30 0.21 475 S 0.11 0.74 0.15 476 N 0.04 0.84 0.12 477 H 0.02 0.86 0.12 478 M 0.00 0.96 0.04 479 D 0.00 0.98 0.02 480 Q 0.00 0.97 0.03 481 T 0.00 0.98 0.02 482 H 0.00 0.97 0.03 483 L 0.01 0.96 0.03 484 Q 0.02 0.91 0.07 485 L 0.04 0.76 0.20 486 S 0.10 0.42 0.48 487 R 0.13 0.29 0.58 488 E 0.06 0.11 0.84 489 P 0.03 0.05 0.92 490 R 0.03 0.04 0.94 491 P 0.07 0.05 0.88 492 L 0.08 0.03 0.89 493 P 0.13 0.04 0.83 494 K 0.46 0.09 0.45 495 L 0.69 0.06 0.25 496 I 0.79 0.03 0.18 497 I 0.64 0.05 0.32 498 K 0.27 0.04 0.70 499 R 0.09 0.03 0.87 500 A 0.07 0.12 0.81 501 P 0.09 0.31 0.60 502 E 0.08 0.30 0.62 503 S 0.10 0.35 0.55 504 I 0.12 0.43 0.45 505 F 0.12 0.44 0.44 506 D 0.17 0.32 0.52 507 Y 0.22 0.18 0.60 508 R 0.26 0.17 0.57 509 F 0.20 0.14 0.66 510 E 0.18 0.07 0.75 511 D 0.43 0.06 0.51 512 F 0.74 0.02 0.24 513 E 0.90 0.01 0.08 514 I 0.91 0.01 0.07 515 E 0.80 0.01 0.19 516 G 0.60 0.01 0.39 517 Y 0.28 0.02 0.69 518 D 0.07 0.02 0.91 519 P 0.07 0.04 0.89 520 H 0.07 0.05 0.88 521 P 0.13 0.10 0.76 522 G 0.32 0.14 0.55 523 I 0.49 0.12 0.39 524 K 0.63 0.08 0.30 525 A 0.70 0.04 0.26 526 P 0.82 0.02 0.16 527 V 0.90 0.02 0.08 528 A 0.90 0.02 0.07 529 I 0.82 0.03 0.15 530 - 0.50 0.03 0.47 END