# TARGET T0634 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t2k-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor2-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 o_notor2 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0634.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 95.9609 # Pos AA G H I P A B S F J M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.037 0.001 0.002 0.022 0.023 0.037 0.183 0.002 0.001 0.060 0.633 2 S 0.007 0.001 0.001 0.046 0.016 0.062 0.154 0.001 0.001 0.058 0.653 3 L 0.001 0.001 0.001 0.135 0.063 0.170 0.158 0.001 0.001 0.031 0.440 4 K 0.001 0.001 0.001 0.529 0.102 0.227 0.029 0.001 0.001 0.031 0.081 5 K 0.001 0.001 0.001 0.708 0.104 0.095 0.011 0.001 0.001 0.023 0.059 6 I 0.001 0.001 0.001 0.861 0.067 0.043 0.003 0.001 0.001 0.010 0.014 7 L 0.001 0.001 0.001 0.814 0.060 0.051 0.008 0.001 0.001 0.015 0.049 8 I 0.003 0.003 0.001 0.699 0.071 0.080 0.027 0.001 0.001 0.046 0.070 9 I 0.015 0.027 0.002 0.353 0.038 0.053 0.078 0.004 0.001 0.151 0.279 10 D 0.090 0.318 0.002 0.030 0.010 0.015 0.099 0.030 0.001 0.083 0.324 11 Q 0.072 0.213 0.005 0.006 0.004 0.005 0.053 0.011 0.001 0.479 0.151 12 Q 0.016 0.687 0.008 0.005 0.002 0.004 0.035 0.009 0.002 0.100 0.133 13 D 0.016 0.901 0.001 0.001 0.001 0.002 0.006 0.009 0.001 0.030 0.033 14 F 0.014 0.944 0.002 0.001 0.001 0.001 0.002 0.009 0.001 0.013 0.014 15 S 0.007 0.963 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.009 0.016 16 R 0.011 0.905 0.003 0.001 0.001 0.001 0.004 0.003 0.001 0.038 0.033 17 I 0.028 0.525 0.025 0.003 0.002 0.003 0.026 0.010 0.008 0.321 0.048 18 E 0.064 0.805 0.008 0.001 0.002 0.002 0.012 0.012 0.004 0.030 0.061 19 L 0.056 0.796 0.003 0.001 0.001 0.002 0.011 0.005 0.001 0.033 0.092 20 K 0.026 0.576 0.007 0.001 0.002 0.005 0.032 0.004 0.002 0.037 0.308 21 N 0.090 0.205 0.031 0.005 0.007 0.016 0.083 0.008 0.009 0.237 0.308 22 F 0.064 0.021 0.103 0.012 0.019 0.021 0.083 0.011 0.035 0.259 0.374 23 L 0.412 0.010 0.008 0.009 0.010 0.010 0.069 0.004 0.003 0.037 0.427 24 D 0.082 0.003 0.002 0.002 0.003 0.005 0.057 0.001 0.001 0.019 0.825 25 S 0.014 0.004 0.001 0.035 0.004 0.009 0.116 0.001 0.001 0.017 0.799 26 E 0.005 0.003 0.001 0.037 0.011 0.033 0.120 0.001 0.001 0.022 0.768 27 Y 0.002 0.001 0.001 0.067 0.129 0.134 0.140 0.001 0.001 0.019 0.509 28 L 0.003 0.003 0.001 0.450 0.107 0.187 0.027 0.001 0.001 0.049 0.172 29 V 0.003 0.003 0.001 0.229 0.112 0.138 0.056 0.001 0.001 0.073 0.384 30 I 0.003 0.002 0.001 0.583 0.118 0.143 0.025 0.001 0.001 0.040 0.086 31 E 0.012 0.007 0.001 0.326 0.110 0.148 0.043 0.001 0.001 0.049 0.302 32 S 0.036 0.017 0.001 0.166 0.114 0.107 0.084 0.002 0.001 0.068 0.403 33 K 0.031 0.070 0.001 0.055 0.026 0.040 0.092 0.005 0.001 0.053 0.627 34 N 0.047 0.510 0.001 0.010 0.005 0.006 0.032 0.007 0.001 0.070 0.311 35 E 0.015 0.882 0.001 0.001 0.002 0.001 0.008 0.004 0.001 0.021 0.066 36 K 0.015 0.826 0.001 0.001 0.002 0.003 0.006 0.003 0.001 0.113 0.030 37 E 0.008 0.883 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.006 0.001 0.081 0.016 38 A 0.008 0.917 0.003 0.001 0.001 0.001 0.002 0.008 0.001 0.045 0.014 39 L 0.021 0.848 0.012 0.001 0.002 0.002 0.002 0.004 0.001 0.091 0.017 40 E 0.030 0.679 0.011 0.001 0.002 0.003 0.015 0.004 0.005 0.154 0.097 41 Q 0.079 0.329 0.071 0.001 0.002 0.002 0.048 0.026 0.043 0.172 0.228 42 I 0.342 0.092 0.104 0.002 0.002 0.002 0.054 0.035 0.041 0.121 0.205 43 D 0.118 0.005 0.009 0.001 0.001 0.001 0.075 0.001 0.005 0.064 0.719 44 H 0.004 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.105 0.001 0.001 0.019 0.865 45 H 0.022 0.004 0.002 0.008 0.001 0.002 0.164 0.001 0.001 0.030 0.765 46 H 0.071 0.004 0.001 0.031 0.001 0.004 0.181 0.003 0.001 0.044 0.659 47 P 0.001 0.002 0.001 0.118 0.003 0.010 0.148 0.001 0.001 0.023 0.694 48 D 0.001 0.001 0.001 0.856 0.009 0.025 0.017 0.001 0.001 0.020 0.072 49 L 0.001 0.001 0.001 0.920 0.011 0.015 0.006 0.001 0.001 0.019 0.027 50 V 0.001 0.001 0.001 0.940 0.015 0.011 0.003 0.001 0.001 0.015 0.015 51 I 0.002 0.003 0.001 0.841 0.038 0.048 0.008 0.001 0.001 0.025 0.034 52 L 0.010 0.006 0.001 0.658 0.052 0.102 0.038 0.002 0.001 0.031 0.099 53 D 0.055 0.009 0.002 0.268 0.076 0.182 0.098 0.007 0.001 0.101 0.200 54 M 0.010 0.005 0.002 0.181 0.084 0.186 0.153 0.002 0.001 0.059 0.318 55 D 0.025 0.010 0.003 0.113 0.061 0.115 0.120 0.003 0.001 0.047 0.502 56 I 0.127 0.012 0.006 0.111 0.059 0.054 0.128 0.008 0.002 0.105 0.388 57 I 0.126 0.024 0.003 0.037 0.014 0.020 0.134 0.011 0.002 0.072 0.555 58 G 0.171 0.031 0.002 0.026 0.010 0.014 0.116 0.004 0.001 0.071 0.554 59 E 0.011 0.046 0.001 0.017 0.006 0.013 0.154 0.002 0.001 0.036 0.714 60 N 0.023 0.527 0.001 0.008 0.004 0.008 0.059 0.005 0.001 0.051 0.315 61 S 0.008 0.911 0.001 0.001 0.001 0.002 0.008 0.003 0.001 0.021 0.043 62 P 0.003 0.956 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.022 0.012 63 N 0.003 0.983 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.003 64 L 0.005 0.971 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.011 0.005 65 C 0.032 0.910 0.005 0.001 0.002 0.003 0.001 0.005 0.001 0.032 0.009 66 L 0.029 0.789 0.005 0.001 0.006 0.010 0.007 0.002 0.001 0.100 0.051 67 K 0.035 0.422 0.028 0.004 0.008 0.018 0.036 0.013 0.008 0.274 0.154 68 L 0.147 0.130 0.103 0.007 0.025 0.024 0.065 0.027 0.027 0.283 0.163 69 K 0.173 0.052 0.031 0.005 0.023 0.021 0.064 0.009 0.013 0.093 0.517 70 R 0.118 0.024 0.004 0.001 0.005 0.008 0.053 0.003 0.001 0.016 0.768 71 S 0.273 0.017 0.004 0.001 0.002 0.003 0.067 0.004 0.002 0.022 0.606 72 K 0.037 0.003 0.006 0.002 0.003 0.003 0.100 0.002 0.002 0.035 0.806 73 G 0.037 0.001 0.005 0.005 0.005 0.006 0.084 0.001 0.001 0.052 0.804 74 L 0.092 0.001 0.002 0.007 0.006 0.007 0.110 0.001 0.001 0.087 0.687 75 K 0.007 0.001 0.001 0.057 0.012 0.031 0.188 0.001 0.001 0.050 0.653 76 N 0.001 0.001 0.001 0.073 0.005 0.033 0.118 0.001 0.001 0.025 0.744 77 V 0.001 0.001 0.001 0.279 0.151 0.211 0.094 0.001 0.001 0.036 0.228 78 P 0.001 0.001 0.001 0.805 0.053 0.090 0.006 0.001 0.001 0.020 0.026 79 L 0.001 0.001 0.001 0.707 0.127 0.083 0.008 0.001 0.001 0.027 0.047 80 I 0.001 0.001 0.001 0.875 0.049 0.043 0.004 0.001 0.001 0.014 0.014 81 L 0.001 0.001 0.001 0.750 0.073 0.094 0.008 0.001 0.001 0.045 0.027 82 L 0.002 0.003 0.001 0.417 0.148 0.229 0.036 0.001 0.001 0.060 0.102 83 F 0.021 0.012 0.004 0.140 0.156 0.232 0.094 0.005 0.001 0.127 0.207 84 S 0.108 0.041 0.004 0.058 0.058 0.093 0.111 0.011 0.001 0.094 0.420 85 S 0.087 0.115 0.004 0.018 0.020 0.037 0.092 0.006 0.001 0.084 0.536 86 E 0.034 0.237 0.005 0.008 0.009 0.017 0.073 0.005 0.001 0.051 0.562 87 H 0.055 0.693 0.002 0.002 0.007 0.008 0.026 0.003 0.001 0.041 0.163 88 K 0.029 0.854 0.001 0.001 0.003 0.006 0.011 0.004 0.001 0.023 0.067 89 E 0.018 0.257 0.003 0.005 0.007 0.023 0.031 0.002 0.001 0.541 0.114 90 A 0.013 0.454 0.007 0.014 0.018 0.031 0.024 0.003 0.001 0.339 0.096 91 I 0.013 0.803 0.002 0.005 0.019 0.018 0.009 0.003 0.001 0.085 0.043 92 V 0.033 0.734 0.003 0.004 0.012 0.016 0.012 0.005 0.001 0.117 0.064 93 N 0.020 0.252 0.009 0.015 0.016 0.040 0.047 0.003 0.003 0.460 0.135 94 G 0.021 0.096 0.057 0.045 0.022 0.040 0.054 0.009 0.010 0.458 0.188 95 L 0.413 0.171 0.012 0.043 0.027 0.015 0.063 0.022 0.002 0.072 0.160 96 H 0.123 0.046 0.006 0.013 0.009 0.012 0.097 0.005 0.003 0.142 0.545 97 S 0.010 0.040 0.005 0.023 0.003 0.009 0.140 0.001 0.001 0.033 0.735 98 G 0.072 0.164 0.006 0.035 0.008 0.026 0.147 0.008 0.001 0.061 0.470 99 A 0.305 0.065 0.005 0.023 0.008 0.013 0.139 0.020 0.004 0.058 0.360 100 D 0.070 0.020 0.006 0.037 0.027 0.059 0.149 0.003 0.002 0.160 0.467 101 D 0.018 0.013 0.001 0.190 0.030 0.092 0.099 0.002 0.001 0.068 0.486 102 Y 0.026 0.005 0.002 0.187 0.070 0.135 0.131 0.002 0.001 0.092 0.350 103 L 0.002 0.001 0.001 0.088 0.165 0.156 0.100 0.001 0.001 0.023 0.464 104 T 0.040 0.009 0.002 0.123 0.077 0.084 0.064 0.002 0.001 0.077 0.522 105 K 0.070 0.009 0.001 0.035 0.065 0.068 0.144 0.003 0.001 0.032 0.576 106 P 0.009 0.006 0.001 0.036 0.016 0.021 0.162 0.001 0.001 0.046 0.701 107 F 0.003 0.023 0.001 0.027 0.021 0.037 0.132 0.001 0.001 0.018 0.737 108 N 0.152 0.784 0.001 0.002 0.001 0.001 0.006 0.003 0.001 0.007 0.045 109 R 0.035 0.893 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.004 0.001 0.014 0.045 110 N 0.005 0.494 0.002 0.001 0.003 0.010 0.019 0.001 0.001 0.395 0.069 111 D 0.006 0.834 0.001 0.004 0.001 0.003 0.003 0.001 0.001 0.135 0.013 112 L 0.002 0.969 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.021 0.003 113 L 0.002 0.970 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.022 0.002 114 S 0.001 0.974 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.017 0.005 115 R 0.001 0.947 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.042 0.004 116 I 0.004 0.980 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 0.002 117 E 0.011 0.885 0.002 0.001 0.001 0.002 0.004 0.001 0.001 0.071 0.020 118 I 0.025 0.439 0.010 0.003 0.002 0.005 0.017 0.003 0.002 0.430 0.063 119 H 0.049 0.570 0.018 0.005 0.006 0.009 0.027 0.009 0.006 0.220 0.082 120 L 0.070 0.424 0.030 0.011 0.011 0.007 0.037 0.009 0.002 0.220 0.179 121 R 0.031 0.456 0.008 0.007 0.005 0.009 0.048 0.006 0.003 0.077 0.349 122 T 0.073 0.683 0.002 0.002 0.001 0.003 0.022 0.009 0.001 0.019 0.186 123 Q 0.077 0.308 0.008 0.006 0.004 0.005 0.060 0.010 0.003 0.199 0.320 124 N 0.026 0.390 0.011 0.014 0.005 0.009 0.086 0.005 0.002 0.135 0.315 125 Y 0.048 0.669 0.003 0.005 0.002 0.003 0.027 0.011 0.001 0.044 0.188 126 Y 0.147 0.669 0.004 0.004 0.001 0.002 0.019 0.025 0.002 0.046 0.081 127 S 0.053 0.630 0.005 0.002 0.002 0.005 0.030 0.006 0.002 0.068 0.197 128 D 0.074 0.362 0.016 0.009 0.003 0.010 0.049 0.015 0.007 0.150 0.305 129 L 0.185 0.226 0.029 0.014 0.014 0.018 0.087 0.031 0.015 0.117 0.264 130 R 0.281 0.086 0.028 0.009 0.010 0.015 0.066 0.025 0.016 0.081 0.383 131 K 0.138 0.033 0.009 0.007 0.008 0.013 0.086 0.007 0.004 0.048 0.646 132 N 0.179 0.041 0.005 0.009 0.005 0.009 0.096 0.006 0.002 0.038 0.610 133 E 0.051 0.017 0.003 0.009 0.007 0.010 0.144 0.004 0.001 0.033 0.720 134 G 0.043 0.017 0.004 0.018 0.016 0.022 0.141 0.003 0.001 0.045 0.689 135 H 0.065 0.017 0.003 0.027 0.026 0.036 0.114 0.004 0.001 0.046 0.661 136 H 0.080 0.012 0.002 0.040 0.031 0.043 0.122 0.004 0.001 0.055 0.611 137 H 0.047 0.006 0.002 0.034 0.036 0.059 0.113 0.002 0.001 0.043 0.657 138 H 0.027 0.005 0.001 0.043 0.034 0.060 0.116 0.001 0.001 0.029 0.685 139 H 0.033 0.005 0.001 0.031 0.034 0.050 0.119 0.001 0.001 0.029 0.696 140 H 0.051 0.008 0.001 0.028 0.035 0.048 0.133 0.002 0.001 0.031 0.662