# TARGET T0634 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0634.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1409.93 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.093 0.001 0.011 0.010 0.014 0.083 0.024 0.764 2 S 0.037 0.001 0.024 0.014 0.032 0.152 0.024 0.716 3 L 0.002 0.001 0.055 0.011 0.046 0.232 0.026 0.627 4 K 0.001 0.001 0.355 0.076 0.138 0.099 0.058 0.273 5 K 0.001 0.001 0.700 0.123 0.075 0.007 0.070 0.025 6 I 0.001 0.001 0.777 0.062 0.048 0.005 0.058 0.048 7 L 0.001 0.001 0.938 0.024 0.023 0.001 0.007 0.007 8 I 0.003 0.001 0.797 0.059 0.073 0.013 0.016 0.039 9 I 0.016 0.006 0.616 0.038 0.052 0.082 0.048 0.143 10 D 0.078 0.044 0.086 0.016 0.034 0.218 0.060 0.464 11 Q 0.074 0.070 0.021 0.003 0.006 0.135 0.266 0.425 12 Q 0.044 0.443 0.010 0.004 0.005 0.061 0.264 0.170 13 D 0.025 0.812 0.004 0.002 0.003 0.025 0.042 0.088 14 F 0.007 0.913 0.002 0.003 0.002 0.008 0.028 0.037 15 S 0.003 0.979 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.005 16 R 0.006 0.945 0.001 0.001 0.001 0.002 0.041 0.005 17 I 0.003 0.484 0.004 0.003 0.002 0.003 0.493 0.008 18 E 0.007 0.879 0.004 0.001 0.001 0.003 0.098 0.007 19 L 0.022 0.907 0.004 0.001 0.001 0.004 0.050 0.011 20 K 0.048 0.675 0.024 0.006 0.005 0.013 0.126 0.103 21 N 0.078 0.248 0.022 0.006 0.008 0.059 0.252 0.327 22 F 0.054 0.066 0.087 0.013 0.009 0.094 0.381 0.298 23 L 0.332 0.028 0.056 0.008 0.010 0.089 0.082 0.395 24 D 0.219 0.007 0.011 0.002 0.002 0.061 0.025 0.672 25 S 0.014 0.010 0.020 0.003 0.008 0.103 0.009 0.833 26 E 0.008 0.010 0.105 0.010 0.050 0.162 0.026 0.630 27 Y 0.009 0.013 0.136 0.110 0.115 0.118 0.059 0.440 28 L 0.008 0.021 0.335 0.155 0.164 0.044 0.090 0.183 29 V 0.013 0.020 0.324 0.127 0.149 0.039 0.088 0.240 30 I 0.011 0.012 0.351 0.261 0.186 0.022 0.072 0.084 31 E 0.037 0.056 0.223 0.084 0.131 0.055 0.078 0.336 32 S 0.079 0.165 0.088 0.062 0.078 0.095 0.047 0.386 33 K 0.026 0.168 0.041 0.036 0.037 0.086 0.048 0.558 34 N 0.023 0.818 0.003 0.003 0.004 0.017 0.036 0.095 35 E 0.018 0.940 0.001 0.001 0.001 0.003 0.026 0.010 36 K 0.009 0.950 0.002 0.002 0.001 0.003 0.018 0.016 37 E 0.010 0.936 0.004 0.001 0.002 0.004 0.021 0.022 38 A 0.027 0.934 0.002 0.001 0.001 0.003 0.023 0.009 39 L 0.076 0.701 0.015 0.002 0.002 0.007 0.167 0.030 40 E 0.050 0.480 0.013 0.007 0.004 0.020 0.168 0.257 41 Q 0.136 0.125 0.041 0.006 0.006 0.055 0.281 0.352 42 I 0.396 0.029 0.020 0.008 0.004 0.051 0.226 0.265 43 D 0.211 0.006 0.004 0.002 0.003 0.041 0.031 0.702 44 H 0.004 0.001 0.003 0.001 0.001 0.068 0.011 0.911 45 H 0.018 0.004 0.031 0.004 0.005 0.215 0.031 0.693 46 H 0.093 0.007 0.044 0.004 0.004 0.201 0.067 0.580 47 P 0.005 0.005 0.157 0.007 0.011 0.182 0.051 0.582 48 D 0.001 0.002 0.838 0.008 0.027 0.025 0.055 0.045 49 L 0.001 0.002 0.785 0.024 0.027 0.017 0.066 0.077 50 V 0.001 0.001 0.951 0.016 0.010 0.003 0.009 0.008 51 I 0.003 0.003 0.838 0.021 0.035 0.018 0.040 0.042 52 L 0.014 0.005 0.708 0.041 0.063 0.054 0.047 0.067 53 D 0.109 0.010 0.272 0.031 0.056 0.137 0.114 0.272 54 M 0.014 0.005 0.182 0.022 0.048 0.183 0.180 0.366 55 D 0.055 0.005 0.095 0.018 0.043 0.143 0.074 0.567 56 I 0.344 0.005 0.040 0.023 0.026 0.125 0.114 0.322 57 I 0.036 0.006 0.019 0.007 0.015 0.161 0.053 0.703 58 G 0.038 0.016 0.011 0.004 0.015 0.159 0.039 0.718 59 E 0.010 0.014 0.013 0.010 0.008 0.134 0.061 0.749 60 N 0.047 0.525 0.013 0.013 0.010 0.070 0.051 0.271 61 S 0.045 0.917 0.002 0.001 0.001 0.005 0.007 0.022 62 P 0.028 0.895 0.006 0.003 0.003 0.009 0.014 0.043 63 N 0.011 0.926 0.010 0.004 0.004 0.004 0.020 0.020 64 L 0.012 0.963 0.003 0.001 0.002 0.003 0.008 0.009 65 C 0.040 0.882 0.026 0.003 0.004 0.004 0.027 0.013 66 L 0.050 0.802 0.016 0.011 0.007 0.010 0.022 0.082 67 K 0.050 0.209 0.047 0.009 0.013 0.036 0.291 0.345 68 L 0.125 0.238 0.039 0.021 0.015 0.060 0.300 0.201 69 K 0.139 0.091 0.020 0.019 0.016 0.067 0.089 0.558 70 R 0.039 0.017 0.004 0.004 0.004 0.035 0.013 0.885 71 S 0.355 0.046 0.006 0.007 0.008 0.060 0.060 0.458 72 K 0.067 0.004 0.014 0.007 0.005 0.097 0.065 0.740 73 G 0.143 0.003 0.010 0.005 0.011 0.079 0.041 0.708 74 L 0.078 0.001 0.015 0.003 0.005 0.074 0.074 0.749 75 K 0.008 0.001 0.104 0.015 0.031 0.241 0.022 0.578 76 N 0.003 0.001 0.097 0.008 0.028 0.088 0.035 0.740 77 V 0.001 0.001 0.325 0.080 0.050 0.151 0.049 0.343 78 P 0.001 0.001 0.898 0.015 0.028 0.011 0.028 0.019 79 L 0.001 0.001 0.729 0.054 0.049 0.012 0.102 0.052 80 I 0.001 0.001 0.954 0.012 0.011 0.002 0.014 0.006 81 L 0.003 0.003 0.844 0.027 0.044 0.010 0.048 0.021 82 L 0.007 0.005 0.768 0.040 0.052 0.031 0.051 0.045 83 F 0.044 0.033 0.433 0.030 0.064 0.111 0.118 0.166 84 S 0.104 0.097 0.101 0.012 0.029 0.186 0.106 0.365 85 S 0.065 0.139 0.031 0.009 0.018 0.159 0.067 0.512 86 E 0.037 0.270 0.013 0.005 0.008 0.123 0.070 0.474 87 H 0.038 0.741 0.004 0.003 0.004 0.033 0.066 0.111 88 K 0.032 0.863 0.002 0.002 0.002 0.010 0.041 0.048 89 E 0.019 0.635 0.006 0.006 0.009 0.020 0.207 0.098 90 A 0.011 0.625 0.013 0.017 0.019 0.028 0.198 0.088 91 I 0.043 0.778 0.008 0.008 0.012 0.022 0.070 0.058 92 V 0.097 0.527 0.030 0.017 0.026 0.038 0.111 0.154 93 N 0.050 0.277 0.041 0.032 0.050 0.070 0.228 0.252 94 G 0.047 0.112 0.071 0.019 0.028 0.097 0.272 0.354 95 L 0.348 0.088 0.039 0.035 0.032 0.094 0.115 0.248 96 H 0.135 0.034 0.021 0.012 0.019 0.090 0.059 0.630 97 S 0.009 0.017 0.030 0.007 0.018 0.154 0.025 0.739 98 G 0.035 0.066 0.103 0.025 0.038 0.147 0.057 0.529 99 A 0.177 0.061 0.040 0.019 0.018 0.117 0.074 0.495 100 D 0.089 0.025 0.102 0.017 0.021 0.084 0.304 0.358 101 D 0.087 0.051 0.102 0.029 0.066 0.109 0.181 0.376 102 Y 0.051 0.007 0.093 0.027 0.058 0.085 0.077 0.603 103 L 0.040 0.004 0.096 0.106 0.127 0.114 0.038 0.475 104 T 0.010 0.001 0.020 0.020 0.059 0.061 0.030 0.798 105 K 0.027 0.007 0.031 0.059 0.071 0.200 0.035 0.570 106 P 0.014 0.008 0.018 0.018 0.031 0.168 0.023 0.720 107 F 0.017 0.034 0.009 0.010 0.006 0.104 0.017 0.804 108 N 0.072 0.843 0.002 0.001 0.001 0.007 0.025 0.048 109 R 0.035 0.946 0.001 0.001 0.001 0.002 0.006 0.011 110 N 0.011 0.719 0.003 0.002 0.002 0.008 0.215 0.040 111 D 0.004 0.784 0.002 0.001 0.001 0.005 0.192 0.012 112 L 0.002 0.985 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.003 113 L 0.002 0.975 0.001 0.001 0.001 0.001 0.013 0.005 114 S 0.002 0.947 0.002 0.002 0.003 0.003 0.034 0.008 115 R 0.004 0.946 0.003 0.001 0.001 0.003 0.037 0.006 116 I 0.007 0.944 0.004 0.001 0.001 0.002 0.035 0.005 117 E 0.031 0.859 0.009 0.002 0.003 0.009 0.059 0.027 118 I 0.033 0.304 0.042 0.007 0.007 0.029 0.463 0.115 119 H 0.031 0.422 0.062 0.010 0.011 0.043 0.298 0.124 120 L 0.100 0.205 0.057 0.012 0.014 0.072 0.160 0.381 121 R 0.074 0.176 0.029 0.015 0.014 0.098 0.073 0.520 122 T 0.127 0.152 0.015 0.006 0.010 0.073 0.063 0.555 123 Q 0.104 0.087 0.018 0.009 0.011 0.129 0.098 0.545 124 N 0.038 0.097 0.023 0.013 0.014 0.127 0.091 0.596 125 Y 0.066 0.199 0.013 0.006 0.007 0.094 0.031 0.584 126 Y 0.123 0.409 0.022 0.010 0.012 0.061 0.046 0.317 127 S 0.120 0.457 0.010 0.006 0.008 0.044 0.038 0.316 128 D 0.076 0.250 0.032 0.014 0.017 0.061 0.190 0.360 129 L 0.072 0.296 0.028 0.022 0.023 0.091 0.136 0.332 130 R 0.126 0.134 0.054 0.026 0.038 0.091 0.124 0.408 131 K 0.121 0.050 0.023 0.021 0.030 0.110 0.044 0.603 132 N 0.200 0.033 0.020 0.018 0.026 0.087 0.071 0.544 133 E 0.062 0.021 0.009 0.010 0.017 0.125 0.022 0.736 134 G 0.043 0.016 0.013 0.012 0.022 0.104 0.031 0.760 135 H 0.059 0.018 0.014 0.023 0.024 0.126 0.035 0.700 136 H 0.123 0.028 0.026 0.029 0.042 0.109 0.074 0.569 137 H 0.101 0.013 0.025 0.029 0.038 0.106 0.048 0.641 138 H 0.068 0.009 0.025 0.035 0.053 0.106 0.051 0.654 139 H 0.030 0.008 0.015 0.022 0.042 0.095 0.041 0.747 140 H 0.039 0.011 0.027 0.042 0.077 0.121 0.051 0.632