This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 1 NATAA M A 2 2 NATAA S A 3 3 NATAA L A 4 4 NATAA K A 5 5 NATAA K A 6 6 NATAA I A 7 7 NATAA L A 8 8 NATAA I A 9 9 NATAA I A 10 10 NATAA D A 11 11 NATAA Q A 12 12 NATAA Q A 13 13 NATAA D A 14 14 NATAA F A 15 15 NATAA S A 16 16 NATAA R A 17 17 NATAA I A 18 18 NATAA E A 19 19 NATAA L A 20 20 NATAA K A 21 21 NATAA N A 22 22 NATAA F A 23 23 NATAA L A 24 24 NATAA D A 25 25 NATAA S A 26 26 NATAA E A 27 27 NATAA Y A 28 28 NATAA L A 29 29 NATAA V A 30 30 NATAA I A 31 31 NATAA E A 32 32 NATAA S A 33 33 NATAA K A 34 34 NATAA N A 35 35 NATAA E A 36 36 NATAA K A 37 37 NATAA E A 38 38 NATAA A A 39 39 NATAA L A 40 40 NATAA E A 41 41 NATAA Q A 42 42 NATAA I A 43 43 NATAA D A 44 44 NATAA H A 45 45 NATAA H A 46 46 NATAA H A 47 47 NATRO P A 48 48 NATAA D A 49 49 NATAA L A 50 50 NATAA V A 51 51 NATAA I A 52 52 NATAA L A 53 53 NATAA D A 54 54 NATAA M A 55 55 NATAA D A 56 56 NATAA I A 57 57 NATAA I A 58 58 NATAA G A 59 59 NATAA E A 60 60 NATAA N A 61 61 NATAA S A 62 62 NATRO P A 63 63 NATAA N A 64 64 NATAA L A 65 65 NATRO C A 66 66 NATAA L A 67 67 NATAA K A 68 68 NATAA L A 69 69 NATAA K A 70 70 NATAA R A 71 71 NATAA S A 72 72 NATAA K A 73 73 NATAA G A 74 74 NATAA L A 75 75 NATAA K A 76 76 NATAA N A 77 77 NATAA V A 78 78 NATRO P A 79 79 NATAA L A 80 80 NATAA I A 81 81 NATAA L A 82 82 NATAA L A 83 83 NATAA F A 84 84 NATAA S A 85 85 NATAA S A 86 86 NATAA E A 87 87 NATAA H A 88 88 NATAA K A 89 89 NATAA E A 90 90 NATAA A A 91 91 NATAA I A 92 92 NATAA V A 93 93 NATAA N A 94 94 NATAA G A 95 95 NATAA L A 96 96 NATAA H A 97 97 NATAA S A 98 98 NATAA G A 99 99 NATAA A A 100 100 NATAA D A 101 101 NATAA D A 102 102 NATAA Y A 103 103 NATAA L A 104 104 NATAA T A 105 105 NATAA K A 106 106 NATRO P A 107 107 NATAA F A 108 108 NATAA N A 109 109 NATAA R A 110 110 NATAA N A 111 111 NATAA D A 112 112 NATAA L A 113 113 NATAA L A 114 114 NATAA S A 115 115 NATAA R A 116 116 NATAA I A 117 117 NATAA E A 118 118 NATAA I A 119 119 NATAA H A 120 120 NATAA L A 121 121 NATAA R A 122 122 NATAA T A 123 123 NATAA Q A 124 124 NATAA N A 125 125 NATAA Y A 126 126 NATAA Y A 127 127 NATAA S A 128 128 NATAA D A 129 129 NATAA L A 130 130 NATAA R A 131 131 NATAA K A 132 132 NATAA N A 133 133 NATAA E A 134 134 NATAA G A 135 135 NATAA H A 136 136 NATAA H A 137 137 NATAA H A 138 138 NATAA H A 139 139 NATAA H A 140 140 NATAA H