# TARGET T0628 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t04-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-near-backbone-11-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0628.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 41.6899 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 S 0.456 0.135 0.049 0.093 0.071 0.050 0.059 0.037 0.025 0.016 0.010 2 N 0.340 0.182 0.065 0.139 0.091 0.056 0.055 0.032 0.021 0.012 0.008 3 A 0.153 0.114 0.051 0.122 0.113 0.096 0.120 0.084 0.068 0.047 0.032 4 M 0.072 0.083 0.048 0.114 0.116 0.121 0.160 0.105 0.082 0.059 0.039 5 T 0.087 0.164 0.122 0.248 0.160 0.084 0.062 0.033 0.021 0.012 0.007 6 A 0.033 0.029 0.036 0.083 0.102 0.116 0.176 0.143 0.126 0.100 0.058 7 R 0.013 0.032 0.036 0.106 0.120 0.146 0.196 0.124 0.112 0.077 0.039 8 Y 0.002 0.005 0.014 0.029 0.044 0.083 0.169 0.157 0.204 0.175 0.118 9 I 0.001 0.002 0.010 0.012 0.019 0.037 0.098 0.120 0.236 0.231 0.234 10 A 0.001 0.001 0.007 0.009 0.015 0.017 0.053 0.096 0.212 0.248 0.342 11 I 0.001 0.001 0.003 0.004 0.008 0.015 0.040 0.082 0.219 0.275 0.353 12 D 0.003 0.008 0.018 0.043 0.071 0.080 0.159 0.178 0.182 0.142 0.115 13 W 0.005 0.008 0.021 0.047 0.070 0.077 0.158 0.225 0.158 0.134 0.098 14 G 0.009 0.012 0.022 0.037 0.045 0.073 0.152 0.155 0.194 0.173 0.126 15 S 0.010 0.020 0.030 0.071 0.088 0.092 0.180 0.160 0.149 0.111 0.089 16 T 0.011 0.019 0.034 0.050 0.064 0.082 0.153 0.143 0.180 0.154 0.110 17 N 0.024 0.048 0.056 0.135 0.147 0.126 0.174 0.102 0.088 0.058 0.042 18 L 0.003 0.005 0.011 0.016 0.025 0.032 0.085 0.141 0.208 0.238 0.237 19 R 0.003 0.011 0.017 0.055 0.089 0.110 0.191 0.160 0.153 0.124 0.087 20 A 0.002 0.003 0.011 0.014 0.022 0.028 0.072 0.121 0.205 0.259 0.263 21 W 0.005 0.007 0.017 0.036 0.059 0.103 0.178 0.152 0.183 0.161 0.099 22 L 0.006 0.008 0.021 0.040 0.051 0.071 0.166 0.144 0.206 0.174 0.113 23 Y 0.007 0.009 0.018 0.026 0.039 0.087 0.171 0.128 0.196 0.183 0.136 24 Q 0.038 0.291 0.097 0.187 0.133 0.093 0.078 0.034 0.025 0.015 0.008 25 G 0.312 0.215 0.045 0.124 0.093 0.066 0.069 0.038 0.021 0.011 0.007 26 E 0.792 0.083 0.019 0.041 0.022 0.015 0.015 0.007 0.004 0.002 0.001 27 E 0.284 0.215 0.090 0.208 0.102 0.048 0.031 0.013 0.005 0.002 0.001 28 C 0.007 0.014 0.015 0.022 0.036 0.074 0.127 0.130 0.206 0.189 0.180 29 L 0.009 0.016 0.029 0.066 0.113 0.138 0.228 0.165 0.117 0.076 0.043 30 E 0.049 0.083 0.436 0.232 0.101 0.049 0.029 0.012 0.006 0.003 0.001 31 S 0.032 0.054 0.201 0.247 0.177 0.127 0.089 0.040 0.018 0.010 0.004 32 R 0.040 0.024 0.032 0.057 0.068 0.105 0.202 0.185 0.134 0.108 0.046 33 Q 0.070 0.249 0.159 0.191 0.113 0.078 0.065 0.036 0.020 0.014 0.006 34 S 0.062 0.101 0.171 0.165 0.154 0.110 0.102 0.062 0.036 0.024 0.014 35 E 0.619 0.139 0.072 0.075 0.038 0.022 0.018 0.009 0.004 0.002 0.001 36 A 0.149 0.090 0.061 0.141 0.117 0.126 0.142 0.080 0.052 0.027 0.014 37 G 0.064 0.071 0.043 0.095 0.103 0.102 0.155 0.127 0.109 0.076 0.055 38 V 0.004 0.005 0.008 0.018 0.033 0.054 0.108 0.133 0.220 0.218 0.196 39 T 0.033 0.050 0.102 0.145 0.153 0.147 0.155 0.093 0.064 0.041 0.019 40 R 0.030 0.050 0.084 0.212 0.173 0.138 0.137 0.079 0.050 0.030 0.016 41 L 0.005 0.004 0.005 0.009 0.015 0.037 0.089 0.122 0.218 0.239 0.256 42 N 0.107 0.166 0.047 0.174 0.152 0.088 0.109 0.068 0.045 0.028 0.016 43 G 0.256 0.133 0.078 0.142 0.105 0.083 0.087 0.046 0.034 0.022 0.013 44 R 0.496 0.167 0.051 0.105 0.063 0.042 0.038 0.017 0.010 0.006 0.004 45 S 0.224 0.304 0.034 0.136 0.089 0.063 0.061 0.041 0.024 0.016 0.009 46 P 0.075 0.096 0.021 0.070 0.092 0.103 0.144 0.132 0.116 0.091 0.061 47 A 0.235 0.109 0.069 0.172 0.145 0.113 0.086 0.037 0.018 0.009 0.004 48 A 0.123 0.077 0.195 0.237 0.134 0.096 0.076 0.034 0.015 0.009 0.003 49 V 0.005 0.015 0.018 0.056 0.078 0.173 0.236 0.137 0.145 0.090 0.048 50 L 0.001 0.001 0.002 0.003 0.008 0.013 0.055 0.110 0.230 0.273 0.305 51 A 0.009 0.021 0.234 0.206 0.220 0.147 0.093 0.036 0.019 0.011 0.004 52 E 0.021 0.050 0.434 0.248 0.128 0.064 0.034 0.012 0.005 0.003 0.001 53 I 0.002 0.003 0.006 0.010 0.019 0.058 0.142 0.164 0.227 0.214 0.155 54 T 0.005 0.007 0.007 0.016 0.029 0.048 0.139 0.160 0.223 0.217 0.150 55 Q 0.055 0.075 0.383 0.241 0.129 0.057 0.032 0.014 0.007 0.004 0.002 56 H 0.114 0.095 0.196 0.200 0.147 0.106 0.087 0.031 0.013 0.006 0.004 57 W 0.014 0.013 0.011 0.018 0.025 0.041 0.102 0.142 0.207 0.199 0.229 58 R 0.065 0.079 0.035 0.104 0.134 0.132 0.186 0.118 0.069 0.048 0.029 59 D 0.149 0.220 0.216 0.207 0.096 0.051 0.029 0.013 0.009 0.006 0.004 60 G 0.303 0.126 0.061 0.126 0.103 0.084 0.103 0.046 0.025 0.014 0.009 61 A 0.169 0.120 0.042 0.121 0.094 0.084 0.118 0.082 0.081 0.054 0.036 62 T 0.013 0.023 0.022 0.059 0.077 0.106 0.172 0.153 0.166 0.124 0.087 63 P 0.009 0.030 0.035 0.088 0.108 0.138 0.195 0.131 0.127 0.083 0.057 64 V 0.001 0.001 0.005 0.007 0.012 0.017 0.055 0.106 0.196 0.220 0.381 65 V 0.001 0.002 0.009 0.018 0.037 0.049 0.131 0.190 0.204 0.179 0.180 66 M 0.001 0.001 0.008 0.007 0.012 0.012 0.043 0.093 0.235 0.274 0.315 67 A 0.001 0.001 0.004 0.006 0.013 0.018 0.052 0.121 0.232 0.254 0.298 68 G 0.002 0.007 0.013 0.027 0.035 0.051 0.115 0.142 0.241 0.220 0.148 69 M 0.002 0.005 0.015 0.027 0.048 0.049 0.125 0.223 0.173 0.160 0.174 70 V 0.004 0.005 0.018 0.024 0.038 0.034 0.091 0.244 0.180 0.202 0.159 71 G 0.007 0.013 0.029 0.048 0.057 0.056 0.122 0.155 0.191 0.179 0.145 72 S 0.005 0.008 0.019 0.032 0.053 0.057 0.131 0.166 0.195 0.157 0.177 73 N 0.034 0.051 0.076 0.143 0.142 0.156 0.165 0.080 0.078 0.049 0.026 74 V 0.037 0.036 0.061 0.101 0.113 0.104 0.194 0.136 0.102 0.066 0.052 75 G 0.042 0.052 0.052 0.095 0.096 0.091 0.148 0.107 0.122 0.101 0.094 76 W 0.006 0.008 0.012 0.021 0.030 0.038 0.079 0.091 0.190 0.223 0.303 77 K 0.048 0.051 0.059 0.124 0.148 0.148 0.159 0.096 0.081 0.053 0.031 78 I 0.036 0.073 0.076 0.163 0.130 0.120 0.148 0.090 0.077 0.054 0.033 79 A 0.007 0.007 0.008 0.018 0.026 0.047 0.092 0.112 0.200 0.209 0.273 80 P 0.176 0.135 0.057 0.150 0.121 0.082 0.100 0.067 0.056 0.034 0.022 81 Y 0.032 0.040 0.040 0.086 0.091 0.112 0.148 0.118 0.138 0.113 0.081 82 L 0.036 0.040 0.027 0.074 0.087 0.098 0.156 0.144 0.139 0.113 0.085 83 P 0.173 0.143 0.049 0.141 0.102 0.091 0.099 0.068 0.063 0.044 0.027 84 L 0.019 0.015 0.013 0.029 0.042 0.060 0.123 0.168 0.199 0.171 0.161 85 P 0.074 0.085 0.046 0.161 0.148 0.097 0.118 0.100 0.076 0.056 0.039 86 A 0.038 0.019 0.024 0.047 0.064 0.071 0.140 0.159 0.166 0.145 0.128 87 A 0.109 0.181 0.077 0.208 0.161 0.087 0.074 0.046 0.030 0.017 0.010 88 F 0.012 0.017 0.013 0.040 0.059 0.076 0.167 0.167 0.183 0.157 0.110 89 S 0.251 0.112 0.098 0.186 0.138 0.080 0.068 0.031 0.020 0.010 0.006 90 D 0.223 0.185 0.137 0.219 0.110 0.053 0.041 0.017 0.008 0.004 0.003 91 I 0.004 0.007 0.008 0.014 0.022 0.044 0.091 0.105 0.231 0.253 0.221 92 G 0.021 0.024 0.018 0.069 0.120 0.143 0.241 0.144 0.107 0.074 0.038 93 Q 0.061 0.086 0.430 0.236 0.096 0.045 0.023 0.011 0.007 0.004 0.002 94 Q 0.030 0.044 0.069 0.154 0.149 0.198 0.205 0.078 0.042 0.021 0.010 95 L 0.002 0.002 0.003 0.005 0.007 0.012 0.037 0.081 0.207 0.260 0.383 96 T 0.049 0.049 0.071 0.148 0.197 0.141 0.153 0.093 0.051 0.031 0.017 97 A 0.047 0.108 0.286 0.211 0.125 0.083 0.058 0.030 0.023 0.018 0.010 98 V 0.029 0.030 0.021 0.053 0.080 0.125 0.217 0.160 0.122 0.090 0.072 99 G 0.316 0.181 0.039 0.108 0.075 0.065 0.078 0.052 0.041 0.028 0.016 100 D 0.133 0.090 0.061 0.148 0.124 0.110 0.134 0.083 0.061 0.035 0.022 101 N 0.129 0.136 0.066 0.191 0.145 0.102 0.107 0.053 0.038 0.021 0.014 102 I 0.004 0.005 0.007 0.012 0.018 0.030 0.074 0.096 0.230 0.240 0.284 103 W 0.007 0.026 0.029 0.104 0.146 0.157 0.184 0.131 0.098 0.068 0.051 104 I 0.001 0.002 0.006 0.008 0.013 0.020 0.051 0.096 0.220 0.290 0.294 105 I 0.001 0.001 0.003 0.008 0.018 0.033 0.077 0.141 0.219 0.247 0.252 106 P 0.003 0.007 0.014 0.033 0.042 0.051 0.126 0.179 0.228 0.202 0.116 107 G 0.004 0.007 0.017 0.045 0.066 0.080 0.149 0.164 0.183 0.150 0.135 108 L 0.003 0.003 0.007 0.009 0.016 0.023 0.062 0.123 0.212 0.251 0.292 109 C 0.012 0.020 0.027 0.080 0.100 0.107 0.174 0.147 0.148 0.112 0.071 110 V 0.015 0.016 0.028 0.048 0.067 0.086 0.173 0.153 0.169 0.135 0.111 111 S 0.089 0.130 0.098 0.183 0.143 0.112 0.108 0.054 0.042 0.025 0.016 112 R 0.143 0.187 0.075 0.159 0.112 0.087 0.106 0.054 0.037 0.024 0.016 113 D 0.284 0.180 0.048 0.109 0.084 0.079 0.081 0.047 0.039 0.028 0.021 114 D 0.518 0.240 0.042 0.093 0.043 0.023 0.019 0.010 0.006 0.004 0.002 115 N 0.297 0.149 0.046 0.113 0.081 0.069 0.078 0.058 0.049 0.036 0.025 116 H 0.141 0.085 0.034 0.097 0.094 0.103 0.130 0.103 0.098 0.069 0.047 117 N 0.111 0.188 0.089 0.184 0.119 0.097 0.081 0.053 0.039 0.024 0.016 118 V 0.039 0.033 0.034 0.093 0.121 0.127 0.170 0.150 0.109 0.066 0.058 119 M 0.128 0.079 0.054 0.089 0.078 0.071 0.122 0.117 0.111 0.087 0.065 120 R 0.029 0.050 0.054 0.162 0.162 0.126 0.165 0.104 0.077 0.043 0.029 121 G 0.121 0.073 0.071 0.108 0.095 0.093 0.131 0.094 0.097 0.070 0.047 122 E 0.025 0.037 0.053 0.108 0.114 0.118 0.203 0.125 0.112 0.066 0.040 123 E 0.011 0.028 0.056 0.102 0.112 0.101 0.181 0.150 0.124 0.086 0.048 124 T 0.002 0.005 0.015 0.018 0.025 0.034 0.086 0.124 0.225 0.255 0.211 125 Q 0.003 0.011 0.027 0.052 0.083 0.090 0.185 0.185 0.160 0.127 0.076 126 L 0.001 0.002 0.008 0.010 0.017 0.021 0.059 0.144 0.214 0.303 0.222 127 L 0.001 0.002 0.008 0.014 0.026 0.045 0.120 0.200 0.230 0.222 0.131 128 G 0.003 0.006 0.020 0.037 0.051 0.051 0.138 0.185 0.205 0.178 0.127 129 A 0.001 0.001 0.005 0.005 0.009 0.014 0.042 0.085 0.218 0.296 0.326 130 R 0.003 0.007 0.017 0.042 0.073 0.135 0.234 0.144 0.166 0.120 0.060 131 A 0.012 0.019 0.070 0.083 0.085 0.093 0.159 0.131 0.146 0.118 0.085 132 L 0.009 0.017 0.029 0.049 0.066 0.154 0.223 0.119 0.138 0.108 0.088 133 A 0.027 0.055 0.040 0.078 0.083 0.101 0.183 0.118 0.127 0.096 0.092 134 P 0.177 0.148 0.073 0.156 0.129 0.097 0.099 0.050 0.033 0.020 0.017 135 S 0.229 0.132 0.065 0.137 0.106 0.081 0.099 0.054 0.044 0.030 0.023 136 S 0.039 0.051 0.028 0.079 0.080 0.093 0.145 0.121 0.149 0.126 0.090 137 V 0.006 0.016 0.010 0.035 0.047 0.076 0.120 0.140 0.202 0.181 0.167 138 Y 0.005 0.010 0.012 0.028 0.039 0.053 0.100 0.149 0.193 0.187 0.224 139 V 0.002 0.003 0.007 0.013 0.023 0.023 0.059 0.138 0.178 0.220 0.336 140 M 0.002 0.002 0.006 0.012 0.021 0.027 0.066 0.139 0.221 0.261 0.244 141 P 0.010 0.018 0.029 0.080 0.097 0.092 0.167 0.155 0.157 0.113 0.082 142 G 0.013 0.018 0.030 0.074 0.095 0.116 0.183 0.138 0.149 0.102 0.082 143 T 0.033 0.041 0.054 0.096 0.098 0.105 0.190 0.123 0.122 0.082 0.054 144 H 0.013 0.031 0.041 0.104 0.117 0.112 0.200 0.133 0.118 0.076 0.055 145 C 0.003 0.006 0.012 0.015 0.020 0.024 0.053 0.084 0.188 0.259 0.335 146 K 0.003 0.014 0.017 0.050 0.091 0.102 0.197 0.175 0.149 0.121 0.080 147 W 0.003 0.005 0.014 0.028 0.045 0.049 0.093 0.158 0.189 0.224 0.192 148 V 0.003 0.002 0.008 0.012 0.021 0.035 0.101 0.181 0.211 0.228 0.197 149 L 0.008 0.017 0.038 0.099 0.111 0.103 0.194 0.140 0.141 0.091 0.059 150 A 0.001 0.001 0.005 0.004 0.009 0.014 0.044 0.074 0.203 0.245 0.399 151 D 0.029 0.221 0.133 0.239 0.170 0.094 0.064 0.022 0.016 0.009 0.005 152 R 0.152 0.124 0.087 0.180 0.145 0.111 0.108 0.046 0.027 0.013 0.008 153 R 0.697 0.120 0.044 0.064 0.030 0.018 0.014 0.007 0.003 0.002 0.001 154 Q 0.096 0.207 0.063 0.242 0.143 0.096 0.089 0.035 0.017 0.007 0.004 155 I 0.007 0.008 0.010 0.010 0.017 0.026 0.052 0.083 0.176 0.232 0.379 156 H 0.054 0.085 0.113 0.210 0.201 0.145 0.107 0.045 0.023 0.011 0.006 157 D 0.052 0.115 0.259 0.254 0.124 0.080 0.058 0.027 0.017 0.010 0.005 158 F 0.004 0.004 0.008 0.014 0.024 0.053 0.124 0.143 0.232 0.211 0.184 159 R 0.062 0.099 0.072 0.182 0.134 0.108 0.129 0.084 0.070 0.040 0.020 160 T 0.020 0.029 0.086 0.108 0.104 0.119 0.154 0.125 0.107 0.082 0.067 161 V 0.014 0.020 0.038 0.060 0.085 0.119 0.198 0.160 0.137 0.099 0.070 162 L 0.004 0.007 0.014 0.021 0.030 0.034 0.116 0.191 0.228 0.204 0.149 163 T 0.013 0.023 0.056 0.083 0.091 0.073 0.116 0.145 0.153 0.133 0.113 164 G 0.035 0.026 0.044 0.074 0.079 0.108 0.178 0.125 0.146 0.111 0.074 165 E 0.012 0.019 0.028 0.073 0.118 0.092 0.191 0.209 0.119 0.081 0.057 166 L 0.002 0.004 0.011 0.015 0.025 0.024 0.074 0.174 0.213 0.265 0.193 167 H 0.005 0.008 0.025 0.056 0.084 0.130 0.216 0.144 0.153 0.117 0.061 168 H 0.031 0.044 0.187 0.182 0.142 0.119 0.138 0.064 0.050 0.029 0.014 169 L 0.003 0.005 0.022 0.034 0.054 0.116 0.244 0.157 0.169 0.126 0.070 170 L 0.001 0.002 0.008 0.007 0.010 0.016 0.049 0.070 0.204 0.295 0.337 171 L 0.005 0.013 0.045 0.071 0.116 0.165 0.229 0.123 0.113 0.082 0.037 172 Q 0.021 0.070 0.223 0.215 0.150 0.113 0.092 0.046 0.037 0.023 0.011 173 L 0.006 0.006 0.014 0.026 0.043 0.096 0.198 0.184 0.170 0.153 0.105 174 S 0.027 0.038 0.036 0.072 0.072 0.096 0.147 0.138 0.152 0.131 0.091 175 L 0.005 0.008 0.015 0.024 0.040 0.061 0.115 0.139 0.200 0.189 0.204 176 V 0.005 0.006 0.013 0.023 0.040 0.044 0.103 0.156 0.193 0.195 0.221 177 G 0.059 0.070 0.071 0.143 0.135 0.133 0.155 0.083 0.075 0.050 0.026 178 A 0.076 0.060 0.053 0.142 0.146 0.132 0.158 0.102 0.066 0.038 0.027 179 G 0.129 0.098 0.042 0.111 0.094 0.093 0.131 0.098 0.088 0.069 0.047 180 L 0.036 0.029 0.014 0.041 0.054 0.076 0.150 0.133 0.170 0.152 0.143 181 P 0.248 0.312 0.076 0.153 0.093 0.043 0.033 0.019 0.012 0.007 0.005 182 P 0.243 0.190 0.045 0.137 0.103 0.084 0.083 0.048 0.033 0.021 0.012 183 Q 0.520 0.160 0.031 0.092 0.061 0.042 0.044 0.023 0.014 0.008 0.005 184 E 0.450 0.180 0.048 0.141 0.076 0.038 0.032 0.018 0.009 0.005 0.003 185 T 0.056 0.065 0.026 0.064 0.078 0.113 0.147 0.124 0.130 0.120 0.077 186 S 0.032 0.132 0.039 0.131 0.142 0.129 0.151 0.103 0.070 0.050 0.022 187 A 0.139 0.080 0.097 0.193 0.167 0.138 0.105 0.045 0.023 0.010 0.004 188 A 0.299 0.114 0.185 0.223 0.094 0.037 0.028 0.013 0.005 0.002 0.001 189 A 0.002 0.006 0.009 0.027 0.042 0.095 0.166 0.147 0.216 0.171 0.119 190 F 0.001 0.001 0.004 0.006 0.017 0.028 0.081 0.124 0.222 0.263 0.253 191 A 0.006 0.019 0.219 0.184 0.190 0.167 0.108 0.049 0.031 0.021 0.007 192 A 0.015 0.032 0.228 0.199 0.165 0.149 0.122 0.050 0.023 0.012 0.005 193 G 0.004 0.007 0.010 0.021 0.032 0.047 0.122 0.162 0.215 0.191 0.187 194 L 0.001 0.001 0.002 0.004 0.010 0.025 0.074 0.114 0.228 0.247 0.295 195 Q 0.054 0.065 0.274 0.236 0.172 0.080 0.061 0.028 0.016 0.010 0.005 196 R 0.018 0.027 0.079 0.132 0.144 0.205 0.231 0.083 0.046 0.024 0.013 197 G 0.004 0.004 0.005 0.006 0.008 0.016 0.045 0.065 0.204 0.258 0.385 198 I 0.017 0.016 0.014 0.058 0.099 0.120 0.224 0.164 0.131 0.096 0.061 199 N 0.086 0.172 0.219 0.204 0.113 0.081 0.052 0.027 0.023 0.016 0.008 200 N 0.093 0.133 0.058 0.154 0.137 0.129 0.137 0.074 0.043 0.026 0.017 201 P 0.301 0.110 0.027 0.083 0.071 0.076 0.107 0.084 0.065 0.046 0.030 202 A 0.401 0.177 0.057 0.143 0.085 0.049 0.039 0.023 0.013 0.008 0.005 203 V 0.036 0.044 0.030 0.060 0.074 0.107 0.148 0.126 0.149 0.131 0.094 204 L 0.018 0.035 0.020 0.066 0.093 0.105 0.177 0.153 0.143 0.109 0.081 205 P 0.126 0.084 0.098 0.178 0.145 0.118 0.108 0.063 0.041 0.025 0.013 206 Q 0.078 0.090 0.101 0.211 0.168 0.128 0.122 0.054 0.028 0.013 0.008 207 L 0.004 0.007 0.011 0.026 0.041 0.045 0.102 0.151 0.207 0.211 0.198 208 F 0.004 0.006 0.009 0.021 0.037 0.068 0.158 0.158 0.220 0.199 0.120 209 E 0.033 0.084 0.212 0.286 0.176 0.091 0.058 0.024 0.019 0.010 0.007 210 V 0.005 0.003 0.015 0.014 0.026 0.045 0.115 0.151 0.196 0.217 0.213 211 R 0.004 0.014 0.018 0.066 0.095 0.112 0.184 0.172 0.159 0.115 0.061 212 A 0.003 0.004 0.012 0.015 0.023 0.038 0.105 0.144 0.232 0.240 0.184 213 S 0.020 0.034 0.106 0.182 0.185 0.157 0.135 0.073 0.055 0.032 0.021 214 H 0.055 0.046 0.084 0.123 0.125 0.122 0.185 0.113 0.074 0.049 0.026 215 V 0.009 0.011 0.016 0.029 0.040 0.068 0.133 0.141 0.203 0.192 0.159 216 L 0.013 0.028 0.022 0.054 0.074 0.105 0.185 0.141 0.158 0.133 0.086 217 G 0.178 0.117 0.136 0.188 0.140 0.084 0.080 0.036 0.023 0.011 0.006 218 A 0.306 0.214 0.120 0.168 0.083 0.045 0.036 0.014 0.007 0.004 0.002 219 L 0.027 0.021 0.011 0.029 0.041 0.074 0.146 0.142 0.186 0.179 0.142 220 P 0.177 0.449 0.058 0.133 0.076 0.040 0.031 0.017 0.009 0.006 0.003 221 R 0.187 0.140 0.089 0.180 0.136 0.106 0.081 0.040 0.023 0.012 0.006 222 E 0.728 0.099 0.051 0.059 0.027 0.014 0.012 0.005 0.002 0.001 0.001 223 Q 0.078 0.110 0.062 0.208 0.149 0.136 0.128 0.064 0.037 0.020 0.009 224 V 0.009 0.018 0.019 0.033 0.048 0.084 0.149 0.161 0.185 0.186 0.106 225 S 0.033 0.055 0.095 0.184 0.176 0.162 0.141 0.072 0.045 0.027 0.010 226 E 0.048 0.087 0.352 0.241 0.111 0.073 0.045 0.022 0.011 0.007 0.003 227 F 0.009 0.011 0.027 0.063 0.090 0.175 0.261 0.145 0.109 0.069 0.041 228 L 0.002 0.004 0.010 0.010 0.016 0.031 0.090 0.114 0.239 0.242 0.243 229 S 0.008 0.022 0.067 0.104 0.141 0.123 0.184 0.127 0.112 0.069 0.044 230 G 0.023 0.026 0.071 0.070 0.070 0.086 0.170 0.116 0.154 0.126 0.091 231 L 0.003 0.005 0.011 0.024 0.039 0.063 0.165 0.185 0.189 0.164 0.153 232 L 0.001 0.003 0.007 0.012 0.020 0.026 0.072 0.164 0.212 0.261 0.222 233 I 0.001 0.002 0.007 0.011 0.023 0.022 0.073 0.178 0.209 0.237 0.236 234 G 0.002 0.004 0.017 0.031 0.052 0.063 0.133 0.168 0.208 0.189 0.132 235 A 0.002 0.005 0.019 0.032 0.046 0.063 0.154 0.174 0.214 0.185 0.107 236 E 0.001 0.005 0.015 0.035 0.059 0.076 0.186 0.203 0.185 0.146 0.089 237 V 0.001 0.001 0.006 0.005 0.008 0.014 0.042 0.083 0.208 0.296 0.336 238 A 0.006 0.009 0.043 0.065 0.105 0.140 0.221 0.135 0.127 0.092 0.058 239 T 0.008 0.016 0.073 0.082 0.095 0.123 0.201 0.133 0.124 0.095 0.052 240 L 0.002 0.004 0.011 0.014 0.020 0.055 0.121 0.117 0.231 0.248 0.179 241 S 0.024 0.036 0.038 0.096 0.110 0.133 0.218 0.123 0.109 0.071 0.041 242 D 0.127 0.139 0.188 0.215 0.123 0.076 0.060 0.032 0.020 0.012 0.008 243 T 0.067 0.050 0.051 0.096 0.115 0.148 0.188 0.111 0.079 0.054 0.041 244 F 0.065 0.062 0.031 0.067 0.071 0.089 0.148 0.135 0.128 0.118 0.089 245 A 0.084 0.098 0.052 0.116 0.121 0.120 0.139 0.093 0.077 0.058 0.042 246 G 0.241 0.196 0.080 0.143 0.103 0.069 0.071 0.040 0.027 0.018 0.012 247 Q 0.159 0.107 0.048 0.157 0.135 0.109 0.117 0.070 0.047 0.032 0.020 248 Q 0.140 0.132 0.057 0.166 0.138 0.107 0.112 0.067 0.042 0.026 0.013 249 A 0.016 0.033 0.028 0.105 0.126 0.137 0.174 0.133 0.116 0.085 0.047 250 I 0.002 0.004 0.006 0.012 0.019 0.044 0.098 0.122 0.245 0.270 0.178 251 S 0.004 0.012 0.018 0.058 0.082 0.117 0.174 0.137 0.164 0.132 0.100 252 L 0.001 0.001 0.006 0.007 0.012 0.019 0.051 0.104 0.193 0.261 0.345 253 V 0.001 0.002 0.004 0.011 0.022 0.038 0.085 0.127 0.216 0.248 0.245 254 A 0.002 0.006 0.008 0.019 0.034 0.044 0.113 0.160 0.230 0.215 0.170 255 G 0.036 0.077 0.050 0.174 0.171 0.169 0.154 0.071 0.054 0.028 0.016 256 S 0.431 0.112 0.074 0.141 0.084 0.056 0.056 0.024 0.013 0.006 0.004 257 S 0.241 0.158 0.048 0.173 0.127 0.091 0.084 0.041 0.019 0.010 0.007 258 L 0.004 0.015 0.008 0.013 0.020 0.032 0.074 0.097 0.205 0.246 0.286 259 T 0.015 0.020 0.024 0.079 0.166 0.212 0.243 0.109 0.067 0.039 0.025 260 S 0.190 0.106 0.444 0.173 0.053 0.018 0.009 0.004 0.002 0.001 0.001 261 R 0.007 0.016 0.026 0.093 0.133 0.219 0.289 0.114 0.058 0.032 0.013 262 Y 0.001 0.001 0.001 0.003 0.006 0.014 0.053 0.110 0.251 0.317 0.244 263 Q 0.009 0.017 0.144 0.173 0.217 0.193 0.148 0.056 0.026 0.013 0.005 264 Q 0.006 0.023 0.584 0.185 0.101 0.053 0.032 0.010 0.004 0.002 0.001 265 A 0.001 0.001 0.006 0.006 0.012 0.035 0.116 0.139 0.246 0.255 0.184 266 F 0.001 0.001 0.002 0.003 0.007 0.025 0.090 0.108 0.264 0.316 0.185 267 A 0.006 0.031 0.418 0.239 0.154 0.073 0.043 0.017 0.010 0.006 0.003 268 A 0.011 0.022 0.171 0.095 0.121 0.173 0.197 0.096 0.052 0.041 0.020 269 I 0.009 0.013 0.013 0.024 0.037 0.098 0.219 0.184 0.192 0.133 0.079 270 G 0.219 0.166 0.067 0.130 0.098 0.077 0.100 0.064 0.040 0.026 0.014 271 R 0.081 0.049 0.086 0.112 0.121 0.133 0.159 0.096 0.078 0.051 0.035 272 E 0.281 0.290 0.098 0.172 0.077 0.033 0.027 0.011 0.006 0.003 0.002 273 V 0.009 0.007 0.006 0.014 0.024 0.049 0.104 0.129 0.216 0.221 0.223 274 S 0.108 0.170 0.101 0.220 0.180 0.090 0.061 0.036 0.018 0.010 0.007 275 A 0.042 0.048 0.080 0.143 0.135 0.142 0.163 0.101 0.072 0.049 0.025 276 V 0.029 0.025 0.026 0.044 0.058 0.104 0.167 0.137 0.153 0.142 0.116 277 A 0.119 0.241 0.068 0.190 0.127 0.075 0.077 0.046 0.030 0.018 0.008 278 G 0.145 0.092 0.053 0.139 0.130 0.114 0.117 0.084 0.060 0.042 0.023 279 D 0.293 0.122 0.069 0.146 0.104 0.085 0.087 0.046 0.027 0.015 0.007 280 T 0.099 0.110 0.078 0.243 0.163 0.116 0.101 0.047 0.024 0.011 0.006 281 A 0.004 0.005 0.008 0.010 0.017 0.033 0.065 0.090 0.196 0.224 0.349 282 F 0.004 0.009 0.013 0.039 0.081 0.089 0.173 0.171 0.168 0.139 0.115 283 Q 0.018 0.031 0.106 0.135 0.142 0.153 0.160 0.090 0.079 0.058 0.028 284 T 0.027 0.034 0.072 0.170 0.173 0.150 0.174 0.096 0.054 0.031 0.019 285 G 0.010 0.017 0.014 0.046 0.061 0.070 0.157 0.165 0.178 0.157 0.124 286 I 0.001 0.001 0.002 0.004 0.011 0.021 0.055 0.097 0.215 0.266 0.328 287 R 0.006 0.011 0.044 0.083 0.136 0.176 0.218 0.122 0.100 0.070 0.033 288 S 0.004 0.010 0.059 0.080 0.099 0.137 0.229 0.137 0.115 0.083 0.048 289 I 0.001 0.001 0.002 0.002 0.004 0.015 0.045 0.058 0.231 0.294 0.346 290 A 0.001 0.001 0.004 0.010 0.022 0.041 0.117 0.127 0.238 0.236 0.201 291 Y 0.010 0.026 0.158 0.166 0.159 0.163 0.140 0.070 0.055 0.036 0.017 292 A 0.012 0.028 0.088 0.113 0.127 0.171 0.207 0.110 0.071 0.043 0.029 293 V 0.013 0.020 0.019 0.031 0.041 0.072 0.157 0.161 0.182 0.158 0.145 294 A 0.140 0.138 0.083 0.150 0.133 0.094 0.112 0.066 0.042 0.024 0.018 295 N 0.314 0.187 0.142 0.152 0.087 0.045 0.035 0.018 0.010 0.006 0.004