This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 1 NATAA S A 2 2 NATAA N A 3 3 NATAA A A 4 4 NATAA M A 5 5 NATAA T A 6 6 NATAA A A 7 7 NATAA R A 8 8 NATAA Y A 9 9 NATAA I A 10 10 NATAA A A 11 11 NATAA I A 12 12 NATAA D A 13 13 NATAA W A 14 14 NATAA G A 15 15 NATAA S A 16 16 NATAA T A 17 17 NATAA N A 18 18 NATAA L A 19 19 NATAA R A 20 20 NATAA A A 21 21 NATAA W A 22 22 NATAA L A 23 23 NATAA Y A 24 24 NATAA Q A 25 25 NATAA G A 26 26 NATAA E A 27 27 NATAA E A 28 28 NATRO C A 29 29 NATAA L A 30 30 NATAA E A 31 31 NATAA S A 32 32 NATAA R A 33 33 NATAA Q A 34 34 NATAA S A 35 35 NATAA E A 36 36 NATAA A A 37 37 NATAA G A 38 38 NATAA V A 39 39 NATAA T A 40 40 NATAA R A 41 41 NATAA L A 42 42 NATAA N A 43 43 NATAA G A 44 44 NATAA R A 45 45 NATAA S A 46 46 NATRO P A 47 47 NATAA A A 48 48 NATAA A A 49 49 NATAA V A 50 50 NATAA L A 51 51 NATAA A A 52 52 NATAA E A 53 53 NATAA I A 54 54 NATAA T A 55 55 NATAA Q A 56 56 NATAA H A 57 57 NATAA W A 58 58 NATAA R A 59 59 NATAA D A 60 60 NATAA G A 61 61 NATAA A A 62 62 NATAA T A 63 63 NATRO P A 64 64 NATAA V A 65 65 NATAA V A 66 66 NATAA M A 67 67 NATAA A A 68 68 NATAA G A 69 69 NATAA M A 70 70 NATAA V A 71 71 NATAA G A 72 72 NATAA S A 73 73 NATAA N A 74 74 NATAA V A 75 75 NATAA G A 76 76 NATAA W A 77 77 NATAA K A 78 78 NATAA I A 79 79 NATAA A A 80 80 NATRO P A 81 81 NATAA Y A 82 82 NATAA L A 83 83 NATRO P A 84 84 NATAA L A 85 85 NATRO P A 86 86 NATAA A A 87 87 NATAA A A 88 88 NATAA F A 89 89 NATAA S A 90 90 NATAA D A 91 91 NATAA I A 92 92 NATAA G A 93 93 NATAA Q A 94 94 NATAA Q A 95 95 NATAA L A 96 96 NATAA T A 97 97 NATAA A A 98 98 NATAA V A 99 99 NATAA G A 100 100 NATAA D A 101 101 NATAA N A 102 102 NATAA I A 103 103 NATAA W A 104 104 NATAA I A 105 105 NATAA I A 106 106 NATRO P A 107 107 NATAA G A 108 108 NATAA L A 109 109 NATRO C A 110 110 NATAA V A 111 111 NATAA S A 112 112 NATAA R A 113 113 NATAA D A 114 114 NATAA D A 115 115 NATAA N A 116 116 NATAA H A 117 117 NATAA N A 118 118 NATAA V A 119 119 NATAA M A 120 120 NATAA R A 121 121 NATAA G A 122 122 NATAA E A 123 123 NATAA E A 124 124 NATAA T A 125 125 NATAA Q A 126 126 NATAA L A 127 127 NATAA L A 128 128 NATAA G A 129 129 NATAA A A 130 130 NATAA R A 131 131 NATAA A A 132 132 NATAA L A 133 133 NATAA A A 134 134 NATRO P A 135 135 NATAA S A 136 136 NATAA S A 137 137 NATAA V A 138 138 NATAA Y A 139 139 NATAA V A 140 140 NATAA M A 141 141 NATRO P A 142 142 NATAA G A 143 143 NATAA T A 144 144 NATAA H A 145 145 NATRO C A 146 146 NATAA K A 147 147 NATAA W A 148 148 NATAA V A 149 149 NATAA L A 150 150 NATAA A A 151 151 NATAA D A 152 152 NATAA R A 153 153 NATAA R A 154 154 NATAA Q A 155 155 NATAA I A 156 156 NATAA H A 157 157 NATAA D A 158 158 NATAA F A 159 159 NATAA R A 160 160 NATAA T A 161 161 NATAA V A 162 162 NATAA L A 163 163 NATAA T A 164 164 NATAA G A 165 165 NATAA E A 166 166 NATAA L A 167 167 NATAA H A 168 168 NATAA H A 169 169 NATAA L A 170 170 NATAA L A 171 171 NATAA L A 172 172 NATAA Q A 173 173 NATAA L A 174 174 NATAA S A 175 175 NATAA L A 176 176 NATAA V A 177 177 NATAA G A 178 178 NATAA A A 179 179 NATAA G A 180 180 NATAA L A 181 181 NATRO P A 182 182 NATRO P A 183 183 NATAA Q A 184 184 NATAA E A 185 185 NATAA T A 186 186 NATAA S A 187 187 NATAA A A 188 188 NATAA A A 189 189 NATAA A A 190 190 NATAA F A 191 191 NATAA A A 192 192 NATAA A A 193 193 NATAA G A 194 194 NATAA L A 195 195 NATAA Q A 196 196 NATAA R A 197 197 NATAA G A 198 198 NATAA I A 199 199 NATAA N A 200 200 NATAA N A 201 201 NATRO P A 202 202 NATAA A A 203 203 NATAA V A 204 204 NATAA L A 205 205 NATRO P A 206 206 NATAA Q A 207 207 NATAA L A 208 208 NATAA F A 209 209 NATAA E A 210 210 NATAA V A 211 211 NATAA R A 212 212 NATAA A A 213 213 NATAA S A 214 214 NATAA H A 215 215 NATAA V A 216 216 NATAA L A 217 217 NATAA G A 218 218 NATAA A A 219 219 NATAA L A 220 220 NATRO P A 221 221 NATAA R A 222 222 NATAA E A 223 223 NATAA Q A 224 224 NATAA V A 225 225 NATAA S A 226 226 NATAA E A 227 227 NATAA F A 228 228 NATAA L A 229 229 NATAA S A 230 230 NATAA G A 231 231 NATAA L A 232 232 NATAA L A 233 233 NATAA I A 234 234 NATAA G A 235 235 NATAA A A 236 236 NATAA E A 237 237 NATAA V A 238 238 NATAA A A 239 239 NATAA T A 240 240 NATAA L A 241 241 NATAA S A 242 242 NATAA D A 243 243 NATAA T A 244 244 NATAA F A 245 245 NATAA A A 246 246 NATAA G A 247 247 NATAA Q A 248 248 NATAA Q A 249 249 NATAA A A 250 250 NATAA I A 251 251 NATAA S A 252 252 NATAA L A 253 253 NATAA V A 254 254 NATAA A A 255 255 NATAA G A 256 256 NATAA S A 257 257 NATAA S A 258 258 NATAA L A 259 259 NATAA T A 260 260 NATAA S A 261 261 NATAA R A 262 262 NATAA Y A 263 263 NATAA Q A 264 264 NATAA Q A 265 265 NATAA A A 266 266 NATAA F A 267 267 NATAA A A 268 268 NATAA A A 269 269 NATAA I A 270 270 NATAA G A 271 271 NATAA R A 272 272 NATAA E A 273 273 NATAA V A 274 274 NATAA S A 275 275 NATAA A A 276 276 NATAA V A 277 277 NATAA A A 278 278 NATAA G A 279 279 NATAA D A 280 280 NATAA T A 281 281 NATAA A A 282 282 NATAA F A 283 283 NATAA Q A 284 284 NATAA T A 285 285 NATAA G A 286 286 NATAA I A 287 287 NATAA R A 288 288 NATAA S A 289 289 NATAA I A 290 290 NATAA A A 291 291 NATAA Y A 292 292 NATAA A A 293 293 NATAA V A 294 294 NATAA A A 295 295 NATAA N