This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 1 NATAA M A 2 2 NATAA I A 3 3 NATAA D A 4 4 NATAA T A 5 5 NATAA F A 6 6 NATAA E A 7 7 NATAA R A 8 8 NATAA T A 9 9 NATAA G A 10 10 NATRO P A 11 11 NATAA L A 12 12 NATAA M A 13 13 NATAA E A 14 14 NATAA A A 15 15 NATAA S A 16 16 NATAA S A 17 17 NATAA Y A 18 18 NATRO P A 19 19 NATAA A A 20 20 NATAA W A 21 21 NATAA A A 22 22 NATAA Q A 23 23 NATAA Q A 24 24 NATAA L A 25 25 NATAA I A 26 26 NATAA N A 27 27 NATAA D A 28 28 NATRO C A 29 29 NATAA S A 30 30 NATRO P A 31 31 NATAA A A 32 32 NATAA K A 33 33 NATAA A A 34 34 NATAA R A 35 35 NATAA V A 36 36 NATAA V A 37 37 NATAA E A 38 38 NATAA H A 39 39 NATAA E A 40 40 NATAA L A 41 41 NATAA Y A 42 42 NATAA Q A 43 43 NATAA Q A 44 44 NATAA M A 45 45 NATAA R A 46 46 NATAA D A 47 47 NATAA A A 48 48 NATAA K A 49 49 NATAA L A 50 50 NATAA S A 51 51 NATRO P A 52 52 NATAA Q A 53 53 NATAA I A 54 54 NATAA M A 55 55 NATAA R A 56 56 NATAA Q A 57 57 NATAA Y A 58 58 NATAA L A 59 59 NATAA I A 60 60 NATAA G A 61 61 NATAA G A 62 62 NATAA W A 63 63 NATRO P A 64 64 NATAA V A 65 65 NATAA V A 66 66 NATAA E A 67 67 NATAA Q A 68 68 NATAA F A 69 69 NATAA A A 70 70 NATAA V A 71 71 NATAA Y A 72 72 NATAA M A 73 73 NATAA A A 74 74 NATAA K A 75 75 NATAA N A 76 76 NATAA L A 77 77 NATAA T A 78 78 NATAA K A 79 79 NATAA T A 80 80 NATAA R A 81 81 NATAA F A 82 82 NATAA G A 83 83 NATAA R A 84 84 NATAA H A 85 85 NATRO P A 86 86 NATAA G A 87 87 NATAA E A 88 88 NATAA D A 89 89 NATAA M A 90 90 NATAA A A 91 91 NATAA R A 92 92 NATAA R A 93 93 NATAA W A 94 94 NATAA L A 95 95 NATAA M A 96 96 NATAA R A 97 97 NATAA N A 98 98 NATAA I A 99 99 NATAA R A 100 100 NATAA V A 101 101 NATAA E A 102 102 NATAA L A 103 103 NATAA N A 104 104 NATAA H A 105 105 NATAA A A 106 106 NATAA D A 107 107 NATAA Y A 108 108 NATAA W A 109 109 NATAA V A 110 110 NATAA N A 111 111 NATAA W A 112 112 NATRO C A 113 113 NATAA A A 114 114 NATAA A A 115 115 NATAA H A 116 116 NATAA D A 117 117 NATAA V A 118 118 NATAA T A 119 119 NATAA L A 120 120 NATAA E A 121 121 NATAA D A 122 122 NATAA L A 123 123 NATAA H A 124 124 NATAA D A 125 125 NATAA Q A 126 126 NATAA R A 127 127 NATAA V A 128 128 NATAA A A 129 129 NATRO P A 130 130 NATAA E A 131 131 NATAA L A 132 132 NATAA H A 133 133 NATAA A A 134 134 NATAA L A 135 135 NATAA S A 136 136 NATAA H A 137 137 NATAA W A 138 138 NATRO C A 139 139 NATAA W A 140 140 NATAA Q A 141 141 NATAA T A 142 142 NATAA S A 143 143 NATAA S A 144 144 NATAA S A 145 145 NATAA D A 146 146 NATAA S A 147 147 NATAA L A 148 148 NATAA A A 149 149 NATAA V A 150 150 NATAA A A 151 151 NATAA M A 152 152 NATAA A A 153 153 NATAA A A 154 154 NATAA T A 155 155 NATAA N A 156 156 NATAA Y A 157 157 NATAA A A 158 158 NATAA I A 159 159 NATAA E A 160 160 NATAA G A 161 161 NATAA A A 162 162 NATAA T A 163 163 NATAA G A 164 164 NATAA E A 165 165 NATAA W A 166 166 NATAA S A 167 167 NATAA A A 168 168 NATAA V A 169 169 NATAA V A 170 170 NATRO C A 171 171 NATAA S A 172 172 NATAA T A 173 173 NATAA G A 174 174 NATAA V A 175 175 NATAA Y A 176 176 NATAA A A 177 177 NATAA E A 178 178 NATAA A A 179 179 NATAA F A 180 180 NATAA A A 181 181 NATAA E A 182 182 NATAA E A 183 183 NATAA T A 184 184 NATAA R A 185 185 NATAA K A 186 186 NATAA K A 187 187 NATAA S A 188 188 NATAA M A 189 189 NATAA K A 190 190 NATAA W A 191 191 NATAA L A 192 192 NATAA K A 193 193 NATAA M A 194 194 NATAA H A 195 195 NATAA A A 196 196 NATAA Q A 197 197 NATAA Y A 198 198 NATAA D A 199 199 NATAA D A 200 200 NATAA A A 201 201 NATAA H A 202 202 NATRO P A 203 203 NATAA W A 204 204 NATAA E A 205 205 NATAA A A 206 206 NATAA L A 207 207 NATAA E A 208 208 NATAA I A 209 209 NATAA I A 210 210 NATRO C A 211 211 NATAA T A 212 212 NATAA L A 213 213 NATAA V A 214 214 NATAA G A 215 215 NATAA N A 216 216 NATAA K A 217 217 NATRO P A 218 218 NATAA S A 219 219 NATAA L A 220 220 NATAA Q A 221 221 NATAA L A 222 222 NATAA Q A 223 223 NATAA A A 224 224 NATAA E A 225 225 NATAA L A 226 226 NATAA R A 227 227 NATAA Q A 228 228 NATAA A A 229 229 NATAA V A 230 230 NATAA T A 231 231 NATAA K A 232 232 NATAA S A 233 233 NATAA Y A 234 234 NATAA D A 235 235 NATAA Y A 236 236 NATAA M A 237 237 NATAA Y A 238 238 NATAA L A 239 239 NATAA F A 240 240 NATAA L A 241 241 NATAA E A 242 242 NATAA R A 243 243 NATRO C A 244 244 NATAA I A 245 245 NATAA Q A 246 246 NATAA L A 247 247 NATAA D A 248 248 NATAA K A 249 249 NATAA V A 250 250 NATAA K A 251 251 NATAA S A 252 252 NATRO P A 253 253 NATAA R A 254 254 NATAA G A 255 255 NATAA R A 256 256 NATAA V A 257 257 NATAA A A 258 258 NATAA A A 259 259 NATAA L A 260 260 NATAA E A 261 261 NATAA M