# TARGET T0590 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0590.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1316 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.020 0.023 0.004 0.019 0.291 0.643 2 N 0.027 0.051 0.011 0.013 0.625 0.273 3 A 0.026 0.040 0.019 0.008 0.719 0.188 4 R 0.016 0.006 0.018 0.004 0.785 0.171 5 D 0.057 0.016 0.009 0.001 0.591 0.326 6 N 0.152 0.040 0.008 0.002 0.275 0.522 7 K 0.363 0.025 0.012 0.003 0.246 0.352 8 F 0.716 0.015 0.012 0.003 0.122 0.133 9 N 0.857 0.008 0.006 0.002 0.038 0.089 10 T 0.919 0.004 0.003 0.002 0.029 0.043 11 W 0.939 0.005 0.002 0.002 0.022 0.030 12 N 0.844 0.009 0.004 0.003 0.069 0.072 13 D 0.551 0.042 0.009 0.006 0.286 0.107 14 S 0.140 0.009 0.014 0.004 0.688 0.145 15 R 0.050 0.013 0.011 0.004 0.796 0.125 16 G 0.073 0.021 0.016 0.006 0.603 0.282 17 N 0.161 0.060 0.028 0.010 0.375 0.366 18 Y 0.179 0.043 0.046 0.013 0.350 0.368 19 W 0.150 0.029 0.085 0.015 0.366 0.355 20 S 0.228 0.043 0.070 0.011 0.335 0.314 21 D 0.264 0.036 0.039 0.008 0.326 0.327 22 Y 0.315 0.029 0.014 0.003 0.362 0.277 23 E 0.369 0.010 0.020 0.005 0.359 0.237 24 G 0.566 0.010 0.020 0.005 0.258 0.140 25 S 0.798 0.011 0.009 0.004 0.111 0.067 26 D 0.853 0.009 0.003 0.003 0.058 0.074 27 E 0.802 0.012 0.003 0.003 0.072 0.108 28 N 0.595 0.014 0.005 0.003 0.163 0.221 29 G 0.379 0.012 0.006 0.002 0.247 0.354 30 D 0.286 0.011 0.009 0.001 0.343 0.350 31 G 0.383 0.011 0.008 0.001 0.280 0.317 32 I 0.684 0.007 0.003 0.001 0.108 0.199 33 G 0.920 0.002 0.001 0.001 0.021 0.056 34 D 0.974 0.001 0.001 0.001 0.006 0.018 35 S 0.984 0.001 0.001 0.001 0.003 0.012 36 A 0.987 0.001 0.001 0.001 0.003 0.009 37 Y 0.985 0.001 0.001 0.001 0.002 0.011 38 A 0.969 0.001 0.001 0.001 0.009 0.020 39 V 0.920 0.005 0.001 0.001 0.023 0.051 40 N 0.711 0.018 0.002 0.001 0.099 0.169 41 P 0.248 0.023 0.010 0.003 0.560 0.156 42 E 0.045 0.005 0.061 0.010 0.808 0.072 43 A 0.046 0.010 0.062 0.007 0.809 0.066 44 G 0.131 0.012 0.035 0.004 0.711 0.107 45 S 0.351 0.022 0.010 0.002 0.304 0.311 46 M 0.647 0.029 0.007 0.001 0.140 0.175 47 D 0.688 0.009 0.007 0.001 0.133 0.162 48 Y 0.791 0.004 0.004 0.001 0.083 0.117 49 M 0.841 0.005 0.003 0.001 0.058 0.093 50 P 0.892 0.003 0.001 0.001 0.039 0.064 51 L 0.911 0.002 0.001 0.001 0.030 0.055 52 M 0.933 0.002 0.001 0.001 0.021 0.042 53 E 0.945 0.002 0.001 0.001 0.016 0.036 54 Y 0.942 0.003 0.001 0.001 0.016 0.037 55 L 0.886 0.009 0.001 0.002 0.033 0.068 56 H 0.677 0.012 0.002 0.003 0.088 0.217 57 S 0.361 0.013 0.006 0.005 0.200 0.416 58 S 0.167 0.018 0.009 0.004 0.313 0.488 59 P 0.106 0.010 0.009 0.003 0.316 0.556 60 V 0.137 0.026 0.012 0.003 0.275 0.548 61 L 0.152 0.008 0.004 0.002 0.195 0.639 62 P 0.268 0.008 0.007 0.003 0.142 0.571 63 T 0.655 0.026 0.008 0.003 0.095 0.212 64 A 0.767 0.007 0.008 0.004 0.067 0.147 65 R 0.826 0.005 0.008 0.003 0.054 0.105 66 F 0.874 0.006 0.004 0.002 0.033 0.081 67 T 0.849 0.010 0.002 0.003 0.045 0.090 68 S 0.733 0.020 0.003 0.004 0.075 0.164 69 D 0.464 0.015 0.010 0.006 0.291 0.216 70 I 0.257 0.022 0.047 0.011 0.475 0.189 71 T 0.140 0.014 0.050 0.010 0.594 0.192 72 E 0.202 0.020 0.049 0.005 0.562 0.162 73 G 0.209 0.021 0.024 0.004 0.408 0.334 74 F 0.272 0.038 0.018 0.003 0.278 0.392 75 A 0.396 0.014 0.012 0.003 0.222 0.353 76 P 0.448 0.010 0.013 0.003 0.182 0.345 77 L 0.714 0.011 0.010 0.003 0.112 0.151 78 S 0.845 0.004 0.008 0.003 0.061 0.077 79 V 0.920 0.006 0.003 0.002 0.024 0.046 80 R 0.918 0.006 0.002 0.002 0.026 0.046 81 F 0.844 0.008 0.003 0.003 0.045 0.097 82 K 0.666 0.054 0.005 0.004 0.108 0.163 83 D 0.179 0.036 0.013 0.006 0.690 0.076 84 F 0.042 0.004 0.028 0.006 0.857 0.064 85 S 0.024 0.008 0.015 0.002 0.880 0.070 86 E 0.052 0.022 0.007 0.002 0.786 0.130 87 N 0.114 0.010 0.002 0.001 0.150 0.723 88 A 0.560 0.032 0.005 0.001 0.106 0.296 89 T 0.803 0.007 0.004 0.001 0.067 0.118 90 S 0.922 0.005 0.003 0.001 0.029 0.041 91 R 0.912 0.004 0.003 0.001 0.025 0.054 92 L 0.928 0.003 0.002 0.001 0.024 0.041 93 W 0.936 0.004 0.002 0.002 0.024 0.032 94 M 0.866 0.011 0.003 0.002 0.046 0.072 95 F 0.540 0.045 0.007 0.004 0.299 0.105 96 G 0.116 0.009 0.014 0.004 0.762 0.094 97 D 0.058 0.010 0.013 0.003 0.832 0.083 98 G 0.073 0.018 0.014 0.004 0.770 0.122 99 N 0.198 0.056 0.016 0.006 0.411 0.312 100 T 0.220 0.053 0.035 0.009 0.346 0.338 101 S 0.145 0.028 0.073 0.013 0.412 0.330 102 D 0.186 0.034 0.078 0.009 0.361 0.332 103 S 0.269 0.045 0.051 0.005 0.331 0.298 104 P 0.290 0.029 0.019 0.003 0.314 0.345 105 S 0.336 0.023 0.006 0.001 0.361 0.272 106 P 0.390 0.007 0.012 0.001 0.375 0.214 107 L 0.661 0.008 0.011 0.001 0.223 0.096 108 H 0.892 0.008 0.003 0.001 0.064 0.032 109 T 0.908 0.004 0.001 0.001 0.034 0.053 110 F 0.869 0.007 0.001 0.001 0.045 0.076 111 F 0.693 0.009 0.002 0.001 0.107 0.187 112 N 0.476 0.010 0.002 0.001 0.164 0.346 113 E 0.326 0.012 0.002 0.001 0.218 0.440 114 G 0.407 0.012 0.002 0.001 0.189 0.390 115 E 0.633 0.007 0.001 0.001 0.086 0.273 116 Y 0.915 0.002 0.001 0.001 0.015 0.067 117 I 0.973 0.001 0.001 0.001 0.005 0.022 118 V 0.985 0.001 0.001 0.001 0.002 0.012 119 S 0.984 0.001 0.001 0.001 0.003 0.012 120 L 0.983 0.001 0.001 0.001 0.002 0.015 121 I 0.974 0.001 0.001 0.001 0.005 0.020 122 V 0.930 0.003 0.001 0.001 0.013 0.053 123 S 0.755 0.026 0.001 0.001 0.052 0.167 124 N 0.215 0.042 0.004 0.001 0.624 0.114 125 E 0.018 0.003 0.021 0.002 0.927 0.030 126 N 0.010 0.003 0.018 0.001 0.947 0.021 127 D 0.042 0.009 0.012 0.001 0.893 0.044 128 S 0.259 0.026 0.005 0.001 0.297 0.412 129 D 0.653 0.038 0.004 0.001 0.107 0.196 130 S 0.714 0.007 0.006 0.002 0.099 0.171 131 A 0.841 0.010 0.004 0.002 0.048 0.095 132 S 0.849 0.010 0.003 0.003 0.041 0.094 133 V 0.872 0.003 0.003 0.003 0.036 0.083 134 T 0.837 0.004 0.003 0.004 0.039 0.112 135 I 0.794 0.013 0.003 0.005 0.038 0.148 136 R 0.632 0.025 0.002 0.007 0.040 0.294 137 A 0.020 0.004 0.001 0.002 0.022 0.951