# TARGET T0586 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t2k-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0586.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 5246 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 S 0.069 0.009 0.028 0.032 0.066 0.117 0.048 0.630 2 N 0.045 0.006 0.040 0.086 0.111 0.145 0.047 0.519 3 A 0.010 0.004 0.035 0.072 0.132 0.141 0.038 0.568 4 M 0.008 0.005 0.034 0.063 0.088 0.136 0.024 0.641 5 N 0.140 0.054 0.031 0.062 0.076 0.092 0.176 0.369 6 P 0.047 0.022 0.034 0.020 0.030 0.113 0.045 0.688 7 T 0.177 0.018 0.054 0.030 0.032 0.087 0.123 0.479 8 F 0.166 0.006 0.026 0.005 0.012 0.073 0.029 0.682 9 H 0.307 0.012 0.006 0.003 0.003 0.066 0.082 0.521 10 A 0.006 0.015 0.003 0.003 0.005 0.105 0.018 0.844 11 D 0.018 0.307 0.003 0.003 0.004 0.062 0.031 0.570 12 K 0.052 0.404 0.006 0.022 0.018 0.056 0.232 0.211 13 P 0.009 0.855 0.003 0.003 0.003 0.010 0.066 0.050 14 I 0.002 0.980 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.006 15 Y 0.003 0.601 0.003 0.001 0.001 0.001 0.384 0.007 16 S 0.002 0.485 0.002 0.001 0.001 0.002 0.503 0.005 17 Q 0.001 0.967 0.001 0.001 0.001 0.001 0.027 0.003 18 I 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 19 S 0.001 0.980 0.001 0.001 0.001 0.001 0.016 0.003 20 D 0.001 0.977 0.001 0.001 0.001 0.001 0.018 0.004 21 W 0.003 0.873 0.003 0.001 0.001 0.001 0.115 0.006 22 M 0.007 0.938 0.004 0.001 0.001 0.001 0.044 0.006 23 K 0.012 0.952 0.001 0.001 0.001 0.001 0.015 0.019 24 K 0.015 0.188 0.029 0.001 0.001 0.013 0.692 0.061 25 Q 0.027 0.058 0.165 0.003 0.003 0.042 0.646 0.056 26 M 0.503 0.038 0.054 0.005 0.005 0.054 0.101 0.241 27 I 0.221 0.012 0.022 0.005 0.007 0.066 0.023 0.645 28 T 0.009 0.003 0.003 0.001 0.004 0.111 0.006 0.863 29 G 0.049 0.009 0.021 0.012 0.020 0.157 0.026 0.706 30 E 0.013 0.005 0.035 0.079 0.095 0.142 0.030 0.602 31 W 0.025 0.004 0.024 0.015 0.025 0.078 0.019 0.810 32 K 0.514 0.019 0.019 0.009 0.010 0.063 0.104 0.262 33 G 0.225 0.031 0.013 0.002 0.004 0.071 0.036 0.618 34 E 0.170 0.017 0.006 0.003 0.004 0.062 0.030 0.709 35 D 0.028 0.021 0.016 0.015 0.016 0.137 0.054 0.714 36 K 0.016 0.110 0.017 0.009 0.014 0.104 0.041 0.688 37 L 0.056 0.524 0.008 0.012 0.011 0.053 0.045 0.293 38 P 0.021 0.759 0.006 0.006 0.006 0.032 0.034 0.136 39 S 0.010 0.920 0.002 0.001 0.002 0.008 0.027 0.029 40 V 0.006 0.967 0.002 0.001 0.001 0.002 0.014 0.008 41 R 0.019 0.925 0.004 0.001 0.001 0.004 0.033 0.012 42 E 0.023 0.889 0.006 0.001 0.001 0.006 0.054 0.019 43 M 0.105 0.703 0.033 0.004 0.006 0.017 0.073 0.059 44 G 0.229 0.136 0.130 0.008 0.009 0.048 0.267 0.173 45 V 0.490 0.037 0.014 0.005 0.006 0.081 0.036 0.331 46 K 0.032 0.005 0.006 0.001 0.005 0.067 0.031 0.853 47 L 0.010 0.005 0.011 0.004 0.003 0.189 0.014 0.764 48 A 0.009 0.014 0.033 0.009 0.023 0.160 0.041 0.710 49 V 0.004 0.020 0.012 0.006 0.004 0.088 0.058 0.809 50 N 0.091 0.724 0.004 0.001 0.001 0.009 0.144 0.028 51 P 0.024 0.772 0.006 0.001 0.001 0.011 0.147 0.040 52 N 0.003 0.810 0.012 0.001 0.001 0.012 0.113 0.048 53 T 0.001 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.003 54 V 0.001 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 55 S 0.002 0.974 0.001 0.001 0.001 0.001 0.019 0.003 56 R 0.001 0.979 0.001 0.001 0.001 0.001 0.015 0.004 57 A 0.001 0.991 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.002 58 Y 0.005 0.982 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.003 59 Q 0.007 0.952 0.001 0.001 0.001 0.002 0.025 0.012 60 E 0.016 0.718 0.016 0.002 0.002 0.011 0.187 0.048 61 L 0.067 0.052 0.121 0.003 0.002 0.018 0.702 0.034 62 E 0.660 0.022 0.015 0.003 0.003 0.043 0.064 0.189 63 R 0.042 0.006 0.004 0.001 0.004 0.063 0.008 0.871 64 A 0.006 0.007 0.014 0.003 0.010 0.160 0.013 0.786 65 G 0.011 0.008 0.060 0.047 0.168 0.145 0.050 0.511 66 Y 0.009 0.005 0.043 0.248 0.195 0.056 0.054 0.389 67 I 0.017 0.005 0.183 0.123 0.214 0.043 0.073 0.341 68 Y 0.012 0.001 0.185 0.208 0.260 0.042 0.066 0.227 69 A 0.024 0.001 0.159 0.103 0.216 0.046 0.041 0.411 70 K 0.291 0.001 0.047 0.122 0.092 0.068 0.052 0.326 71 R 0.016 0.001 0.033 0.032 0.078 0.095 0.014 0.731 72 G 0.023 0.001 0.018 0.044 0.090 0.129 0.028 0.667 73 M 0.008 0.003 0.025 0.187 0.258 0.108 0.028 0.383 74 G 0.009 0.005 0.031 0.148 0.381 0.060 0.048 0.318 75 S 0.005 0.005 0.035 0.317 0.379 0.039 0.058 0.161 76 F 0.006 0.010 0.062 0.299 0.359 0.038 0.045 0.180 77 V 0.016 0.015 0.063 0.212 0.223 0.057 0.065 0.348 78 T 0.109 0.104 0.054 0.123 0.162 0.067 0.105 0.276 79 S 0.063 0.152 0.027 0.028 0.041 0.086 0.061 0.541 80 D 0.154 0.389 0.011 0.013 0.015 0.044 0.089 0.285 81 K 0.110 0.383 0.011 0.007 0.009 0.064 0.080 0.335 82 A 0.058 0.438 0.012 0.008 0.009 0.061 0.063 0.350 83 L 0.073 0.635 0.007 0.005 0.007 0.031 0.044 0.199 84 F 0.092 0.565 0.010 0.004 0.005 0.037 0.061 0.227 85 D 0.060 0.614 0.008 0.003 0.005 0.035 0.041 0.234 86 Q 0.057 0.661 0.007 0.002 0.003 0.029 0.038 0.203 87 L 0.040 0.643 0.014 0.003 0.004 0.029 0.088 0.180 88 K 0.030 0.812 0.004 0.001 0.002 0.016 0.021 0.114 89 K 0.071 0.691 0.008 0.002 0.002 0.023 0.054 0.150 90 E 0.024 0.751 0.011 0.002 0.002 0.023 0.055 0.132 91 L 0.021 0.872 0.003 0.001 0.002 0.010 0.021 0.071 92 A 0.053 0.381 0.018 0.001 0.002 0.017 0.449 0.078 93 D 0.042 0.696 0.009 0.001 0.001 0.028 0.117 0.106 94 A 0.013 0.865 0.004 0.001 0.001 0.011 0.024 0.082 95 I 0.006 0.893 0.006 0.001 0.001 0.006 0.046 0.041 96 T 0.009 0.956 0.001 0.001 0.001 0.002 0.018 0.014 97 E 0.008 0.961 0.001 0.001 0.001 0.002 0.012 0.017 98 R 0.003 0.935 0.002 0.001 0.001 0.004 0.032 0.022 99 F 0.001 0.990 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.005 100 L 0.021 0.930 0.003 0.001 0.001 0.002 0.033 0.010 101 E 0.024 0.613 0.008 0.001 0.001 0.009 0.316 0.030 102 E 0.043 0.717 0.017 0.001 0.002 0.023 0.114 0.083 103 A 0.072 0.109 0.257 0.003 0.003 0.022 0.466 0.069 104 K 0.629 0.053 0.019 0.004 0.005 0.055 0.035 0.200 105 S 0.059 0.008 0.004 0.001 0.004 0.056 0.020 0.848 106 I 0.008 0.008 0.008 0.002 0.003 0.179 0.015 0.778 107 G 0.024 0.034 0.017 0.007 0.013 0.185 0.051 0.670 108 L 0.011 0.031 0.010 0.006 0.006 0.118 0.086 0.731 109 D 0.034 0.830 0.002 0.001 0.001 0.013 0.052 0.067 110 D 0.023 0.955 0.001 0.001 0.001 0.001 0.013 0.007 111 Q 0.003 0.954 0.001 0.001 0.001 0.002 0.026 0.013 112 T 0.002 0.963 0.001 0.001 0.001 0.001 0.026 0.007 113 A 0.001 0.996 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 114 I 0.001 0.995 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 115 E 0.006 0.903 0.003 0.001 0.001 0.002 0.072 0.014 116 L 0.012 0.918 0.004 0.001 0.001 0.003 0.050 0.012 117 L 0.051 0.192 0.038 0.002 0.002 0.009 0.685 0.021 118 I 0.127 0.275 0.024 0.003 0.003 0.058 0.237 0.272 119 K 0.036 0.065 0.026 0.005 0.006 0.092 0.068 0.703 120 R 0.069 0.054 0.090 0.011 0.015 0.108 0.076 0.578 121 S 0.476 0.018 0.007 0.004 0.005 0.079 0.060 0.351 122 R 0.059 0.009 0.004 0.002 0.003 0.068 0.016 0.839 123 N 0.024 0.009 0.007 0.002 0.006 0.101 0.024 0.827 124 H 0.071 0.014 0.036 0.022 0.025 0.154 0.070 0.609 125 E 0.025 0.009 0.073 0.047 0.089 0.105 0.052 0.599