# TARGET T0586 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-n_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 n_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0586.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 9555 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 S 0.021 0.007 0.020 0.014 0.024 0.071 0.004 0.838 2 N 0.027 0.011 0.017 0.016 0.021 0.071 0.007 0.831 3 A 0.181 0.014 0.029 0.021 0.046 0.134 0.014 0.562 4 M 0.177 0.031 0.056 0.039 0.072 0.166 0.022 0.438 5 N 0.107 0.025 0.050 0.083 0.096 0.104 0.009 0.526 6 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 7 T 0.015 0.005 0.013 0.039 0.106 0.335 0.003 0.483 8 F 0.273 0.012 0.014 0.018 0.031 0.070 0.008 0.572 9 H 0.078 0.042 0.014 0.020 0.038 0.244 0.006 0.557 10 A 0.115 0.026 0.012 0.009 0.017 0.144 0.010 0.667 11 D 0.111 0.071 0.011 0.006 0.008 0.085 0.025 0.683 12 K 0.371 0.029 0.012 0.010 0.011 0.106 0.015 0.445 13 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.996 14 I 0.021 0.053 0.014 0.032 0.107 0.212 0.003 0.557 15 Y 0.090 0.189 0.026 0.016 0.052 0.088 0.005 0.534 16 S 0.030 0.469 0.006 0.011 0.024 0.087 0.003 0.370 17 Q 0.038 0.701 0.003 0.005 0.005 0.037 0.002 0.208 18 I 0.021 0.864 0.001 0.002 0.003 0.013 0.003 0.093 19 S 0.006 0.938 0.002 0.001 0.003 0.004 0.001 0.045 20 D 0.002 0.969 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.025 21 W 0.002 0.982 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.014 22 M 0.006 0.970 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.020 23 K 0.003 0.980 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.013 24 K 0.004 0.981 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.011 25 Q 0.018 0.960 0.002 0.001 0.001 0.001 0.007 0.012 26 M 0.017 0.955 0.004 0.002 0.002 0.001 0.008 0.013 27 I 0.019 0.896 0.026 0.006 0.008 0.006 0.013 0.025 28 T 0.034 0.829 0.022 0.012 0.009 0.007 0.023 0.063 29 G 0.407 0.241 0.039 0.022 0.009 0.008 0.151 0.123 30 E 0.266 0.062 0.194 0.025 0.017 0.050 0.045 0.342 31 W 0.033 0.035 0.205 0.070 0.076 0.052 0.014 0.516 32 K 0.034 0.021 0.077 0.091 0.139 0.166 0.008 0.465 33 G 0.002 0.002 0.006 0.004 0.007 0.012 0.001 0.965 34 E 0.052 0.019 0.039 0.017 0.029 0.128 0.016 0.700 35 D 0.558 0.007 0.017 0.010 0.010 0.091 0.028 0.279 36 K 0.118 0.010 0.038 0.011 0.017 0.100 0.015 0.691 37 L 0.202 0.009 0.042 0.054 0.082 0.210 0.009 0.392 38 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.997 39 S 0.005 0.006 0.006 0.013 0.053 0.273 0.001 0.643 40 V 0.069 0.026 0.011 0.005 0.030 0.081 0.004 0.775 41 R 0.033 0.096 0.003 0.004 0.010 0.199 0.003 0.653 42 E 0.056 0.228 0.002 0.002 0.004 0.433 0.004 0.272 43 M 0.034 0.871 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.086 44 G 0.007 0.923 0.001 0.001 0.004 0.005 0.002 0.056 45 V 0.011 0.929 0.001 0.002 0.003 0.003 0.005 0.046 46 K 0.029 0.923 0.002 0.002 0.003 0.002 0.008 0.030 47 L 0.020 0.928 0.006 0.009 0.004 0.002 0.011 0.020 48 A 0.203 0.408 0.052 0.028 0.020 0.017 0.067 0.205 49 V 0.075 0.134 0.238 0.026 0.022 0.045 0.018 0.442 50 N 0.034 0.170 0.070 0.034 0.034 0.102 0.007 0.549 51 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 52 N 0.008 0.018 0.008 0.003 0.005 0.725 0.002 0.230 53 T 0.153 0.052 0.004 0.001 0.002 0.450 0.006 0.332 54 V 0.011 0.895 0.004 0.001 0.002 0.027 0.001 0.059 55 S 0.006 0.839 0.002 0.001 0.002 0.071 0.002 0.078 56 R 0.023 0.869 0.001 0.001 0.001 0.038 0.002 0.066 57 A 0.004 0.988 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 58 Y 0.002 0.987 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 59 Q 0.001 0.996 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 60 E 0.001 0.994 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 61 L 0.021 0.952 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.018 62 E 0.014 0.953 0.002 0.001 0.002 0.002 0.006 0.020 63 R 0.026 0.913 0.003 0.003 0.002 0.003 0.016 0.035 64 A 0.052 0.761 0.033 0.008 0.004 0.005 0.072 0.067 65 G 0.329 0.224 0.034 0.038 0.013 0.013 0.175 0.175 66 Y 0.042 0.034 0.516 0.062 0.057 0.044 0.010 0.236 67 I 0.014 0.017 0.140 0.326 0.331 0.047 0.004 0.120 68 Y 0.020 0.014 0.230 0.232 0.270 0.030 0.003 0.201 69 A 0.005 0.017 0.160 0.342 0.276 0.026 0.003 0.170 70 K 0.010 0.015 0.200 0.233 0.249 0.044 0.005 0.245 71 R 0.005 0.006 0.030 0.084 0.138 0.047 0.005 0.686 72 G 0.031 0.010 0.042 0.079 0.145 0.131 0.024 0.538 73 M 0.101 0.004 0.029 0.026 0.032 0.150 0.020 0.637 74 G 0.072 0.013 0.098 0.162 0.104 0.104 0.030 0.418 75 S 0.154 0.003 0.078 0.084 0.169 0.107 0.007 0.397 76 F 0.012 0.003 0.148 0.257 0.233 0.037 0.002 0.308 77 V 0.021 0.004 0.078 0.166 0.417 0.063 0.002 0.249 78 T 0.014 0.008 0.156 0.249 0.346 0.063 0.003 0.160 79 S 0.016 0.008 0.036 0.069 0.161 0.055 0.003 0.653 80 D 0.019 0.006 0.022 0.021 0.075 0.130 0.004 0.722 81 K 0.047 0.009 0.009 0.008 0.021 0.273 0.006 0.627 82 A 0.090 0.049 0.011 0.008 0.016 0.425 0.011 0.389 83 L 0.130 0.133 0.010 0.007 0.017 0.299 0.011 0.393 84 F 0.107 0.323 0.013 0.006 0.015 0.077 0.008 0.451 85 D 0.088 0.382 0.011 0.007 0.011 0.093 0.016 0.392 86 Q 0.185 0.425 0.017 0.008 0.013 0.079 0.018 0.254 87 L 0.097 0.483 0.012 0.007 0.013 0.056 0.012 0.320 88 K 0.063 0.431 0.024 0.011 0.028 0.091 0.012 0.340 89 K 0.033 0.462 0.012 0.004 0.010 0.056 0.006 0.418 90 E 0.038 0.579 0.005 0.002 0.005 0.112 0.007 0.252 91 L 0.043 0.865 0.004 0.001 0.003 0.014 0.004 0.065 92 A 0.021 0.914 0.003 0.001 0.002 0.007 0.004 0.048 93 D 0.039 0.865 0.005 0.002 0.002 0.009 0.010 0.067 94 A 0.085 0.831 0.008 0.002 0.002 0.008 0.011 0.053 95 I 0.049 0.878 0.008 0.002 0.004 0.013 0.008 0.038 96 T 0.045 0.819 0.016 0.004 0.007 0.020 0.013 0.075 97 E 0.047 0.786 0.018 0.003 0.005 0.021 0.011 0.109 98 R 0.068 0.706 0.017 0.004 0.004 0.043 0.019 0.139 99 F 0.081 0.710 0.016 0.004 0.005 0.039 0.014 0.130 100 L 0.041 0.748 0.018 0.005 0.009 0.024 0.008 0.147 101 E 0.051 0.558 0.014 0.005 0.011 0.064 0.013 0.285 102 E 0.075 0.626 0.010 0.004 0.006 0.052 0.015 0.212 103 A 0.086 0.739 0.007 0.003 0.005 0.020 0.014 0.126 104 K 0.121 0.611 0.019 0.007 0.008 0.029 0.033 0.172 105 S 0.174 0.429 0.030 0.011 0.012 0.046 0.036 0.263 106 I 0.265 0.270 0.047 0.013 0.021 0.048 0.028 0.308 107 G 0.206 0.180 0.040 0.015 0.022 0.099 0.031 0.408 108 L 0.208 0.111 0.100 0.016 0.027 0.103 0.019 0.416 109 D 0.051 0.083 0.025 0.010 0.017 0.120 0.008 0.686 110 D 0.039 0.043 0.015 0.005 0.011 0.059 0.006 0.823 111 Q 0.066 0.093 0.021 0.006 0.013 0.277 0.008 0.516 112 T 0.078 0.131 0.009 0.005 0.007 0.429 0.010 0.330 113 A 0.085 0.537 0.010 0.005 0.010 0.098 0.005 0.250 114 I 0.029 0.775 0.007 0.004 0.011 0.040 0.003 0.130 115 E 0.024 0.817 0.007 0.004 0.007 0.044 0.006 0.091 116 L 0.030 0.916 0.003 0.002 0.003 0.008 0.005 0.033 117 L 0.058 0.889 0.004 0.002 0.004 0.006 0.008 0.029 118 I 0.036 0.892 0.010 0.004 0.006 0.006 0.008 0.037 119 K 0.043 0.818 0.011 0.005 0.008 0.014 0.015 0.085 120 R 0.125 0.671 0.017 0.005 0.007 0.021 0.032 0.123 121 S 0.161 0.621 0.018 0.006 0.006 0.024 0.034 0.131 122 R 0.224 0.312 0.051 0.009 0.010 0.069 0.053 0.272 123 N 0.174 0.196 0.041 0.009 0.013 0.120 0.033 0.413 124 H 0.133 0.122 0.035 0.008 0.016 0.071 0.018 0.597 125 E 0.051 0.099 0.022 0.008 0.014 0.159 0.011 0.636