# TARGET T0586 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t04-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-n_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 n_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0586.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1767 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 S 0.036 0.012 0.018 0.021 0.033 0.040 0.008 0.832 2 N 0.036 0.009 0.022 0.024 0.036 0.061 0.007 0.806 3 A 0.125 0.009 0.038 0.040 0.055 0.181 0.014 0.539 4 M 0.147 0.019 0.090 0.086 0.117 0.114 0.013 0.414 5 N 0.068 0.009 0.072 0.098 0.111 0.144 0.006 0.493 6 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.995 7 T 0.018 0.004 0.035 0.071 0.152 0.353 0.004 0.363 8 F 0.182 0.004 0.011 0.022 0.025 0.116 0.006 0.635 9 H 0.067 0.021 0.017 0.024 0.031 0.453 0.011 0.376 10 A 0.147 0.014 0.012 0.010 0.012 0.247 0.021 0.537 11 D 0.146 0.033 0.024 0.008 0.018 0.095 0.048 0.627 12 K 0.264 0.018 0.040 0.029 0.029 0.188 0.016 0.416 13 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 14 I 0.009 0.013 0.011 0.048 0.166 0.258 0.001 0.494 15 Y 0.102 0.150 0.025 0.017 0.039 0.163 0.002 0.504 16 S 0.030 0.522 0.011 0.006 0.013 0.079 0.001 0.339 17 Q 0.022 0.819 0.007 0.001 0.003 0.049 0.001 0.097 18 I 0.023 0.950 0.002 0.001 0.002 0.004 0.001 0.017 19 S 0.015 0.972 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.009 20 D 0.005 0.976 0.001 0.001 0.001 0.004 0.002 0.013 21 W 0.012 0.934 0.001 0.001 0.001 0.004 0.007 0.043 22 M 0.008 0.973 0.004 0.001 0.001 0.001 0.002 0.013 23 K 0.015 0.930 0.006 0.001 0.001 0.006 0.005 0.038 24 K 0.005 0.984 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.007 25 Q 0.016 0.960 0.003 0.001 0.001 0.001 0.008 0.013 26 M 0.021 0.951 0.011 0.001 0.001 0.001 0.006 0.010 27 I 0.013 0.889 0.053 0.008 0.006 0.003 0.007 0.022 28 T 0.062 0.747 0.027 0.016 0.014 0.007 0.042 0.085 29 G 0.351 0.251 0.053 0.013 0.013 0.010 0.133 0.176 30 E 0.312 0.070 0.243 0.040 0.022 0.072 0.039 0.203 31 W 0.012 0.019 0.132 0.071 0.072 0.033 0.005 0.655 32 K 0.030 0.017 0.098 0.142 0.216 0.180 0.006 0.312 33 G 0.006 0.001 0.005 0.004 0.007 0.021 0.001 0.956 34 E 0.037 0.008 0.028 0.019 0.040 0.216 0.014 0.638 35 D 0.422 0.006 0.011 0.012 0.010 0.146 0.017 0.376 36 K 0.077 0.029 0.027 0.013 0.028 0.112 0.011 0.702 37 L 0.118 0.033 0.049 0.036 0.094 0.167 0.008 0.495 38 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.994 39 S 0.012 0.014 0.005 0.009 0.022 0.165 0.001 0.772 40 V 0.083 0.118 0.021 0.007 0.019 0.160 0.002 0.590 41 R 0.035 0.390 0.008 0.009 0.016 0.095 0.003 0.444 42 E 0.018 0.630 0.004 0.002 0.004 0.124 0.002 0.215 43 M 0.016 0.939 0.002 0.001 0.001 0.012 0.002 0.026 44 G 0.010 0.979 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 45 V 0.009 0.970 0.006 0.001 0.002 0.001 0.003 0.007 46 K 0.047 0.885 0.004 0.003 0.003 0.002 0.022 0.033 47 L 0.114 0.733 0.017 0.007 0.007 0.003 0.080 0.038 48 A 0.258 0.263 0.122 0.028 0.023 0.015 0.121 0.170 49 V 0.038 0.078 0.558 0.037 0.020 0.024 0.009 0.237 50 N 0.025 0.061 0.223 0.092 0.075 0.141 0.007 0.375 51 P 0.006 0.010 0.015 0.002 0.005 0.021 0.001 0.940 52 N 0.008 0.032 0.024 0.003 0.007 0.415 0.002 0.508 53 T 0.078 0.036 0.002 0.001 0.001 0.620 0.004 0.258 54 V 0.041 0.786 0.008 0.001 0.003 0.047 0.002 0.112 55 S 0.016 0.792 0.003 0.001 0.001 0.068 0.002 0.118 56 R 0.010 0.944 0.001 0.001 0.001 0.012 0.001 0.032 57 A 0.004 0.987 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 58 Y 0.002 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 59 Q 0.006 0.977 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.012 60 E 0.005 0.989 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 61 L 0.015 0.973 0.002 0.001 0.001 0.001 0.006 0.005 62 E 0.010 0.979 0.003 0.001 0.001 0.001 0.004 0.004 63 R 0.019 0.946 0.005 0.001 0.001 0.002 0.010 0.017 64 A 0.045 0.823 0.004 0.001 0.001 0.004 0.085 0.037 65 G 0.409 0.293 0.034 0.010 0.005 0.005 0.155 0.089 66 Y 0.061 0.233 0.405 0.085 0.023 0.038 0.018 0.137 67 I 0.013 0.095 0.060 0.482 0.217 0.017 0.004 0.113 68 Y 0.023 0.129 0.049 0.292 0.390 0.014 0.003 0.100 69 A 0.018 0.119 0.037 0.217 0.281 0.015 0.004 0.309 70 K 0.019 0.070 0.043 0.234 0.435 0.021 0.007 0.173 71 R 0.054 0.042 0.030 0.134 0.231 0.055 0.020 0.434 72 G 0.121 0.019 0.045 0.152 0.255 0.046 0.036 0.325 73 M 0.073 0.009 0.081 0.083 0.124 0.087 0.014 0.529 74 G 0.017 0.004 0.067 0.170 0.263 0.044 0.004 0.433 75 S 0.031 0.003 0.098 0.148 0.271 0.081 0.003 0.365 76 F 0.010 0.002 0.080 0.281 0.332 0.022 0.001 0.273 77 V 0.008 0.004 0.152 0.233 0.406 0.053 0.001 0.144 78 T 0.009 0.004 0.086 0.319 0.361 0.038 0.001 0.182 79 S 0.005 0.004 0.045 0.052 0.168 0.064 0.002 0.660 80 D 0.016 0.004 0.012 0.017 0.049 0.173 0.004 0.725 81 K 0.075 0.010 0.009 0.009 0.020 0.170 0.013 0.695 82 A 0.052 0.024 0.004 0.003 0.006 0.551 0.008 0.351 83 L 0.170 0.114 0.010 0.007 0.016 0.319 0.016 0.348 84 F 0.139 0.386 0.033 0.008 0.020 0.094 0.009 0.312 85 D 0.037 0.433 0.021 0.005 0.009 0.050 0.006 0.440 86 Q 0.062 0.468 0.011 0.003 0.007 0.054 0.010 0.387 87 L 0.068 0.606 0.007 0.002 0.005 0.118 0.012 0.183 88 K 0.105 0.685 0.007 0.002 0.004 0.052 0.018 0.127 89 K 0.073 0.749 0.021 0.002 0.002 0.014 0.010 0.129 90 E 0.037 0.733 0.020 0.002 0.002 0.029 0.009 0.169 91 L 0.069 0.669 0.009 0.002 0.003 0.038 0.012 0.199 92 A 0.054 0.785 0.011 0.001 0.003 0.025 0.008 0.113 93 D 0.045 0.752 0.013 0.001 0.002 0.025 0.009 0.153 94 A 0.046 0.684 0.009 0.001 0.001 0.034 0.008 0.218 95 I 0.046 0.796 0.007 0.001 0.001 0.048 0.006 0.096 96 T 0.043 0.880 0.006 0.001 0.001 0.013 0.005 0.052 97 E 0.040 0.894 0.006 0.001 0.001 0.007 0.005 0.047 98 R 0.024 0.858 0.003 0.001 0.001 0.017 0.005 0.092 99 F 0.030 0.877 0.002 0.001 0.001 0.018 0.007 0.066 100 L 0.020 0.933 0.005 0.001 0.001 0.003 0.004 0.035 101 E 0.012 0.911 0.011 0.001 0.001 0.012 0.004 0.049 102 E 0.023 0.908 0.003 0.001 0.001 0.009 0.008 0.049 103 A 0.051 0.909 0.011 0.001 0.001 0.001 0.007 0.021 104 K 0.023 0.913 0.024 0.002 0.002 0.003 0.009 0.024 105 S 0.116 0.656 0.022 0.006 0.005 0.016 0.044 0.135 106 I 0.219 0.507 0.054 0.007 0.006 0.015 0.081 0.110 107 G 0.391 0.099 0.085 0.016 0.014 0.028 0.113 0.255 108 L 0.083 0.041 0.566 0.028 0.015 0.056 0.007 0.204 109 D 0.011 0.017 0.056 0.022 0.014 0.239 0.003 0.638 110 D 0.003 0.003 0.004 0.001 0.002 0.019 0.001 0.967 111 Q 0.004 0.008 0.003 0.001 0.001 0.689 0.001 0.294 112 T 0.018 0.007 0.001 0.001 0.001 0.932 0.001 0.041 113 A 0.153 0.727 0.005 0.001 0.001 0.021 0.005 0.088 114 I 0.010 0.940 0.013 0.001 0.002 0.006 0.001 0.027 115 E 0.009 0.900 0.003 0.001 0.001 0.013 0.002 0.071 116 L 0.016 0.955 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.020 117 L 0.034 0.931 0.004 0.001 0.002 0.002 0.010 0.018 118 I 0.030 0.910 0.014 0.003 0.002 0.004 0.012 0.024 119 K 0.082 0.756 0.013 0.004 0.005 0.008 0.034 0.097 120 R 0.194 0.541 0.019 0.004 0.005 0.016 0.064 0.156 121 S 0.173 0.193 0.025 0.008 0.007 0.041 0.062 0.491 122 R 0.087 0.119 0.058 0.017 0.015 0.085 0.027 0.593 123 N 0.135 0.079 0.032 0.017 0.016 0.227 0.027 0.467 124 H 0.217 0.069 0.023 0.014 0.015 0.087 0.021 0.553 125 E 0.074 0.051 0.029 0.011 0.015 0.123 0.011 0.688