This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 1 NATAA S A 2 2 NATAA N A 3 3 NATAA A A 4 4 NATAA M A 5 5 NATAA N A 6 6 NATRO P A 7 7 NATAA T A 8 8 NATAA F A 9 9 NATAA H A 10 10 NATAA A A 11 11 NATAA D A 12 12 NATAA K A 13 13 NATRO P A 14 14 NATAA I A 15 15 NATAA Y A 16 16 NATAA S A 17 17 NATAA Q A 18 18 NATAA I A 19 19 NATAA S A 20 20 NATAA D A 21 21 NATAA W A 22 22 NATAA M A 23 23 NATAA K A 24 24 NATAA K A 25 25 NATAA Q A 26 26 NATAA M A 27 27 NATAA I A 28 28 NATAA T A 29 29 NATAA G A 30 30 NATAA E A 31 31 NATAA W A 32 32 NATAA K A 33 33 NATAA G A 34 34 NATAA E A 35 35 NATAA D A 36 36 NATAA K A 37 37 NATAA L A 38 38 NATRO P A 39 39 NATAA S A 40 40 NATAA V A 41 41 NATAA R A 42 42 NATAA E A 43 43 NATAA M A 44 44 NATAA G A 45 45 NATAA V A 46 46 NATAA K A 47 47 NATAA L A 48 48 NATAA A A 49 49 NATAA V A 50 50 NATAA N A 51 51 NATRO P A 52 52 NATAA N A 53 53 NATAA T A 54 54 NATAA V A 55 55 NATAA S A 56 56 NATAA R A 57 57 NATAA A A 58 58 NATAA Y A 59 59 NATAA Q A 60 60 NATAA E A 61 61 NATAA L A 62 62 NATAA E A 63 63 NATAA R A 64 64 NATAA A A 65 65 NATAA G A 66 66 NATAA Y A 67 67 NATAA I A 68 68 NATAA Y A 69 69 NATAA A A 70 70 NATAA K A 71 71 NATAA R A 72 72 NATAA G A 73 73 NATAA M A 74 74 NATAA G A 75 75 NATAA S A 76 76 NATAA F A 77 77 NATAA V A 78 78 NATAA T A 79 79 NATAA S A 80 80 NATAA D A 81 81 NATAA K A 82 82 NATAA A A 83 83 NATAA L A 84 84 NATAA F A 85 85 NATAA D A 86 86 NATAA Q A 87 87 NATAA L A 88 88 NATAA K A 89 89 NATAA K A 90 90 NATAA E A 91 91 NATAA L A 92 92 NATAA A A 93 93 NATAA D A 94 94 NATAA A A 95 95 NATAA I A 96 96 NATAA T A 97 97 NATAA E A 98 98 NATAA R A 99 99 NATAA F A 100 100 NATAA L A 101 101 NATAA E A 102 102 NATAA E A 103 103 NATAA A A 104 104 NATAA K A 105 105 NATAA S A 106 106 NATAA I A 107 107 NATAA G A 108 108 NATAA L A 109 109 NATAA D A 110 110 NATAA D A 111 111 NATAA Q A 112 112 NATAA T A 113 113 NATAA A A 114 114 NATAA I A 115 115 NATAA E A 116 116 NATAA L A 117 117 NATAA L A 118 118 NATAA I A 119 119 NATAA K A 120 120 NATAA R A 121 121 NATAA S A 122 122 NATAA R A 123 123 NATAA N A 124 124 NATAA H A 125 125 NATAA E