# TARGET T0585 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0585.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1553 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 S 0.004 0.003 0.005 0.007 0.009 0.010 0.963 2 N 0.024 0.028 0.055 0.029 0.016 0.048 0.799 3 A 0.023 0.006 0.162 0.029 0.132 0.463 0.185 4 S 0.036 0.005 0.112 0.012 0.191 0.391 0.254 5 F 0.138 0.010 0.014 0.003 0.114 0.017 0.705 6 R 0.558 0.009 0.001 0.001 0.045 0.004 0.384 7 V 0.946 0.004 0.001 0.001 0.016 0.001 0.032 8 V 0.979 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.018 9 L 0.951 0.008 0.001 0.001 0.003 0.001 0.035 10 D 0.579 0.006 0.002 0.001 0.020 0.003 0.388 11 P 0.101 0.002 0.018 0.002 0.172 0.180 0.526 12 G 0.054 0.021 0.020 0.002 0.345 0.187 0.371 13 H 0.038 0.017 0.046 0.004 0.394 0.113 0.387 14 G 0.036 0.020 0.033 0.006 0.424 0.135 0.346 15 G 0.117 0.064 0.060 0.012 0.222 0.107 0.418 16 I 0.114 0.079 0.086 0.020 0.207 0.126 0.367 17 D 0.100 0.034 0.101 0.025 0.185 0.155 0.399 18 G 0.035 0.009 0.120 0.021 0.070 0.673 0.072 19 G 0.044 0.009 0.065 0.019 0.094 0.684 0.085 20 A 0.309 0.036 0.039 0.021 0.125 0.135 0.334 21 R 0.496 0.108 0.011 0.018 0.074 0.053 0.239 22 G 0.303 0.045 0.014 0.012 0.108 0.079 0.438 23 V 0.086 0.011 0.036 0.008 0.165 0.525 0.169 24 T 0.009 0.003 0.022 0.004 0.095 0.841 0.027 25 G 0.039 0.004 0.032 0.017 0.277 0.431 0.200 26 I 0.182 0.029 0.010 0.042 0.141 0.054 0.542 27 L 0.299 0.074 0.006 0.092 0.079 0.026 0.424 28 E 0.034 0.004 0.031 0.742 0.026 0.035 0.128 29 K 0.009 0.001 0.027 0.833 0.041 0.030 0.059 30 D 0.006 0.001 0.015 0.915 0.017 0.017 0.029 31 V 0.003 0.001 0.004 0.959 0.005 0.006 0.022 32 T 0.001 0.001 0.001 0.989 0.002 0.002 0.004 33 L 0.001 0.001 0.001 0.993 0.002 0.001 0.002 34 A 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 35 F 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 36 A 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 37 R 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.003 0.001 38 A 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.005 0.001 39 L 0.001 0.001 0.001 0.992 0.001 0.006 0.001 40 R 0.001 0.001 0.001 0.990 0.001 0.007 0.001 41 D 0.001 0.001 0.002 0.977 0.002 0.017 0.002 42 E 0.001 0.001 0.003 0.966 0.003 0.021 0.006 43 L 0.001 0.001 0.010 0.936 0.007 0.032 0.014 44 Q 0.003 0.001 0.030 0.840 0.010 0.106 0.011 45 K 0.003 0.002 0.033 0.704 0.021 0.216 0.021 46 G 0.007 0.003 0.041 0.228 0.211 0.188 0.323 47 S 0.001 0.002 0.016 0.014 0.086 0.850 0.031 48 H 0.009 0.001 0.012 0.001 0.097 0.779 0.100 49 T 0.250 0.004 0.001 0.001 0.078 0.004 0.663 50 I 0.840 0.003 0.001 0.001 0.036 0.001 0.119 51 V 0.976 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.019 52 A 0.986 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 53 L 0.968 0.002 0.001 0.001 0.003 0.001 0.026 54 T 0.732 0.008 0.001 0.001 0.017 0.002 0.240 55 R 0.273 0.017 0.006 0.002 0.154 0.030 0.519 56 D 0.045 0.008 0.039 0.006 0.324 0.256 0.322 57 S 0.009 0.009 0.082 0.010 0.364 0.338 0.187 58 D 0.011 0.013 0.089 0.012 0.263 0.210 0.402 59 I 0.030 0.025 0.067 0.017 0.362 0.207 0.293 60 F 0.043 0.034 0.026 0.020 0.304 0.133 0.439 61 L 0.013 0.023 0.006 0.012 0.309 0.019 0.619 62 R 0.010 0.034 0.002 0.019 0.063 0.008 0.864 63 L 0.001 0.001 0.034 0.902 0.012 0.033 0.018 64 S 0.001 0.001 0.023 0.935 0.006 0.030 0.006 65 E 0.001 0.001 0.019 0.956 0.004 0.014 0.005 66 R 0.001 0.001 0.003 0.982 0.003 0.007 0.004 67 V 0.001 0.001 0.002 0.978 0.003 0.009 0.006 68 K 0.002 0.001 0.004 0.963 0.003 0.022 0.006 69 K 0.001 0.001 0.004 0.964 0.005 0.018 0.008 70 A 0.001 0.001 0.009 0.956 0.005 0.022 0.008 71 Q 0.001 0.001 0.023 0.876 0.005 0.087 0.007 72 E 0.001 0.001 0.055 0.772 0.015 0.127 0.029 73 F 0.001 0.001 0.037 0.397 0.060 0.488 0.016 74 D 0.002 0.003 0.010 0.028 0.027 0.886 0.045 75 A 0.005 0.001 0.001 0.001 0.050 0.003 0.941 76 D 0.078 0.001 0.001 0.001 0.772 0.003 0.147 77 L 0.986 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 78 F 0.998 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 79 I 0.998 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 80 S 0.984 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.014 81 I 0.833 0.003 0.004 0.001 0.027 0.002 0.131 82 H 0.531 0.005 0.011 0.005 0.093 0.006 0.350 83 A 0.312 0.060 0.030 0.009 0.082 0.020 0.486 84 D 0.337 0.052 0.040 0.015 0.132 0.069 0.355 85 T 0.217 0.019 0.067 0.018 0.187 0.205 0.288 86 I 0.066 0.017 0.077 0.027 0.265 0.314 0.234 87 D 0.051 0.013 0.057 0.021 0.347 0.242 0.268 88 V 0.055 0.012 0.056 0.013 0.276 0.168 0.420 89 H 0.090 0.018 0.101 0.028 0.228 0.358 0.178 90 S 0.121 0.030 0.104 0.018 0.165 0.289 0.273 91 L 0.176 0.031 0.085 0.009 0.204 0.188 0.307 92 R 0.181 0.016 0.038 0.007 0.200 0.385 0.174 93 G 0.368 0.006 0.019 0.003 0.207 0.181 0.217 94 A 0.836 0.006 0.001 0.001 0.016 0.004 0.136 95 T 0.971 0.004 0.001 0.001 0.003 0.001 0.021 96 V 0.979 0.002 0.001 0.001 0.002 0.001 0.016 97 Y 0.961 0.003 0.001 0.001 0.003 0.001 0.031 98 T 0.875 0.007 0.001 0.001 0.013 0.003 0.099 99 I 0.589 0.016 0.004 0.004 0.072 0.020 0.296 100 S 0.169 0.014 0.011 0.010 0.256 0.093 0.446 101 D 0.031 0.009 0.054 0.043 0.363 0.259 0.241 102 E 0.012 0.011 0.086 0.105 0.323 0.249 0.213 103 A 0.009 0.009 0.103 0.201 0.222 0.206 0.252 104 S 0.006 0.006 0.061 0.334 0.132 0.151 0.310 105 D 0.004 0.004 0.041 0.569 0.089 0.115 0.178 106 A 0.003 0.003 0.021 0.777 0.052 0.061 0.083 107 I 0.002 0.002 0.010 0.862 0.028 0.034 0.061 108 A 0.002 0.001 0.004 0.919 0.016 0.022 0.034 109 K 0.002 0.001 0.002 0.944 0.011 0.018 0.022 110 S 0.002 0.001 0.001 0.955 0.009 0.014 0.018 111 L 0.001 0.001 0.001 0.957 0.009 0.014 0.018 112 A 0.001 0.001 0.002 0.946 0.009 0.024 0.017 113 E 0.001 0.001 0.003 0.919 0.009 0.049 0.017 114 S 0.001 0.001 0.004 0.861 0.014 0.086 0.032 115 E 0.001 0.002 0.006 0.790 0.029 0.113 0.060 116 N 0.003 0.003 0.012 0.670 0.062 0.115 0.135 117 K 0.005 0.006 0.018 0.670 0.063 0.091 0.148 118 V 0.007 0.004 0.020 0.667 0.070 0.079 0.152 119 D 0.011 0.005 0.034 0.660 0.064 0.116 0.110 120 L 0.012 0.006 0.040 0.668 0.065 0.095 0.113 121 L 0.015 0.008 0.041 0.673 0.052 0.104 0.107 122 D 0.015 0.004 0.032 0.455 0.053 0.363 0.078 123 G 0.019 0.008 0.034 0.244 0.085 0.452 0.158 124 L 0.035 0.029 0.032 0.142 0.176 0.067 0.519 125 P 0.063 0.035 0.067 0.162 0.123 0.139 0.411 126 K 0.043 0.017 0.099 0.169 0.134 0.297 0.241 127 E 0.027 0.015 0.096 0.162 0.184 0.252 0.265 128 E 0.033 0.011 0.064 0.172 0.217 0.232 0.271 129 S 0.025 0.010 0.042 0.242 0.205 0.191 0.285 130 L 0.015 0.011 0.019 0.298 0.188 0.076 0.394 131 E 0.006 0.004 0.023 0.745 0.065 0.061 0.096 132 L 0.005 0.004 0.022 0.860 0.020 0.049 0.040 133 T 0.004 0.002 0.021 0.911 0.011 0.027 0.023 134 D 0.006 0.001 0.014 0.930 0.010 0.017 0.020 135 I 0.010 0.001 0.012 0.930 0.010 0.018 0.019 136 L 0.009 0.002 0.013 0.922 0.010 0.026 0.019 137 L 0.008 0.003 0.010 0.905 0.013 0.038 0.023 138 D 0.009 0.001 0.014 0.859 0.016 0.069 0.031 139 L 0.010 0.002 0.019 0.806 0.028 0.082 0.054 140 T 0.011 0.004 0.022 0.775 0.041 0.077 0.069 141 R 0.015 0.008 0.027 0.694 0.060 0.104 0.094 142 R 0.014 0.006 0.029 0.606 0.076 0.132 0.136 143 E 0.014 0.006 0.028 0.588 0.080 0.164 0.120 144 T 0.009 0.004 0.027 0.533 0.095 0.200 0.131 145 H 0.007 0.005 0.023 0.493 0.107 0.181 0.184 146 A 0.006 0.003 0.019 0.631 0.096 0.066 0.179 147 F 0.005 0.004 0.028 0.742 0.047 0.093 0.080 148 S 0.003 0.002 0.030 0.794 0.032 0.093 0.046 149 I 0.003 0.001 0.017 0.882 0.021 0.037 0.039 150 N 0.002 0.001 0.008 0.945 0.012 0.015 0.016 151 F 0.002 0.001 0.007 0.954 0.006 0.017 0.013 152 A 0.001 0.001 0.005 0.961 0.005 0.018 0.010 153 N 0.001 0.001 0.003 0.979 0.003 0.009 0.005 154 N 0.001 0.001 0.002 0.980 0.002 0.011 0.004 155 V 0.001 0.001 0.002 0.982 0.001 0.012 0.003 156 V 0.001 0.001 0.002 0.981 0.002 0.010 0.003 157 S 0.001 0.001 0.002 0.975 0.003 0.016 0.003 158 N 0.001 0.001 0.004 0.957 0.004 0.030 0.005 159 L 0.001 0.001 0.005 0.938 0.005 0.043 0.008 160 S 0.004 0.003 0.007 0.905 0.017 0.041 0.025 161 K 0.006 0.002 0.031 0.844 0.022 0.063 0.032 162 S 0.007 0.001 0.031 0.795 0.029 0.112 0.024 163 H 0.007 0.003 0.031 0.738 0.036 0.144 0.042 164 I 0.020 0.011 0.026 0.373 0.135 0.291 0.144 165 N 0.031 0.015 0.026 0.096 0.160 0.283 0.390 166 L 0.059 0.025 0.042 0.089 0.197 0.140 0.448 167 I 0.078 0.016 0.057 0.080 0.190 0.217 0.362 168 N 0.052 0.015 0.084 0.088 0.224 0.275 0.263 169 N 0.085 0.013 0.069 0.082 0.285 0.176 0.292 170 P 0.141 0.014 0.059 0.080 0.181 0.142 0.383 171 H 0.292 0.037 0.046 0.086 0.116 0.067 0.356 172 R 0.318 0.031 0.039 0.085 0.099 0.071 0.356 173 Y 0.291 0.028 0.051 0.086 0.125 0.099 0.321 174 A 0.215 0.016 0.055 0.069 0.194 0.172 0.278 175 D 0.206 0.006 0.040 0.026 0.224 0.183 0.315 176 F 0.693 0.013 0.017 0.029 0.036 0.022 0.189 177 Q 0.913 0.008 0.005 0.013 0.008 0.006 0.047 178 V 0.928 0.005 0.007 0.018 0.006 0.005 0.032 179 L 0.888 0.008 0.008 0.021 0.013 0.009 0.052 180 K 0.647 0.023 0.016 0.033 0.067 0.031 0.183 181 A 0.239 0.009 0.031 0.026 0.158 0.117 0.419 182 P 0.101 0.015 0.021 0.019 0.268 0.208 0.368 183 D 0.055 0.010 0.009 0.007 0.454 0.178 0.286 184 V 0.062 0.008 0.001 0.009 0.597 0.014 0.308 185 P 0.117 0.013 0.003 0.021 0.159 0.013 0.674 186 S 0.767 0.011 0.003 0.021 0.035 0.007 0.155 187 V 0.937 0.004 0.003 0.019 0.012 0.002 0.023 188 L 0.956 0.003 0.003 0.015 0.002 0.001 0.021 189 I 0.939 0.002 0.005 0.015 0.004 0.005 0.030 190 E 0.886 0.005 0.008 0.016 0.017 0.008 0.061 191 I 0.579 0.007 0.036 0.032 0.067 0.039 0.240 192 G 0.358 0.021 0.047 0.037 0.233 0.096 0.207 193 Y 0.356 0.043 0.050 0.044 0.134 0.092 0.282 194 L 0.196 0.061 0.034 0.050 0.212 0.120 0.328 195 S 0.067 0.032 0.010 0.039 0.321 0.135 0.396 196 N 0.008 0.006 0.004 0.070 0.299 0.037 0.577 197 K 0.001 0.001 0.040 0.836 0.027 0.073 0.024 198 E 0.001 0.001 0.053 0.848 0.014 0.072 0.011 199 D 0.001 0.001 0.059 0.882 0.011 0.033 0.013 200 E 0.001 0.001 0.057 0.889 0.009 0.025 0.018 201 K 0.002 0.001 0.082 0.793 0.017 0.087 0.018 202 L 0.003 0.005 0.148 0.607 0.019 0.204 0.016 203 L 0.003 0.005 0.103 0.336 0.091 0.409 0.053 204 N 0.002 0.010 0.042 0.219 0.197 0.375 0.154 205 N 0.001 0.002 0.002 0.040 0.209 0.013 0.733 206 P 0.001 0.001 0.053 0.854 0.016 0.058 0.018 207 Q 0.001 0.001 0.032 0.904 0.012 0.044 0.007 208 W 0.001 0.001 0.025 0.932 0.007 0.024 0.011 209 R 0.001 0.001 0.002 0.983 0.004 0.006 0.005 210 K 0.001 0.001 0.001 0.985 0.004 0.006 0.004 211 Q 0.001 0.001 0.001 0.987 0.002 0.007 0.003 212 M 0.001 0.001 0.001 0.992 0.001 0.004 0.002 213 A 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.003 0.001 214 A 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.002 0.001 215 S 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 216 I 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 217 A 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.002 0.001 218 Y 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.005 0.001 219 S 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.006 0.001 220 I 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.002 0.001 221 R 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.002 0.001 222 Q 0.001 0.001 0.002 0.991 0.001 0.006 0.001 223 F 0.001 0.001 0.003 0.984 0.001 0.013 0.001 224 A 0.001 0.001 0.005 0.952 0.002 0.039 0.001 225 E 0.001 0.001 0.015 0.764 0.008 0.207 0.006 226 Y 0.002 0.002 0.022 0.412 0.190 0.235 0.135 227 R 0.004 0.020 0.018 0.070 0.210 0.076 0.602 228 Q 0.003 0.011 0.087 0.025 0.134 0.212 0.527 229 K 0.004 0.005 0.084 0.017 0.132 0.244 0.515 230 I 0.005 0.013 0.060 0.019 0.286 0.118 0.499 231 M 0.005 0.017 0.010 0.025 0.542 0.022 0.380 232 Q 0.008 0.014 0.008 0.032 0.117 0.063 0.758 233 P 0.006 0.026 0.004 0.015 0.005 0.059 0.885 234 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999