# TARGET T0582 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t2k-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0582.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 133.033 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.037 0.024 0.038 0.074 0.101 0.133 0.036 0.556 2 E 0.018 0.023 0.060 0.097 0.139 0.112 0.045 0.506 3 I 0.027 0.018 0.049 0.056 0.083 0.111 0.043 0.613 4 N 0.357 0.025 0.031 0.020 0.023 0.060 0.208 0.276 5 A 0.090 0.007 0.023 0.016 0.022 0.106 0.037 0.700 6 D 0.082 0.004 0.014 0.012 0.017 0.102 0.043 0.726 7 F 0.029 0.002 0.016 0.010 0.017 0.167 0.028 0.730 8 T 0.020 0.005 0.032 0.017 0.030 0.133 0.062 0.702 9 K 0.019 0.006 0.039 0.059 0.091 0.162 0.056 0.568 10 P 0.012 0.005 0.128 0.075 0.165 0.094 0.049 0.472 11 V 0.005 0.002 0.221 0.203 0.201 0.056 0.066 0.246 12 V 0.003 0.002 0.229 0.175 0.236 0.063 0.041 0.251 13 I 0.003 0.002 0.257 0.140 0.155 0.064 0.021 0.358 14 D 0.326 0.040 0.100 0.033 0.031 0.043 0.260 0.167 15 T 0.258 0.030 0.036 0.010 0.014 0.075 0.069 0.508 16 D 0.056 0.011 0.036 0.030 0.025 0.090 0.035 0.717 17 Q 0.084 0.010 0.021 0.009 0.025 0.094 0.047 0.710 18 L 0.130 0.007 0.014 0.037 0.024 0.139 0.057 0.591 19 E 0.019 0.005 0.015 0.043 0.075 0.102 0.022 0.719 20 W 0.030 0.007 0.010 0.021 0.032 0.107 0.032 0.762 21 R 0.048 0.017 0.028 0.077 0.090 0.124 0.056 0.560 22 P 0.032 0.014 0.020 0.023 0.037 0.103 0.033 0.737 23 S 0.097 0.017 0.047 0.061 0.059 0.103 0.108 0.507 24 P 0.119 0.019 0.020 0.014 0.024 0.093 0.051 0.660 25 M 0.292 0.031 0.010 0.011 0.011 0.086 0.067 0.492 26 K 0.025 0.048 0.016 0.013 0.033 0.103 0.034 0.730 27 G 0.042 0.105 0.019 0.022 0.045 0.090 0.068 0.609 28 V 0.037 0.229 0.031 0.141 0.097 0.076 0.070 0.320 29 E 0.037 0.440 0.033 0.043 0.075 0.043 0.040 0.291 30 R 0.068 0.352 0.032 0.062 0.100 0.048 0.072 0.264 31 R 0.058 0.404 0.047 0.066 0.099 0.046 0.062 0.218 32 M 0.099 0.285 0.035 0.044 0.079 0.057 0.085 0.316 33 L 0.159 0.083 0.076 0.043 0.050 0.073 0.172 0.344 34 D 0.143 0.034 0.036 0.024 0.031 0.101 0.053 0.579 35 R 0.096 0.017 0.012 0.013 0.020 0.091 0.031 0.720 36 I 0.042 0.025 0.009 0.006 0.010 0.140 0.032 0.737 37 G 0.061 0.062 0.009 0.007 0.016 0.111 0.072 0.662 38 G 0.060 0.132 0.015 0.026 0.033 0.109 0.059 0.565 39 E 0.053 0.254 0.024 0.041 0.065 0.102 0.070 0.391 40 V 0.055 0.084 0.042 0.050 0.084 0.086 0.332 0.266 41 A 0.027 0.091 0.061 0.070 0.218 0.072 0.248 0.213 42 R 0.024 0.160 0.050 0.140 0.226 0.064 0.108 0.228 43 A 0.011 0.091 0.062 0.192 0.376 0.033 0.080 0.154 44 T 0.009 0.067 0.066 0.200 0.399 0.034 0.076 0.148 45 S 0.010 0.029 0.071 0.309 0.407 0.026 0.050 0.097 46 I 0.014 0.028 0.070 0.243 0.393 0.031 0.048 0.173 47 V 0.036 0.019 0.098 0.250 0.280 0.051 0.047 0.219 48 R 0.014 0.005 0.138 0.166 0.281 0.057 0.049 0.291 49 Y 0.069 0.006 0.061 0.068 0.089 0.092 0.056 0.559 50 A 0.414 0.012 0.028 0.028 0.022 0.073 0.111 0.312 51 P 0.039 0.008 0.014 0.007 0.018 0.110 0.018 0.785 52 G 0.087 0.008 0.016 0.017 0.032 0.106 0.038 0.696 53 S 0.030 0.007 0.037 0.106 0.097 0.148 0.035 0.539 54 R 0.022 0.007 0.036 0.045 0.078 0.128 0.041 0.642 55 F 0.065 0.009 0.033 0.062 0.084 0.142 0.086 0.518 56 S 0.163 0.024 0.030 0.033 0.055 0.119 0.095 0.481 57 A 0.056 0.010 0.020 0.028 0.056 0.122 0.043 0.664 58 H 0.023 0.006 0.055 0.071 0.096 0.128 0.047 0.574 59 T 0.031 0.003 0.046 0.032 0.066 0.126 0.050 0.647 60 H 0.382 0.008 0.013 0.023 0.020 0.103 0.086 0.365 61 D 0.111 0.014 0.012 0.013 0.020 0.156 0.039 0.634 62 G 0.037 0.024 0.011 0.010 0.027 0.167 0.059 0.665 63 G 0.030 0.024 0.024 0.064 0.160 0.201 0.089 0.407 64 E 0.004 0.019 0.054 0.203 0.390 0.073 0.078 0.180 65 E 0.002 0.009 0.079 0.144 0.581 0.017 0.093 0.075 66 F 0.002 0.012 0.108 0.293 0.453 0.012 0.065 0.056 67 I 0.002 0.002 0.175 0.397 0.358 0.006 0.039 0.021 68 V 0.008 0.003 0.131 0.386 0.309 0.018 0.071 0.074 69 L 0.022 0.006 0.094 0.259 0.479 0.028 0.038 0.074 70 D 0.016 0.008 0.058 0.188 0.320 0.081 0.054 0.275 71 G 0.014 0.008 0.046 0.260 0.426 0.051 0.034 0.161 72 V 0.018 0.016 0.067 0.243 0.213 0.088 0.052 0.302 73 F 0.023 0.008 0.116 0.183 0.257 0.085 0.071 0.257 74 Q 0.031 0.004 0.064 0.058 0.162 0.088 0.088 0.506 75 D 0.525 0.007 0.016 0.045 0.031 0.050 0.101 0.226 76 E 0.102 0.004 0.014 0.018 0.041 0.082 0.027 0.712 77 H 0.062 0.002 0.006 0.012 0.022 0.098 0.017 0.783 78 G 0.011 0.001 0.027 0.068 0.132 0.109 0.017 0.633 79 D 0.017 0.002 0.014 0.083 0.073 0.111 0.034 0.667 80 Y 0.083 0.003 0.017 0.070 0.060 0.133 0.037 0.598 81 P 0.233 0.012 0.014 0.022 0.035 0.117 0.092 0.474 82 A 0.020 0.007 0.018 0.027 0.088 0.129 0.033 0.678 83 G 0.016 0.008 0.046 0.104 0.223 0.102 0.041 0.460 84 T 0.009 0.004 0.082 0.292 0.301 0.057 0.063 0.192 85 Y 0.014 0.004 0.118 0.190 0.301 0.051 0.067 0.256 86 V 0.014 0.001 0.073 0.282 0.343 0.053 0.039 0.195 87 R 0.006 0.001 0.095 0.162 0.260 0.074 0.026 0.376 88 N 0.063 0.005 0.050 0.123 0.162 0.082 0.102 0.413 89 P 0.126 0.007 0.030 0.042 0.044 0.120 0.118 0.513 90 P 0.026 0.004 0.030 0.039 0.045 0.122 0.029 0.706 91 T 0.074 0.007 0.027 0.031 0.061 0.098 0.060 0.642 92 T 0.168 0.008 0.025 0.053 0.049 0.130 0.062 0.506 93 S 0.021 0.004 0.029 0.058 0.141 0.115 0.027 0.605 94 H 0.035 0.006 0.014 0.055 0.096 0.104 0.044 0.645 95 V 0.066 0.012 0.023 0.097 0.110 0.134 0.064 0.495 96 P 0.018 0.007 0.018 0.063 0.085 0.135 0.036 0.638 97 G 0.012 0.004 0.026 0.068 0.121 0.101 0.048 0.619 98 S 0.460 0.017 0.007 0.019 0.018 0.066 0.122 0.292 99 A 0.463 0.019 0.004 0.007 0.008 0.073 0.096 0.330 100 E 0.016 0.020 0.009 0.012 0.033 0.134 0.036 0.741 101 G 0.017 0.044 0.021 0.042 0.122 0.153 0.060 0.542 102 C 0.003 0.025 0.033 0.297 0.402 0.050 0.063 0.127 103 T 0.002 0.026 0.063 0.199 0.497 0.019 0.096 0.097 104 I 0.002 0.024 0.048 0.326 0.513 0.008 0.040 0.040 105 F 0.003 0.019 0.092 0.323 0.466 0.007 0.050 0.039 106 V 0.007 0.013 0.094 0.421 0.369 0.009 0.046 0.042 107 K 0.017 0.011 0.074 0.332 0.424 0.021 0.047 0.075 108 L 0.049 0.006 0.051 0.220 0.395 0.048 0.052 0.178 109 W 0.057 0.005 0.034 0.217 0.252 0.073 0.043 0.318 110 Q 0.011 0.004 0.021 0.100 0.170 0.119 0.029 0.545 111 F 0.005 0.004 0.014 0.029 0.042 0.132 0.017 0.758 112 D 0.449 0.087 0.006 0.012 0.010 0.046 0.175 0.215 113 P 0.285 0.047 0.006 0.007 0.011 0.076 0.101 0.467 114 A 0.038 0.024 0.010 0.014 0.017 0.087 0.041 0.769 115 D 0.123 0.071 0.011 0.016 0.028 0.109 0.085 0.557 116 R 0.077 0.045 0.023 0.026 0.034 0.112 0.123 0.560 117 T 0.046 0.064 0.027 0.073 0.113 0.099 0.085 0.492 118 Q 0.034 0.057 0.052 0.064 0.105 0.090 0.103 0.493 119 F 0.028 0.119 0.089 0.105 0.110 0.084 0.075 0.390 120 S 0.081 0.202 0.065 0.057 0.086 0.077 0.068 0.365 121 K 0.050 0.122 0.083 0.060 0.079 0.084 0.042 0.481 122 N 0.140 0.306 0.037 0.029 0.045 0.058 0.069 0.315 123 M 0.174 0.173 0.033 0.015 0.021 0.085 0.075 0.424 124 E 0.083 0.071 0.048 0.021 0.022 0.106 0.069 0.580 125 A 0.267 0.060 0.014 0.012 0.021 0.074 0.051 0.502 126 E 0.195 0.017 0.007 0.011 0.016 0.094 0.057 0.603 127 L 0.015 0.008 0.007 0.017 0.028 0.123 0.021 0.781 128 G 0.018 0.011 0.010 0.017 0.034 0.099 0.033 0.778 129 A 0.020 0.004 0.047 0.081 0.061 0.106 0.067 0.615 130 P 0.235 0.006 0.017 0.016 0.026 0.077 0.059 0.565 131 V 0.671 0.003 0.005 0.005 0.004 0.041 0.044 0.227 132 E 0.011 0.003 0.022 0.005 0.017 0.099 0.019 0.825 133 G 0.020 0.005 0.022 0.016 0.052 0.091 0.047 0.747 134 I 0.015 0.009 0.046 0.331 0.109 0.093 0.037 0.361 135 S 0.022 0.023 0.081 0.113 0.171 0.074 0.059 0.458 136 T 0.025 0.020 0.032 0.142 0.261 0.068 0.059 0.392 137 S 0.025 0.024 0.075 0.175 0.292 0.063 0.044 0.304 138 L 0.025 0.020 0.049 0.158 0.203 0.077 0.060 0.407 139 L 0.043 0.019 0.057 0.067 0.105 0.096 0.081 0.532 140 H 0.140 0.026 0.032 0.047 0.054 0.100 0.103 0.499 141 E 0.104 0.021 0.009 0.014 0.026 0.088 0.039 0.699 142 D 0.148 0.029 0.009 0.028 0.022 0.100 0.112 0.553 143 E 0.033 0.047 0.012 0.019 0.045 0.133 0.065 0.647 144 R 0.048 0.031 0.015 0.048 0.072 0.119 0.133 0.533 145 E 0.011 0.046 0.051 0.200 0.315 0.061 0.090 0.225 146 T 0.010 0.049 0.043 0.149 0.361 0.040 0.082 0.266 147 V 0.012 0.029 0.057 0.377 0.253 0.033 0.066 0.173 148 T 0.026 0.019 0.052 0.254 0.473 0.026 0.046 0.104 149 H 0.040 0.012 0.029 0.200 0.307 0.046 0.053 0.314 150 R 0.028 0.008 0.049 0.212 0.285 0.068 0.033 0.316 151 K 0.006 0.002 0.052 0.157 0.288 0.069 0.033 0.394 152 L 0.069 0.002 0.021 0.041 0.061 0.080 0.032 0.693 153 E 0.696 0.004 0.004 0.011 0.005 0.024 0.111 0.144 154 P 0.014 0.004 0.003 0.001 0.005 0.089 0.009 0.874 155 G 0.072 0.004 0.008 0.008 0.017 0.088 0.030 0.772 156 A 0.011 0.004 0.048 0.205 0.175 0.093 0.039 0.426 157 N 0.012 0.013 0.050 0.060 0.078 0.101 0.056 0.630 158 L 0.022 0.029 0.037 0.109 0.111 0.109 0.047 0.536 159 T 0.187 0.206 0.047 0.027 0.037 0.079 0.112 0.304 160 S 0.116 0.074 0.049 0.034 0.056 0.101 0.127 0.443 161 E 0.076 0.020 0.057 0.034 0.043 0.097 0.102 0.572 162 A 0.385 0.012 0.013 0.010 0.014 0.092 0.075 0.398 163 A 0.101 0.013 0.007 0.008 0.012 0.139 0.039 0.680 164 G 0.013 0.016 0.011 0.011 0.026 0.180 0.031 0.712 165 G 0.022 0.020 0.031 0.050 0.119 0.185 0.104 0.468 166 I 0.006 0.016 0.078 0.180 0.248 0.112 0.097 0.261 167 E 0.002 0.009 0.155 0.114 0.505 0.022 0.081 0.110 168 V 0.003 0.012 0.211 0.198 0.363 0.020 0.088 0.104 169 L 0.001 0.001 0.337 0.296 0.305 0.006 0.031 0.023 170 V 0.005 0.001 0.214 0.334 0.268 0.022 0.051 0.103 171 L 0.048 0.003 0.161 0.250 0.387 0.035 0.041 0.075 172 D 0.015 0.003 0.059 0.125 0.257 0.083 0.070 0.388 173 G 0.014 0.004 0.034 0.191 0.403 0.065 0.037 0.252 174 D 0.016 0.005 0.060 0.340 0.210 0.075 0.058 0.237 175 V 0.017 0.003 0.116 0.177 0.220 0.083 0.046 0.338 176 T 0.048 0.003 0.046 0.096 0.221 0.089 0.054 0.443 177 V 0.209 0.010 0.021 0.059 0.059 0.098 0.069 0.476 178 N 0.078 0.015 0.009 0.017 0.049 0.093 0.053 0.686 179 D 0.098 0.015 0.010 0.033 0.060 0.095 0.039 0.650 180 E 0.025 0.009 0.031 0.171 0.196 0.088 0.033 0.447 181 V 0.024 0.003 0.030 0.136 0.131 0.099 0.062 0.515 182 L 0.077 0.004 0.024 0.079 0.129 0.115 0.036 0.535 183 G 0.332 0.014 0.012 0.029 0.033 0.093 0.083 0.404 184 R 0.027 0.010 0.016 0.029 0.092 0.119 0.036 0.670 185 N 0.017 0.008 0.034 0.069 0.144 0.117 0.042 0.570 186 A 0.012 0.005 0.061 0.313 0.318 0.064 0.045 0.183 187 W 0.017 0.005 0.075 0.141 0.289 0.064 0.065 0.344 188 L 0.009 0.003 0.064 0.276 0.335 0.058 0.038 0.218 189 R 0.005 0.003 0.110 0.160 0.288 0.070 0.032 0.332 190 L 0.047 0.009 0.065 0.103 0.124 0.104 0.062 0.487 191 P 0.318 0.045 0.034 0.034 0.028 0.087 0.125 0.329 192 E 0.100 0.041 0.014 0.010 0.019 0.105 0.048 0.664 193 G 0.109 0.039 0.014 0.014 0.022 0.103 0.080 0.620 194 E 0.135 0.055 0.019 0.046 0.049 0.134 0.094 0.468 195 A 0.049 0.036 0.025 0.046 0.076 0.122 0.111 0.535 196 L 0.042 0.046 0.023 0.076 0.128 0.119 0.071 0.494 197 S 0.065 0.035 0.036 0.108 0.191 0.100 0.116 0.350 198 A 0.028 0.015 0.027 0.117 0.222 0.078 0.048 0.465 199 T 0.049 0.003 0.031 0.157 0.169 0.095 0.097 0.399 200 A 0.010 0.001 0.033 0.057 0.112 0.109 0.046 0.633 201 G 0.268 0.004 0.015 0.028 0.035 0.088 0.102 0.460 202 A 0.261 0.008 0.006 0.013 0.011 0.106 0.036 0.558 203 R 0.006 0.003 0.018 0.028 0.100 0.129 0.020 0.695 204 G 0.005 0.003 0.033 0.092 0.431 0.085 0.047 0.304 205 A 0.001 0.001 0.025 0.182 0.752 0.006 0.008 0.026 206 K 0.001 0.002 0.043 0.406 0.414 0.007 0.075 0.052 207 I 0.001 0.001 0.037 0.573 0.353 0.003 0.022 0.012 208 W 0.002 0.001 0.064 0.353 0.489 0.009 0.035 0.048 209 M 0.020 0.001 0.034 0.513 0.338 0.016 0.020 0.059 210 K 0.025 0.002 0.036 0.283 0.447 0.034 0.024 0.149 211 T 0.043 0.004 0.031 0.124 0.206 0.110 0.029 0.455 212 G 0.016 0.004 0.075 0.215 0.227 0.086 0.030 0.346 213 H 0.036 0.016 0.056 0.108 0.128 0.104 0.061 0.493 214 L 0.141 0.014 0.044 0.045 0.069 0.138 0.056 0.493 215 R 0.081 0.012 0.040 0.095 0.164 0.092 0.042 0.474 216 F 0.032 0.005 0.020 0.044 0.094 0.092 0.042 0.671 217 V 0.014 0.003 0.027 0.068 0.061 0.140 0.022 0.665 218 R 0.050 0.010 0.033 0.043 0.071 0.096 0.040 0.657 219 T 0.301 0.011 0.007 0.013 0.020 0.069 0.075 0.505 220 P 0.031 0.005 0.018 0.034 0.036 0.116 0.020 0.741 221 E 0.013 0.003 0.027 0.022 0.060 0.092 0.031 0.753 222 V 0.021 0.003 0.037 0.043 0.035 0.141 0.049 0.670