# TARGET T0582 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0582.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 2410 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.051 0.054 0.024 0.047 0.069 0.120 0.058 0.576 2 E 0.062 0.043 0.034 0.060 0.070 0.109 0.082 0.540 3 I 0.091 0.031 0.014 0.026 0.031 0.091 0.042 0.674 4 N 0.184 0.024 0.024 0.034 0.041 0.076 0.171 0.446 5 A 0.072 0.012 0.015 0.022 0.028 0.119 0.055 0.677 6 D 0.079 0.008 0.017 0.016 0.029 0.101 0.038 0.711 7 F 0.027 0.004 0.013 0.010 0.016 0.121 0.022 0.787 8 T 0.065 0.010 0.021 0.018 0.040 0.118 0.057 0.671 9 K 0.091 0.009 0.025 0.040 0.074 0.125 0.053 0.583 10 P 0.011 0.003 0.061 0.067 0.158 0.090 0.037 0.573 11 V 0.006 0.003 0.121 0.158 0.268 0.073 0.038 0.333 12 V 0.004 0.002 0.085 0.143 0.187 0.086 0.035 0.458 13 I 0.010 0.004 0.148 0.126 0.081 0.079 0.033 0.519 14 D 0.391 0.048 0.038 0.046 0.039 0.052 0.087 0.299 15 T 0.465 0.042 0.016 0.009 0.010 0.056 0.052 0.348 16 D 0.046 0.019 0.024 0.017 0.026 0.106 0.025 0.737 17 Q 0.061 0.013 0.015 0.014 0.040 0.093 0.041 0.722 18 L 0.119 0.010 0.016 0.044 0.048 0.114 0.054 0.595 19 E 0.039 0.005 0.023 0.057 0.117 0.130 0.040 0.589 20 W 0.017 0.002 0.010 0.019 0.041 0.080 0.021 0.811 21 R 0.014 0.004 0.031 0.118 0.117 0.134 0.022 0.560 22 P 0.030 0.004 0.013 0.016 0.029 0.096 0.021 0.792 23 S 0.169 0.023 0.028 0.056 0.039 0.134 0.091 0.461 24 P 0.198 0.022 0.010 0.007 0.010 0.090 0.020 0.644 25 M 0.330 0.050 0.008 0.008 0.012 0.070 0.047 0.476 26 K 0.039 0.060 0.022 0.018 0.052 0.136 0.025 0.648 27 G 0.036 0.065 0.025 0.031 0.113 0.095 0.059 0.576 28 V 0.027 0.090 0.044 0.222 0.158 0.079 0.050 0.328 29 E 0.024 0.127 0.054 0.116 0.223 0.060 0.059 0.337 30 R 0.040 0.120 0.053 0.139 0.198 0.054 0.075 0.320 31 R 0.030 0.089 0.097 0.232 0.225 0.053 0.076 0.198 32 M 0.078 0.103 0.055 0.099 0.144 0.068 0.072 0.381 33 L 0.080 0.069 0.063 0.119 0.148 0.071 0.125 0.325 34 D 0.072 0.049 0.033 0.063 0.079 0.092 0.075 0.537 35 R 0.173 0.041 0.016 0.026 0.034 0.090 0.060 0.560 36 I 0.082 0.032 0.012 0.021 0.025 0.106 0.047 0.673 37 G 0.069 0.044 0.011 0.011 0.021 0.100 0.034 0.710 38 G 0.096 0.067 0.012 0.019 0.025 0.095 0.039 0.647 39 E 0.067 0.092 0.017 0.029 0.042 0.096 0.057 0.601 40 V 0.040 0.046 0.025 0.031 0.062 0.101 0.176 0.520 41 A 0.019 0.036 0.034 0.072 0.131 0.090 0.339 0.279 42 R 0.014 0.054 0.058 0.104 0.188 0.078 0.156 0.349 43 A 0.013 0.040 0.089 0.158 0.380 0.064 0.063 0.192 44 T 0.011 0.016 0.084 0.162 0.438 0.037 0.077 0.175 45 S 0.015 0.011 0.083 0.286 0.399 0.035 0.064 0.106 46 I 0.017 0.007 0.086 0.198 0.353 0.056 0.037 0.247 47 V 0.023 0.005 0.055 0.269 0.262 0.079 0.037 0.272 48 R 0.005 0.003 0.091 0.108 0.221 0.094 0.045 0.433 49 Y 0.050 0.003 0.047 0.066 0.103 0.092 0.044 0.595 50 A 0.340 0.007 0.035 0.117 0.063 0.070 0.120 0.250 51 P 0.028 0.003 0.016 0.014 0.032 0.105 0.016 0.785 52 G 0.031 0.003 0.030 0.028 0.085 0.094 0.034 0.696 53 S 0.017 0.004 0.047 0.094 0.098 0.138 0.047 0.554 54 R 0.024 0.005 0.039 0.047 0.079 0.118 0.045 0.641 55 F 0.086 0.006 0.036 0.072 0.067 0.103 0.077 0.554 56 S 0.076 0.009 0.030 0.055 0.064 0.111 0.097 0.557 57 A 0.041 0.005 0.021 0.029 0.054 0.100 0.042 0.708 58 H 0.034 0.004 0.031 0.069 0.096 0.143 0.060 0.562 59 T 0.106 0.004 0.019 0.025 0.040 0.105 0.047 0.653 60 H 0.327 0.006 0.010 0.012 0.023 0.101 0.031 0.490 61 D 0.059 0.004 0.015 0.010 0.025 0.148 0.024 0.715 62 G 0.023 0.008 0.029 0.027 0.132 0.146 0.039 0.597 63 G 0.007 0.005 0.053 0.107 0.316 0.102 0.066 0.345 64 E 0.001 0.002 0.079 0.327 0.425 0.024 0.025 0.116 65 E 0.001 0.001 0.093 0.370 0.454 0.009 0.018 0.054 66 F 0.001 0.001 0.136 0.361 0.412 0.010 0.017 0.062 67 I 0.001 0.001 0.254 0.323 0.385 0.006 0.014 0.017 68 V 0.017 0.005 0.213 0.298 0.327 0.027 0.044 0.070 69 L 0.052 0.011 0.140 0.236 0.222 0.069 0.081 0.189 70 D 0.030 0.008 0.050 0.078 0.225 0.083 0.036 0.490 71 G 0.029 0.008 0.136 0.098 0.306 0.081 0.073 0.270 72 V 0.014 0.006 0.081 0.199 0.236 0.091 0.042 0.330 73 F 0.006 0.002 0.133 0.234 0.241 0.066 0.043 0.275 74 Q 0.014 0.002 0.079 0.114 0.176 0.101 0.063 0.452 75 D 0.491 0.003 0.035 0.051 0.056 0.070 0.095 0.199 76 E 0.347 0.003 0.007 0.015 0.018 0.077 0.023 0.510 77 H 0.012 0.001 0.006 0.006 0.019 0.081 0.007 0.869 78 G 0.013 0.001 0.015 0.030 0.078 0.156 0.019 0.688 79 D 0.014 0.002 0.016 0.077 0.101 0.139 0.044 0.608 80 Y 0.081 0.002 0.029 0.041 0.034 0.123 0.051 0.639 81 P 0.402 0.012 0.022 0.032 0.026 0.088 0.081 0.338 82 A 0.032 0.008 0.014 0.007 0.020 0.102 0.017 0.801 83 G 0.021 0.007 0.058 0.025 0.132 0.131 0.056 0.570 84 T 0.018 0.006 0.076 0.225 0.351 0.064 0.104 0.156 85 Y 0.009 0.003 0.110 0.219 0.300 0.047 0.049 0.263 86 V 0.004 0.002 0.149 0.245 0.375 0.038 0.031 0.156 87 R 0.003 0.001 0.185 0.189 0.277 0.057 0.039 0.249 88 N 0.061 0.004 0.117 0.150 0.155 0.101 0.109 0.302 89 P 0.171 0.009 0.043 0.069 0.071 0.109 0.133 0.395 90 P 0.029 0.004 0.049 0.023 0.064 0.169 0.041 0.619 91 T 0.051 0.005 0.050 0.026 0.079 0.109 0.064 0.616 92 T 0.061 0.005 0.045 0.090 0.086 0.136 0.085 0.492 93 S 0.015 0.003 0.043 0.042 0.096 0.129 0.035 0.637 94 H 0.035 0.002 0.032 0.046 0.089 0.113 0.049 0.634 95 V 0.067 0.004 0.034 0.110 0.082 0.123 0.063 0.517 96 P 0.018 0.003 0.023 0.028 0.054 0.124 0.030 0.720 97 G 0.063 0.005 0.016 0.028 0.042 0.105 0.035 0.707 98 S 0.412 0.018 0.007 0.015 0.018 0.069 0.048 0.413 99 A 0.085 0.029 0.006 0.011 0.022 0.103 0.042 0.703 100 E 0.032 0.052 0.020 0.030 0.140 0.145 0.049 0.532 101 G 0.014 0.083 0.024 0.119 0.277 0.076 0.071 0.336 102 C 0.006 0.070 0.035 0.212 0.459 0.047 0.043 0.127 103 T 0.003 0.041 0.038 0.243 0.543 0.014 0.043 0.076 104 I 0.002 0.021 0.035 0.408 0.491 0.007 0.018 0.018 105 F 0.003 0.019 0.111 0.200 0.570 0.009 0.046 0.041 106 V 0.003 0.007 0.033 0.518 0.405 0.005 0.016 0.013 107 K 0.008 0.006 0.062 0.303 0.520 0.013 0.028 0.059 108 L 0.018 0.007 0.036 0.272 0.451 0.036 0.027 0.152 109 W 0.044 0.010 0.037 0.221 0.272 0.065 0.036 0.314 110 Q 0.018 0.009 0.016 0.045 0.060 0.109 0.019 0.722 111 F 0.029 0.017 0.013 0.022 0.021 0.098 0.026 0.773 112 D 0.371 0.080 0.009 0.012 0.009 0.073 0.077 0.370 113 P 0.308 0.066 0.008 0.005 0.006 0.074 0.118 0.416 114 A 0.153 0.062 0.009 0.006 0.010 0.079 0.086 0.595 115 D 0.131 0.051 0.007 0.008 0.019 0.091 0.047 0.645 116 R 0.031 0.026 0.013 0.019 0.039 0.125 0.055 0.691 117 T 0.031 0.043 0.024 0.026 0.061 0.142 0.049 0.623 118 Q 0.028 0.034 0.036 0.049 0.059 0.130 0.065 0.599 119 F 0.048 0.097 0.032 0.033 0.032 0.105 0.048 0.605 120 S 0.182 0.380 0.020 0.016 0.022 0.054 0.053 0.274 121 K 0.069 0.295 0.022 0.017 0.020 0.070 0.042 0.465 122 N 0.068 0.434 0.031 0.022 0.027 0.051 0.083 0.282 123 M 0.162 0.346 0.023 0.020 0.021 0.056 0.087 0.284 124 E 0.128 0.139 0.051 0.050 0.049 0.075 0.157 0.352 125 A 0.202 0.054 0.014 0.017 0.029 0.070 0.063 0.551 126 E 0.177 0.013 0.012 0.016 0.019 0.085 0.052 0.625 127 L 0.029 0.006 0.006 0.016 0.021 0.086 0.014 0.822 128 G 0.056 0.007 0.005 0.007 0.016 0.086 0.020 0.803 129 A 0.016 0.004 0.018 0.041 0.036 0.174 0.029 0.682 130 P 0.091 0.004 0.009 0.007 0.013 0.075 0.022 0.779 131 V 0.571 0.008 0.008 0.012 0.008 0.047 0.082 0.265 132 E 0.024 0.006 0.029 0.013 0.041 0.142 0.029 0.717 133 G 0.009 0.003 0.041 0.015 0.082 0.077 0.040 0.733 134 I 0.007 0.005 0.110 0.273 0.205 0.092 0.041 0.268 135 S 0.008 0.009 0.133 0.130 0.252 0.059 0.042 0.367 136 T 0.013 0.007 0.109 0.241 0.286 0.042 0.054 0.248 137 S 0.013 0.005 0.243 0.247 0.249 0.037 0.051 0.155 138 L 0.013 0.007 0.177 0.174 0.248 0.054 0.051 0.277 139 L 0.025 0.010 0.176 0.122 0.154 0.076 0.042 0.395 140 H 0.134 0.023 0.089 0.111 0.105 0.075 0.075 0.388 141 E 0.072 0.034 0.015 0.015 0.031 0.096 0.029 0.707 142 D 0.037 0.023 0.022 0.014 0.026 0.109 0.143 0.625 143 E 0.091 0.107 0.015 0.029 0.040 0.110 0.165 0.444 144 R 0.036 0.075 0.015 0.021 0.039 0.099 0.228 0.486 145 E 0.010 0.099 0.062 0.089 0.195 0.095 0.118 0.333 146 T 0.029 0.086 0.058 0.126 0.375 0.051 0.095 0.180 147 V 0.036 0.040 0.063 0.197 0.265 0.053 0.076 0.270 148 T 0.020 0.022 0.083 0.220 0.434 0.035 0.044 0.143 149 H 0.017 0.010 0.046 0.200 0.351 0.061 0.022 0.292 150 R 0.019 0.010 0.064 0.213 0.257 0.084 0.031 0.322 151 K 0.006 0.004 0.107 0.189 0.258 0.076 0.042 0.318 152 L 0.132 0.007 0.036 0.046 0.064 0.075 0.032 0.608 153 E 0.753 0.009 0.014 0.031 0.015 0.021 0.053 0.105 154 P 0.029 0.006 0.010 0.008 0.023 0.096 0.010 0.819 155 G 0.013 0.003 0.019 0.013 0.063 0.066 0.034 0.789 156 A 0.012 0.008 0.037 0.193 0.155 0.101 0.089 0.405 157 N 0.018 0.013 0.045 0.090 0.119 0.100 0.042 0.573 158 L 0.046 0.024 0.037 0.148 0.126 0.065 0.040 0.514 159 T 0.066 0.038 0.042 0.085 0.092 0.061 0.065 0.550 160 S 0.074 0.039 0.040 0.098 0.101 0.080 0.134 0.434 161 E 0.069 0.014 0.041 0.073 0.071 0.094 0.119 0.520 162 A 0.594 0.009 0.009 0.013 0.019 0.045 0.050 0.261 163 A 0.169 0.004 0.010 0.007 0.013 0.085 0.037 0.675 164 G 0.021 0.003 0.016 0.011 0.062 0.134 0.016 0.738 165 G 0.006 0.002 0.041 0.036 0.177 0.129 0.060 0.548 166 I 0.001 0.001 0.079 0.282 0.324 0.059 0.029 0.226 167 E 0.001 0.001 0.192 0.322 0.392 0.011 0.027 0.054 168 V 0.001 0.001 0.166 0.345 0.317 0.012 0.031 0.128 169 L 0.001 0.001 0.472 0.272 0.232 0.003 0.009 0.010 170 V 0.005 0.001 0.340 0.224 0.298 0.017 0.039 0.076 171 L 0.049 0.003 0.217 0.252 0.216 0.049 0.055 0.158 172 D 0.026 0.003 0.065 0.068 0.174 0.087 0.039 0.539 173 G 0.016 0.003 0.093 0.067 0.212 0.115 0.046 0.448 174 D 0.008 0.002 0.113 0.204 0.290 0.068 0.055 0.259 175 V 0.004 0.002 0.133 0.201 0.217 0.061 0.041 0.341 176 T 0.055 0.005 0.126 0.154 0.180 0.071 0.031 0.379 177 V 0.293 0.011 0.046 0.092 0.078 0.071 0.058 0.352 178 N 0.071 0.030 0.013 0.021 0.050 0.071 0.016 0.728 179 D 0.021 0.011 0.034 0.036 0.104 0.069 0.026 0.698 180 E 0.044 0.027 0.027 0.315 0.162 0.077 0.045 0.304 181 V 0.025 0.008 0.049 0.135 0.158 0.075 0.052 0.498 182 L 0.069 0.005 0.040 0.074 0.086 0.123 0.037 0.566 183 G 0.474 0.014 0.017 0.037 0.035 0.046 0.048 0.329 184 R 0.033 0.009 0.007 0.008 0.022 0.090 0.014 0.816 185 N 0.014 0.007 0.029 0.035 0.144 0.096 0.053 0.621 186 A 0.030 0.005 0.057 0.256 0.336 0.071 0.058 0.189 187 W 0.009 0.002 0.064 0.154 0.220 0.054 0.029 0.468 188 L 0.002 0.001 0.118 0.278 0.394 0.045 0.018 0.144 189 R 0.002 0.001 0.119 0.147 0.291 0.057 0.034 0.348 190 L 0.160 0.005 0.073 0.129 0.088 0.093 0.056 0.395 191 P 0.506 0.017 0.018 0.025 0.021 0.053 0.048 0.312 192 E 0.063 0.021 0.009 0.006 0.022 0.122 0.013 0.745 193 G 0.029 0.013 0.028 0.012 0.048 0.095 0.050 0.725 194 E 0.051 0.058 0.022 0.177 0.149 0.095 0.086 0.361 195 A 0.014 0.021 0.041 0.084 0.164 0.067 0.075 0.534 196 L 0.016 0.018 0.040 0.223 0.321 0.055 0.060 0.266 197 S 0.012 0.009 0.064 0.261 0.361 0.033 0.066 0.193 198 A 0.028 0.006 0.031 0.240 0.235 0.052 0.020 0.387 199 T 0.064 0.009 0.034 0.222 0.322 0.051 0.066 0.233 200 A 0.015 0.002 0.023 0.063 0.093 0.096 0.040 0.668 201 G 0.300 0.007 0.014 0.032 0.076 0.062 0.041 0.469 202 A 0.198 0.008 0.009 0.029 0.029 0.072 0.045 0.611 203 R 0.010 0.005 0.040 0.031 0.133 0.182 0.016 0.583 204 G 0.004 0.004 0.054 0.060 0.284 0.082 0.053 0.459 205 A 0.001 0.003 0.076 0.376 0.293 0.040 0.047 0.163 206 K 0.001 0.002 0.202 0.292 0.385 0.012 0.055 0.051 207 I 0.002 0.002 0.149 0.394 0.341 0.008 0.055 0.050 208 W 0.001 0.001 0.403 0.215 0.321 0.005 0.029 0.026 209 M 0.005 0.002 0.211 0.317 0.361 0.013 0.034 0.058 210 K 0.035 0.004 0.115 0.282 0.312 0.042 0.045 0.165 211 T 0.035 0.004 0.051 0.061 0.122 0.112 0.038 0.576 212 G 0.028 0.005 0.049 0.035 0.062 0.174 0.031 0.616 213 H 0.043 0.006 0.026 0.025 0.039 0.108 0.044 0.709 214 L 0.090 0.010 0.036 0.042 0.042 0.092 0.089 0.600 215 R 0.065 0.009 0.065 0.082 0.141 0.094 0.087 0.458 216 F 0.025 0.003 0.049 0.050 0.090 0.077 0.056 0.650 217 V 0.005 0.002 0.114 0.150 0.215 0.094 0.031 0.388 218 R 0.015 0.002 0.044 0.047 0.098 0.068 0.029 0.697 219 T 0.153 0.010 0.042 0.123 0.091 0.087 0.103 0.392 220 P 0.034 0.006 0.035 0.037 0.063 0.119 0.036 0.670 221 E 0.031 0.007 0.024 0.032 0.076 0.107 0.044 0.681 222 V 0.041 0.009 0.032 0.061 0.070 0.104 0.053 0.631