# TARGET T0582 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-n_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 n_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0582.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 2410 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.103 0.019 0.070 0.043 0.067 0.096 0.016 0.586 2 E 0.134 0.015 0.053 0.048 0.069 0.155 0.016 0.510 3 I 0.085 0.019 0.106 0.050 0.099 0.091 0.008 0.543 4 N 0.029 0.022 0.028 0.052 0.096 0.119 0.005 0.648 5 A 0.061 0.017 0.040 0.035 0.061 0.088 0.009 0.690 6 D 0.073 0.022 0.024 0.040 0.055 0.299 0.013 0.474 7 F 0.300 0.016 0.032 0.024 0.054 0.142 0.028 0.404 8 T 0.096 0.040 0.054 0.048 0.063 0.350 0.027 0.323 9 K 0.098 0.013 0.074 0.053 0.064 0.118 0.022 0.558 10 P 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.005 0.001 0.990 11 V 0.025 0.003 0.249 0.181 0.265 0.084 0.007 0.186 12 V 0.040 0.005 0.177 0.100 0.148 0.040 0.003 0.487 13 I 0.008 0.003 0.376 0.172 0.274 0.018 0.002 0.147 14 D 0.008 0.005 0.084 0.111 0.175 0.092 0.002 0.523 15 T 0.013 0.004 0.053 0.025 0.120 0.038 0.003 0.745 16 D 0.016 0.003 0.014 0.013 0.029 0.524 0.004 0.395 17 Q 0.188 0.005 0.005 0.005 0.010 0.585 0.019 0.182 18 L 0.443 0.087 0.025 0.025 0.027 0.110 0.014 0.268 19 E 0.060 0.065 0.042 0.050 0.078 0.146 0.022 0.538 20 W 0.031 0.018 0.018 0.014 0.029 0.033 0.011 0.845 21 R 0.141 0.030 0.092 0.209 0.243 0.060 0.013 0.212 22 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 23 S 0.011 0.004 0.089 0.132 0.297 0.081 0.004 0.382 24 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 25 M 0.054 0.006 0.026 0.029 0.099 0.222 0.004 0.560 26 K 0.179 0.006 0.017 0.013 0.013 0.129 0.007 0.636 27 G 0.240 0.013 0.017 0.016 0.017 0.070 0.014 0.612 28 V 0.268 0.014 0.081 0.048 0.062 0.126 0.009 0.391 29 E 0.027 0.021 0.083 0.106 0.139 0.088 0.005 0.531 30 R 0.015 0.024 0.050 0.086 0.199 0.054 0.004 0.568 31 R 0.029 0.055 0.166 0.164 0.217 0.082 0.008 0.279 32 M 0.037 0.075 0.106 0.107 0.164 0.081 0.008 0.421 33 L 0.049 0.084 0.155 0.133 0.275 0.071 0.009 0.223 34 D 0.059 0.110 0.076 0.112 0.164 0.089 0.014 0.376 35 R 0.123 0.112 0.074 0.068 0.118 0.079 0.029 0.396 36 I 0.145 0.090 0.047 0.038 0.062 0.185 0.030 0.404 37 G 0.121 0.061 0.028 0.027 0.037 0.094 0.039 0.593 38 G 0.090 0.034 0.024 0.016 0.020 0.068 0.025 0.722 39 E 0.098 0.025 0.024 0.014 0.022 0.193 0.019 0.606 40 V 0.088 0.032 0.022 0.021 0.035 0.138 0.014 0.650 41 A 0.092 0.062 0.044 0.073 0.104 0.173 0.015 0.437 42 R 0.043 0.033 0.035 0.058 0.070 0.106 0.009 0.645 43 A 0.078 0.055 0.092 0.179 0.231 0.097 0.012 0.257 44 T 0.067 0.055 0.069 0.274 0.346 0.069 0.010 0.110 45 S 0.034 0.025 0.094 0.313 0.412 0.036 0.007 0.079 46 I 0.015 0.013 0.088 0.274 0.418 0.038 0.002 0.152 47 V 0.008 0.017 0.064 0.448 0.392 0.013 0.003 0.054 48 R 0.015 0.012 0.127 0.262 0.370 0.018 0.010 0.186 49 Y 0.020 0.010 0.122 0.216 0.417 0.017 0.013 0.185 50 A 0.019 0.005 0.072 0.154 0.300 0.080 0.004 0.366 51 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 52 G 0.028 0.004 0.022 0.045 0.086 0.103 0.018 0.692 53 S 0.905 0.001 0.006 0.004 0.003 0.012 0.009 0.061 54 R 0.061 0.003 0.062 0.033 0.032 0.046 0.005 0.758 55 F 0.071 0.005 0.082 0.071 0.194 0.101 0.004 0.472 56 S 0.014 0.004 0.052 0.038 0.062 0.079 0.002 0.748 57 A 0.020 0.006 0.016 0.025 0.059 0.105 0.004 0.765 58 H 0.194 0.014 0.058 0.051 0.084 0.183 0.012 0.404 59 T 0.085 0.020 0.022 0.048 0.053 0.142 0.011 0.619 60 H 0.073 0.037 0.061 0.091 0.153 0.121 0.015 0.450 61 D 0.020 0.012 0.012 0.020 0.035 0.122 0.008 0.772 62 G 0.087 0.018 0.016 0.033 0.036 0.130 0.029 0.651 63 G 0.214 0.026 0.046 0.046 0.047 0.218 0.043 0.359 64 E 0.211 0.010 0.045 0.067 0.130 0.309 0.012 0.217 65 E 0.032 0.015 0.049 0.239 0.278 0.096 0.003 0.287 66 F 0.013 0.008 0.045 0.322 0.530 0.025 0.002 0.057 67 I 0.006 0.008 0.060 0.415 0.412 0.012 0.002 0.087 68 V 0.002 0.008 0.042 0.316 0.519 0.016 0.002 0.095 69 L 0.004 0.016 0.058 0.327 0.544 0.017 0.002 0.032 70 D 0.010 0.020 0.036 0.238 0.487 0.046 0.007 0.155 71 G 0.038 0.018 0.037 0.290 0.296 0.046 0.033 0.243 72 V 0.299 0.004 0.038 0.102 0.204 0.168 0.013 0.172 73 F 0.026 0.007 0.023 0.320 0.254 0.056 0.003 0.311 74 Q 0.022 0.006 0.018 0.266 0.507 0.042 0.003 0.137 75 D 0.013 0.008 0.022 0.311 0.394 0.024 0.004 0.223 76 E 0.024 0.008 0.021 0.090 0.212 0.110 0.007 0.526 77 H 0.025 0.006 0.006 0.032 0.051 0.445 0.014 0.422 78 G 0.284 0.020 0.016 0.078 0.044 0.088 0.066 0.404 79 D 0.091 0.005 0.024 0.020 0.039 0.234 0.011 0.577 80 Y 0.037 0.004 0.042 0.126 0.175 0.107 0.009 0.499 81 P 0.004 0.001 0.006 0.025 0.043 0.029 0.001 0.892 82 A 0.002 0.001 0.008 0.029 0.060 0.028 0.001 0.872 83 G 0.045 0.010 0.047 0.157 0.166 0.075 0.015 0.485 84 T 0.501 0.002 0.017 0.048 0.109 0.137 0.008 0.179 85 Y 0.033 0.004 0.057 0.202 0.176 0.062 0.002 0.465 86 V 0.024 0.003 0.043 0.288 0.530 0.042 0.003 0.067 87 R 0.018 0.005 0.068 0.204 0.318 0.025 0.005 0.358 88 N 0.012 0.005 0.066 0.239 0.435 0.026 0.005 0.212 89 P 0.001 0.001 0.002 0.004 0.006 0.003 0.001 0.984 90 P 0.001 0.001 0.002 0.004 0.010 0.007 0.001 0.976 91 T 0.043 0.002 0.025 0.042 0.075 0.109 0.008 0.696 92 T 0.338 0.003 0.041 0.040 0.054 0.072 0.009 0.442 93 S 0.050 0.006 0.066 0.066 0.081 0.073 0.004 0.653 94 H 0.070 0.007 0.056 0.067 0.156 0.107 0.010 0.526 95 V 0.066 0.007 0.066 0.093 0.119 0.125 0.006 0.518 96 P 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.003 0.001 0.993 97 G 0.020 0.004 0.021 0.055 0.122 0.150 0.005 0.624 98 S 0.112 0.008 0.014 0.035 0.051 0.113 0.008 0.659 99 A 0.035 0.008 0.010 0.021 0.043 0.058 0.005 0.821 100 E 0.048 0.007 0.008 0.018 0.029 0.301 0.010 0.579 101 G 0.153 0.016 0.011 0.024 0.020 0.183 0.028 0.565 102 C 0.217 0.021 0.026 0.051 0.073 0.231 0.014 0.366 103 T 0.040 0.017 0.055 0.249 0.242 0.152 0.007 0.239 104 I 0.028 0.011 0.046 0.261 0.469 0.066 0.003 0.116 105 F 0.008 0.008 0.065 0.343 0.514 0.019 0.001 0.043 106 V 0.002 0.011 0.072 0.457 0.429 0.007 0.001 0.021 107 K 0.003 0.014 0.113 0.330 0.492 0.009 0.002 0.036 108 L 0.005 0.017 0.128 0.291 0.479 0.018 0.002 0.059 109 W 0.009 0.032 0.080 0.269 0.435 0.035 0.005 0.136 110 Q 0.027 0.032 0.083 0.134 0.292 0.054 0.017 0.362 111 F 0.080 0.029 0.063 0.058 0.130 0.090 0.038 0.512 112 D 0.115 0.019 0.020 0.050 0.064 0.122 0.014 0.596 113 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 114 A 0.010 0.004 0.006 0.010 0.036 0.380 0.004 0.550 115 D 0.421 0.010 0.005 0.003 0.004 0.172 0.018 0.368 116 R 0.451 0.097 0.015 0.009 0.012 0.074 0.009 0.333 117 T 0.308 0.089 0.053 0.019 0.027 0.179 0.016 0.309 118 Q 0.166 0.060 0.078 0.031 0.041 0.096 0.015 0.513 119 F 0.067 0.062 0.041 0.033 0.061 0.078 0.007 0.651 120 S 0.031 0.047 0.036 0.033 0.087 0.113 0.006 0.648 121 K 0.015 0.024 0.011 0.008 0.021 0.045 0.003 0.875 122 N 0.041 0.052 0.008 0.009 0.018 0.386 0.009 0.478 123 M 0.294 0.119 0.012 0.009 0.017 0.149 0.013 0.386 124 E 0.086 0.420 0.017 0.019 0.025 0.090 0.010 0.333 125 A 0.060 0.297 0.019 0.017 0.034 0.072 0.016 0.485 126 E 0.145 0.395 0.017 0.020 0.030 0.051 0.019 0.325 127 L 0.140 0.247 0.018 0.019 0.036 0.059 0.030 0.451 128 G 0.193 0.122 0.019 0.019 0.029 0.047 0.058 0.512 129 A 0.296 0.068 0.046 0.042 0.038 0.072 0.025 0.413 130 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 131 V 0.056 0.015 0.039 0.063 0.152 0.121 0.008 0.547 132 E 0.008 0.003 0.008 0.011 0.008 0.018 0.002 0.942 133 G 0.057 0.011 0.024 0.041 0.056 0.054 0.015 0.743 134 I 0.520 0.003 0.070 0.037 0.044 0.084 0.009 0.233 135 S 0.022 0.004 0.176 0.128 0.104 0.081 0.004 0.482 136 T 0.015 0.003 0.159 0.151 0.335 0.042 0.003 0.292 137 S 0.007 0.002 0.454 0.212 0.195 0.017 0.002 0.112 138 L 0.008 0.003 0.224 0.169 0.274 0.039 0.003 0.279 139 L 0.012 0.004 0.444 0.111 0.309 0.040 0.002 0.078 140 H 0.019 0.008 0.137 0.132 0.246 0.163 0.005 0.290 141 E 0.032 0.005 0.051 0.030 0.084 0.091 0.008 0.699 142 D 0.056 0.005 0.019 0.014 0.031 0.202 0.011 0.662 143 E 0.092 0.008 0.014 0.010 0.019 0.233 0.016 0.609 144 R 0.041 0.022 0.012 0.013 0.022 0.252 0.013 0.626 145 E 0.062 0.038 0.016 0.018 0.028 0.211 0.012 0.613 146 T 0.099 0.144 0.034 0.047 0.062 0.237 0.011 0.367 147 V 0.101 0.213 0.060 0.112 0.201 0.109 0.014 0.188 148 T 0.045 0.234 0.064 0.201 0.306 0.054 0.006 0.090 149 H 0.030 0.159 0.042 0.249 0.348 0.032 0.007 0.134 150 R 0.050 0.147 0.048 0.315 0.338 0.021 0.010 0.070 151 K 0.066 0.082 0.051 0.300 0.298 0.023 0.031 0.150 152 L 0.057 0.043 0.119 0.182 0.340 0.017 0.031 0.211 153 E 0.028 0.016 0.043 0.157 0.287 0.099 0.008 0.363 154 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 155 G 0.041 0.011 0.027 0.061 0.107 0.123 0.021 0.608 156 A 0.919 0.001 0.008 0.004 0.004 0.012 0.010 0.043 157 N 0.089 0.007 0.085 0.051 0.049 0.042 0.006 0.671 158 L 0.094 0.008 0.138 0.128 0.252 0.061 0.004 0.315 159 T 0.016 0.007 0.053 0.052 0.087 0.097 0.002 0.686 160 S 0.029 0.013 0.047 0.068 0.187 0.093 0.005 0.558 161 E 0.041 0.028 0.026 0.038 0.070 0.157 0.007 0.633 162 A 0.144 0.045 0.026 0.046 0.089 0.216 0.022 0.411 163 A 0.093 0.098 0.027 0.045 0.059 0.118 0.018 0.543 164 G 0.062 0.045 0.018 0.045 0.050 0.078 0.037 0.665 165 G 0.331 0.021 0.034 0.042 0.043 0.098 0.079 0.352 166 I 0.379 0.010 0.078 0.064 0.101 0.176 0.017 0.175 167 E 0.022 0.006 0.119 0.313 0.271 0.076 0.005 0.188 168 V 0.011 0.003 0.100 0.238 0.475 0.029 0.002 0.143 169 L 0.002 0.001 0.236 0.412 0.317 0.006 0.001 0.025 170 V 0.001 0.002 0.128 0.335 0.380 0.014 0.001 0.138 171 L 0.001 0.001 0.301 0.258 0.411 0.008 0.001 0.019 172 D 0.003 0.003 0.104 0.206 0.371 0.056 0.003 0.255 173 G 0.012 0.003 0.109 0.206 0.336 0.050 0.021 0.263 174 D 0.243 0.001 0.043 0.064 0.158 0.210 0.006 0.277 175 V 0.008 0.001 0.020 0.133 0.092 0.041 0.001 0.705 176 T 0.011 0.001 0.030 0.287 0.506 0.048 0.002 0.114 177 V 0.014 0.002 0.048 0.282 0.291 0.032 0.002 0.329 178 N 0.009 0.003 0.036 0.147 0.399 0.097 0.004 0.305 179 D 0.049 0.004 0.033 0.079 0.150 0.111 0.012 0.562 180 E 0.190 0.006 0.043 0.084 0.109 0.329 0.014 0.225 181 V 0.038 0.004 0.024 0.059 0.092 0.130 0.006 0.648 182 L 0.030 0.010 0.069 0.239 0.382 0.067 0.005 0.197 183 G 0.019 0.007 0.036 0.133 0.246 0.136 0.007 0.416 184 R 0.024 0.008 0.032 0.061 0.175 0.068 0.008 0.624 185 N 0.032 0.014 0.031 0.086 0.104 0.127 0.017 0.589 186 A 0.448 0.004 0.026 0.052 0.091 0.208 0.021 0.149 187 W 0.105 0.012 0.098 0.152 0.222 0.109 0.007 0.295 188 L 0.021 0.006 0.094 0.383 0.429 0.020 0.005 0.042 189 R 0.034 0.008 0.095 0.222 0.369 0.031 0.008 0.232 190 L 0.014 0.004 0.115 0.287 0.470 0.016 0.003 0.091 191 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.995 192 E 0.002 0.001 0.008 0.032 0.115 0.079 0.003 0.760 193 G 0.204 0.004 0.016 0.020 0.026 0.080 0.026 0.623 194 E 0.577 0.003 0.017 0.019 0.029 0.167 0.011 0.177 195 A 0.027 0.005 0.028 0.040 0.030 0.051 0.003 0.815 196 L 0.077 0.011 0.088 0.166 0.399 0.099 0.005 0.156 197 S 0.030 0.012 0.063 0.224 0.297 0.057 0.003 0.314 198 A 0.012 0.012 0.071 0.241 0.481 0.026 0.003 0.154 199 T 0.030 0.030 0.061 0.290 0.400 0.066 0.005 0.116 200 A 0.067 0.032 0.090 0.243 0.359 0.043 0.014 0.151 201 G 0.059 0.029 0.041 0.151 0.243 0.083 0.021 0.373 202 A 0.130 0.017 0.068 0.071 0.159 0.131 0.027 0.397 203 R 0.011 0.006 0.011 0.023 0.023 0.056 0.008 0.862 204 G 0.110 0.005 0.016 0.041 0.050 0.126 0.048 0.605 205 A 0.346 0.004 0.102 0.061 0.081 0.179 0.012 0.215 206 K 0.020 0.003 0.215 0.291 0.254 0.066 0.003 0.148 207 I 0.005 0.003 0.135 0.261 0.431 0.021 0.001 0.143 208 W 0.002 0.003 0.369 0.232 0.360 0.007 0.001 0.026 209 M 0.002 0.008 0.288 0.293 0.326 0.014 0.001 0.068 210 K 0.003 0.010 0.307 0.204 0.391 0.020 0.003 0.063 211 T 0.012 0.019 0.150 0.142 0.271 0.069 0.009 0.329 212 G 0.057 0.017 0.128 0.071 0.149 0.077 0.028 0.474 213 H 0.092 0.008 0.047 0.029 0.067 0.228 0.019 0.510 214 L 0.077 0.018 0.039 0.047 0.061 0.127 0.019 0.613 215 R 0.065 0.026 0.022 0.033 0.040 0.115 0.014 0.685 216 F 0.111 0.034 0.052 0.048 0.062 0.100 0.017 0.574 217 V 0.122 0.047 0.091 0.107 0.157 0.118 0.015 0.342 218 R 0.055 0.044 0.071 0.104 0.185 0.081 0.020 0.440 219 T 0.063 0.023 0.063 0.134 0.149 0.059 0.008 0.501 220 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 221 E 0.012 0.004 0.026 0.057 0.154 0.183 0.004 0.559 222 V 0.172 0.017 0.041 0.044 0.066 0.078 0.009 0.573