# TARGET T0582 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t04-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0582.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1685 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.031 0.024 0.028 0.077 0.098 0.110 0.037 0.596 2 E 0.043 0.028 0.028 0.056 0.104 0.115 0.048 0.577 3 I 0.056 0.024 0.031 0.048 0.051 0.103 0.034 0.651 4 N 0.321 0.033 0.021 0.025 0.039 0.075 0.216 0.270 5 A 0.074 0.017 0.036 0.026 0.027 0.123 0.087 0.609 6 D 0.072 0.009 0.019 0.008 0.022 0.101 0.045 0.723 7 F 0.029 0.014 0.027 0.031 0.028 0.161 0.046 0.662 8 T 0.052 0.018 0.027 0.022 0.036 0.135 0.039 0.671 9 K 0.091 0.037 0.053 0.052 0.066 0.132 0.084 0.486 10 P 0.027 0.020 0.076 0.032 0.083 0.097 0.062 0.604 11 V 0.010 0.009 0.157 0.122 0.181 0.089 0.066 0.366 12 V 0.005 0.005 0.122 0.122 0.199 0.112 0.056 0.379 13 I 0.012 0.006 0.173 0.092 0.133 0.086 0.040 0.459 14 D 0.378 0.043 0.038 0.036 0.039 0.063 0.127 0.276 15 T 0.418 0.016 0.012 0.011 0.011 0.076 0.042 0.414 16 D 0.044 0.013 0.026 0.011 0.028 0.104 0.043 0.731 17 Q 0.044 0.008 0.030 0.030 0.060 0.120 0.042 0.666 18 L 0.103 0.007 0.030 0.056 0.094 0.112 0.078 0.521 19 E 0.013 0.003 0.050 0.068 0.087 0.135 0.037 0.606 20 W 0.013 0.001 0.013 0.017 0.042 0.108 0.016 0.789 21 R 0.023 0.007 0.051 0.124 0.098 0.152 0.060 0.487 22 P 0.031 0.002 0.007 0.013 0.017 0.108 0.012 0.809 23 S 0.108 0.015 0.033 0.036 0.041 0.117 0.146 0.504 24 P 0.178 0.017 0.012 0.009 0.010 0.090 0.029 0.655 25 M 0.239 0.047 0.009 0.008 0.018 0.086 0.044 0.549 26 K 0.010 0.037 0.013 0.022 0.032 0.136 0.027 0.725 27 G 0.035 0.109 0.024 0.071 0.146 0.089 0.081 0.446 28 V 0.033 0.140 0.042 0.188 0.139 0.073 0.081 0.304 29 E 0.062 0.192 0.067 0.106 0.204 0.049 0.050 0.271 30 R 0.063 0.157 0.037 0.121 0.205 0.054 0.092 0.272 31 R 0.062 0.131 0.069 0.158 0.222 0.049 0.084 0.225 32 M 0.118 0.103 0.060 0.114 0.237 0.051 0.075 0.243 33 L 0.119 0.044 0.066 0.097 0.131 0.083 0.095 0.365 34 D 0.085 0.024 0.029 0.050 0.069 0.096 0.053 0.595 35 R 0.115 0.026 0.015 0.019 0.027 0.085 0.038 0.674 36 I 0.111 0.053 0.012 0.012 0.016 0.082 0.053 0.662 37 G 0.064 0.062 0.008 0.012 0.014 0.100 0.044 0.696 38 G 0.093 0.112 0.010 0.021 0.031 0.101 0.044 0.588 39 E 0.102 0.161 0.020 0.029 0.078 0.088 0.069 0.452 40 V 0.057 0.071 0.031 0.037 0.101 0.099 0.220 0.384 41 A 0.015 0.054 0.064 0.122 0.166 0.073 0.365 0.141 42 R 0.036 0.059 0.120 0.130 0.238 0.069 0.162 0.187 43 A 0.031 0.053 0.081 0.182 0.264 0.073 0.086 0.231 44 T 0.012 0.017 0.075 0.172 0.293 0.100 0.060 0.270 45 S 0.011 0.016 0.095 0.207 0.345 0.069 0.078 0.179 46 I 0.009 0.010 0.086 0.193 0.292 0.060 0.057 0.293 47 V 0.004 0.003 0.119 0.304 0.341 0.049 0.041 0.139 48 R 0.003 0.002 0.106 0.187 0.358 0.076 0.035 0.235 49 Y 0.026 0.002 0.097 0.103 0.148 0.096 0.038 0.491 50 A 0.288 0.014 0.043 0.047 0.064 0.107 0.137 0.300 51 P 0.036 0.008 0.017 0.013 0.019 0.125 0.026 0.756 52 G 0.039 0.009 0.017 0.017 0.043 0.119 0.050 0.705 53 S 0.031 0.011 0.049 0.067 0.122 0.171 0.062 0.488 54 R 0.021 0.007 0.023 0.044 0.078 0.125 0.028 0.673 55 F 0.085 0.011 0.020 0.047 0.083 0.138 0.128 0.487 56 S 0.062 0.022 0.019 0.075 0.111 0.117 0.109 0.485 57 A 0.025 0.004 0.015 0.028 0.073 0.127 0.030 0.696 58 H 0.024 0.004 0.023 0.076 0.097 0.154 0.077 0.546 59 T 0.022 0.002 0.008 0.025 0.030 0.120 0.031 0.762 60 H 0.335 0.007 0.011 0.016 0.031 0.085 0.075 0.441 61 D 0.106 0.005 0.006 0.012 0.027 0.116 0.028 0.700 62 G 0.014 0.005 0.007 0.016 0.045 0.164 0.013 0.737 63 G 0.009 0.010 0.013 0.106 0.302 0.124 0.053 0.383 64 E 0.002 0.006 0.051 0.239 0.529 0.035 0.058 0.080 65 E 0.001 0.003 0.047 0.346 0.504 0.016 0.026 0.058 66 F 0.001 0.001 0.087 0.399 0.430 0.014 0.015 0.053 67 I 0.001 0.001 0.116 0.491 0.337 0.006 0.038 0.012 68 V 0.011 0.001 0.063 0.359 0.355 0.030 0.032 0.148 69 L 0.060 0.005 0.113 0.230 0.327 0.054 0.061 0.151 70 D 0.009 0.003 0.031 0.118 0.191 0.095 0.026 0.527 71 G 0.004 0.004 0.047 0.180 0.432 0.062 0.034 0.237 72 V 0.004 0.003 0.049 0.347 0.335 0.040 0.034 0.187 73 F 0.005 0.002 0.083 0.324 0.360 0.033 0.032 0.161 74 Q 0.011 0.001 0.060 0.325 0.356 0.035 0.044 0.167 75 D 0.060 0.001 0.076 0.127 0.201 0.067 0.057 0.410 76 E 0.265 0.003 0.028 0.049 0.071 0.078 0.041 0.466 77 H 0.073 0.001 0.009 0.011 0.026 0.091 0.018 0.771 78 G 0.010 0.001 0.015 0.033 0.062 0.139 0.012 0.726 79 D 0.005 0.001 0.005 0.026 0.040 0.120 0.018 0.785 80 Y 0.025 0.001 0.038 0.113 0.108 0.130 0.080 0.505 81 P 0.311 0.008 0.023 0.051 0.075 0.089 0.085 0.357 82 A 0.039 0.002 0.012 0.030 0.052 0.147 0.019 0.698 83 G 0.017 0.004 0.021 0.061 0.162 0.127 0.026 0.581 84 T 0.012 0.007 0.045 0.221 0.428 0.057 0.072 0.158 85 Y 0.010 0.002 0.056 0.146 0.298 0.078 0.031 0.380 86 V 0.003 0.001 0.080 0.256 0.342 0.085 0.028 0.205 87 R 0.002 0.001 0.050 0.121 0.286 0.111 0.027 0.403 88 N 0.035 0.003 0.078 0.115 0.178 0.115 0.076 0.400 89 P 0.216 0.008 0.019 0.026 0.033 0.142 0.143 0.413 90 P 0.014 0.006 0.022 0.018 0.024 0.187 0.041 0.688 91 T 0.036 0.025 0.027 0.026 0.069 0.140 0.072 0.606 92 T 0.033 0.017 0.036 0.104 0.128 0.142 0.088 0.452 93 S 0.014 0.011 0.043 0.070 0.125 0.143 0.038 0.556 94 H 0.026 0.013 0.027 0.074 0.143 0.112 0.077 0.529 95 V 0.079 0.009 0.025 0.073 0.120 0.117 0.085 0.492 96 P 0.024 0.003 0.018 0.047 0.096 0.171 0.052 0.589 97 G 0.011 0.002 0.016 0.027 0.044 0.142 0.030 0.728 98 S 0.364 0.011 0.007 0.014 0.017 0.091 0.056 0.439 99 A 0.132 0.017 0.005 0.008 0.011 0.118 0.058 0.652 100 E 0.004 0.012 0.022 0.014 0.038 0.191 0.033 0.686 101 G 0.010 0.053 0.029 0.085 0.182 0.134 0.084 0.423 102 C 0.004 0.025 0.067 0.244 0.241 0.088 0.045 0.286 103 T 0.006 0.048 0.173 0.263 0.332 0.026 0.091 0.063 104 I 0.008 0.030 0.122 0.194 0.367 0.036 0.082 0.161 105 F 0.008 0.022 0.180 0.297 0.314 0.028 0.059 0.092 106 V 0.012 0.012 0.091 0.308 0.367 0.035 0.057 0.117 107 K 0.033 0.018 0.119 0.195 0.307 0.065 0.056 0.208 108 L 0.039 0.017 0.070 0.075 0.140 0.097 0.064 0.497 109 W 0.073 0.012 0.068 0.070 0.102 0.104 0.061 0.511 110 Q 0.010 0.004 0.023 0.025 0.048 0.145 0.038 0.707 111 F 0.006 0.004 0.038 0.013 0.024 0.093 0.020 0.803 112 D 0.577 0.044 0.007 0.007 0.007 0.038 0.130 0.190 113 P 0.296 0.022 0.007 0.003 0.003 0.078 0.094 0.496 114 A 0.030 0.017 0.015 0.003 0.011 0.109 0.041 0.774 115 D 0.074 0.043 0.011 0.007 0.023 0.137 0.055 0.649 116 R 0.037 0.031 0.012 0.030 0.032 0.170 0.069 0.620 117 T 0.050 0.108 0.022 0.053 0.080 0.132 0.112 0.443 118 Q 0.047 0.060 0.041 0.039 0.086 0.110 0.185 0.431 119 F 0.058 0.059 0.052 0.116 0.094 0.103 0.131 0.386 120 S 0.099 0.073 0.026 0.065 0.092 0.097 0.077 0.471 121 K 0.046 0.062 0.020 0.038 0.057 0.082 0.033 0.661 122 N 0.160 0.146 0.015 0.024 0.037 0.075 0.087 0.457 123 M 0.235 0.104 0.014 0.038 0.033 0.083 0.076 0.417 124 E 0.209 0.047 0.019 0.033 0.057 0.073 0.100 0.462 125 A 0.128 0.019 0.020 0.032 0.060 0.081 0.037 0.622 126 E 0.096 0.009 0.031 0.032 0.082 0.106 0.059 0.585 127 L 0.012 0.008 0.063 0.072 0.113 0.115 0.031 0.586 128 G 0.032 0.003 0.022 0.028 0.064 0.109 0.019 0.724 129 A 0.019 0.003 0.058 0.136 0.087 0.138 0.068 0.490 130 P 0.106 0.004 0.026 0.023 0.030 0.090 0.016 0.705 131 V 0.553 0.011 0.011 0.007 0.013 0.046 0.056 0.304 132 E 0.008 0.005 0.035 0.012 0.019 0.152 0.039 0.730 133 G 0.011 0.016 0.033 0.038 0.069 0.145 0.066 0.622 134 I 0.034 0.037 0.044 0.136 0.096 0.121 0.074 0.459 135 S 0.075 0.082 0.066 0.080 0.109 0.089 0.057 0.442 136 T 0.053 0.071 0.044 0.072 0.109 0.094 0.121 0.436 137 S 0.049 0.063 0.078 0.122 0.188 0.071 0.123 0.305 138 L 0.063 0.044 0.075 0.110 0.257 0.065 0.078 0.307 139 L 0.052 0.032 0.041 0.122 0.193 0.089 0.066 0.406 140 H 0.071 0.037 0.035 0.090 0.173 0.115 0.077 0.402 141 E 0.136 0.043 0.010 0.026 0.046 0.089 0.032 0.618 142 D 0.099 0.035 0.013 0.022 0.040 0.118 0.176 0.498 143 E 0.045 0.061 0.016 0.033 0.043 0.141 0.092 0.568 144 R 0.107 0.034 0.016 0.021 0.052 0.099 0.246 0.425 145 E 0.009 0.030 0.049 0.111 0.094 0.156 0.104 0.446 146 T 0.028 0.043 0.048 0.100 0.254 0.088 0.066 0.373 147 V 0.014 0.017 0.069 0.223 0.213 0.088 0.058 0.317 148 T 0.033 0.021 0.099 0.182 0.307 0.065 0.073 0.221 149 H 0.023 0.008 0.059 0.147 0.288 0.061 0.073 0.340 150 R 0.017 0.003 0.107 0.177 0.346 0.069 0.039 0.241 151 K 0.003 0.001 0.033 0.122 0.182 0.108 0.023 0.527 152 L 0.028 0.004 0.057 0.078 0.111 0.089 0.031 0.602 153 E 0.493 0.020 0.020 0.025 0.034 0.061 0.138 0.210 154 P 0.032 0.006 0.013 0.010 0.010 0.125 0.019 0.784 155 G 0.049 0.009 0.016 0.009 0.031 0.113 0.080 0.694 156 A 0.013 0.020 0.047 0.085 0.096 0.142 0.091 0.506 157 N 0.027 0.027 0.035 0.037 0.065 0.119 0.039 0.652 158 L 0.050 0.076 0.026 0.091 0.078 0.105 0.106 0.468 159 T 0.127 0.065 0.030 0.062 0.086 0.083 0.080 0.466 160 S 0.125 0.032 0.028 0.062 0.100 0.100 0.096 0.456 161 E 0.066 0.008 0.029 0.042 0.058 0.098 0.079 0.620 162 A 0.335 0.008 0.011 0.019 0.030 0.068 0.054 0.474 163 A 0.222 0.006 0.010 0.016 0.031 0.086 0.037 0.591 164 G 0.011 0.002 0.015 0.011 0.031 0.139 0.011 0.780 165 G 0.018 0.006 0.020 0.067 0.144 0.142 0.040 0.564 166 I 0.003 0.002 0.064 0.138 0.278 0.105 0.044 0.366 167 E 0.001 0.001 0.144 0.280 0.474 0.016 0.036 0.048 168 V 0.001 0.001 0.132 0.251 0.370 0.026 0.015 0.205 169 L 0.001 0.001 0.353 0.370 0.240 0.003 0.027 0.006 170 V 0.004 0.001 0.113 0.320 0.402 0.017 0.017 0.125 171 L 0.052 0.001 0.249 0.169 0.376 0.028 0.038 0.087 172 D 0.012 0.001 0.024 0.068 0.087 0.104 0.017 0.688 173 G 0.003 0.001 0.039 0.139 0.430 0.061 0.018 0.309 174 D 0.003 0.001 0.038 0.310 0.341 0.053 0.026 0.228 175 V 0.001 0.001 0.036 0.337 0.188 0.060 0.020 0.357 176 T 0.046 0.001 0.044 0.308 0.330 0.046 0.053 0.171 177 V 0.228 0.002 0.021 0.081 0.132 0.068 0.036 0.432 178 N 0.024 0.003 0.009 0.058 0.064 0.113 0.015 0.714 179 D 0.017 0.004 0.006 0.060 0.114 0.094 0.023 0.682 180 E 0.025 0.008 0.023 0.319 0.327 0.047 0.035 0.215 181 V 0.029 0.003 0.026 0.118 0.188 0.083 0.047 0.507 182 L 0.024 0.002 0.035 0.220 0.225 0.072 0.045 0.378 183 G 0.420 0.005 0.014 0.035 0.114 0.060 0.041 0.310 184 R 0.058 0.006 0.013 0.068 0.081 0.122 0.020 0.632 185 N 0.025 0.006 0.011 0.038 0.112 0.132 0.022 0.655 186 A 0.018 0.012 0.036 0.222 0.388 0.065 0.062 0.197 187 W 0.009 0.002 0.074 0.147 0.355 0.065 0.025 0.323 188 L 0.002 0.001 0.107 0.313 0.385 0.046 0.022 0.124 189 R 0.003 0.001 0.074 0.126 0.231 0.082 0.027 0.455 190 L 0.099 0.008 0.053 0.167 0.128 0.072 0.122 0.352 191 P 0.344 0.017 0.020 0.025 0.029 0.082 0.095 0.387 192 E 0.061 0.017 0.014 0.011 0.016 0.099 0.021 0.761 193 G 0.069 0.017 0.008 0.012 0.026 0.125 0.042 0.702 194 E 0.058 0.090 0.025 0.079 0.112 0.117 0.092 0.426 195 A 0.038 0.025 0.023 0.035 0.086 0.114 0.108 0.571 196 L 0.017 0.073 0.048 0.190 0.161 0.106 0.087 0.317 197 S 0.053 0.068 0.053 0.094 0.200 0.089 0.093 0.349 198 A 0.059 0.046 0.047 0.167 0.119 0.084 0.076 0.402 199 T 0.136 0.057 0.042 0.057 0.120 0.096 0.108 0.384 200 A 0.060 0.023 0.049 0.040 0.057 0.123 0.056 0.592 201 G 0.202 0.054 0.016 0.020 0.039 0.101 0.069 0.497 202 A 0.156 0.068 0.014 0.022 0.033 0.125 0.077 0.506 203 R 0.033 0.091 0.020 0.023 0.050 0.130 0.060 0.593 204 G 0.018 0.114 0.045 0.071 0.177 0.123 0.114 0.338 205 A 0.006 0.081 0.078 0.194 0.362 0.060 0.062 0.158 206 K 0.005 0.042 0.104 0.160 0.496 0.032 0.061 0.100 207 I 0.002 0.015 0.149 0.334 0.337 0.021 0.094 0.048 208 W 0.002 0.009 0.179 0.297 0.345 0.023 0.098 0.048 209 M 0.020 0.011 0.179 0.310 0.220 0.039 0.099 0.121 210 K 0.169 0.023 0.063 0.107 0.116 0.081 0.098 0.342 211 T 0.112 0.019 0.020 0.032 0.044 0.127 0.039 0.605 212 G 0.029 0.014 0.012 0.021 0.034 0.131 0.033 0.727 213 H 0.065 0.037 0.016 0.076 0.067 0.110 0.056 0.573 214 L 0.139 0.026 0.013 0.049 0.062 0.080 0.034 0.598 215 R 0.113 0.035 0.031 0.072 0.117 0.074 0.040 0.518 216 F 0.060 0.003 0.008 0.024 0.064 0.093 0.021 0.728 217 V 0.012 0.005 0.037 0.102 0.192 0.132 0.031 0.489 218 R 0.033 0.009 0.016 0.027 0.058 0.084 0.016 0.757 219 T 0.441 0.033 0.006 0.028 0.019 0.056 0.101 0.315 220 P 0.068 0.022 0.017 0.025 0.030 0.105 0.057 0.677 221 E 0.028 0.013 0.042 0.017 0.064 0.092 0.038 0.708 222 V 0.039 0.013 0.030 0.050 0.056 0.118 0.049 0.645