# TARGET T0582 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t04-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-n_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 n_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0582.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1685 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.062 0.027 0.078 0.078 0.108 0.067 0.010 0.571 2 E 0.037 0.012 0.035 0.046 0.075 0.148 0.006 0.641 3 I 0.038 0.018 0.056 0.059 0.100 0.081 0.004 0.644 4 N 0.045 0.027 0.056 0.065 0.133 0.143 0.008 0.523 5 A 0.065 0.017 0.027 0.024 0.035 0.093 0.005 0.733 6 D 0.094 0.038 0.037 0.036 0.056 0.166 0.021 0.552 7 F 0.292 0.030 0.027 0.023 0.033 0.110 0.026 0.458 8 T 0.104 0.045 0.040 0.031 0.046 0.344 0.023 0.365 9 K 0.119 0.018 0.034 0.050 0.076 0.128 0.018 0.558 10 P 0.003 0.001 0.004 0.003 0.007 0.006 0.001 0.977 11 V 0.019 0.005 0.048 0.168 0.178 0.076 0.003 0.503 12 V 0.045 0.010 0.073 0.226 0.353 0.020 0.002 0.271 13 I 0.052 0.019 0.118 0.182 0.287 0.054 0.003 0.285 14 D 0.018 0.012 0.052 0.265 0.284 0.055 0.004 0.310 15 T 0.013 0.009 0.038 0.053 0.097 0.097 0.005 0.689 16 D 0.014 0.005 0.011 0.011 0.016 0.611 0.008 0.324 17 Q 0.343 0.007 0.007 0.006 0.007 0.369 0.074 0.186 18 L 0.349 0.063 0.051 0.028 0.024 0.149 0.034 0.302 19 E 0.033 0.023 0.039 0.057 0.079 0.243 0.007 0.519 20 W 0.024 0.009 0.026 0.028 0.098 0.028 0.004 0.783 21 R 0.080 0.013 0.069 0.146 0.243 0.112 0.006 0.330 22 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 23 S 0.034 0.004 0.048 0.097 0.213 0.136 0.003 0.465 24 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 25 M 0.050 0.008 0.026 0.051 0.108 0.237 0.007 0.512 26 K 0.198 0.002 0.007 0.006 0.009 0.087 0.008 0.684 27 G 0.157 0.014 0.022 0.020 0.032 0.200 0.020 0.534 28 V 0.265 0.027 0.060 0.075 0.074 0.116 0.014 0.370 29 E 0.029 0.053 0.074 0.131 0.188 0.165 0.004 0.357 30 R 0.019 0.033 0.029 0.131 0.326 0.039 0.003 0.421 31 R 0.029 0.088 0.069 0.190 0.330 0.078 0.004 0.212 32 M 0.046 0.105 0.038 0.106 0.176 0.073 0.008 0.447 33 L 0.042 0.210 0.069 0.144 0.320 0.033 0.007 0.175 34 D 0.055 0.154 0.045 0.094 0.192 0.044 0.011 0.406 35 R 0.144 0.156 0.035 0.066 0.124 0.068 0.028 0.380 36 I 0.155 0.154 0.042 0.034 0.063 0.125 0.038 0.389 37 G 0.059 0.040 0.013 0.012 0.019 0.073 0.020 0.764 38 G 0.082 0.047 0.039 0.023 0.033 0.101 0.020 0.655 39 E 0.110 0.047 0.039 0.030 0.030 0.203 0.013 0.530 40 V 0.066 0.083 0.032 0.045 0.065 0.084 0.008 0.616 41 A 0.057 0.144 0.057 0.079 0.156 0.069 0.007 0.431 42 R 0.047 0.162 0.052 0.101 0.161 0.053 0.007 0.417 43 A 0.056 0.217 0.046 0.166 0.298 0.034 0.011 0.172 44 T 0.047 0.219 0.057 0.217 0.308 0.024 0.011 0.117 45 S 0.029 0.111 0.053 0.367 0.359 0.016 0.008 0.057 46 I 0.021 0.087 0.069 0.341 0.365 0.018 0.007 0.093 47 V 0.007 0.030 0.038 0.460 0.414 0.009 0.002 0.040 48 R 0.011 0.020 0.043 0.303 0.482 0.015 0.003 0.124 49 Y 0.011 0.018 0.052 0.238 0.505 0.013 0.004 0.159 50 A 0.020 0.013 0.069 0.184 0.370 0.062 0.004 0.279 51 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.994 52 G 0.027 0.005 0.042 0.051 0.178 0.147 0.013 0.537 53 S 0.611 0.003 0.022 0.025 0.024 0.074 0.010 0.230 54 R 0.080 0.016 0.056 0.046 0.071 0.086 0.008 0.637 55 F 0.073 0.014 0.068 0.069 0.159 0.157 0.007 0.452 56 S 0.026 0.006 0.018 0.021 0.044 0.082 0.003 0.800 57 A 0.020 0.006 0.011 0.015 0.030 0.099 0.006 0.813 58 H 0.220 0.011 0.025 0.041 0.054 0.160 0.022 0.468 59 T 0.160 0.017 0.020 0.030 0.034 0.157 0.020 0.562 60 H 0.090 0.039 0.042 0.095 0.130 0.187 0.017 0.400 61 D 0.022 0.006 0.007 0.008 0.014 0.088 0.005 0.851 62 G 0.046 0.012 0.016 0.022 0.036 0.254 0.020 0.594 63 G 0.509 0.009 0.015 0.019 0.025 0.131 0.055 0.237 64 E 0.083 0.028 0.048 0.224 0.139 0.239 0.013 0.226 65 E 0.016 0.012 0.036 0.259 0.443 0.051 0.003 0.180 66 F 0.008 0.007 0.028 0.333 0.551 0.008 0.001 0.064 67 I 0.001 0.001 0.012 0.586 0.394 0.001 0.001 0.004 68 V 0.002 0.005 0.049 0.337 0.501 0.010 0.001 0.095 69 L 0.001 0.001 0.009 0.455 0.530 0.001 0.001 0.003 70 D 0.001 0.003 0.042 0.215 0.613 0.008 0.001 0.116 71 G 0.007 0.003 0.043 0.224 0.528 0.035 0.005 0.156 72 V 0.122 0.004 0.116 0.165 0.300 0.139 0.016 0.138 73 F 0.009 0.002 0.059 0.351 0.360 0.011 0.002 0.207 74 Q 0.005 0.003 0.095 0.239 0.445 0.080 0.002 0.132 75 D 0.015 0.004 0.058 0.245 0.297 0.062 0.002 0.317 76 E 0.015 0.007 0.046 0.110 0.254 0.184 0.006 0.376 77 H 0.044 0.008 0.018 0.056 0.063 0.332 0.014 0.464 78 G 0.236 0.011 0.021 0.038 0.049 0.097 0.062 0.484 79 D 0.127 0.016 0.042 0.039 0.052 0.263 0.017 0.445 80 Y 0.058 0.012 0.059 0.091 0.134 0.136 0.010 0.501 81 P 0.005 0.001 0.005 0.008 0.028 0.018 0.001 0.936 82 A 0.004 0.001 0.010 0.017 0.057 0.016 0.001 0.894 83 G 0.058 0.009 0.074 0.144 0.325 0.063 0.010 0.317 84 T 0.329 0.007 0.047 0.116 0.100 0.110 0.009 0.282 85 Y 0.021 0.011 0.075 0.216 0.202 0.029 0.003 0.443 86 V 0.012 0.006 0.056 0.334 0.453 0.046 0.002 0.091 87 R 0.024 0.010 0.078 0.220 0.333 0.041 0.003 0.291 88 N 0.020 0.011 0.094 0.171 0.400 0.055 0.004 0.246 89 P 0.001 0.001 0.001 0.002 0.007 0.002 0.001 0.987 90 P 0.001 0.001 0.003 0.004 0.021 0.008 0.001 0.962 91 T 0.111 0.002 0.021 0.035 0.072 0.130 0.011 0.617 92 T 0.446 0.004 0.035 0.031 0.030 0.072 0.012 0.371 93 S 0.041 0.004 0.030 0.019 0.027 0.084 0.004 0.790 94 H 0.055 0.005 0.044 0.031 0.090 0.138 0.007 0.630 95 V 0.150 0.006 0.062 0.049 0.069 0.200 0.007 0.457 96 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.996 97 G 0.029 0.004 0.027 0.041 0.115 0.164 0.004 0.616 98 S 0.195 0.007 0.022 0.055 0.074 0.107 0.008 0.531 99 A 0.072 0.010 0.015 0.025 0.042 0.084 0.009 0.743 100 E 0.024 0.003 0.006 0.007 0.010 0.228 0.005 0.716 101 G 0.146 0.005 0.008 0.007 0.014 0.171 0.026 0.624 102 C 0.206 0.040 0.058 0.143 0.158 0.091 0.020 0.284 103 T 0.022 0.023 0.074 0.330 0.310 0.095 0.003 0.143 104 I 0.012 0.014 0.042 0.293 0.457 0.020 0.001 0.160 105 F 0.002 0.013 0.030 0.329 0.610 0.004 0.001 0.011 106 V 0.003 0.019 0.047 0.377 0.520 0.006 0.001 0.027 107 K 0.004 0.027 0.073 0.269 0.531 0.007 0.002 0.086 108 L 0.007 0.017 0.048 0.224 0.625 0.010 0.002 0.067 109 W 0.015 0.016 0.030 0.261 0.496 0.023 0.006 0.153 110 Q 0.032 0.011 0.033 0.170 0.339 0.035 0.011 0.369 111 F 0.051 0.010 0.027 0.051 0.141 0.109 0.017 0.593 112 D 0.130 0.008 0.014 0.044 0.060 0.190 0.024 0.531 113 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 114 A 0.007 0.003 0.004 0.004 0.007 0.781 0.003 0.191 115 D 0.662 0.004 0.003 0.003 0.003 0.122 0.021 0.182 116 R 0.307 0.084 0.039 0.013 0.024 0.099 0.024 0.410 117 T 0.065 0.054 0.063 0.040 0.046 0.300 0.009 0.421 118 Q 0.040 0.017 0.017 0.016 0.040 0.044 0.004 0.823 119 F 0.081 0.080 0.049 0.081 0.176 0.158 0.010 0.365 120 S 0.115 0.093 0.053 0.116 0.149 0.104 0.012 0.358 121 K 0.090 0.134 0.071 0.079 0.112 0.094 0.013 0.409 122 N 0.090 0.078 0.039 0.067 0.091 0.128 0.018 0.489 123 M 0.087 0.073 0.038 0.041 0.063 0.097 0.015 0.586 124 E 0.032 0.047 0.016 0.019 0.030 0.375 0.010 0.472 125 A 0.126 0.068 0.017 0.023 0.031 0.285 0.024 0.427 126 E 0.264 0.143 0.044 0.021 0.028 0.101 0.043 0.356 127 L 0.194 0.122 0.068 0.053 0.054 0.109 0.032 0.368 128 G 0.073 0.049 0.059 0.032 0.065 0.040 0.014 0.668 129 A 0.086 0.024 0.109 0.111 0.150 0.082 0.007 0.432 130 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.993 131 V 0.038 0.011 0.064 0.079 0.151 0.130 0.005 0.523 132 E 0.028 0.003 0.014 0.008 0.013 0.040 0.003 0.892 133 G 0.149 0.009 0.025 0.016 0.033 0.133 0.028 0.607 134 I 0.589 0.007 0.042 0.021 0.019 0.073 0.019 0.230 135 S 0.028 0.014 0.062 0.054 0.062 0.169 0.004 0.605 136 T 0.026 0.014 0.049 0.085 0.206 0.091 0.004 0.525 137 S 0.059 0.031 0.086 0.106 0.179 0.138 0.004 0.396 138 L 0.044 0.039 0.042 0.085 0.130 0.135 0.005 0.521 139 L 0.074 0.119 0.069 0.111 0.259 0.110 0.010 0.248 140 H 0.095 0.118 0.050 0.127 0.237 0.076 0.011 0.285 141 E 0.058 0.079 0.021 0.035 0.064 0.090 0.016 0.637 142 D 0.100 0.062 0.024 0.031 0.058 0.103 0.030 0.592 143 E 0.101 0.037 0.014 0.013 0.019 0.130 0.025 0.661 144 R 0.068 0.061 0.020 0.027 0.030 0.401 0.026 0.368 145 E 0.224 0.063 0.022 0.020 0.024 0.157 0.032 0.459 146 T 0.113 0.141 0.082 0.065 0.064 0.130 0.019 0.387 147 V 0.085 0.108 0.111 0.146 0.171 0.071 0.012 0.296 148 T 0.026 0.100 0.091 0.331 0.324 0.033 0.004 0.092 149 H 0.023 0.082 0.062 0.197 0.347 0.028 0.006 0.255 150 R 0.033 0.063 0.071 0.337 0.356 0.032 0.007 0.100 151 K 0.039 0.034 0.086 0.191 0.275 0.036 0.009 0.331 152 L 0.024 0.026 0.107 0.210 0.365 0.030 0.007 0.230 153 E 0.022 0.012 0.101 0.144 0.242 0.110 0.005 0.363 154 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.994 155 G 0.029 0.005 0.046 0.037 0.129 0.159 0.010 0.585 156 A 0.481 0.005 0.028 0.031 0.030 0.092 0.011 0.323 157 N 0.102 0.023 0.054 0.051 0.077 0.086 0.011 0.597 158 L 0.101 0.023 0.086 0.108 0.175 0.114 0.008 0.385 159 T 0.039 0.020 0.037 0.049 0.069 0.211 0.006 0.569 160 S 0.058 0.028 0.034 0.080 0.124 0.131 0.009 0.537 161 E 0.091 0.033 0.039 0.041 0.070 0.187 0.014 0.524 162 A 0.121 0.066 0.035 0.069 0.080 0.219 0.020 0.389 163 A 0.099 0.072 0.029 0.039 0.061 0.122 0.020 0.558 164 G 0.074 0.040 0.026 0.028 0.044 0.121 0.020 0.647 165 G 0.254 0.018 0.041 0.033 0.046 0.106 0.051 0.451 166 I 0.202 0.019 0.090 0.152 0.112 0.100 0.020 0.304 167 E 0.023 0.009 0.094 0.251 0.293 0.079 0.005 0.247 168 V 0.014 0.005 0.093 0.221 0.394 0.018 0.002 0.254 169 L 0.004 0.001 0.091 0.480 0.394 0.007 0.001 0.022 170 V 0.004 0.002 0.174 0.298 0.335 0.019 0.001 0.169 171 L 0.001 0.001 0.073 0.473 0.435 0.005 0.001 0.011 172 D 0.001 0.001 0.078 0.128 0.351 0.017 0.001 0.423 173 G 0.006 0.001 0.068 0.187 0.476 0.058 0.004 0.201 174 D 0.141 0.001 0.085 0.111 0.178 0.247 0.015 0.222 175 V 0.014 0.001 0.043 0.246 0.220 0.013 0.002 0.461 176 T 0.004 0.001 0.060 0.263 0.464 0.084 0.001 0.123 177 V 0.012 0.002 0.052 0.257 0.324 0.053 0.001 0.299 178 N 0.008 0.003 0.045 0.140 0.368 0.091 0.004 0.341 179 D 0.035 0.002 0.016 0.047 0.082 0.135 0.008 0.675 180 E 0.188 0.007 0.041 0.124 0.115 0.244 0.024 0.257 181 V 0.055 0.007 0.025 0.072 0.102 0.167 0.006 0.566 182 L 0.018 0.008 0.045 0.221 0.398 0.055 0.003 0.252 183 G 0.014 0.007 0.033 0.122 0.309 0.088 0.002 0.423 184 R 0.017 0.006 0.022 0.056 0.135 0.053 0.003 0.709 185 N 0.036 0.014 0.041 0.088 0.215 0.090 0.014 0.502 186 A 0.250 0.012 0.025 0.104 0.116 0.188 0.031 0.274 187 W 0.100 0.033 0.066 0.192 0.181 0.090 0.016 0.322 188 L 0.023 0.017 0.061 0.366 0.396 0.053 0.004 0.081 189 R 0.026 0.013 0.053 0.241 0.414 0.043 0.003 0.206 190 L 0.018 0.013 0.054 0.271 0.460 0.042 0.003 0.139 191 P 0.001 0.001 0.003 0.008 0.026 0.006 0.001 0.956 192 E 0.003 0.001 0.006 0.014 0.046 0.052 0.001 0.875 193 G 0.118 0.004 0.016 0.021 0.043 0.176 0.022 0.599 194 E 0.431 0.012 0.018 0.031 0.031 0.148 0.021 0.308 195 A 0.045 0.019 0.029 0.017 0.028 0.146 0.007 0.710 196 L 0.076 0.027 0.064 0.146 0.264 0.124 0.007 0.293 197 S 0.061 0.040 0.080 0.085 0.152 0.098 0.005 0.477 198 A 0.032 0.055 0.067 0.143 0.202 0.053 0.004 0.444 199 T 0.041 0.137 0.076 0.122 0.224 0.149 0.008 0.244 200 A 0.110 0.154 0.065 0.091 0.149 0.113 0.017 0.301 201 G 0.131 0.115 0.058 0.056 0.132 0.082 0.039 0.387 202 A 0.121 0.060 0.055 0.048 0.068 0.112 0.024 0.513 203 R 0.029 0.031 0.022 0.026 0.039 0.077 0.016 0.759 204 G 0.116 0.039 0.037 0.036 0.076 0.129 0.049 0.519 205 A 0.241 0.037 0.076 0.172 0.149 0.076 0.025 0.223 206 K 0.025 0.034 0.060 0.368 0.282 0.060 0.006 0.165 207 I 0.008 0.010 0.027 0.510 0.396 0.010 0.001 0.037 208 W 0.003 0.020 0.055 0.351 0.542 0.004 0.001 0.023 209 M 0.003 0.015 0.039 0.358 0.548 0.004 0.001 0.032 210 K 0.004 0.023 0.040 0.278 0.548 0.013 0.002 0.091 211 T 0.014 0.025 0.047 0.154 0.412 0.037 0.007 0.305 212 G 0.055 0.016 0.054 0.081 0.240 0.095 0.031 0.428 213 H 0.165 0.013 0.077 0.054 0.069 0.193 0.020 0.409 214 L 0.022 0.015 0.054 0.040 0.054 0.071 0.005 0.739 215 R 0.054 0.022 0.051 0.058 0.144 0.145 0.008 0.518 216 F 0.121 0.027 0.056 0.031 0.062 0.076 0.009 0.618 217 V 0.147 0.042 0.111 0.091 0.121 0.075 0.011 0.402 218 R 0.039 0.023 0.040 0.032 0.057 0.056 0.007 0.746 219 T 0.065 0.019 0.052 0.030 0.062 0.116 0.010 0.645 220 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 221 E 0.037 0.006 0.033 0.025 0.049 0.221 0.007 0.621 222 V 0.287 0.012 0.052 0.040 0.041 0.071 0.005 0.492