This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 1 NATAA M A 2 2 NATAA E A 3 3 NATAA I A 4 4 NATAA N A 5 5 NATAA A A 6 6 NATAA D A 7 7 NATAA F A 8 8 NATAA T A 9 9 NATAA K A 10 10 NATRO P A 11 11 NATAA V A 12 12 NATAA V A 13 13 NATAA I A 14 14 NATAA D A 15 15 NATAA T A 16 16 NATAA D A 17 17 NATAA Q A 18 18 NATAA L A 19 19 NATAA E A 20 20 NATAA W A 21 21 NATAA R A 22 22 NATRO P A 23 23 NATAA S A 24 24 NATRO P A 25 25 NATAA M A 26 26 NATAA K A 27 27 NATAA G A 28 28 NATAA V A 29 29 NATAA E A 30 30 NATAA R A 31 31 NATAA R A 32 32 NATAA M A 33 33 NATAA L A 34 34 NATAA D A 35 35 NATAA R A 36 36 NATAA I A 37 37 NATAA G A 38 38 NATAA G A 39 39 NATAA E A 40 40 NATAA V A 41 41 NATAA A A 42 42 NATAA R A 43 43 NATAA A A 44 44 NATAA T A 45 45 NATAA S A 46 46 NATAA I A 47 47 NATAA V A 48 48 NATAA R A 49 49 NATAA Y A 50 50 NATAA A A 51 51 NATRO P A 52 52 NATAA G A 53 53 NATAA S A 54 54 NATAA R A 55 55 NATAA F A 56 56 NATAA S A 57 57 NATAA A A 58 58 NATAA H A 59 59 NATAA T A 60 60 NATAA H A 61 61 NATAA D A 62 62 NATAA G A 63 63 NATAA G A 64 64 NATAA E A 65 65 NATAA E A 66 66 NATAA F A 67 67 NATAA I A 68 68 NATAA V A 69 69 NATAA L A 70 70 NATAA D A 71 71 NATAA G A 72 72 NATAA V A 73 73 NATAA F A 74 74 NATAA Q A 75 75 NATAA D A 76 76 NATAA E A 77 77 NATAA H A 78 78 NATAA G A 79 79 NATAA D A 80 80 NATAA Y A 81 81 NATRO P A 82 82 NATAA A A 83 83 NATAA G A 84 84 NATAA T A 85 85 NATAA Y A 86 86 NATAA V A 87 87 NATAA R A 88 88 NATAA N A 89 89 NATRO P A 90 90 NATRO P A 91 91 NATAA T A 92 92 NATAA T A 93 93 NATAA S A 94 94 NATAA H A 95 95 NATAA V A 96 96 NATRO P A 97 97 NATAA G A 98 98 NATAA S A 99 99 NATAA A A 100 100 NATAA E A 101 101 NATAA G A 102 102 NATRO C A 103 103 NATAA T A 104 104 NATAA I A 105 105 NATAA F A 106 106 NATAA V A 107 107 NATAA K A 108 108 NATAA L A 109 109 NATAA W A 110 110 NATAA Q A 111 111 NATAA F A 112 112 NATAA D A 113 113 NATRO P A 114 114 NATAA A A 115 115 NATAA D A 116 116 NATAA R A 117 117 NATAA T A 118 118 NATAA Q A 119 119 NATAA F A 120 120 NATAA S A 121 121 NATAA K A 122 122 NATAA N A 123 123 NATAA M A 124 124 NATAA E A 125 125 NATAA A A 126 126 NATAA E A 127 127 NATAA L A 128 128 NATAA G A 129 129 NATAA A A 130 130 NATRO P A 131 131 NATAA V A 132 132 NATAA E A 133 133 NATAA G A 134 134 NATAA I A 135 135 NATAA S A 136 136 NATAA T A 137 137 NATAA S A 138 138 NATAA L A 139 139 NATAA L A 140 140 NATAA H A 141 141 NATAA E A 142 142 NATAA D A 143 143 NATAA E A 144 144 NATAA R A 145 145 NATAA E A 146 146 NATAA T A 147 147 NATAA V A 148 148 NATAA T A 149 149 NATAA H A 150 150 NATAA R A 151 151 NATAA K A 152 152 NATAA L A 153 153 NATAA E A 154 154 NATRO P A 155 155 NATAA G A 156 156 NATAA A A 157 157 NATAA N A 158 158 NATAA L A 159 159 NATAA T A 160 160 NATAA S A 161 161 NATAA E A 162 162 NATAA A A 163 163 NATAA A A 164 164 NATAA G A 165 165 NATAA G A 166 166 NATAA I A 167 167 NATAA E A 168 168 NATAA V A 169 169 NATAA L A 170 170 NATAA V A 171 171 NATAA L A 172 172 NATAA D A 173 173 NATAA G A 174 174 NATAA D A 175 175 NATAA V A 176 176 NATAA T A 177 177 NATAA V A 178 178 NATAA N A 179 179 NATAA D A 180 180 NATAA E A 181 181 NATAA V A 182 182 NATAA L A 183 183 NATAA G A 184 184 NATAA R A 185 185 NATAA N A 186 186 NATAA A A 187 187 NATAA W A 188 188 NATAA L A 189 189 NATAA R A 190 190 NATAA L A 191 191 NATRO P A 192 192 NATAA E A 193 193 NATAA G A 194 194 NATAA E A 195 195 NATAA A A 196 196 NATAA L A 197 197 NATAA S A 198 198 NATAA A A 199 199 NATAA T A 200 200 NATAA A A 201 201 NATAA G A 202 202 NATAA A A 203 203 NATAA R A 204 204 NATAA G A 205 205 NATAA A A 206 206 NATAA K A 207 207 NATAA I A 208 208 NATAA W A 209 209 NATAA M A 210 210 NATAA K A 211 211 NATAA T A 212 212 NATAA G A 213 213 NATAA H A 214 214 NATAA L A 215 215 NATAA R A 216 216 NATAA F A 217 217 NATAA V A 218 218 NATAA R A 219 219 NATAA T A 220 220 NATRO P A 221 221 NATAA E A 222 222 NATAA V