# TARGET T0582 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0582.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 396 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.096 0.007 0.009 0.013 0.160 0.715 2 E 0.288 0.066 0.011 0.013 0.126 0.496 3 I 0.401 0.065 0.007 0.010 0.113 0.404 4 N 0.267 0.038 0.018 0.014 0.379 0.285 5 A 0.126 0.032 0.018 0.021 0.496 0.307 6 D 0.042 0.016 0.012 0.011 0.802 0.117 7 F 0.013 0.008 0.057 0.032 0.832 0.058 8 T 0.038 0.007 0.059 0.023 0.721 0.151 9 K 0.145 0.019 0.150 0.029 0.553 0.103 10 P 0.363 0.014 0.047 0.030 0.190 0.355 11 V 0.743 0.026 0.022 0.017 0.080 0.112 12 V 0.762 0.020 0.014 0.011 0.081 0.112 13 I 0.643 0.044 0.007 0.008 0.085 0.212 14 D 0.284 0.024 0.028 0.018 0.324 0.323 15 T 0.021 0.001 0.577 0.024 0.328 0.048 16 D 0.015 0.002 0.525 0.018 0.381 0.058 17 Q 0.036 0.011 0.520 0.020 0.356 0.057 18 L 0.122 0.012 0.081 0.025 0.456 0.304 19 E 0.151 0.007 0.030 0.014 0.281 0.517 20 W 0.554 0.023 0.026 0.016 0.157 0.224 21 R 0.682 0.014 0.013 0.014 0.103 0.175 22 P 0.634 0.026 0.009 0.010 0.081 0.240 23 S 0.345 0.012 0.009 0.007 0.164 0.463 24 P 0.152 0.022 0.009 0.009 0.212 0.596 25 M 0.073 0.026 0.011 0.019 0.451 0.419 26 K 0.064 0.005 0.017 0.030 0.489 0.394 27 G 0.204 0.024 0.030 0.052 0.420 0.270 28 V 0.492 0.019 0.025 0.084 0.206 0.174 29 E 0.737 0.026 0.016 0.070 0.059 0.093 30 R 0.664 0.016 0.018 0.084 0.066 0.151 31 R 0.641 0.017 0.026 0.096 0.098 0.121 32 M 0.531 0.014 0.052 0.131 0.143 0.129 33 L 0.420 0.011 0.072 0.109 0.254 0.134 34 D 0.462 0.021 0.048 0.080 0.259 0.130 35 R 0.329 0.022 0.029 0.064 0.386 0.170 36 I 0.179 0.025 0.022 0.061 0.467 0.246 37 G 0.073 0.009 0.022 0.042 0.579 0.275 38 G 0.044 0.008 0.070 0.086 0.606 0.186 39 E 0.083 0.017 0.098 0.120 0.494 0.189 40 V 0.144 0.019 0.089 0.074 0.482 0.192 41 A 0.222 0.012 0.032 0.021 0.373 0.340 42 R 0.520 0.017 0.012 0.007 0.161 0.284 43 A 0.857 0.008 0.003 0.002 0.039 0.091 44 T 0.938 0.001 0.002 0.001 0.015 0.044 45 S 0.980 0.001 0.001 0.001 0.006 0.012 46 I 0.982 0.001 0.001 0.001 0.005 0.011 47 V 0.974 0.001 0.001 0.001 0.006 0.017 48 R 0.955 0.003 0.001 0.001 0.011 0.030 49 Y 0.738 0.028 0.002 0.002 0.062 0.168 50 A 0.184 0.028 0.006 0.002 0.719 0.061 51 P 0.024 0.003 0.013 0.002 0.909 0.049 52 G 0.020 0.004 0.009 0.001 0.923 0.043 53 S 0.166 0.062 0.009 0.003 0.689 0.073 54 R 0.357 0.055 0.005 0.006 0.200 0.376 55 F 0.437 0.144 0.011 0.006 0.180 0.221 56 S 0.245 0.031 0.018 0.007 0.411 0.288 57 A 0.180 0.011 0.086 0.012 0.428 0.283 58 H 0.200 0.030 0.068 0.009 0.408 0.284 59 T 0.229 0.032 0.049 0.007 0.437 0.247 60 H 0.083 0.023 0.018 0.007 0.636 0.233 61 D 0.031 0.018 0.018 0.006 0.743 0.184 62 G 0.053 0.005 0.023 0.007 0.813 0.099 63 G 0.207 0.009 0.019 0.006 0.604 0.156 64 E 0.769 0.013 0.004 0.002 0.100 0.113 65 E 0.947 0.004 0.001 0.001 0.012 0.036 66 F 0.984 0.001 0.001 0.001 0.002 0.012 67 I 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 68 V 0.991 0.001 0.001 0.001 0.002 0.006 69 L 0.979 0.001 0.001 0.001 0.005 0.016 70 D 0.952 0.001 0.001 0.001 0.013 0.033 71 G 0.874 0.003 0.001 0.001 0.034 0.088 72 V 0.894 0.005 0.001 0.001 0.037 0.062 73 F 0.884 0.010 0.002 0.002 0.040 0.062 74 Q 0.860 0.021 0.003 0.003 0.046 0.067 75 D 0.569 0.013 0.021 0.013 0.290 0.094 76 E 0.121 0.004 0.060 0.039 0.606 0.170 77 H 0.055 0.007 0.034 0.021 0.673 0.211 78 G 0.072 0.012 0.025 0.020 0.590 0.281 79 D 0.197 0.029 0.007 0.010 0.192 0.565 80 Y 0.375 0.102 0.009 0.010 0.166 0.338 81 P 0.298 0.033 0.012 0.007 0.441 0.210 82 A 0.328 0.026 0.016 0.006 0.457 0.168 83 G 0.237 0.006 0.020 0.006 0.555 0.176 84 T 0.718 0.010 0.010 0.003 0.192 0.067 85 Y 0.810 0.028 0.008 0.004 0.059 0.091 86 V 0.778 0.022 0.013 0.007 0.072 0.108 87 R 0.763 0.032 0.009 0.005 0.071 0.120 88 N 0.370 0.050 0.007 0.004 0.235 0.334 89 P 0.080 0.018 0.007 0.002 0.810 0.084 90 P 0.022 0.005 0.013 0.003 0.894 0.062 91 T 0.023 0.016 0.019 0.002 0.866 0.074 92 T 0.102 0.109 0.013 0.002 0.664 0.111 93 S 0.180 0.011 0.010 0.002 0.236 0.561 94 H 0.480 0.074 0.021 0.004 0.184 0.238 95 V 0.524 0.046 0.013 0.003 0.179 0.235 96 P 0.598 0.019 0.020 0.004 0.143 0.218 97 G 0.629 0.040 0.021 0.003 0.149 0.158 98 S 0.449 0.040 0.027 0.007 0.356 0.121 99 A 0.047 0.008 0.047 0.017 0.862 0.019 100 E 0.011 0.002 0.049 0.011 0.918 0.009 101 G 0.030 0.002 0.018 0.005 0.931 0.015 102 C 0.495 0.007 0.003 0.004 0.387 0.104 103 T 0.942 0.005 0.001 0.001 0.008 0.044 104 I 0.991 0.002 0.001 0.001 0.001 0.005 105 F 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 106 V 0.989 0.001 0.001 0.001 0.003 0.006 107 K 0.963 0.001 0.002 0.003 0.011 0.021 108 L 0.909 0.002 0.006 0.007 0.034 0.043 109 W 0.842 0.004 0.014 0.015 0.064 0.062 110 Q 0.712 0.020 0.022 0.022 0.127 0.098 111 F 0.361 0.036 0.019 0.024 0.261 0.299 112 D 0.063 0.009 0.011 0.010 0.512 0.395 113 P 0.014 0.003 0.162 0.052 0.653 0.115 114 A 0.012 0.004 0.220 0.061 0.626 0.077 115 D 0.036 0.009 0.300 0.091 0.471 0.093 116 R 0.163 0.020 0.141 0.086 0.319 0.270 117 T 0.290 0.018 0.086 0.089 0.225 0.292 118 Q 0.432 0.015 0.048 0.057 0.166 0.282 119 F 0.534 0.018 0.017 0.050 0.099 0.283 120 S 0.594 0.018 0.013 0.045 0.081 0.249 121 K 0.637 0.016 0.021 0.056 0.085 0.185 122 N 0.411 0.017 0.036 0.059 0.263 0.214 123 M 0.219 0.016 0.069 0.104 0.400 0.192 124 E 0.127 0.014 0.054 0.082 0.480 0.243 125 A 0.107 0.023 0.047 0.047 0.571 0.205 126 E 0.090 0.016 0.114 0.093 0.458 0.229 127 L 0.112 0.034 0.156 0.095 0.390 0.214 128 G 0.149 0.029 0.162 0.076 0.376 0.209 129 A 0.157 0.045 0.062 0.070 0.309 0.357 130 P 0.102 0.029 0.031 0.049 0.314 0.475 131 V 0.068 0.032 0.026 0.054 0.609 0.212 132 E 0.054 0.005 0.025 0.034 0.647 0.235 133 G 0.119 0.008 0.035 0.034 0.647 0.156 134 I 0.482 0.013 0.015 0.031 0.268 0.190 135 S 0.817 0.019 0.004 0.014 0.043 0.102 136 T 0.847 0.014 0.002 0.011 0.029 0.097 137 S 0.801 0.008 0.004 0.012 0.047 0.129 138 L 0.645 0.021 0.012 0.019 0.093 0.211 139 L 0.442 0.016 0.050 0.031 0.209 0.252 140 H 0.298 0.033 0.072 0.037 0.434 0.125 141 E 0.112 0.014 0.081 0.039 0.617 0.138 142 D 0.037 0.009 0.046 0.015 0.850 0.043 143 E 0.023 0.007 0.055 0.015 0.846 0.053 144 R 0.081 0.008 0.030 0.009 0.701 0.170 145 E 0.469 0.018 0.012 0.006 0.347 0.149 146 T 0.792 0.012 0.002 0.002 0.059 0.133 147 V 0.949 0.004 0.001 0.001 0.012 0.034 148 T 0.975 0.001 0.001 0.001 0.008 0.014 149 H 0.972 0.002 0.001 0.001 0.006 0.018 150 R 0.951 0.001 0.002 0.002 0.014 0.029 151 K 0.887 0.009 0.002 0.001 0.026 0.075 152 L 0.550 0.028 0.003 0.003 0.146 0.270 153 E 0.173 0.019 0.007 0.002 0.714 0.085 154 P 0.059 0.006 0.013 0.002 0.855 0.065 155 G 0.053 0.003 0.012 0.003 0.866 0.063 156 A 0.499 0.029 0.007 0.004 0.380 0.080 157 N 0.673 0.035 0.003 0.005 0.077 0.207 158 L 0.671 0.047 0.006 0.008 0.094 0.173 159 T 0.480 0.021 0.013 0.010 0.184 0.291 160 S 0.370 0.029 0.030 0.014 0.250 0.306 161 E 0.282 0.030 0.023 0.010 0.289 0.367 162 A 0.142 0.033 0.021 0.020 0.534 0.251 163 A 0.061 0.027 0.030 0.044 0.683 0.155 164 G 0.062 0.006 0.015 0.017 0.730 0.169 165 G 0.210 0.008 0.016 0.013 0.613 0.140 166 I 0.749 0.011 0.003 0.004 0.117 0.117 167 E 0.955 0.007 0.001 0.001 0.011 0.026 168 V 0.982 0.001 0.001 0.001 0.003 0.014 169 L 0.991 0.001 0.001 0.001 0.002 0.007 170 V 0.991 0.001 0.001 0.001 0.002 0.006 171 L 0.972 0.001 0.001 0.001 0.006 0.021 172 D 0.947 0.001 0.001 0.001 0.016 0.035 173 G 0.910 0.003 0.001 0.001 0.026 0.059 174 D 0.948 0.004 0.001 0.001 0.021 0.025 175 V 0.923 0.005 0.001 0.001 0.034 0.036 176 T 0.896 0.013 0.001 0.001 0.049 0.040 177 V 0.602 0.012 0.007 0.005 0.323 0.052 178 N 0.079 0.001 0.021 0.013 0.828 0.059 179 D 0.067 0.005 0.019 0.009 0.829 0.071 180 E 0.356 0.044 0.016 0.014 0.430 0.139 181 V 0.608 0.057 0.004 0.007 0.101 0.223 182 L 0.538 0.083 0.004 0.006 0.120 0.250 183 G 0.223 0.036 0.009 0.004 0.657 0.071 184 R 0.118 0.011 0.015 0.002 0.803 0.051 185 N 0.082 0.001 0.009 0.001 0.843 0.064 186 A 0.723 0.006 0.003 0.001 0.226 0.041 187 W 0.887 0.030 0.001 0.001 0.019 0.062 188 L 0.878 0.018 0.002 0.001 0.023 0.079 189 R 0.825 0.016 0.002 0.001 0.031 0.125 190 L 0.474 0.029 0.003 0.001 0.122 0.371 191 P 0.184 0.031 0.003 0.001 0.660 0.121 192 E 0.039 0.021 0.003 0.001 0.803 0.132 193 G 0.022 0.019 0.006 0.002 0.843 0.108 194 E 0.068 0.047 0.005 0.001 0.793 0.084 195 A 0.227 0.036 0.010 0.007 0.489 0.231 196 L 0.270 0.025 0.018 0.008 0.522 0.158 197 S 0.532 0.033 0.021 0.005 0.277 0.131 198 A 0.772 0.029 0.016 0.004 0.077 0.102 199 T 0.789 0.024 0.024 0.003 0.089 0.072 200 A 0.825 0.033 0.011 0.002 0.060 0.070 201 G 0.440 0.040 0.016 0.004 0.387 0.113 202 A 0.015 0.004 0.076 0.009 0.887 0.010 203 R 0.009 0.001 0.076 0.006 0.900 0.008 204 G 0.046 0.007 0.029 0.002 0.900 0.016 205 A 0.530 0.016 0.002 0.001 0.265 0.187 206 K 0.933 0.004 0.001 0.001 0.010 0.052 207 I 0.992 0.002 0.001 0.001 0.002 0.004 208 W 0.991 0.001 0.001 0.001 0.003 0.005 209 M 0.974 0.003 0.001 0.001 0.010 0.012 210 K 0.747 0.002 0.003 0.003 0.069 0.175 211 T 0.444 0.004 0.010 0.004 0.238 0.300 212 G 0.267 0.022 0.020 0.004 0.319 0.367 213 H 0.155 0.062 0.032 0.006 0.358 0.388 214 L 0.069 0.035 0.097 0.007 0.598 0.195 215 R 0.042 0.007 0.079 0.007 0.524 0.341 216 F 0.049 0.009 0.175 0.017 0.545 0.205 217 V 0.066 0.021 0.037 0.009 0.616 0.252 218 R 0.085 0.031 0.018 0.008 0.334 0.525 219 T 0.065 0.018 0.021 0.009 0.491 0.396 220 P 0.038 0.018 0.116 0.036 0.438 0.354 221 E 0.042 0.028 0.105 0.043 0.295 0.486 222 V 0.006 0.006 0.035 0.020 0.194 0.739