# TARGET T0582 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0582.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 396 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 2 E 0.116 0.046 0.005 0.017 0.005 0.018 0.792 3 I 0.139 0.057 0.010 0.021 0.132 0.025 0.616 4 N 0.105 0.015 0.010 0.016 0.083 0.035 0.735 5 A 0.060 0.014 0.015 0.019 0.194 0.072 0.626 6 D 0.045 0.029 0.024 0.013 0.159 0.115 0.615 7 F 0.024 0.011 0.180 0.046 0.193 0.318 0.227 8 T 0.028 0.008 0.237 0.036 0.203 0.346 0.143 9 K 0.047 0.010 0.215 0.038 0.226 0.257 0.207 10 P 0.205 0.017 0.044 0.031 0.133 0.093 0.478 11 V 0.626 0.024 0.015 0.020 0.085 0.028 0.202 12 V 0.884 0.015 0.003 0.006 0.010 0.008 0.074 13 I 0.892 0.011 0.002 0.005 0.012 0.004 0.075 14 D 0.700 0.015 0.001 0.003 0.013 0.004 0.263 15 T 0.101 0.006 0.287 0.066 0.050 0.311 0.179 16 D 0.011 0.001 0.258 0.023 0.092 0.583 0.032 17 Q 0.020 0.004 0.395 0.036 0.113 0.363 0.069 18 L 0.089 0.024 0.050 0.041 0.228 0.056 0.511 19 E 0.202 0.021 0.018 0.019 0.135 0.071 0.535 20 W 0.472 0.075 0.020 0.021 0.060 0.035 0.318 21 R 0.486 0.024 0.023 0.025 0.092 0.022 0.328 22 P 0.403 0.025 0.018 0.015 0.132 0.026 0.381 23 S 0.185 0.020 0.013 0.012 0.149 0.042 0.579 24 P 0.067 0.023 0.015 0.009 0.236 0.110 0.540 25 M 0.039 0.009 0.027 0.017 0.320 0.130 0.458 26 K 0.041 0.012 0.055 0.028 0.263 0.245 0.356 27 G 0.111 0.010 0.058 0.050 0.209 0.174 0.386 28 V 0.397 0.033 0.032 0.074 0.099 0.035 0.330 29 E 0.622 0.041 0.012 0.072 0.037 0.013 0.202 30 R 0.595 0.017 0.024 0.083 0.032 0.015 0.233 31 R 0.558 0.014 0.043 0.105 0.041 0.021 0.218 32 M 0.510 0.014 0.078 0.128 0.042 0.036 0.193 33 L 0.415 0.018 0.106 0.126 0.056 0.049 0.230 34 D 0.373 0.019 0.070 0.118 0.115 0.066 0.239 35 R 0.193 0.013 0.054 0.132 0.168 0.120 0.320 36 I 0.068 0.009 0.027 0.092 0.241 0.242 0.322 37 G 0.023 0.006 0.026 0.043 0.266 0.342 0.294 38 G 0.033 0.007 0.038 0.048 0.334 0.181 0.359 39 E 0.068 0.012 0.062 0.074 0.277 0.220 0.287 40 V 0.177 0.017 0.042 0.061 0.207 0.120 0.376 41 A 0.350 0.015 0.021 0.030 0.123 0.053 0.408 42 R 0.604 0.017 0.015 0.014 0.079 0.012 0.260 43 A 0.824 0.011 0.010 0.006 0.020 0.004 0.125 44 T 0.924 0.004 0.007 0.003 0.009 0.002 0.051 45 S 0.971 0.001 0.002 0.001 0.004 0.001 0.019 46 I 0.983 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.012 47 V 0.976 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.018 48 R 0.942 0.003 0.001 0.001 0.007 0.001 0.045 49 Y 0.788 0.053 0.001 0.001 0.018 0.003 0.136 50 A 0.337 0.016 0.006 0.001 0.044 0.020 0.577 51 P 0.012 0.003 0.011 0.001 0.085 0.857 0.032 52 G 0.006 0.004 0.011 0.001 0.137 0.803 0.038 53 S 0.047 0.024 0.005 0.001 0.304 0.044 0.575 54 R 0.136 0.091 0.003 0.001 0.150 0.038 0.580 55 F 0.241 0.071 0.003 0.002 0.183 0.019 0.481 56 S 0.265 0.035 0.007 0.003 0.116 0.028 0.547 57 A 0.393 0.040 0.013 0.005 0.125 0.062 0.363 58 H 0.343 0.045 0.022 0.007 0.157 0.084 0.343 59 T 0.232 0.094 0.014 0.006 0.191 0.051 0.412 60 H 0.102 0.025 0.015 0.003 0.194 0.080 0.582 61 D 0.030 0.008 0.030 0.002 0.296 0.457 0.176 62 G 0.044 0.009 0.031 0.002 0.271 0.467 0.176 63 G 0.224 0.014 0.025 0.003 0.247 0.090 0.397 64 E 0.582 0.019 0.009 0.002 0.117 0.014 0.257 65 E 0.894 0.012 0.004 0.001 0.018 0.002 0.069 66 F 0.972 0.002 0.002 0.001 0.003 0.001 0.020 67 I 0.983 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.012 68 V 0.986 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.010 69 L 0.964 0.004 0.001 0.001 0.002 0.001 0.029 70 D 0.848 0.002 0.001 0.001 0.029 0.011 0.108 71 G 0.651 0.004 0.005 0.002 0.117 0.042 0.180 72 V 0.719 0.025 0.003 0.002 0.064 0.010 0.177 73 F 0.641 0.034 0.005 0.005 0.047 0.011 0.256 74 Q 0.372 0.058 0.012 0.012 0.108 0.036 0.402 75 D 0.169 0.015 0.034 0.020 0.130 0.199 0.433 76 E 0.043 0.004 0.035 0.018 0.171 0.630 0.099 77 H 0.048 0.008 0.047 0.012 0.259 0.481 0.146 78 G 0.063 0.006 0.013 0.003 0.467 0.096 0.352 79 D 0.180 0.063 0.010 0.002 0.208 0.038 0.499 80 Y 0.224 0.192 0.005 0.003 0.112 0.011 0.454 81 P 0.069 0.015 0.006 0.002 0.061 0.017 0.830 82 A 0.049 0.009 0.044 0.007 0.245 0.521 0.126 83 G 0.119 0.014 0.056 0.010 0.244 0.431 0.127 84 T 0.454 0.019 0.034 0.007 0.061 0.029 0.395 85 Y 0.849 0.012 0.007 0.003 0.019 0.009 0.100 86 V 0.891 0.015 0.005 0.002 0.016 0.006 0.066 87 R 0.846 0.016 0.005 0.002 0.025 0.008 0.099 88 N 0.532 0.075 0.003 0.002 0.061 0.008 0.319 89 P 0.113 0.011 0.007 0.001 0.053 0.020 0.796 90 P 0.011 0.003 0.021 0.001 0.147 0.770 0.046 91 T 0.013 0.007 0.032 0.002 0.191 0.689 0.067 92 T 0.075 0.024 0.020 0.003 0.284 0.046 0.547 93 S 0.225 0.077 0.012 0.004 0.137 0.062 0.483 94 H 0.328 0.074 0.017 0.005 0.114 0.055 0.407 95 V 0.309 0.041 0.017 0.005 0.121 0.029 0.477 96 P 0.382 0.024 0.013 0.007 0.141 0.038 0.395 97 G 0.279 0.057 0.019 0.014 0.116 0.068 0.447 98 S 0.122 0.034 0.014 0.015 0.119 0.062 0.632 99 A 0.059 0.013 0.035 0.019 0.206 0.258 0.411 100 E 0.011 0.003 0.025 0.019 0.164 0.731 0.048 101 G 0.040 0.003 0.016 0.021 0.255 0.545 0.120 102 C 0.319 0.019 0.004 0.026 0.097 0.017 0.517 103 T 0.772 0.023 0.002 0.019 0.017 0.004 0.163 104 I 0.895 0.007 0.004 0.025 0.014 0.003 0.053 105 F 0.936 0.003 0.005 0.025 0.005 0.002 0.024 106 V 0.919 0.001 0.008 0.040 0.005 0.003 0.023 107 K 0.892 0.002 0.012 0.052 0.007 0.005 0.029 108 L 0.793 0.004 0.021 0.097 0.016 0.012 0.057 109 W 0.695 0.006 0.029 0.124 0.041 0.029 0.076 110 Q 0.443 0.009 0.034 0.150 0.098 0.084 0.181 111 F 0.139 0.021 0.019 0.082 0.276 0.083 0.380 112 D 0.047 0.013 0.013 0.021 0.184 0.052 0.670 113 P 0.020 0.006 0.164 0.071 0.146 0.422 0.171 114 A 0.019 0.006 0.239 0.054 0.167 0.377 0.139 115 D 0.037 0.011 0.241 0.051 0.188 0.191 0.282 116 R 0.104 0.015 0.131 0.091 0.176 0.198 0.286 117 T 0.161 0.014 0.073 0.077 0.198 0.146 0.331 118 Q 0.300 0.017 0.042 0.065 0.125 0.088 0.363 119 F 0.510 0.029 0.018 0.062 0.056 0.023 0.301 120 S 0.595 0.026 0.011 0.054 0.041 0.012 0.260 121 K 0.461 0.030 0.024 0.077 0.046 0.028 0.334 122 N 0.299 0.036 0.036 0.080 0.075 0.071 0.404 123 M 0.169 0.016 0.065 0.097 0.129 0.187 0.338 124 E 0.094 0.014 0.055 0.070 0.275 0.191 0.301 125 A 0.060 0.015 0.043 0.050 0.358 0.073 0.401 126 E 0.043 0.013 0.155 0.112 0.171 0.168 0.339 127 L 0.049 0.017 0.185 0.124 0.099 0.271 0.255 128 G 0.051 0.018 0.179 0.100 0.116 0.193 0.344 129 A 0.080 0.022 0.072 0.097 0.191 0.104 0.434 130 P 0.090 0.032 0.052 0.061 0.163 0.105 0.497 131 V 0.071 0.021 0.059 0.046 0.209 0.151 0.443 132 E 0.070 0.012 0.062 0.031 0.175 0.338 0.312 133 G 0.153 0.008 0.079 0.037 0.195 0.240 0.288 134 I 0.467 0.018 0.037 0.035 0.110 0.043 0.290 135 S 0.695 0.022 0.018 0.025 0.048 0.015 0.177 136 T 0.792 0.015 0.011 0.021 0.023 0.010 0.127 137 S 0.715 0.012 0.016 0.023 0.027 0.010 0.197 138 L 0.667 0.017 0.031 0.028 0.029 0.018 0.210 139 L 0.586 0.016 0.034 0.030 0.051 0.039 0.244 140 H 0.382 0.032 0.055 0.030 0.113 0.081 0.308 141 E 0.156 0.011 0.041 0.024 0.258 0.157 0.353 142 D 0.059 0.008 0.040 0.012 0.335 0.194 0.353 143 E 0.054 0.007 0.034 0.014 0.345 0.307 0.240 144 R 0.121 0.006 0.019 0.009 0.296 0.211 0.338 145 E 0.418 0.011 0.009 0.008 0.217 0.012 0.325 146 T 0.820 0.022 0.003 0.004 0.015 0.004 0.132 147 V 0.922 0.003 0.004 0.004 0.007 0.003 0.057 148 T 0.959 0.001 0.003 0.003 0.004 0.002 0.027 149 H 0.956 0.002 0.002 0.002 0.003 0.001 0.034 150 R 0.949 0.001 0.002 0.001 0.006 0.001 0.041 151 K 0.908 0.007 0.002 0.001 0.011 0.002 0.068 152 L 0.686 0.043 0.004 0.002 0.041 0.005 0.218 153 E 0.241 0.006 0.014 0.001 0.052 0.025 0.661 154 P 0.012 0.002 0.024 0.001 0.086 0.849 0.027 155 G 0.017 0.002 0.027 0.001 0.130 0.778 0.044 156 A 0.199 0.015 0.010 0.002 0.264 0.025 0.485 157 N 0.603 0.055 0.003 0.002 0.033 0.010 0.295 158 L 0.618 0.027 0.005 0.003 0.035 0.010 0.303 159 T 0.601 0.013 0.009 0.003 0.044 0.016 0.315 160 S 0.624 0.015 0.012 0.004 0.080 0.024 0.241 161 E 0.549 0.039 0.019 0.005 0.095 0.034 0.258 162 A 0.263 0.024 0.027 0.004 0.123 0.061 0.497 163 A 0.116 0.011 0.037 0.003 0.294 0.267 0.272 164 G 0.065 0.004 0.021 0.002 0.278 0.522 0.107 165 G 0.214 0.006 0.013 0.002 0.314 0.154 0.297 166 I 0.567 0.015 0.004 0.001 0.109 0.009 0.296 167 E 0.917 0.017 0.001 0.001 0.008 0.001 0.055 168 V 0.969 0.002 0.001 0.001 0.004 0.001 0.024 169 L 0.982 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.013 170 V 0.989 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 171 L 0.980 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.016 172 D 0.917 0.001 0.001 0.001 0.018 0.007 0.056 173 G 0.804 0.002 0.003 0.001 0.064 0.019 0.107 174 D 0.882 0.011 0.001 0.001 0.026 0.003 0.076 175 V 0.854 0.024 0.002 0.001 0.012 0.004 0.102 176 T 0.719 0.039 0.006 0.003 0.046 0.024 0.163 177 V 0.442 0.011 0.024 0.006 0.091 0.184 0.242 178 N 0.038 0.002 0.021 0.004 0.102 0.795 0.038 179 D 0.047 0.004 0.040 0.004 0.140 0.697 0.069 180 E 0.313 0.009 0.014 0.003 0.251 0.069 0.341 181 V 0.522 0.097 0.006 0.002 0.076 0.023 0.274 182 L 0.434 0.166 0.003 0.003 0.062 0.008 0.325 183 G 0.111 0.010 0.006 0.002 0.083 0.034 0.753 184 R 0.022 0.005 0.022 0.003 0.193 0.699 0.056 185 N 0.036 0.008 0.043 0.005 0.160 0.648 0.100 186 A 0.223 0.021 0.035 0.011 0.133 0.056 0.522 187 W 0.615 0.046 0.021 0.011 0.046 0.032 0.229 188 L 0.637 0.054 0.022 0.010 0.061 0.025 0.191 189 R 0.599 0.068 0.013 0.008 0.065 0.019 0.227 190 L 0.277 0.043 0.006 0.004 0.117 0.018 0.535 191 P 0.102 0.017 0.011 0.003 0.134 0.058 0.675 192 E 0.031 0.017 0.031 0.011 0.268 0.336 0.306 193 G 0.016 0.012 0.067 0.015 0.365 0.297 0.227 194 E 0.027 0.013 0.050 0.023 0.380 0.089 0.418 195 A 0.099 0.047 0.072 0.085 0.215 0.154 0.327 196 L 0.183 0.059 0.070 0.113 0.085 0.097 0.393 197 S 0.200 0.035 0.068 0.093 0.117 0.073 0.414 198 A 0.347 0.023 0.061 0.110 0.115 0.085 0.260 199 T 0.314 0.049 0.054 0.091 0.132 0.102 0.259 200 A 0.241 0.088 0.019 0.081 0.147 0.092 0.333 201 G 0.070 0.012 0.012 0.022 0.169 0.091 0.625 202 A 0.030 0.008 0.064 0.040 0.239 0.428 0.191 203 R 0.032 0.010 0.060 0.052 0.186 0.572 0.088 204 G 0.103 0.009 0.047 0.056 0.238 0.258 0.289 205 A 0.332 0.007 0.009 0.027 0.099 0.014 0.511 206 K 0.870 0.006 0.003 0.026 0.033 0.005 0.057 207 I 0.932 0.004 0.003 0.030 0.003 0.003 0.025 208 W 0.942 0.002 0.004 0.028 0.003 0.004 0.017 209 M 0.896 0.003 0.007 0.038 0.010 0.008 0.038 210 K 0.717 0.005 0.018 0.074 0.042 0.021 0.122 211 T 0.359 0.005 0.022 0.082 0.183 0.078 0.271 212 G 0.188 0.007 0.016 0.030 0.284 0.155 0.320 213 H 0.213 0.046 0.019 0.025 0.158 0.062 0.477 214 L 0.249 0.085 0.035 0.044 0.098 0.035 0.454 215 R 0.179 0.015 0.057 0.053 0.105 0.106 0.485 216 F 0.139 0.025 0.096 0.061 0.159 0.160 0.361 217 V 0.096 0.030 0.023 0.052 0.269 0.098 0.432 218 R 0.042 0.012 0.013 0.030 0.333 0.063 0.507 219 T 0.025 0.011 0.015 0.043 0.326 0.055 0.524 220 P 0.031 0.015 0.042 0.089 0.158 0.203 0.462 221 E 0.032 0.019 0.027 0.063 0.008 0.134 0.717 222 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997