# TARGET T0582 # Using neural net t04-2621-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-ebghstl-dssp-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0582.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1665 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.002 0.001 0.001 0.004 0.002 0.001 0.990 2 E 0.022 0.020 0.004 0.029 0.010 0.014 0.901 3 I 0.037 0.035 0.027 0.058 0.165 0.067 0.612 4 N 0.019 0.006 0.058 0.017 0.064 0.053 0.784 5 A 0.016 0.013 0.216 0.059 0.123 0.331 0.241 6 D 0.013 0.011 0.161 0.030 0.127 0.329 0.330 7 F 0.032 0.018 0.064 0.020 0.249 0.079 0.539 8 T 0.032 0.035 0.017 0.012 0.238 0.060 0.607 9 K 0.143 0.012 0.009 0.003 0.387 0.022 0.425 10 P 0.185 0.010 0.012 0.006 0.065 0.016 0.706 11 V 0.762 0.014 0.013 0.007 0.033 0.014 0.157 12 V 0.903 0.014 0.003 0.002 0.008 0.003 0.067 13 I 0.869 0.044 0.001 0.001 0.017 0.002 0.066 14 D 0.441 0.016 0.003 0.001 0.017 0.005 0.517 15 T 0.018 0.002 0.416 0.038 0.033 0.431 0.063 16 D 0.008 0.001 0.434 0.022 0.036 0.479 0.019 17 Q 0.014 0.005 0.605 0.019 0.080 0.209 0.068 18 L 0.168 0.037 0.066 0.027 0.131 0.069 0.501 19 E 0.347 0.036 0.021 0.013 0.049 0.036 0.497 20 W 0.603 0.043 0.008 0.009 0.059 0.024 0.255 21 R 0.618 0.027 0.002 0.004 0.061 0.008 0.279 22 P 0.518 0.048 0.004 0.003 0.064 0.007 0.357 23 S 0.187 0.028 0.006 0.001 0.069 0.016 0.692 24 P 0.069 0.015 0.047 0.012 0.144 0.291 0.421 25 M 0.034 0.009 0.099 0.040 0.170 0.305 0.343 26 K 0.016 0.004 0.057 0.080 0.301 0.424 0.117 27 G 0.060 0.005 0.025 0.075 0.188 0.477 0.170 28 V 0.479 0.066 0.003 0.055 0.023 0.007 0.367 29 E 0.795 0.018 0.001 0.038 0.012 0.003 0.132 30 R 0.876 0.004 0.003 0.043 0.015 0.005 0.055 31 R 0.866 0.004 0.005 0.045 0.016 0.005 0.058 32 M 0.858 0.006 0.010 0.050 0.015 0.006 0.054 33 L 0.741 0.012 0.022 0.068 0.030 0.017 0.110 34 D 0.548 0.011 0.035 0.100 0.062 0.063 0.182 35 R 0.270 0.019 0.038 0.098 0.191 0.085 0.300 36 I 0.114 0.021 0.034 0.071 0.229 0.179 0.353 37 G 0.043 0.007 0.040 0.052 0.192 0.447 0.219 38 G 0.061 0.012 0.051 0.071 0.277 0.224 0.303 39 E 0.155 0.024 0.058 0.099 0.199 0.160 0.306 40 V 0.271 0.030 0.049 0.081 0.160 0.150 0.259 41 A 0.357 0.019 0.036 0.040 0.146 0.061 0.340 42 R 0.548 0.012 0.031 0.043 0.127 0.042 0.197 43 A 0.817 0.009 0.012 0.012 0.035 0.023 0.091 44 T 0.925 0.005 0.003 0.003 0.011 0.006 0.046 45 S 0.963 0.001 0.002 0.003 0.007 0.003 0.022 46 I 0.973 0.002 0.001 0.003 0.002 0.002 0.018 47 V 0.972 0.001 0.001 0.003 0.002 0.002 0.019 48 R 0.957 0.005 0.001 0.002 0.006 0.001 0.030 49 Y 0.732 0.039 0.001 0.002 0.012 0.002 0.214 50 A 0.092 0.009 0.001 0.001 0.042 0.008 0.849 51 P 0.007 0.003 0.011 0.003 0.064 0.879 0.033 52 G 0.007 0.004 0.027 0.003 0.179 0.687 0.093 53 S 0.025 0.032 0.026 0.004 0.287 0.062 0.565 54 R 0.079 0.116 0.012 0.003 0.188 0.055 0.547 55 F 0.089 0.108 0.022 0.003 0.221 0.020 0.537 56 S 0.084 0.048 0.038 0.004 0.158 0.074 0.595 57 A 0.078 0.044 0.074 0.016 0.191 0.236 0.361 58 H 0.114 0.091 0.050 0.011 0.270 0.124 0.340 59 T 0.084 0.060 0.045 0.007 0.210 0.187 0.407 60 H 0.054 0.034 0.023 0.003 0.289 0.199 0.398 61 D 0.020 0.007 0.033 0.003 0.230 0.577 0.131 62 G 0.012 0.004 0.017 0.001 0.296 0.600 0.070 63 G 0.162 0.017 0.007 0.001 0.210 0.109 0.495 64 E 0.444 0.027 0.001 0.001 0.104 0.006 0.418 65 E 0.915 0.003 0.001 0.001 0.011 0.001 0.071 66 F 0.982 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.016 67 I 0.998 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 68 V 0.996 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 69 L 0.982 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.017 70 D 0.888 0.001 0.001 0.001 0.022 0.012 0.077 71 G 0.842 0.001 0.001 0.001 0.046 0.045 0.066 72 V 0.952 0.002 0.001 0.001 0.008 0.007 0.030 73 F 0.980 0.002 0.001 0.001 0.002 0.002 0.013 74 Q 0.964 0.004 0.001 0.001 0.004 0.004 0.023 75 D 0.862 0.007 0.002 0.002 0.018 0.020 0.091 76 E 0.359 0.010 0.011 0.003 0.119 0.325 0.174 77 H 0.094 0.014 0.026 0.001 0.234 0.453 0.177 78 G 0.064 0.005 0.012 0.001 0.426 0.356 0.137 79 D 0.134 0.050 0.010 0.001 0.321 0.128 0.356 80 Y 0.117 0.065 0.001 0.001 0.278 0.003 0.536 81 P 0.077 0.016 0.002 0.001 0.020 0.005 0.879 82 A 0.047 0.019 0.254 0.034 0.080 0.488 0.077 83 G 0.062 0.002 0.315 0.027 0.113 0.403 0.077 84 T 0.216 0.010 0.303 0.067 0.087 0.063 0.255 85 Y 0.804 0.017 0.032 0.038 0.011 0.021 0.076 86 V 0.904 0.016 0.006 0.018 0.007 0.005 0.045 87 R 0.905 0.014 0.002 0.008 0.012 0.006 0.053 88 N 0.444 0.018 0.001 0.003 0.140 0.008 0.386 89 P 0.077 0.014 0.002 0.001 0.111 0.014 0.781 90 P 0.014 0.005 0.023 0.002 0.173 0.669 0.114 91 T 0.017 0.015 0.044 0.004 0.258 0.496 0.164 92 T 0.049 0.031 0.036 0.006 0.376 0.041 0.463 93 S 0.079 0.060 0.034 0.010 0.114 0.107 0.596 94 H 0.124 0.110 0.065 0.018 0.196 0.142 0.345 95 V 0.097 0.043 0.064 0.013 0.197 0.080 0.506 96 P 0.047 0.021 0.078 0.022 0.176 0.265 0.391 97 G 0.039 0.032 0.065 0.019 0.193 0.374 0.277 98 S 0.028 0.018 0.023 0.009 0.295 0.073 0.554 99 A 0.031 0.010 0.076 0.031 0.176 0.187 0.489 100 E 0.031 0.012 0.082 0.060 0.184 0.498 0.133 101 G 0.133 0.009 0.049 0.064 0.154 0.268 0.322 102 C 0.384 0.012 0.004 0.029 0.041 0.008 0.523 103 T 0.903 0.005 0.001 0.016 0.018 0.003 0.055 104 I 0.985 0.001 0.001 0.008 0.001 0.001 0.004 105 F 0.987 0.001 0.001 0.008 0.001 0.001 0.003 106 V 0.985 0.001 0.001 0.004 0.002 0.001 0.007 107 K 0.942 0.001 0.003 0.006 0.008 0.002 0.038 108 L 0.843 0.005 0.007 0.008 0.018 0.007 0.112 109 W 0.432 0.010 0.019 0.016 0.180 0.013 0.330 110 Q 0.227 0.021 0.030 0.020 0.165 0.034 0.503 111 F 0.060 0.041 0.022 0.021 0.187 0.041 0.627 112 D 0.014 0.015 0.009 0.003 0.088 0.009 0.863 113 P 0.003 0.002 0.324 0.079 0.073 0.387 0.131 114 A 0.003 0.003 0.293 0.075 0.049 0.503 0.074 115 D 0.011 0.007 0.295 0.079 0.141 0.253 0.214 116 R 0.032 0.014 0.086 0.136 0.201 0.141 0.390 117 T 0.074 0.017 0.069 0.155 0.198 0.091 0.395 118 Q 0.163 0.023 0.059 0.272 0.081 0.088 0.314 119 F 0.275 0.040 0.029 0.354 0.041 0.058 0.203 120 S 0.365 0.033 0.026 0.279 0.053 0.043 0.202 121 K 0.239 0.014 0.026 0.287 0.111 0.120 0.203 122 N 0.162 0.021 0.029 0.145 0.116 0.130 0.397 123 M 0.127 0.018 0.056 0.165 0.115 0.116 0.403 124 E 0.140 0.018 0.096 0.196 0.100 0.117 0.333 125 A 0.111 0.011 0.113 0.196 0.143 0.086 0.340 126 E 0.150 0.027 0.080 0.197 0.104 0.144 0.298 127 L 0.235 0.037 0.042 0.100 0.121 0.141 0.324 128 G 0.261 0.035 0.021 0.042 0.120 0.091 0.430 129 A 0.227 0.033 0.008 0.009 0.131 0.023 0.569 130 P 0.178 0.047 0.015 0.013 0.105 0.057 0.585 131 V 0.076 0.033 0.050 0.013 0.128 0.063 0.638 132 E 0.029 0.008 0.062 0.019 0.198 0.548 0.136 133 G 0.029 0.004 0.033 0.008 0.161 0.622 0.143 134 I 0.183 0.051 0.007 0.010 0.106 0.020 0.624 135 S 0.410 0.020 0.005 0.010 0.040 0.014 0.501 136 T 0.772 0.016 0.010 0.013 0.030 0.009 0.151 137 S 0.839 0.009 0.011 0.019 0.021 0.007 0.094 138 L 0.836 0.009 0.021 0.039 0.021 0.009 0.064 139 L 0.772 0.016 0.024 0.042 0.021 0.020 0.106 140 H 0.589 0.013 0.025 0.040 0.059 0.047 0.226 141 E 0.293 0.015 0.043 0.063 0.228 0.094 0.264 142 D 0.167 0.013 0.044 0.036 0.206 0.094 0.439 143 E 0.083 0.012 0.093 0.063 0.207 0.348 0.195 144 R 0.113 0.008 0.095 0.049 0.195 0.282 0.257 145 E 0.288 0.009 0.053 0.038 0.177 0.075 0.360 146 T 0.717 0.017 0.014 0.026 0.036 0.027 0.163 147 V 0.877 0.014 0.004 0.014 0.010 0.005 0.076 148 T 0.903 0.005 0.004 0.016 0.009 0.007 0.057 149 H 0.888 0.005 0.008 0.017 0.010 0.010 0.062 150 R 0.832 0.006 0.007 0.017 0.027 0.014 0.097 151 K 0.765 0.013 0.006 0.010 0.047 0.015 0.145 152 L 0.346 0.045 0.006 0.012 0.154 0.019 0.419 153 E 0.085 0.010 0.004 0.003 0.115 0.021 0.762 154 P 0.010 0.003 0.024 0.009 0.103 0.788 0.062 155 G 0.014 0.004 0.036 0.008 0.144 0.689 0.106 156 A 0.069 0.022 0.024 0.015 0.202 0.053 0.615 157 N 0.202 0.076 0.015 0.018 0.082 0.042 0.566 158 L 0.286 0.072 0.009 0.015 0.142 0.013 0.461 159 T 0.285 0.027 0.013 0.018 0.057 0.028 0.573 160 S 0.313 0.041 0.055 0.066 0.164 0.069 0.292 161 E 0.246 0.026 0.097 0.045 0.168 0.098 0.320 162 A 0.156 0.023 0.151 0.038 0.169 0.135 0.328 163 A 0.083 0.012 0.121 0.031 0.127 0.473 0.153 164 G 0.039 0.007 0.040 0.004 0.197 0.616 0.097 165 G 0.159 0.010 0.015 0.001 0.244 0.212 0.358 166 I 0.360 0.013 0.002 0.001 0.122 0.016 0.486 167 E 0.873 0.005 0.001 0.001 0.024 0.003 0.095 168 V 0.968 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.027 169 L 0.994 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 170 V 0.995 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 171 L 0.981 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.017 172 D 0.899 0.001 0.001 0.001 0.019 0.020 0.061 173 G 0.883 0.001 0.001 0.001 0.027 0.030 0.059 174 D 0.967 0.001 0.001 0.001 0.010 0.006 0.016 175 V 0.985 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.010 176 T 0.983 0.002 0.001 0.001 0.001 0.003 0.010 177 V 0.929 0.006 0.001 0.002 0.004 0.034 0.024 178 N 0.114 0.001 0.002 0.001 0.065 0.793 0.025 179 D 0.125 0.001 0.004 0.001 0.187 0.652 0.030 180 E 0.862 0.012 0.001 0.001 0.046 0.018 0.058 181 V 0.942 0.021 0.001 0.001 0.007 0.001 0.028 182 L 0.701 0.019 0.001 0.001 0.017 0.002 0.260 183 G 0.439 0.003 0.003 0.001 0.026 0.021 0.507 184 R 0.041 0.004 0.029 0.003 0.087 0.816 0.020 185 N 0.099 0.003 0.045 0.001 0.082 0.654 0.116 186 A 0.199 0.004 0.022 0.002 0.245 0.025 0.503 187 W 0.852 0.028 0.003 0.001 0.009 0.004 0.103 188 L 0.950 0.003 0.001 0.001 0.002 0.001 0.042 189 R 0.955 0.028 0.001 0.001 0.002 0.001 0.015 190 L 0.529 0.013 0.001 0.001 0.005 0.001 0.450 191 P 0.094 0.002 0.002 0.001 0.066 0.056 0.781 192 E 0.010 0.001 0.010 0.002 0.092 0.867 0.018 193 G 0.024 0.002 0.038 0.004 0.304 0.545 0.082 194 E 0.093 0.012 0.022 0.005 0.219 0.036 0.613 195 A 0.408 0.078 0.015 0.008 0.068 0.030 0.393 196 L 0.661 0.028 0.009 0.007 0.043 0.009 0.243 197 S 0.712 0.020 0.008 0.010 0.025 0.012 0.214 198 A 0.751 0.009 0.013 0.017 0.019 0.019 0.173 199 T 0.819 0.023 0.009 0.016 0.019 0.024 0.089 200 A 0.672 0.023 0.020 0.012 0.053 0.075 0.145 201 G 0.267 0.008 0.029 0.010 0.177 0.178 0.332 202 A 0.136 0.007 0.073 0.018 0.280 0.343 0.143 203 R 0.056 0.008 0.057 0.006 0.150 0.676 0.047 204 G 0.211 0.009 0.032 0.002 0.176 0.307 0.263 205 A 0.495 0.008 0.003 0.001 0.129 0.014 0.350 206 K 0.976 0.003 0.001 0.001 0.003 0.001 0.017 207 I 0.994 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 208 W 0.995 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 209 M 0.975 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.020 210 K 0.772 0.004 0.002 0.002 0.014 0.005 0.200 211 T 0.193 0.012 0.125 0.049 0.117 0.243 0.261 212 G 0.049 0.008 0.165 0.030 0.201 0.391 0.155 213 H 0.038 0.022 0.177 0.027 0.250 0.178 0.308 214 L 0.035 0.018 0.234 0.069 0.123 0.147 0.374 215 R 0.061 0.013 0.256 0.066 0.132 0.155 0.317 216 F 0.080 0.041 0.223 0.065 0.129 0.162 0.300 217 V 0.105 0.057 0.038 0.036 0.228 0.067 0.469 218 R 0.064 0.036 0.023 0.023 0.135 0.079 0.640 219 T 0.024 0.011 0.117 0.024 0.217 0.058 0.549 220 P 0.009 0.005 0.237 0.030 0.137 0.438 0.143 221 E 0.019 0.017 0.253 0.029 0.050 0.470 0.162 222 V 0.027 0.016 0.020 0.019 0.087 0.013 0.819