# TARGET T0581 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t2k-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-n_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 n_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0581.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 3.4265 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.037 0.017 0.019 0.011 0.019 0.049 0.005 0.843 2 S 0.064 0.031 0.046 0.029 0.051 0.152 0.008 0.619 3 R 0.094 0.050 0.053 0.024 0.040 0.143 0.009 0.587 4 F 0.065 0.125 0.075 0.044 0.089 0.096 0.006 0.502 5 M 0.027 0.143 0.042 0.029 0.064 0.090 0.004 0.600 6 A 0.034 0.315 0.037 0.029 0.071 0.123 0.006 0.385 7 L 0.031 0.642 0.038 0.027 0.057 0.042 0.004 0.159 8 A 0.016 0.791 0.025 0.021 0.034 0.021 0.004 0.086 9 L 0.021 0.815 0.024 0.022 0.038 0.013 0.007 0.059 10 C 0.023 0.873 0.019 0.019 0.026 0.004 0.005 0.031 11 F 0.050 0.794 0.017 0.029 0.030 0.006 0.014 0.059 12 V 0.072 0.599 0.069 0.029 0.051 0.012 0.026 0.142 13 L 0.075 0.308 0.121 0.063 0.084 0.039 0.020 0.290 14 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 15 T 0.013 0.048 0.051 0.015 0.052 0.183 0.006 0.631 16 A 0.159 0.327 0.039 0.010 0.030 0.060 0.009 0.367 17 A 0.068 0.612 0.029 0.013 0.030 0.054 0.004 0.190 18 H 0.100 0.534 0.018 0.024 0.028 0.072 0.013 0.211 19 A 0.147 0.636 0.015 0.015 0.039 0.017 0.014 0.116 20 A 0.148 0.595 0.016 0.020 0.023 0.040 0.037 0.122 21 S 0.310 0.243 0.020 0.015 0.017 0.056 0.126 0.213 22 L 0.188 0.320 0.092 0.016 0.029 0.042 0.035 0.278 23 K 0.019 0.059 0.010 0.006 0.005 0.343 0.015 0.543 24 D 0.135 0.068 0.019 0.005 0.010 0.368 0.029 0.366 25 F 0.106 0.561 0.016 0.004 0.007 0.073 0.005 0.229 26 E 0.053 0.452 0.010 0.004 0.009 0.166 0.006 0.300 27 L 0.043 0.678 0.012 0.003 0.011 0.051 0.008 0.193 28 S 0.033 0.809 0.005 0.002 0.007 0.021 0.006 0.117 29 K 0.026 0.783 0.003 0.001 0.003 0.029 0.005 0.150 30 M 0.015 0.884 0.003 0.001 0.001 0.022 0.003 0.071 31 L 0.017 0.941 0.002 0.001 0.001 0.010 0.003 0.025 32 E 0.011 0.944 0.003 0.001 0.001 0.008 0.003 0.030 33 K 0.011 0.951 0.001 0.001 0.001 0.004 0.004 0.027 34 V 0.009 0.974 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.013 35 A 0.006 0.978 0.003 0.001 0.001 0.002 0.002 0.008 36 K 0.025 0.909 0.013 0.004 0.004 0.006 0.009 0.029 37 E 0.071 0.790 0.023 0.007 0.007 0.006 0.031 0.064 38 S 0.140 0.616 0.041 0.011 0.011 0.014 0.055 0.112 39 S 0.148 0.203 0.124 0.021 0.015 0.065 0.067 0.358 40 V 0.082 0.051 0.190 0.022 0.019 0.129 0.031 0.474 41 G 0.127 0.022 0.097 0.020 0.025 0.114 0.041 0.555 42 T 0.143 0.014 0.089 0.028 0.025 0.262 0.009 0.429 43 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 44 R 0.017 0.009 0.079 0.068 0.178 0.138 0.003 0.508 45 A 0.143 0.037 0.045 0.014 0.025 0.131 0.006 0.598 46 I 0.188 0.144 0.097 0.034 0.065 0.078 0.009 0.386 47 N 0.089 0.264 0.087 0.022 0.099 0.069 0.008 0.362 48 E 0.045 0.179 0.041 0.011 0.036 0.052 0.008 0.627 49 D 0.028 0.160 0.012 0.007 0.011 0.295 0.013 0.474 50 I 0.190 0.293 0.019 0.009 0.015 0.234 0.021 0.219 51 L 0.102 0.712 0.025 0.013 0.014 0.039 0.007 0.088 52 D 0.099 0.620 0.024 0.014 0.019 0.029 0.019 0.175 53 Q 0.145 0.437 0.024 0.009 0.020 0.023 0.061 0.281 54 G 0.381 0.153 0.039 0.022 0.024 0.039 0.143 0.199 55 Y 0.221 0.055 0.217 0.067 0.029 0.138 0.032 0.241 56 T 0.020 0.028 0.194 0.094 0.059 0.137 0.008 0.460 57 V 0.026 0.032 0.116 0.103 0.281 0.048 0.004 0.390 58 E 0.010 0.029 0.028 0.026 0.044 0.166 0.005 0.690 59 G 0.119 0.032 0.069 0.047 0.106 0.125 0.026 0.478 60 N 0.137 0.100 0.044 0.054 0.076 0.093 0.016 0.480 61 Q 0.064 0.060 0.036 0.048 0.055 0.136 0.012 0.590 62 L 0.065 0.100 0.073 0.078 0.166 0.108 0.009 0.402 63 I 0.044 0.131 0.140 0.213 0.266 0.040 0.007 0.159 64 N 0.035 0.187 0.064 0.137 0.190 0.055 0.011 0.320 65 H 0.102 0.131 0.166 0.052 0.138 0.040 0.024 0.347 66 L 0.132 0.093 0.128 0.109 0.125 0.114 0.029 0.270 67 S 0.041 0.034 0.168 0.094 0.117 0.179 0.016 0.351 68 V 0.037 0.045 0.145 0.072 0.118 0.086 0.008 0.489 69 R 0.032 0.067 0.110 0.043 0.120 0.193 0.006 0.429 70 A 0.026 0.066 0.048 0.015 0.048 0.080 0.007 0.710 71 S 0.026 0.139 0.026 0.009 0.027 0.180 0.009 0.585 72 H 0.116 0.158 0.017 0.007 0.019 0.186 0.021 0.476 73 A 0.063 0.515 0.014 0.005 0.015 0.121 0.008 0.259 74 E 0.055 0.460 0.010 0.007 0.010 0.227 0.009 0.223 75 R 0.105 0.680 0.003 0.004 0.007 0.036 0.013 0.152 76 M 0.129 0.802 0.003 0.002 0.004 0.004 0.008 0.049 77 R 0.126 0.731 0.008 0.008 0.012 0.007 0.021 0.087 78 S 0.162 0.425 0.040 0.010 0.010 0.052 0.074 0.226 79 N 0.237 0.209 0.032 0.015 0.014 0.108 0.036 0.349 80 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 81 D 0.003 0.016 0.009 0.002 0.002 0.456 0.003 0.508 82 S 0.441 0.049 0.019 0.003 0.004 0.259 0.021 0.203 83 V 0.080 0.741 0.011 0.005 0.009 0.026 0.003 0.125 84 R 0.020 0.813 0.018 0.008 0.023 0.021 0.002 0.096 85 S 0.027 0.797 0.013 0.014 0.023 0.028 0.007 0.092 86 Q 0.069 0.768 0.013 0.013 0.022 0.014 0.023 0.077 87 L 0.095 0.725 0.026 0.021 0.030 0.013 0.022 0.068 88 G 0.088 0.420 0.116 0.030 0.029 0.057 0.046 0.213 89 D 0.116 0.201 0.080 0.029 0.035 0.052 0.045 0.441 90 S 0.137 0.164 0.067 0.030 0.041 0.091 0.026 0.445 91 V 0.127 0.125 0.109 0.046 0.054 0.094 0.017 0.428 92 C 0.074 0.139 0.185 0.069 0.088 0.097 0.009 0.340 93 S 0.060 0.131 0.064 0.043 0.064 0.068 0.011 0.558 94 N 0.078 0.127 0.048 0.018 0.061 0.080 0.016 0.571 95 T 0.129 0.070 0.047 0.009 0.018 0.137 0.025 0.565 96 G 0.084 0.044 0.037 0.006 0.009 0.189 0.021 0.611 97 Y 0.065 0.100 0.056 0.012 0.031 0.280 0.010 0.447 98 R 0.016 0.246 0.021 0.010 0.024 0.137 0.003 0.543 99 Q 0.009 0.553 0.003 0.003 0.010 0.076 0.002 0.345 100 L 0.020 0.888 0.002 0.002 0.005 0.020 0.001 0.062 101 L 0.025 0.943 0.001 0.003 0.005 0.004 0.003 0.017 102 A 0.029 0.926 0.002 0.003 0.005 0.002 0.010 0.022 103 R 0.092 0.770 0.005 0.006 0.009 0.004 0.055 0.058 104 G 0.211 0.500 0.033 0.023 0.025 0.008 0.097 0.104 105 A 0.099 0.202 0.266 0.127 0.048 0.069 0.029 0.161 106 I 0.022 0.057 0.274 0.211 0.169 0.047 0.008 0.211 107 L 0.017 0.031 0.128 0.356 0.337 0.014 0.005 0.112 108 T 0.015 0.030 0.137 0.233 0.343 0.023 0.005 0.214 109 Y 0.008 0.012 0.142 0.355 0.362 0.012 0.003 0.105 110 S 0.012 0.010 0.074 0.267 0.355 0.042 0.007 0.232 111 F 0.022 0.007 0.062 0.214 0.397 0.037 0.006 0.255 112 T 0.008 0.008 0.054 0.272 0.387 0.082 0.003 0.186 113 E 0.017 0.015 0.032 0.119 0.221 0.088 0.005 0.503 114 Y 0.029 0.045 0.060 0.112 0.333 0.100 0.006 0.315 115 K 0.052 0.067 0.048 0.108 0.176 0.129 0.010 0.409 116 T 0.058 0.098 0.029 0.069 0.123 0.155 0.017 0.451 117 N 0.110 0.081 0.030 0.031 0.083 0.064 0.032 0.569 118 Q 0.130 0.060 0.053 0.073 0.074 0.183 0.011 0.418 119 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.995 120 V 0.028 0.046 0.051 0.074 0.296 0.062 0.004 0.440 121 A 0.092 0.279 0.048 0.047 0.110 0.052 0.007 0.364 122 T 0.062 0.287 0.068 0.062 0.119 0.060 0.010 0.331 123 E 0.075 0.287 0.055 0.045 0.080 0.057 0.015 0.384 124 R 0.149 0.238 0.035 0.047 0.071 0.110 0.029 0.323 125 F 0.147 0.268 0.079 0.051 0.082 0.092 0.023 0.257 126 D 0.051 0.313 0.063 0.050 0.057 0.110 0.014 0.343 127 A 0.080 0.262 0.043 0.021 0.072 0.063 0.021 0.437 128 G 0.151 0.131 0.038 0.016 0.026 0.322 0.061 0.254 129 S 0.411 0.045 0.033 0.013 0.015 0.109 0.090 0.284 130 C 0.131 0.160 0.071 0.032 0.039 0.126 0.014 0.427 131 R 0.043 0.079 0.044 0.038 0.056 0.192 0.008 0.540 132 I 0.070 0.103 0.045 0.046 0.105 0.125 0.010 0.496 133 Q 0.105 0.155 0.039 0.048 0.086 0.114 0.015 0.438 134 G 0.165 0.097 0.029 0.029 0.051 0.061 0.028 0.540 135 K 0.234 0.093 0.053 0.031 0.042 0.085 0.030 0.431 136 K 0.056 0.029 0.027 0.019 0.019 0.071 0.014 0.766