# TARGET T0581 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-n_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 n_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0581.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 3.16805 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.106 0.038 0.062 0.027 0.050 0.120 0.014 0.582 2 S 0.129 0.056 0.084 0.059 0.075 0.150 0.019 0.428 3 R 0.121 0.077 0.185 0.078 0.107 0.097 0.015 0.319 4 F 0.041 0.084 0.137 0.067 0.083 0.081 0.010 0.497 5 M 0.041 0.101 0.169 0.068 0.102 0.129 0.013 0.377 6 A 0.035 0.169 0.152 0.065 0.113 0.081 0.008 0.376 7 L 0.013 0.143 0.054 0.025 0.066 0.081 0.006 0.611 8 A 0.036 0.265 0.042 0.025 0.046 0.133 0.014 0.439 9 L 0.158 0.513 0.024 0.018 0.027 0.068 0.022 0.170 10 C 0.178 0.594 0.035 0.025 0.029 0.036 0.026 0.077 11 F 0.137 0.582 0.041 0.032 0.030 0.022 0.029 0.127 12 V 0.089 0.550 0.067 0.024 0.032 0.020 0.038 0.181 13 L 0.114 0.365 0.071 0.061 0.053 0.031 0.024 0.281 14 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 15 T 0.009 0.102 0.020 0.022 0.055 0.174 0.004 0.614 16 A 0.086 0.560 0.023 0.009 0.015 0.045 0.007 0.256 17 A 0.034 0.801 0.006 0.006 0.011 0.027 0.004 0.110 18 H 0.071 0.820 0.005 0.003 0.006 0.022 0.006 0.067 19 A 0.053 0.913 0.003 0.002 0.003 0.003 0.004 0.018 20 A 0.058 0.889 0.003 0.003 0.003 0.005 0.013 0.024 21 S 0.214 0.658 0.008 0.006 0.006 0.008 0.048 0.052 22 L 0.146 0.607 0.042 0.007 0.018 0.009 0.024 0.147 23 K 0.063 0.332 0.021 0.008 0.017 0.147 0.027 0.385 24 D 0.092 0.268 0.020 0.006 0.008 0.136 0.026 0.445 25 F 0.105 0.657 0.018 0.005 0.006 0.024 0.007 0.177 26 E 0.046 0.484 0.024 0.010 0.012 0.128 0.011 0.284 27 L 0.075 0.578 0.029 0.011 0.018 0.049 0.010 0.230 28 S 0.056 0.733 0.010 0.006 0.013 0.054 0.007 0.121 29 K 0.050 0.749 0.009 0.005 0.007 0.036 0.009 0.136 30 M 0.021 0.873 0.004 0.002 0.003 0.024 0.004 0.069 31 L 0.036 0.877 0.005 0.003 0.005 0.016 0.008 0.050 32 E 0.017 0.919 0.005 0.002 0.004 0.011 0.005 0.037 33 K 0.022 0.877 0.004 0.002 0.003 0.010 0.007 0.076 34 V 0.022 0.911 0.003 0.002 0.003 0.005 0.005 0.050 35 A 0.010 0.939 0.004 0.002 0.005 0.004 0.003 0.034 36 K 0.024 0.833 0.006 0.005 0.009 0.012 0.012 0.099 37 E 0.055 0.805 0.011 0.005 0.005 0.009 0.020 0.090 38 S 0.051 0.836 0.011 0.006 0.004 0.006 0.023 0.063 39 S 0.173 0.268 0.044 0.018 0.011 0.036 0.092 0.357 40 V 0.135 0.083 0.103 0.018 0.020 0.145 0.038 0.458 41 G 0.172 0.096 0.056 0.017 0.024 0.124 0.051 0.460 42 T 0.171 0.047 0.056 0.018 0.022 0.164 0.008 0.513 43 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 44 R 0.016 0.015 0.036 0.037 0.107 0.379 0.004 0.407 45 A 0.258 0.076 0.034 0.030 0.036 0.126 0.009 0.430 46 I 0.142 0.323 0.041 0.044 0.076 0.078 0.006 0.289 47 N 0.094 0.315 0.042 0.035 0.079 0.081 0.009 0.344 48 E 0.061 0.246 0.031 0.012 0.033 0.061 0.009 0.547 49 D 0.065 0.200 0.007 0.008 0.015 0.432 0.017 0.255 50 I 0.218 0.397 0.006 0.006 0.013 0.153 0.026 0.183 51 L 0.025 0.886 0.009 0.005 0.008 0.014 0.005 0.047 52 D 0.022 0.810 0.011 0.010 0.011 0.027 0.021 0.088 53 Q 0.293 0.420 0.038 0.014 0.015 0.028 0.083 0.108 54 G 0.390 0.245 0.047 0.040 0.034 0.024 0.053 0.166 55 Y 0.104 0.068 0.322 0.112 0.090 0.041 0.025 0.238 56 T 0.011 0.035 0.154 0.085 0.098 0.039 0.007 0.572 57 V 0.015 0.036 0.180 0.107 0.156 0.057 0.006 0.443 58 E 0.015 0.039 0.083 0.071 0.085 0.297 0.006 0.404 59 G 0.066 0.037 0.066 0.034 0.072 0.129 0.022 0.575 60 N 0.167 0.043 0.045 0.024 0.032 0.189 0.010 0.490 61 Q 0.054 0.074 0.053 0.050 0.039 0.213 0.018 0.499 62 L 0.124 0.131 0.072 0.062 0.138 0.156 0.024 0.294 63 I 0.067 0.253 0.113 0.106 0.188 0.063 0.009 0.201 64 N 0.025 0.281 0.085 0.083 0.135 0.080 0.012 0.298 65 H 0.054 0.236 0.108 0.065 0.108 0.071 0.022 0.335 66 L 0.081 0.418 0.115 0.085 0.084 0.051 0.018 0.148 67 S 0.078 0.152 0.109 0.067 0.092 0.186 0.037 0.279 68 V 0.101 0.183 0.099 0.049 0.059 0.053 0.011 0.445 69 R 0.049 0.203 0.059 0.022 0.055 0.339 0.011 0.262 70 A 0.089 0.117 0.023 0.007 0.021 0.214 0.016 0.513 71 S 0.040 0.483 0.012 0.005 0.008 0.073 0.006 0.372 72 H 0.102 0.308 0.008 0.004 0.008 0.129 0.020 0.421 73 A 0.084 0.656 0.012 0.004 0.013 0.047 0.009 0.175 74 E 0.033 0.708 0.004 0.003 0.009 0.087 0.007 0.148 75 R 0.052 0.859 0.002 0.002 0.002 0.018 0.005 0.060 76 M 0.066 0.872 0.002 0.001 0.002 0.004 0.011 0.043 77 R 0.099 0.793 0.009 0.003 0.004 0.008 0.017 0.067 78 S 0.072 0.592 0.035 0.006 0.007 0.017 0.050 0.221 79 N 0.261 0.291 0.016 0.007 0.011 0.036 0.029 0.348 80 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 81 D 0.005 0.016 0.007 0.004 0.007 0.534 0.003 0.424 82 S 0.263 0.065 0.007 0.002 0.002 0.351 0.008 0.302 83 V 0.058 0.792 0.006 0.003 0.004 0.022 0.002 0.114 84 R 0.016 0.849 0.013 0.004 0.009 0.018 0.002 0.089 85 S 0.031 0.835 0.007 0.005 0.006 0.013 0.008 0.096 86 Q 0.228 0.635 0.008 0.005 0.009 0.016 0.031 0.068 87 L 0.090 0.784 0.017 0.008 0.012 0.013 0.017 0.060 88 G 0.066 0.592 0.038 0.017 0.026 0.036 0.038 0.188 89 D 0.071 0.348 0.044 0.015 0.020 0.046 0.024 0.432 90 S 0.141 0.304 0.047 0.022 0.028 0.093 0.030 0.335 91 V 0.156 0.324 0.070 0.025 0.034 0.079 0.023 0.290 92 C 0.079 0.359 0.111 0.049 0.052 0.094 0.021 0.235 93 S 0.080 0.292 0.067 0.035 0.045 0.114 0.020 0.348 94 N 0.137 0.215 0.046 0.016 0.030 0.097 0.032 0.427 95 T 0.139 0.122 0.028 0.010 0.010 0.177 0.024 0.490 96 G 0.091 0.096 0.023 0.007 0.008 0.334 0.025 0.415 97 Y 0.127 0.228 0.046 0.013 0.031 0.213 0.013 0.329 98 R 0.021 0.528 0.033 0.019 0.036 0.095 0.004 0.265 99 Q 0.021 0.574 0.011 0.011 0.027 0.092 0.005 0.259 100 L 0.019 0.891 0.006 0.007 0.013 0.012 0.003 0.048 101 L 0.012 0.949 0.002 0.005 0.008 0.004 0.004 0.016 102 A 0.045 0.884 0.005 0.009 0.011 0.005 0.018 0.023 103 R 0.180 0.611 0.016 0.016 0.013 0.009 0.087 0.067 104 G 0.430 0.197 0.039 0.030 0.018 0.016 0.152 0.118 105 A 0.159 0.112 0.317 0.073 0.070 0.060 0.045 0.165 106 I 0.038 0.066 0.246 0.178 0.193 0.065 0.020 0.195 107 L 0.041 0.030 0.291 0.189 0.273 0.054 0.008 0.113 108 T 0.012 0.028 0.199 0.286 0.279 0.038 0.004 0.154 109 Y 0.008 0.017 0.187 0.320 0.324 0.027 0.005 0.112 110 S 0.014 0.013 0.076 0.262 0.361 0.055 0.005 0.215 111 F 0.017 0.010 0.054 0.176 0.316 0.053 0.005 0.369 112 T 0.027 0.014 0.033 0.241 0.352 0.094 0.005 0.233 113 E 0.022 0.015 0.021 0.100 0.150 0.065 0.005 0.623 114 Y 0.042 0.047 0.034 0.155 0.271 0.134 0.007 0.309 115 K 0.081 0.071 0.027 0.126 0.149 0.190 0.017 0.339 116 T 0.059 0.164 0.028 0.082 0.106 0.074 0.022 0.466 117 N 0.114 0.145 0.043 0.060 0.079 0.058 0.105 0.396 118 Q 0.379 0.016 0.029 0.035 0.044 0.303 0.016 0.179 119 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 120 V 0.025 0.026 0.054 0.132 0.344 0.174 0.005 0.240 121 A 0.112 0.068 0.073 0.094 0.128 0.097 0.009 0.419 122 T 0.049 0.114 0.030 0.099 0.227 0.049 0.006 0.426 123 E 0.141 0.104 0.048 0.070 0.151 0.132 0.010 0.344 124 R 0.124 0.200 0.028 0.046 0.060 0.152 0.022 0.368 125 F 0.170 0.235 0.059 0.063 0.107 0.075 0.031 0.260 126 D 0.066 0.261 0.030 0.059 0.092 0.100 0.018 0.375 127 A 0.041 0.128 0.026 0.018 0.062 0.043 0.011 0.670 128 G 0.081 0.196 0.023 0.033 0.051 0.155 0.029 0.432 129 S 0.287 0.103 0.017 0.023 0.026 0.116 0.048 0.379 130 C 0.299 0.155 0.060 0.060 0.063 0.045 0.019 0.299 131 R 0.079 0.089 0.041 0.075 0.127 0.144 0.013 0.432 132 I 0.056 0.080 0.049 0.066 0.115 0.080 0.011 0.545 133 Q 0.056 0.091 0.023 0.047 0.079 0.130 0.013 0.562 134 G 0.153 0.047 0.020 0.028 0.033 0.094 0.034 0.590 135 K 0.309 0.047 0.045 0.028 0.035 0.127 0.023 0.386 136 K 0.053 0.045 0.046 0.046 0.057 0.111 0.009 0.632