This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 1 NATAA M A 2 2 NATAA S A 3 3 NATAA R A 4 4 NATAA F A 5 5 NATAA M A 6 6 NATAA A A 7 7 NATAA L A 8 8 NATAA A A 9 9 NATAA L A 10 10 NATRO C A 11 11 NATAA F A 12 12 NATAA V A 13 13 NATAA L A 14 14 NATRO P A 15 15 NATAA T A 16 16 NATAA A A 17 17 NATAA A A 18 18 NATAA H A 19 19 NATAA A A 20 20 NATAA A A 21 21 NATAA S A 22 22 NATAA L A 23 23 NATAA K A 24 24 NATAA D A 25 25 NATAA F A 26 26 NATAA E A 27 27 NATAA L A 28 28 NATAA S A 29 29 NATAA K A 30 30 NATAA M A 31 31 NATAA L A 32 32 NATAA E A 33 33 NATAA K A 34 34 NATAA V A 35 35 NATAA A A 36 36 NATAA K A 37 37 NATAA E A 38 38 NATAA S A 39 39 NATAA S A 40 40 NATAA V A 41 41 NATAA G A 42 42 NATAA T A 43 43 NATRO P A 44 44 NATAA R A 45 45 NATAA A A 46 46 NATAA I A 47 47 NATAA N A 48 48 NATAA E A 49 49 NATAA D A 50 50 NATAA I A 51 51 NATAA L A 52 52 NATAA D A 53 53 NATAA Q A 54 54 NATAA G A 55 55 NATAA Y A 56 56 NATAA T A 57 57 NATAA V A 58 58 NATAA E A 59 59 NATAA G A 60 60 NATAA N A 61 61 NATAA Q A 62 62 NATAA L A 63 63 NATAA I A 64 64 NATAA N A 65 65 NATAA H A 66 66 NATAA L A 67 67 NATAA S A 68 68 NATAA V A 69 69 NATAA R A 70 70 NATAA A A 71 71 NATAA S A 72 72 NATAA H A 73 73 NATAA A A 74 74 NATAA E A 75 75 NATAA R A 76 76 NATAA M A 77 77 NATAA R A 78 78 NATAA S A 79 79 NATAA N A 80 80 NATRO P A 81 81 NATAA D A 82 82 NATAA S A 83 83 NATAA V A 84 84 NATAA R A 85 85 NATAA S A 86 86 NATAA Q A 87 87 NATAA L A 88 88 NATAA G A 89 89 NATAA D A 90 90 NATAA S A 91 91 NATAA V A 92 92 NATRO C A 93 93 NATAA S A 94 94 NATAA N A 95 95 NATAA T A 96 96 NATAA G A 97 97 NATAA Y A 98 98 NATAA R A 99 99 NATAA Q A 100 100 NATAA L A 101 101 NATAA L A 102 102 NATAA A A 103 103 NATAA R A 104 104 NATAA G A 105 105 NATAA A A 106 106 NATAA I A 107 107 NATAA L A 108 108 NATAA T A 109 109 NATAA Y A 110 110 NATAA S A 111 111 NATAA F A 112 112 NATAA T A 113 113 NATAA E A 114 114 NATAA Y A 115 115 NATAA K A 116 116 NATAA T A 117 117 NATAA N A 118 118 NATAA Q A 119 119 NATRO P A 120 120 NATAA V A 121 121 NATAA A A 122 122 NATAA T A 123 123 NATAA E A 124 124 NATAA R A 125 125 NATAA F A 126 126 NATAA D A 127 127 NATAA A A 128 128 NATAA G A 129 129 NATAA S A 130 130 NATRO C A 131 131 NATAA R A 132 132 NATAA I A 133 133 NATAA Q A 134 134 NATAA G A 135 135 NATAA K A 136 136 NATAA K