# TARGET T0576 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-n_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 n_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0576.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 3.62227 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.033 0.011 0.063 0.031 0.043 0.066 0.008 0.743 2 G 0.081 0.017 0.089 0.052 0.079 0.108 0.019 0.555 3 S 0.098 0.009 0.095 0.031 0.060 0.122 0.011 0.574 4 S 0.038 0.011 0.045 0.033 0.058 0.130 0.007 0.679 5 H 0.103 0.011 0.035 0.027 0.062 0.226 0.012 0.525 6 H 0.100 0.019 0.047 0.038 0.053 0.235 0.013 0.496 7 H 0.085 0.034 0.056 0.057 0.086 0.143 0.012 0.528 8 H 0.074 0.029 0.051 0.076 0.137 0.132 0.010 0.491 9 H 0.046 0.025 0.030 0.067 0.124 0.097 0.007 0.604 10 H 0.049 0.038 0.041 0.098 0.190 0.090 0.010 0.484 11 S 0.072 0.039 0.034 0.065 0.106 0.176 0.014 0.494 12 S 0.101 0.038 0.025 0.055 0.063 0.155 0.020 0.544 13 G 0.191 0.044 0.032 0.048 0.060 0.130 0.032 0.464 14 R 0.150 0.030 0.061 0.042 0.092 0.290 0.014 0.320 15 E 0.019 0.034 0.034 0.054 0.066 0.113 0.007 0.673 16 N 0.065 0.055 0.049 0.101 0.161 0.133 0.018 0.417 17 L 0.149 0.059 0.152 0.162 0.183 0.060 0.020 0.214 18 Y 0.046 0.041 0.164 0.185 0.306 0.078 0.010 0.171 19 F 0.026 0.033 0.098 0.235 0.377 0.060 0.008 0.163 20 Q 0.030 0.034 0.089 0.192 0.347 0.052 0.005 0.250 21 G 0.024 0.033 0.058 0.213 0.219 0.053 0.012 0.388 22 H 0.089 0.014 0.071 0.092 0.168 0.072 0.020 0.473 23 V 0.065 0.028 0.074 0.130 0.203 0.056 0.019 0.425 24 E 0.042 0.015 0.036 0.092 0.178 0.139 0.009 0.490 25 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 26 G 0.054 0.010 0.026 0.043 0.063 0.170 0.013 0.622 27 V 0.522 0.007 0.038 0.018 0.021 0.066 0.011 0.317 28 T 0.036 0.041 0.095 0.083 0.092 0.062 0.004 0.586 29 D 0.037 0.031 0.053 0.055 0.110 0.072 0.004 0.640 30 R 0.045 0.039 0.038 0.025 0.043 0.284 0.006 0.520 31 I 0.080 0.107 0.027 0.019 0.040 0.387 0.009 0.331 32 G 0.061 0.316 0.027 0.018 0.030 0.152 0.013 0.383 33 Q 0.052 0.456 0.021 0.014 0.021 0.090 0.009 0.336 34 M 0.059 0.554 0.016 0.017 0.028 0.071 0.011 0.244 35 I 0.049 0.727 0.010 0.017 0.042 0.032 0.010 0.114 36 L 0.018 0.868 0.010 0.012 0.029 0.009 0.004 0.050 37 E 0.026 0.845 0.006 0.012 0.016 0.014 0.010 0.071 38 M 0.110 0.711 0.011 0.012 0.012 0.012 0.031 0.103 39 F 0.156 0.611 0.021 0.021 0.022 0.014 0.043 0.112 40 R 0.101 0.412 0.081 0.041 0.040 0.059 0.054 0.211 41 T 0.042 0.196 0.060 0.029 0.031 0.057 0.041 0.544 42 G 0.205 0.137 0.091 0.046 0.043 0.055 0.082 0.341 43 M 0.190 0.040 0.198 0.051 0.047 0.114 0.031 0.329 44 C 0.027 0.018 0.276 0.133 0.107 0.081 0.015 0.343 45 L 0.040 0.010 0.166 0.136 0.268 0.064 0.004 0.311 46 F 0.018 0.009 0.162 0.298 0.297 0.048 0.004 0.165 47 S 0.017 0.006 0.101 0.148 0.196 0.065 0.005 0.461 48 V 0.024 0.008 0.135 0.187 0.310 0.044 0.005 0.287 49 R 0.029 0.010 0.056 0.106 0.257 0.182 0.009 0.350 50 S 0.044 0.007 0.029 0.072 0.142 0.170 0.008 0.528 51 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 52 G 0.023 0.005 0.022 0.054 0.080 0.330 0.012 0.475 53 G 0.348 0.005 0.016 0.014 0.020 0.129 0.018 0.449 54 V 0.102 0.038 0.098 0.083 0.162 0.089 0.004 0.424 55 A 0.025 0.042 0.085 0.191 0.277 0.090 0.003 0.286 56 E 0.072 0.058 0.080 0.108 0.236 0.088 0.012 0.346 57 L 0.096 0.110 0.129 0.179 0.243 0.040 0.015 0.188 58 Y 0.056 0.089 0.069 0.190 0.220 0.063 0.017 0.296 59 G 0.048 0.045 0.048 0.087 0.166 0.050 0.025 0.531 60 G 0.073 0.029 0.043 0.070 0.116 0.082 0.035 0.552 61 E 0.150 0.010 0.021 0.045 0.066 0.143 0.027 0.539 62 A 0.040 0.008 0.024 0.039 0.050 0.104 0.009 0.726 63 R 0.112 0.014 0.072 0.278 0.245 0.122 0.016 0.140 64 K 0.089 0.007 0.090 0.187 0.261 0.060 0.005 0.300 65 V 0.006 0.003 0.109 0.319 0.343 0.021 0.001 0.198 66 E 0.003 0.002 0.084 0.352 0.388 0.020 0.001 0.150 67 I 0.005 0.004 0.115 0.270 0.399 0.021 0.002 0.184 68 T 0.004 0.004 0.145 0.194 0.293 0.047 0.004 0.309 69 G 0.019 0.005 0.091 0.140 0.197 0.071 0.014 0.463 70 T 0.132 0.003 0.117 0.074 0.152 0.189 0.012 0.321 71 S 0.012 0.001 0.034 0.055 0.063 0.078 0.003 0.754 72 L 0.046 0.004 0.077 0.231 0.388 0.080 0.005 0.169 73 T 0.033 0.003 0.064 0.215 0.308 0.085 0.004 0.289 74 I 0.018 0.005 0.051 0.259 0.415 0.032 0.002 0.218 75 E 0.018 0.008 0.039 0.197 0.425 0.101 0.004 0.209 76 R 0.048 0.011 0.035 0.155 0.329 0.122 0.012 0.288 77 E 0.031 0.012 0.022 0.052 0.121 0.101 0.009 0.651 78 D 0.025 0.007 0.011 0.034 0.051 0.083 0.015 0.775 79 W 0.143 0.010 0.029 0.056 0.057 0.125 0.039 0.540 80 H 0.255 0.007 0.039 0.066 0.119 0.249 0.019 0.246 81 L 0.090 0.008 0.087 0.275 0.354 0.078 0.006 0.103 82 H 0.028 0.006 0.052 0.284 0.456 0.047 0.003 0.124 83 C 0.013 0.004 0.082 0.360 0.410 0.027 0.003 0.102 84 K 0.007 0.004 0.057 0.381 0.404 0.029 0.002 0.116 85 L 0.005 0.003 0.043 0.230 0.501 0.026 0.002 0.190 86 E 0.008 0.003 0.050 0.332 0.481 0.042 0.002 0.084 87 T 0.014 0.003 0.044 0.142 0.220 0.068 0.005 0.505 88 V 0.024 0.005 0.122 0.228 0.354 0.058 0.005 0.204 89 E 0.017 0.007 0.150 0.272 0.302 0.063 0.005 0.184 90 T 0.012 0.006 0.129 0.160 0.232 0.043 0.008 0.409 91 V 0.016 0.006 0.368 0.160 0.214 0.039 0.005 0.190 92 V 0.009 0.008 0.161 0.149 0.196 0.053 0.002 0.422 93 F 0.008 0.006 0.114 0.132 0.269 0.076 0.004 0.390 94 D 0.035 0.011 0.050 0.126 0.256 0.116 0.008 0.398 95 L 0.126 0.017 0.099 0.101 0.171 0.092 0.023 0.371 96 S 0.040 0.004 0.011 0.044 0.063 0.665 0.005 0.167 97 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 98 K 0.009 0.007 0.006 0.027 0.104 0.480 0.003 0.365 99 D 0.332 0.012 0.007 0.012 0.016 0.192 0.027 0.401 100 N 0.196 0.140 0.014 0.030 0.029 0.119 0.027 0.446 101 G 0.403 0.032 0.025 0.048 0.040 0.077 0.078 0.298 102 G 0.249 0.010 0.075 0.040 0.054 0.207 0.029 0.336 103 I 0.090 0.007 0.046 0.160 0.268 0.175 0.010 0.246 104 R 0.028 0.005 0.047 0.214 0.356 0.105 0.004 0.240 105 M 0.023 0.003 0.048 0.213 0.526 0.075 0.002 0.110 106 A 0.005 0.002 0.056 0.485 0.424 0.009 0.001 0.018 107 V 0.002 0.001 0.037 0.381 0.472 0.009 0.001 0.098 108 V 0.002 0.002 0.071 0.302 0.556 0.011 0.001 0.056 109 F 0.005 0.005 0.067 0.309 0.524 0.022 0.001 0.067 110 R 0.010 0.006 0.053 0.197 0.426 0.059 0.004 0.244 111 D 0.028 0.012 0.039 0.079 0.178 0.103 0.011 0.550 112 K 0.087 0.008 0.016 0.019 0.047 0.114 0.012 0.699 113 H 0.086 0.015 0.012 0.035 0.037 0.398 0.041 0.378 114 Q 0.276 0.022 0.020 0.021 0.036 0.228 0.091 0.307 115 A 0.172 0.017 0.049 0.052 0.049 0.076 0.007 0.579 116 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 117 V 0.004 0.002 0.037 0.049 0.172 0.045 0.001 0.690 118 L 0.063 0.019 0.193 0.186 0.247 0.033 0.004 0.254 119 R 0.034 0.032 0.102 0.264 0.335 0.049 0.004 0.181 120 A 0.043 0.051 0.149 0.108 0.247 0.044 0.003 0.356 121 A 0.060 0.066 0.119 0.119 0.186 0.097 0.015 0.338 122 W 0.139 0.057 0.037 0.043 0.066 0.072 0.053 0.532 123 L 0.335 0.043 0.087 0.068 0.099 0.057 0.026 0.285 124 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 125 R 0.034 0.022 0.032 0.055 0.143 0.100 0.016 0.596 126 L 0.269 0.076 0.107 0.034 0.050 0.048 0.034 0.383 127 M 0.173 0.050 0.094 0.101 0.091 0.084 0.019 0.387 128 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 129 E 0.029 0.008 0.037 0.029 0.078 0.160 0.008 0.652 130 T 0.352 0.009 0.021 0.018 0.019 0.066 0.013 0.502 131 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 132 S 0.023 0.003 0.011 0.013 0.031 0.546 0.005 0.368 133 P 0.073 0.002 0.002 0.002 0.002 0.031 0.002 0.886 134 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 135 E 0.014 0.010 0.008 0.011 0.023 0.307 0.003 0.623 136 Q 0.232 0.121 0.010 0.010 0.017 0.104 0.006 0.499 137 F 0.106 0.495 0.010 0.029 0.066 0.038 0.005 0.251 138 W 0.072 0.595 0.014 0.032 0.060 0.037 0.005 0.184 139 A 0.052 0.667 0.015 0.037 0.044 0.021 0.011 0.154 140 F 0.091 0.621 0.013 0.034 0.046 0.025 0.026 0.143 141 T 0.089 0.567 0.025 0.053 0.061 0.028 0.032 0.144 142 Q 0.041 0.515 0.049 0.066 0.073 0.039 0.017 0.199 143 R 0.072 0.374 0.037 0.072 0.081 0.080 0.027 0.257 144 Y 0.112 0.265 0.067 0.081 0.097 0.072 0.030 0.275 145 I 0.076 0.250 0.093 0.163 0.141 0.048 0.024 0.205 146 D 0.020 0.100 0.088 0.092 0.098 0.050 0.034 0.519 147 L 0.127 0.030 0.115 0.124 0.171 0.081 0.028 0.323 148 P 0.001 0.001 0.002 0.003 0.002 0.005 0.001 0.987 149 M 0.020 0.005 0.167 0.155 0.250 0.128 0.008 0.268 150 V 0.049 0.020 0.203 0.161 0.167 0.040 0.004 0.356 151 V 0.009 0.010 0.270 0.230 0.296 0.023 0.002 0.161 152 D 0.009 0.017 0.072 0.177 0.265 0.061 0.002 0.397 153 A 0.031 0.028 0.164 0.102 0.308 0.061 0.008 0.300 154 R 0.037 0.023 0.031 0.057 0.097 0.497 0.015 0.242 155 N 0.262 0.034 0.026 0.037 0.055 0.171 0.062 0.354 156 R 0.249 0.092 0.077 0.062 0.060 0.131 0.030 0.299 157 Q 0.117 0.048 0.098 0.125 0.138 0.170 0.031 0.273 158 L 0.062 0.021 0.098 0.148 0.239 0.058 0.015 0.359 159 V 0.033 0.018 0.107 0.178 0.363 0.037 0.009 0.256 160 F 0.013 0.012 0.118 0.233 0.249 0.057 0.004 0.314 161 P 0.001 0.001 0.002 0.004 0.006 0.003 0.001 0.984 162 G 0.012 0.006 0.038 0.071 0.177 0.193 0.007 0.496 163 S 0.327 0.005 0.021 0.029 0.033 0.093 0.018 0.473 164 G 0.083 0.021 0.083 0.073 0.068 0.117 0.021 0.534 165 Q 0.132 0.008 0.037 0.037 0.080 0.233 0.011 0.461 166 G 0.051 0.014 0.061 0.064 0.072 0.105 0.012 0.621 167 G 0.109 0.009 0.029 0.056 0.094 0.141 0.013 0.550 168 F 0.089 0.011 0.103 0.087 0.138 0.113 0.008 0.451 169 T 0.047 0.010 0.025 0.084 0.197 0.187 0.006 0.445 170 E 0.046 0.012 0.032 0.083 0.153 0.097 0.006 0.570 171 G 0.045 0.018 0.021 0.051 0.096 0.239 0.010 0.520 172 S 0.140 0.014 0.018 0.035 0.063 0.203 0.015 0.512