This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 1 NATAA M A 2 2 NATAA K A 3 3 NATAA N A 4 4 NATAA A A 5 5 NATAA M A 6 6 NATAA A A 7 7 NATAA L A 8 8 NATAA T A 9 9 NATAA L A 10 10 NATAA A A 11 11 NATAA G A 12 12 NATAA L A 13 13 NATAA L A 14 14 NATAA A A 15 15 NATAA A A 16 16 NATRO P A 17 17 NATAA S A 18 18 NATAA L A 19 19 NATAA G A 20 20 NATAA F A 21 21 NATAA A A 22 22 NATAA A A 23 23 NATAA A A 24 24 NATRO P A 25 25 NATAA D A 26 26 NATAA A A 27 27 NATAA V A 28 28 NATAA M A 29 29 NATAA V A 30 30 NATAA F A 31 31 NATAA A A 32 32 NATAA R A 33 33 NATAA Q A 34 34 NATAA G A 35 35 NATAA D A 36 36 NATAA K A 37 37 NATAA G A 38 38 NATAA S A 39 39 NATAA V A 40 40 NATAA S A 41 41 NATAA V A 42 42 NATAA G A 43 43 NATAA D A 44 44 NATAA K A 45 45 NATAA H A 46 46 NATAA F A 47 47 NATAA R A 48 48 NATAA T A 49 49 NATAA Q A 50 50 NATAA A A 51 51 NATAA F A 52 52 NATAA K A 53 53 NATAA V A 54 54 NATAA R A 55 55 NATAA L A 56 56 NATAA V A 57 57 NATAA N A 58 58 NATAA A A 59 59 NATAA A A 60 60 NATAA K A 61 61 NATAA S A 62 62 NATAA E A 63 63 NATAA I A 64 64 NATAA S A 65 65 NATAA L A 66 66 NATAA K A 67 67 NATAA N A 68 68 NATAA S A 69 69 NATRO C A 70 70 NATAA L A 71 71 NATAA V A 72 72 NATAA A A 73 73 NATAA Q A 74 74 NATAA S A 75 75 NATAA A A 76 76 NATAA A A 77 77 NATAA G A 78 78 NATAA Q A 79 79 NATAA S A 80 80 NATAA F A 81 81 NATAA R A 82 82 NATAA L A 83 83 NATAA D A 84 84 NATAA T A 85 85 NATAA V A 86 86 NATAA D A 87 87 NATAA E A 88 88 NATAA E A 89 89 NATAA L A 90 90 NATAA T A 91 91 NATAA A A 92 92 NATAA D A 93 93 NATAA T A 94 94 NATAA L A 95 95 NATAA K A 96 96 NATRO P A 97 97 NATAA G A 98 98 NATAA A A 99 99 NATAA S A 100 100 NATAA V A 101 101 NATAA E A 102 102 NATAA G A 103 103 NATAA D A 104 104 NATAA A A 105 105 NATAA I A 106 106 NATAA F A 107 107 NATAA A A 108 108 NATAA S A 109 109 NATAA E A 110 110 NATAA D A 111 111 NATAA D A 112 112 NATAA A A 113 113 NATAA V A 114 114 NATAA Y A 115 115 NATAA G A 116 116 NATAA A A 117 117 NATAA S A 118 118 NATAA L A 119 119 NATAA V A 120 120 NATAA R A 121 121 NATAA L A 122 122 NATAA S A 123 123 NATAA D A 124 124 NATAA R A 125 125 NATRO C A 126 126 NATAA K