# TARGET T0573 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0573.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 2495 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.073 0.004 0.007 0.006 0.171 0.738 2 S 0.213 0.040 0.009 0.006 0.140 0.592 3 T 0.295 0.018 0.003 0.005 0.108 0.571 4 S 0.333 0.005 0.007 0.007 0.091 0.557 5 A 0.720 0.027 0.008 0.010 0.057 0.178 6 I 0.794 0.036 0.005 0.008 0.046 0.111 7 D 0.503 0.018 0.007 0.015 0.137 0.321 8 P 0.084 0.005 0.280 0.109 0.307 0.214 9 V 0.021 0.009 0.505 0.088 0.267 0.110 10 S 0.007 0.004 0.593 0.078 0.270 0.047 11 F 0.012 0.016 0.203 0.115 0.473 0.181 12 S 0.011 0.042 0.083 0.113 0.508 0.243 13 L 0.004 0.005 0.037 0.060 0.558 0.336 14 Y 0.002 0.003 0.037 0.070 0.474 0.414 15 A 0.001 0.004 0.079 0.153 0.571 0.191 16 K 0.001 0.002 0.123 0.351 0.428 0.094 17 D 0.002 0.006 0.120 0.381 0.348 0.142 18 F 0.003 0.004 0.055 0.614 0.187 0.138 19 T 0.001 0.001 0.016 0.859 0.052 0.070 20 R 0.001 0.002 0.013 0.947 0.018 0.020 21 F 0.001 0.001 0.009 0.973 0.007 0.009 22 A 0.001 0.001 0.002 0.994 0.002 0.002 23 Q 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 24 E 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 25 L 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 26 G 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 27 A 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 28 S 0.001 0.001 0.001 0.995 0.003 0.001 29 F 0.001 0.001 0.004 0.987 0.007 0.002 30 E 0.001 0.001 0.010 0.960 0.022 0.007 31 R 0.002 0.001 0.014 0.797 0.108 0.078 32 Y 0.017 0.001 0.012 0.333 0.243 0.394 33 G 0.041 0.002 0.001 0.010 0.126 0.820 34 F 0.579 0.006 0.001 0.008 0.072 0.334 35 A 0.904 0.002 0.001 0.009 0.019 0.066 36 V 0.957 0.003 0.001 0.010 0.010 0.019 37 L 0.949 0.001 0.002 0.011 0.015 0.023 38 S 0.836 0.005 0.006 0.021 0.065 0.067 39 D 0.289 0.010 0.030 0.082 0.330 0.258 40 Y 0.056 0.005 0.021 0.033 0.483 0.403 41 D 0.009 0.004 0.003 0.003 0.306 0.674 42 L 0.005 0.028 0.001 0.001 0.219 0.746 43 D 0.002 0.002 0.001 0.006 0.096 0.894 44 Q 0.001 0.001 0.010 0.941 0.026 0.023 45 A 0.001 0.001 0.010 0.965 0.020 0.004 46 R 0.001 0.001 0.016 0.967 0.014 0.003 47 I 0.001 0.001 0.002 0.993 0.002 0.002 48 D 0.001 0.001 0.002 0.990 0.005 0.003 49 A 0.001 0.001 0.002 0.987 0.006 0.005 50 A 0.001 0.001 0.001 0.985 0.005 0.009 51 V 0.001 0.001 0.001 0.996 0.002 0.002 52 D 0.001 0.001 0.001 0.994 0.002 0.003 53 S 0.001 0.001 0.001 0.994 0.003 0.002 54 A 0.001 0.001 0.003 0.987 0.007 0.002 55 K 0.001 0.001 0.012 0.959 0.024 0.005 56 A 0.001 0.001 0.020 0.910 0.055 0.014 57 F 0.001 0.001 0.032 0.851 0.085 0.032 58 F 0.001 0.003 0.038 0.730 0.135 0.093 59 A 0.004 0.003 0.028 0.271 0.338 0.356 60 L 0.009 0.004 0.004 0.049 0.242 0.692 61 P 0.004 0.002 0.004 0.053 0.212 0.725 62 V 0.002 0.001 0.029 0.822 0.093 0.054 63 E 0.005 0.001 0.026 0.861 0.081 0.026 64 T 0.004 0.001 0.025 0.902 0.054 0.014 65 K 0.019 0.002 0.022 0.855 0.048 0.054 66 K 0.020 0.005 0.040 0.815 0.077 0.043 67 Q 0.010 0.002 0.041 0.782 0.093 0.074 68 Y 0.021 0.003 0.029 0.676 0.126 0.145 69 A 0.029 0.014 0.030 0.564 0.166 0.196 70 G 0.047 0.009 0.028 0.313 0.261 0.342 71 V 0.028 0.010 0.031 0.106 0.401 0.425 72 K 0.022 0.009 0.051 0.063 0.556 0.298 73 G 0.017 0.008 0.084 0.048 0.629 0.214 74 G 0.024 0.010 0.113 0.043 0.572 0.237 75 A 0.070 0.016 0.107 0.040 0.470 0.297 76 R 0.165 0.020 0.061 0.038 0.350 0.365 77 G 0.300 0.029 0.034 0.037 0.248 0.352 78 Y 0.419 0.031 0.021 0.038 0.179 0.313 79 I 0.470 0.031 0.018 0.042 0.156 0.282 80 P 0.423 0.023 0.020 0.047 0.196 0.291 81 F 0.300 0.014 0.035 0.065 0.270 0.316 82 G 0.231 0.017 0.055 0.083 0.315 0.300 83 V 0.213 0.022 0.069 0.106 0.307 0.283 84 E 0.228 0.020 0.067 0.116 0.283 0.286 85 T 0.263 0.024 0.067 0.132 0.259 0.255 86 A 0.226 0.025 0.058 0.132 0.274 0.284 87 K 0.144 0.022 0.058 0.130 0.357 0.290 88 G 0.077 0.014 0.054 0.125 0.423 0.307 89 A 0.053 0.013 0.052 0.101 0.449 0.332 90 D 0.057 0.016 0.038 0.087 0.422 0.381 91 H 0.074 0.025 0.036 0.094 0.368 0.402 92 Y 0.065 0.017 0.049 0.145 0.372 0.351 93 D 0.067 0.012 0.058 0.136 0.389 0.338 94 L 0.069 0.012 0.132 0.290 0.313 0.184 95 K 0.122 0.015 0.116 0.283 0.253 0.210 96 E 0.186 0.014 0.108 0.329 0.190 0.173 97 F 0.273 0.022 0.063 0.290 0.151 0.201 98 W 0.286 0.019 0.045 0.277 0.141 0.232 99 H 0.233 0.019 0.037 0.226 0.205 0.280 100 M 0.129 0.015 0.064 0.293 0.236 0.263 101 G 0.083 0.016 0.084 0.234 0.320 0.264 102 R 0.063 0.010 0.121 0.265 0.341 0.200 103 D 0.049 0.015 0.102 0.251 0.343 0.239 104 L 0.038 0.017 0.088 0.215 0.373 0.269 105 P 0.029 0.011 0.104 0.217 0.382 0.258 106 P 0.026 0.015 0.123 0.218 0.367 0.252 107 G 0.029 0.014 0.115 0.194 0.388 0.260 108 H 0.035 0.017 0.080 0.190 0.336 0.342 109 R 0.039 0.018 0.064 0.156 0.307 0.416 110 F 0.036 0.019 0.073 0.171 0.309 0.392 111 R 0.034 0.019 0.095 0.190 0.312 0.349 112 A 0.035 0.015 0.092 0.166 0.324 0.368 113 H 0.043 0.022 0.083 0.140 0.379 0.333 114 M 0.037 0.022 0.069 0.133 0.370 0.369 115 A 0.039 0.021 0.048 0.099 0.403 0.390 116 D 0.038 0.018 0.063 0.112 0.419 0.350 117 N 0.037 0.023 0.041 0.098 0.320 0.480 118 V 0.030 0.025 0.050 0.104 0.324 0.467 119 W 0.018 0.022 0.033 0.090 0.325 0.512 120 P 0.012 0.009 0.085 0.126 0.402 0.366 121 A 0.008 0.010 0.108 0.161 0.394 0.320 122 E 0.004 0.009 0.063 0.123 0.378 0.423 123 I 0.003 0.006 0.043 0.212 0.357 0.380 124 P 0.001 0.001 0.073 0.618 0.221 0.085 125 A 0.001 0.003 0.064 0.673 0.178 0.081 126 F 0.001 0.001 0.029 0.851 0.072 0.045 127 K 0.001 0.001 0.007 0.919 0.033 0.040 128 H 0.001 0.001 0.005 0.964 0.016 0.014 129 D 0.001 0.001 0.006 0.976 0.008 0.008 130 V 0.001 0.001 0.004 0.967 0.009 0.019 131 S 0.001 0.001 0.002 0.987 0.004 0.007 132 W 0.001 0.001 0.001 0.990 0.003 0.005 133 L 0.001 0.001 0.001 0.991 0.002 0.006 134 Y 0.001 0.001 0.001 0.993 0.002 0.004 135 N 0.001 0.001 0.001 0.992 0.004 0.004 136 S 0.001 0.001 0.002 0.991 0.004 0.004 137 L 0.001 0.001 0.001 0.991 0.003 0.005 138 D 0.001 0.001 0.001 0.993 0.002 0.004 139 G 0.001 0.001 0.001 0.990 0.003 0.006 140 M 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.002 141 G 0.001 0.001 0.002 0.995 0.002 0.002 142 G 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 143 K 0.001 0.001 0.001 0.995 0.002 0.003 144 V 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.002 145 L 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 146 E 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 147 A 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 148 I 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 149 A 0.001 0.001 0.001 0.998 0.002 0.001 150 T 0.001 0.001 0.002 0.992 0.005 0.001 151 Y 0.001 0.001 0.003 0.981 0.009 0.007 152 L 0.001 0.001 0.005 0.902 0.020 0.073 153 K 0.001 0.001 0.001 0.015 0.051 0.930 154 L 0.005 0.006 0.001 0.007 0.075 0.906 155 E 0.011 0.006 0.005 0.016 0.173 0.788 156 R 0.003 0.002 0.388 0.334 0.193 0.081 157 D 0.004 0.001 0.501 0.358 0.105 0.031 158 F 0.003 0.001 0.554 0.389 0.048 0.006 159 F 0.013 0.004 0.182 0.725 0.046 0.030 160 K 0.015 0.004 0.238 0.673 0.055 0.015 161 P 0.012 0.001 0.196 0.675 0.087 0.028 162 T 0.015 0.002 0.160 0.564 0.174 0.085 163 V 0.021 0.021 0.087 0.382 0.322 0.166 164 Q 0.033 0.012 0.059 0.185 0.495 0.216 165 D 0.027 0.005 0.049 0.055 0.705 0.157 166 G 0.040 0.006 0.052 0.027 0.740 0.135 167 N 0.128 0.009 0.047 0.013 0.617 0.186 168 S 0.535 0.009 0.014 0.010 0.230 0.203 169 V 0.871 0.008 0.004 0.004 0.038 0.076 170 L 0.954 0.005 0.001 0.002 0.009 0.029 171 R 0.964 0.002 0.002 0.003 0.009 0.020 172 L 0.922 0.006 0.005 0.005 0.019 0.044 173 L 0.680 0.004 0.013 0.016 0.099 0.189 174 H 0.502 0.009 0.005 0.008 0.128 0.348 175 Y 0.240 0.060 0.004 0.003 0.177 0.517 176 P 0.140 0.064 0.008 0.005 0.443 0.340 177 P 0.080 0.025 0.031 0.009 0.516 0.340 178 I 0.027 0.026 0.043 0.013 0.608 0.284 179 P 0.038 0.023 0.036 0.016 0.585 0.302 180 K 0.035 0.024 0.024 0.014 0.437 0.466 181 D 0.026 0.035 0.062 0.020 0.562 0.294 182 A 0.023 0.013 0.067 0.017 0.555 0.325 183 T 0.052 0.011 0.086 0.028 0.495 0.328 184 G 0.153 0.037 0.038 0.033 0.372 0.368 185 V 0.234 0.097 0.022 0.032 0.242 0.373 186 R 0.149 0.019 0.009 0.014 0.275 0.533 187 A 0.088 0.026 0.037 0.018 0.334 0.497 188 G 0.056 0.070 0.050 0.015 0.541 0.268 189 A 0.053 0.010 0.104 0.018 0.555 0.260 190 H 0.069 0.019 0.085 0.015 0.559 0.252 191 G 0.090 0.079 0.019 0.009 0.465 0.338 192 D 0.046 0.027 0.016 0.019 0.630 0.262 193 I 0.012 0.004 0.154 0.169 0.603 0.058 194 N 0.035 0.005 0.164 0.150 0.590 0.055 195 T 0.124 0.006 0.195 0.242 0.394 0.039 196 I 0.470 0.018 0.058 0.234 0.116 0.105 197 T 0.717 0.022 0.033 0.140 0.046 0.042 198 L 0.783 0.006 0.036 0.101 0.041 0.034 199 L 0.806 0.008 0.015 0.088 0.037 0.046 200 L 0.658 0.014 0.020 0.112 0.103 0.092 201 G 0.410 0.011 0.026 0.065 0.318 0.171 202 A 0.201 0.016 0.029 0.018 0.559 0.177 203 E 0.118 0.015 0.033 0.015 0.660 0.158 204 E 0.124 0.031 0.042 0.014 0.648 0.141 205 G 0.131 0.009 0.042 0.010 0.591 0.216 206 G 0.319 0.004 0.056 0.010 0.440 0.171 207 L 0.707 0.031 0.023 0.005 0.125 0.109 208 E 0.875 0.010 0.006 0.002 0.039 0.068 209 V 0.935 0.004 0.004 0.001 0.023 0.032 210 L 0.937 0.024 0.001 0.001 0.015 0.023 211 D 0.520 0.025 0.002 0.002 0.439 0.012 212 R 0.040 0.001 0.004 0.003 0.944 0.008 213 D 0.019 0.001 0.002 0.001 0.974 0.004 214 G 0.054 0.003 0.001 0.001 0.927 0.015 215 Q 0.735 0.008 0.001 0.001 0.054 0.203 216 W 0.936 0.047 0.001 0.001 0.005 0.013 217 L 0.941 0.001 0.001 0.001 0.010 0.048 218 P 0.860 0.014 0.001 0.001 0.020 0.106 219 I 0.327 0.032 0.001 0.001 0.064 0.575 220 N 0.128 0.006 0.002 0.001 0.125 0.738 221 P 0.072 0.030 0.006 0.002 0.189 0.701 222 P 0.053 0.082 0.020 0.002 0.784 0.058 223 P 0.044 0.011 0.013 0.002 0.884 0.047 224 G 0.020 0.001 0.006 0.001 0.935 0.038 225 C 0.561 0.024 0.002 0.001 0.366 0.046 226 L 0.928 0.016 0.001 0.001 0.015 0.039 227 V 0.978 0.004 0.001 0.002 0.003 0.013 228 I 0.957 0.004 0.001 0.003 0.007 0.030 229 N 0.741 0.036 0.001 0.013 0.021 0.188 230 I 0.104 0.002 0.012 0.515 0.098 0.269 231 G 0.001 0.001 0.007 0.959 0.020 0.012 232 D 0.001 0.001 0.007 0.983 0.008 0.002 233 M 0.001 0.001 0.002 0.995 0.003 0.001 234 L 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 235 E 0.001 0.001 0.001 0.996 0.002 0.001 236 R 0.001 0.001 0.002 0.990 0.007 0.002 237 L 0.001 0.001 0.001 0.988 0.006 0.003 238 T 0.002 0.003 0.003 0.953 0.024 0.015 239 N 0.004 0.001 0.005 0.704 0.131 0.155 240 N 0.006 0.001 0.011 0.083 0.347 0.552 241 V 0.070 0.020 0.023 0.087 0.398 0.402 242 L 0.157 0.077 0.025 0.050 0.329 0.361 243 P 0.119 0.031 0.018 0.035 0.249 0.548 244 S 0.188 0.014 0.077 0.034 0.308 0.379 245 T 0.300 0.015 0.093 0.027 0.323 0.242 246 V 0.335 0.012 0.098 0.030 0.263 0.263 247 H 0.447 0.014 0.060 0.028 0.223 0.227 248 R 0.660 0.006 0.018 0.021 0.123 0.172 249 V 0.758 0.016 0.010 0.027 0.057 0.133 250 V 0.711 0.026 0.006 0.024 0.086 0.147 251 N 0.371 0.032 0.005 0.026 0.182 0.384 252 P 0.116 0.017 0.012 0.023 0.338 0.495 253 P 0.017 0.009 0.192 0.050 0.505 0.227 254 P 0.008 0.006 0.429 0.063 0.378 0.116 255 E 0.006 0.006 0.413 0.068 0.417 0.091 256 R 0.010 0.018 0.150 0.088 0.590 0.145 257 R 0.020 0.009 0.069 0.093 0.579 0.230 258 G 0.032 0.014 0.051 0.039 0.540 0.325 259 V 0.047 0.010 0.034 0.027 0.510 0.372 260 P 0.160 0.015 0.023 0.024 0.222 0.557 261 R 0.439 0.016 0.021 0.031 0.120 0.372 262 Y 0.629 0.025 0.009 0.027 0.056 0.254 263 S 0.600 0.020 0.009 0.043 0.047 0.281 264 T 0.527 0.010 0.043 0.177 0.070 0.173 265 P 0.370 0.007 0.154 0.283 0.099 0.087 266 F 0.366 0.004 0.220 0.222 0.130 0.057 267 F 0.326 0.017 0.186 0.219 0.177 0.075 268 L 0.217 0.052 0.063 0.109 0.279 0.278 269 H 0.072 0.014 0.023 0.024 0.607 0.260 270 F 0.017 0.012 0.038 0.020 0.658 0.254 271 A 0.015 0.023 0.034 0.008 0.878 0.042 272 S 0.016 0.005 0.053 0.009 0.887 0.030 273 D 0.050 0.004 0.039 0.010 0.754 0.141 274 Y 0.537 0.040 0.016 0.008 0.311 0.088 275 E 0.788 0.011 0.003 0.005 0.050 0.142 276 I 0.884 0.014 0.002 0.005 0.021 0.074 277 K 0.815 0.015 0.003 0.009 0.039 0.119 278 T 0.381 0.019 0.006 0.023 0.091 0.479 279 L 0.099 0.010 0.093 0.081 0.258 0.459 280 Q 0.015 0.003 0.626 0.050 0.204 0.103 281 N 0.008 0.002 0.707 0.047 0.180 0.056 282 C 0.013 0.013 0.545 0.056 0.260 0.112 283 V 0.032 0.058 0.129 0.075 0.346 0.360 284 T 0.016 0.013 0.038 0.039 0.608 0.285 285 A 0.006 0.004 0.118 0.075 0.651 0.146 286 E 0.005 0.004 0.157 0.063 0.673 0.097 287 N 0.011 0.011 0.156 0.048 0.646 0.128 288 P 0.013 0.014 0.269 0.085 0.372 0.247 289 D 0.016 0.016 0.256 0.066 0.395 0.252 290 R 0.019 0.016 0.264 0.071 0.367 0.264 291 Y 0.024 0.057 0.089 0.029 0.502 0.299 292 P 0.015 0.010 0.029 0.017 0.468 0.461 293 E 0.034 0.006 0.022 0.020 0.353 0.565 294 S 0.223 0.072 0.020 0.030 0.265 0.391 295 I 0.224 0.090 0.004 0.028 0.070 0.584 296 T 0.007 0.001 0.014 0.933 0.026 0.021 297 A 0.001 0.001 0.006 0.979 0.011 0.003 298 D 0.001 0.001 0.005 0.982 0.011 0.002 299 E 0.001 0.001 0.003 0.977 0.016 0.004 300 F 0.001 0.001 0.001 0.975 0.010 0.012 301 L 0.002 0.001 0.002 0.967 0.017 0.011 302 Q 0.001 0.001 0.003 0.963 0.019 0.014 303 Q 0.002 0.002 0.005 0.936 0.032 0.024 304 R 0.002 0.002 0.015 0.883 0.059 0.039 305 L 0.004 0.001 0.021 0.808 0.095 0.072 306 R 0.006 0.002 0.037 0.654 0.159 0.144 307 E 0.008 0.006 0.038 0.477 0.234 0.237 308 I 0.010 0.012 0.079 0.321 0.309 0.268 309 K 0.005 0.006 0.072 0.159 0.339 0.419 310 L 0.004 0.004 0.035 0.073 0.279 0.605 311 A 0.002 0.005 0.030 0.081 0.220 0.661