# TARGET T0569 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0569.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 4.52249 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.128 0.001 0.005 0.009 0.018 0.073 0.021 0.744 2 D 0.067 0.002 0.009 0.009 0.018 0.087 0.046 0.762 3 E 0.012 0.002 0.063 0.043 0.144 0.185 0.032 0.520 4 D 0.002 0.001 0.081 0.053 0.166 0.074 0.059 0.565 5 A 0.001 0.001 0.242 0.269 0.258 0.039 0.045 0.146 6 T 0.002 0.001 0.363 0.197 0.251 0.019 0.052 0.115 7 I 0.002 0.001 0.243 0.307 0.288 0.017 0.025 0.119 8 T 0.002 0.001 0.501 0.138 0.247 0.016 0.021 0.076 9 Y 0.004 0.001 0.147 0.287 0.354 0.040 0.026 0.143 10 V 0.013 0.001 0.144 0.147 0.140 0.098 0.026 0.432 11 D 0.150 0.008 0.040 0.099 0.107 0.146 0.091 0.358 12 D 0.082 0.006 0.015 0.013 0.026 0.150 0.027 0.681 13 D 0.305 0.007 0.004 0.005 0.009 0.080 0.016 0.574 14 K 0.445 0.022 0.004 0.013 0.012 0.086 0.033 0.385 15 G 0.036 0.021 0.003 0.012 0.054 0.106 0.013 0.755 16 G 0.024 0.008 0.012 0.041 0.150 0.086 0.025 0.655 17 A 0.021 0.005 0.014 0.461 0.216 0.067 0.033 0.183 18 Q 0.052 0.006 0.019 0.095 0.136 0.079 0.030 0.584 19 V 0.091 0.006 0.021 0.093 0.190 0.084 0.040 0.474 20 G 0.026 0.003 0.024 0.071 0.157 0.080 0.047 0.592 21 D 0.030 0.007 0.021 0.100 0.189 0.076 0.063 0.513 22 I 0.014 0.003 0.041 0.186 0.244 0.080 0.059 0.372 23 V 0.006 0.002 0.078 0.191 0.323 0.073 0.049 0.278 24 T 0.023 0.001 0.074 0.096 0.159 0.074 0.050 0.524 25 V 0.061 0.002 0.065 0.154 0.117 0.096 0.054 0.451 26 T 0.021 0.003 0.055 0.052 0.107 0.101 0.040 0.620 27 G 0.021 0.003 0.050 0.046 0.103 0.135 0.032 0.609 28 K 0.034 0.003 0.044 0.092 0.096 0.122 0.060 0.550 29 T 0.057 0.004 0.022 0.038 0.047 0.101 0.183 0.549 30 D 0.088 0.008 0.029 0.057 0.080 0.123 0.140 0.475 31 D 0.055 0.004 0.019 0.028 0.068 0.121 0.041 0.663 32 S 0.029 0.003 0.022 0.038 0.075 0.106 0.048 0.678 33 T 0.035 0.004 0.032 0.061 0.171 0.113 0.061 0.524 34 T 0.037 0.003 0.026 0.077 0.142 0.101 0.072 0.542 35 Y 0.016 0.002 0.048 0.158 0.239 0.099 0.034 0.405 36 T 0.005 0.001 0.042 0.108 0.206 0.067 0.025 0.548 37 V 0.003 0.001 0.090 0.239 0.324 0.071 0.027 0.245 38 T 0.007 0.001 0.121 0.130 0.202 0.063 0.049 0.428 39 I 0.236 0.006 0.069 0.146 0.092 0.071 0.050 0.330 40 P 0.181 0.008 0.041 0.034 0.037 0.079 0.048 0.572 41 D 0.039 0.008 0.027 0.020 0.067 0.127 0.018 0.694 42 G 0.048 0.008 0.041 0.037 0.170 0.094 0.051 0.552 43 Y 0.015 0.004 0.031 0.240 0.217 0.079 0.042 0.370 44 E 0.007 0.001 0.058 0.259 0.318 0.058 0.024 0.274 45 Y 0.006 0.001 0.040 0.211 0.265 0.064 0.056 0.356 46 V 0.016 0.002 0.102 0.215 0.213 0.073 0.055 0.325 47 G 0.243 0.002 0.036 0.040 0.066 0.069 0.057 0.487 48 T 0.338 0.003 0.009 0.026 0.021 0.064 0.039 0.500 49 D 0.050 0.002 0.014 0.014 0.053 0.135 0.018 0.714 50 G 0.007 0.001 0.015 0.022 0.117 0.095 0.017 0.726 51 G 0.002 0.001 0.052 0.366 0.345 0.054 0.017 0.164 52 V 0.002 0.001 0.037 0.194 0.208 0.056 0.032 0.471 53 V 0.006 0.001 0.082 0.307 0.194 0.051 0.032 0.326 54 S 0.218 0.001 0.050 0.028 0.037 0.061 0.048 0.558 55 S 0.652 0.002 0.008 0.009 0.007 0.030 0.036 0.256 56 D 0.032 0.002 0.016 0.007 0.035 0.115 0.012 0.781 57 G 0.004 0.001 0.031 0.013 0.091 0.119 0.024 0.719 58 K 0.005 0.001 0.090 0.312 0.381 0.051 0.038 0.122 59 T 0.002 0.001 0.082 0.147 0.194 0.044 0.056 0.475 60 V 0.001 0.001 0.214 0.366 0.313 0.018 0.017 0.069 61 T 0.003 0.002 0.360 0.164 0.306 0.017 0.039 0.109 62 I 0.008 0.004 0.248 0.350 0.234 0.020 0.040 0.096 63 T 0.005 0.002 0.408 0.183 0.262 0.017 0.050 0.073 64 F 0.032 0.003 0.126 0.198 0.242 0.066 0.071 0.261 65 A 0.158 0.002 0.115 0.124 0.124 0.080 0.063 0.334 66 A 0.043 0.001 0.015 0.019 0.044 0.141 0.040 0.696 67 D 0.012 0.001 0.010 0.006 0.017 0.135 0.021 0.798 68 D 0.079 0.003 0.010 0.011 0.021 0.146 0.043 0.687 69 S 0.086 0.010 0.022 0.022 0.029 0.171 0.087 0.574 70 D 0.016 0.006 0.071 0.047 0.164 0.161 0.042 0.493 71 N 0.004 0.003 0.119 0.107 0.316 0.067 0.066 0.319 72 V 0.002 0.002 0.207 0.280 0.338 0.031 0.034 0.105 73 V 0.001 0.001 0.290 0.251 0.348 0.013 0.031 0.065 74 I 0.002 0.001 0.179 0.400 0.337 0.010 0.026 0.045 75 H 0.005 0.001 0.270 0.217 0.395 0.015 0.040 0.056 76 L 0.026 0.001 0.099 0.268 0.351 0.041 0.036 0.178 77 K 0.061 0.002 0.050 0.181 0.224 0.073 0.049 0.361 78 H 0.014 0.002 0.015 0.031 0.081 0.101 0.019 0.737 79 G 0.029 0.003 0.022 0.050 0.116 0.119 0.032 0.630