# TARGET T0523 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t04-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-n_notor2-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 n_notor2 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0523.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 5880 # Pos AA G H I P A B S F J M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 0.993 2 A 0.010 0.002 0.001 0.007 0.005 0.015 0.055 0.001 0.001 0.001 0.906 3 I 0.075 0.024 0.001 0.009 0.009 0.020 0.131 0.001 0.001 0.003 0.727 4 D 0.098 0.119 0.002 0.009 0.005 0.010 0.183 0.001 0.001 0.002 0.572 5 Y 0.085 0.347 0.005 0.018 0.006 0.016 0.067 0.002 0.001 0.002 0.452 6 K 0.024 0.566 0.002 0.009 0.006 0.016 0.055 0.002 0.001 0.001 0.318 7 T 0.022 0.736 0.001 0.007 0.002 0.005 0.056 0.002 0.001 0.001 0.168 8 A 0.027 0.889 0.002 0.003 0.002 0.004 0.007 0.005 0.001 0.001 0.061 9 F 0.011 0.955 0.003 0.001 0.001 0.002 0.001 0.008 0.001 0.001 0.018 10 H 0.032 0.892 0.006 0.001 0.002 0.003 0.002 0.024 0.001 0.001 0.038 11 L 0.142 0.664 0.025 0.003 0.002 0.004 0.004 0.095 0.001 0.001 0.060 12 A 0.275 0.394 0.085 0.006 0.019 0.017 0.010 0.073 0.001 0.001 0.121 13 P 0.003 0.001 0.001 0.002 0.002 0.003 0.002 0.001 0.001 0.001 0.985 14 I 0.035 0.010 0.029 0.126 0.097 0.134 0.084 0.002 0.001 0.002 0.479 15 G 0.135 0.028 0.009 0.131 0.110 0.132 0.075 0.003 0.001 0.010 0.368 16 L 0.028 0.019 0.006 0.375 0.172 0.249 0.026 0.001 0.001 0.001 0.122 17 V 0.004 0.004 0.002 0.379 0.181 0.290 0.015 0.001 0.001 0.001 0.123 18 L 0.002 0.003 0.001 0.211 0.285 0.356 0.018 0.001 0.001 0.001 0.121 19 S 0.002 0.002 0.001 0.172 0.246 0.374 0.039 0.001 0.001 0.002 0.161 20 R 0.007 0.001 0.002 0.059 0.131 0.290 0.086 0.001 0.001 0.003 0.422 21 D 0.004 0.001 0.001 0.039 0.007 0.014 0.191 0.001 0.001 0.003 0.743 22 R 0.310 0.001 0.003 0.022 0.027 0.027 0.162 0.001 0.001 0.038 0.411 23 V 0.221 0.002 0.003 0.094 0.035 0.019 0.292 0.001 0.001 0.011 0.322 24 I 0.015 0.004 0.002 0.097 0.252 0.426 0.044 0.001 0.001 0.002 0.158 25 E 0.008 0.004 0.001 0.108 0.228 0.500 0.049 0.001 0.001 0.001 0.101 26 D 0.011 0.006 0.001 0.120 0.155 0.452 0.042 0.001 0.001 0.001 0.212 27 C 0.038 0.023 0.001 0.084 0.135 0.388 0.089 0.001 0.001 0.002 0.239 28 N 0.091 0.053 0.003 0.061 0.083 0.277 0.205 0.003 0.001 0.005 0.220 29 D 0.013 0.039 0.001 0.004 0.004 0.011 0.087 0.001 0.001 0.002 0.838 30 E 0.008 0.040 0.001 0.001 0.001 0.004 0.720 0.001 0.001 0.003 0.220 31 L 0.161 0.389 0.002 0.002 0.002 0.003 0.311 0.002 0.001 0.005 0.123 32 A 0.009 0.951 0.003 0.001 0.001 0.002 0.006 0.003 0.001 0.001 0.024 33 A 0.006 0.978 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.009 34 I 0.036 0.930 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.001 0.001 0.021 35 F 0.083 0.818 0.003 0.004 0.007 0.008 0.003 0.041 0.001 0.001 0.032 36 R 0.163 0.498 0.054 0.006 0.011 0.019 0.011 0.100 0.001 0.002 0.137 37 C 0.143 0.333 0.223 0.021 0.012 0.016 0.045 0.043 0.001 0.003 0.161 38 A 0.042 0.124 0.026 0.014 0.013 0.014 0.093 0.010 0.001 0.002 0.662 39 R 0.027 0.070 0.013 0.015 0.015 0.041 0.072 0.002 0.001 0.004 0.741 40 A 0.031 0.048 0.004 0.028 0.007 0.032 0.162 0.001 0.001 0.009 0.678 41 D 0.381 0.087 0.004 0.030 0.006 0.010 0.166 0.003 0.001 0.007 0.305 42 L 0.433 0.405 0.014 0.014 0.006 0.007 0.017 0.006 0.001 0.002 0.095 43 I 0.122 0.499 0.009 0.046 0.024 0.042 0.033 0.016 0.001 0.002 0.205 44 G 0.229 0.184 0.014 0.044 0.027 0.056 0.028 0.039 0.001 0.006 0.372 45 R 0.365 0.085 0.028 0.043 0.027 0.045 0.034 0.020 0.001 0.005 0.347 46 S 0.029 0.011 0.004 0.027 0.012 0.011 0.173 0.002 0.001 0.001 0.730 47 F 0.029 0.008 0.015 0.030 0.017 0.038 0.035 0.001 0.001 0.002 0.825 48 E 0.015 0.017 0.003 0.108 0.051 0.137 0.243 0.001 0.001 0.011 0.413 49 V 0.202 0.014 0.002 0.053 0.022 0.038 0.194 0.001 0.001 0.009 0.464 50 L 0.252 0.113 0.014 0.142 0.043 0.094 0.053 0.005 0.001 0.006 0.277 51 Y 0.136 0.092 0.027 0.111 0.069 0.128 0.088 0.006 0.001 0.007 0.336 52 P 0.004 0.001 0.001 0.013 0.001 0.004 0.009 0.001 0.001 0.001 0.968 53 S 0.008 0.001 0.001 0.010 0.005 0.009 0.031 0.001 0.001 0.001 0.936 54 S 0.131 0.010 0.003 0.014 0.009 0.015 0.096 0.001 0.001 0.005 0.717 55 D 0.077 0.030 0.004 0.006 0.003 0.007 0.252 0.001 0.001 0.011 0.609 56 E 0.081 0.038 0.006 0.004 0.002 0.005 0.509 0.001 0.001 0.012 0.344 57 F 0.170 0.167 0.005 0.006 0.004 0.009 0.196 0.002 0.001 0.009 0.433 58 E 0.040 0.346 0.005 0.005 0.003 0.008 0.178 0.002 0.001 0.003 0.410 59 R 0.056 0.473 0.003 0.005 0.001 0.002 0.109 0.003 0.001 0.002 0.346 60 I 0.047 0.834 0.003 0.002 0.001 0.002 0.017 0.004 0.001 0.001 0.091 61 G 0.029 0.857 0.003 0.001 0.002 0.004 0.010 0.007 0.001 0.001 0.088 62 E 0.037 0.779 0.007 0.001 0.001 0.002 0.011 0.009 0.001 0.001 0.153 63 R 0.103 0.725 0.005 0.001 0.001 0.001 0.018 0.011 0.001 0.001 0.136 64 I 0.098 0.770 0.011 0.001 0.001 0.001 0.011 0.012 0.001 0.001 0.095 65 S 0.046 0.708 0.020 0.002 0.002 0.004 0.016 0.012 0.001 0.001 0.188 66 P 0.011 0.187 0.003 0.002 0.001 0.001 0.018 0.002 0.001 0.001 0.775 67 V 0.073 0.615 0.005 0.009 0.003 0.005 0.030 0.009 0.001 0.001 0.251 68 M 0.070 0.835 0.007 0.005 0.003 0.005 0.008 0.013 0.001 0.001 0.053 69 I 0.035 0.880 0.011 0.006 0.004 0.006 0.004 0.017 0.001 0.001 0.037 70 A 0.120 0.663 0.022 0.014 0.007 0.011 0.008 0.042 0.001 0.002 0.112 71 H 0.330 0.275 0.023 0.014 0.011 0.017 0.013 0.047 0.001 0.003 0.267 72 G 0.231 0.049 0.048 0.020 0.027 0.033 0.047 0.016 0.001 0.004 0.526 73 S 0.021 0.005 0.018 0.019 0.012 0.012 0.066 0.002 0.001 0.001 0.844 74 Y 0.034 0.012 0.020 0.030 0.075 0.109 0.073 0.001 0.001 0.004 0.643 75 A 0.029 0.013 0.006 0.044 0.069 0.092 0.148 0.001 0.001 0.007 0.591 76 D 0.032 0.011 0.002 0.034 0.077 0.115 0.088 0.001 0.001 0.006 0.635 77 D 0.054 0.028 0.004 0.044 0.121 0.197 0.148 0.001 0.001 0.010 0.394 78 R 0.061 0.078 0.003 0.043 0.190 0.242 0.154 0.001 0.001 0.006 0.223 79 I 0.023 0.084 0.002 0.029 0.257 0.391 0.056 0.001 0.001 0.002 0.153 80 M 0.009 0.036 0.002 0.014 0.391 0.451 0.012 0.001 0.001 0.001 0.081 81 K 0.006 0.022 0.003 0.007 0.405 0.451 0.008 0.002 0.001 0.001 0.094 82 R 0.004 0.007 0.002 0.008 0.378 0.533 0.006 0.001 0.001 0.001 0.060 83 A 0.007 0.006 0.002 0.009 0.332 0.457 0.019 0.001 0.001 0.001 0.167 84 G 0.027 0.007 0.006 0.020 0.113 0.225 0.067 0.001 0.001 0.019 0.515 85 G 0.346 0.001 0.028 0.014 0.048 0.091 0.074 0.001 0.001 0.139 0.259 86 E 0.418 0.001 0.004 0.022 0.060 0.028 0.253 0.001 0.001 0.006 0.207 87 L 0.004 0.001 0.001 0.016 0.078 0.129 0.023 0.001 0.001 0.001 0.747 88 F 0.001 0.001 0.001 0.015 0.358 0.606 0.006 0.001 0.001 0.001 0.013 89 W 0.002 0.001 0.001 0.054 0.127 0.305 0.032 0.001 0.001 0.001 0.481 90 C 0.002 0.001 0.001 0.034 0.458 0.478 0.003 0.001 0.001 0.001 0.025 91 H 0.002 0.001 0.001 0.041 0.318 0.506 0.022 0.001 0.001 0.001 0.110 92 V 0.002 0.001 0.001 0.036 0.375 0.495 0.018 0.001 0.001 0.001 0.073 93 T 0.003 0.001 0.001 0.065 0.300 0.452 0.039 0.001 0.001 0.001 0.139 94 G 0.008 0.003 0.001 0.051 0.229 0.383 0.046 0.001 0.001 0.005 0.274 95 R 0.016 0.005 0.002 0.071 0.218 0.249 0.144 0.001 0.001 0.007 0.288 96 A 0.007 0.001 0.001 0.021 0.062 0.162 0.045 0.001 0.001 0.002 0.699 97 L 0.020 0.007 0.002 0.051 0.165 0.292 0.119 0.001 0.001 0.006 0.336 98 D 0.039 0.008 0.004 0.040 0.084 0.117 0.144 0.002 0.001 0.015 0.546 99 R 0.056 0.010 0.003 0.016 0.017 0.025 0.077 0.001 0.001 0.006 0.790 100 T 0.007 0.002 0.001 0.008 0.003 0.006 0.607 0.001 0.001 0.011 0.354 101 A 0.612 0.004 0.008 0.004 0.012 0.010 0.107 0.001 0.001 0.056 0.187 102 P 0.026 0.007 0.002 0.004 0.004 0.004 0.091 0.001 0.001 0.001 0.860 103 L 0.023 0.013 0.006 0.027 0.069 0.103 0.115 0.001 0.001 0.002 0.642 104 A 0.045 0.060 0.004 0.059 0.183 0.314 0.085 0.001 0.001 0.005 0.243 105 A 0.025 0.068 0.003 0.068 0.238 0.335 0.060 0.001 0.001 0.003 0.198 106 G 0.024 0.049 0.004 0.120 0.300 0.339 0.030 0.001 0.001 0.001 0.131 107 V 0.019 0.061 0.005 0.135 0.258 0.369 0.028 0.001 0.001 0.001 0.123 108 W 0.007 0.044 0.001 0.106 0.375 0.389 0.014 0.001 0.001 0.001 0.062 109 T 0.008 0.030 0.003 0.080 0.297 0.445 0.027 0.001 0.001 0.001 0.107 110 F 0.010 0.042 0.004 0.089 0.235 0.458 0.027 0.001 0.001 0.001 0.133 111 E 0.012 0.037 0.002 0.040 0.273 0.334 0.059 0.002 0.001 0.002 0.239 112 D 0.043 0.030 0.006 0.032 0.109 0.208 0.066 0.004 0.001 0.005 0.497 113 L 0.079 0.102 0.013 0.062 0.073 0.161 0.148 0.006 0.001 0.005 0.350 114 S 0.028 0.064 0.005 0.025 0.039 0.062 0.419 0.004 0.001 0.005 0.349 115 A 0.040 0.074 0.004 0.010 0.006 0.008 0.112 0.002 0.001 0.009 0.736 116 T 0.033 0.103 0.005 0.010 0.008 0.019 0.410 0.002 0.001 0.022 0.390 117 R 0.343 0.179 0.009 0.008 0.007 0.010 0.223 0.004 0.001 0.014 0.202 118 R 0.069 0.706 0.012 0.007 0.006 0.011 0.048 0.006 0.001 0.003 0.132 119 V 0.117 0.590 0.016 0.012 0.013 0.021 0.038 0.014 0.001 0.002 0.175 120 A 0.163 0.364 0.009 0.013 0.013 0.030 0.016 0.016 0.001 0.001 0.375