This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 1 NATRO P A 2 2 NATAA A A 3 3 NATAA I A 4 4 NATAA D A 5 5 NATAA Y A 6 6 NATAA K A 7 7 NATAA T A 8 8 NATAA A A 9 9 NATAA F A 10 10 NATAA H A 11 11 NATAA L A 12 12 NATAA A A 13 13 NATRO P A 14 14 NATAA I A 15 15 NATAA G A 16 16 NATAA L A 17 17 NATAA V A 18 18 NATAA L A 19 19 NATAA S A 20 20 NATAA R A 21 21 NATAA D A 22 22 NATAA R A 23 23 NATAA V A 24 24 NATAA I A 25 25 NATAA E A 26 26 NATAA D A 27 27 NATRO C A 28 28 NATAA N A 29 29 NATAA D A 30 30 NATAA E A 31 31 NATAA L A 32 32 NATAA A A 33 33 NATAA A A 34 34 NATAA I A 35 35 NATAA F A 36 36 NATAA R A 37 37 NATRO C A 38 38 NATAA A A 39 39 NATAA R A 40 40 NATAA A A 41 41 NATAA D A 42 42 NATAA L A 43 43 NATAA I A 44 44 NATAA G A 45 45 NATAA R A 46 46 NATAA S A 47 47 NATAA F A 48 48 NATAA E A 49 49 NATAA V A 50 50 NATAA L A 51 51 NATAA Y A 52 52 NATRO P A 53 53 NATAA S A 54 54 NATAA S A 55 55 NATAA D A 56 56 NATAA E A 57 57 NATAA F A 58 58 NATAA E A 59 59 NATAA R A 60 60 NATAA I A 61 61 NATAA G A 62 62 NATAA E A 63 63 NATAA R A 64 64 NATAA I A 65 65 NATAA S A 66 66 NATRO P A 67 67 NATAA V A 68 68 NATAA M A 69 69 NATAA I A 70 70 NATAA A A 71 71 NATAA H A 72 72 NATAA G A 73 73 NATAA S A 74 74 NATAA Y A 75 75 NATAA A A 76 76 NATAA D A 77 77 NATAA D A 78 78 NATAA R A 79 79 NATAA I A 80 80 NATAA M A 81 81 NATAA K A 82 82 NATAA R A 83 83 NATAA A A 84 84 NATAA G A 85 85 NATAA G A 86 86 NATAA E A 87 87 NATAA L A 88 88 NATAA F A 89 89 NATAA W A 90 90 NATRO C A 91 91 NATAA H A 92 92 NATAA V A 93 93 NATAA T A 94 94 NATAA G A 95 95 NATAA R A 96 96 NATAA A A 97 97 NATAA L A 98 98 NATAA D A 99 99 NATAA R A 100 100 NATAA T A 101 101 NATAA A A 102 102 NATRO P A 103 103 NATAA L A 104 104 NATAA A A 105 105 NATAA A A 106 106 NATAA G A 107 107 NATAA V A 108 108 NATAA W A 109 109 NATAA T A 110 110 NATAA F A 111 111 NATAA E A 112 112 NATAA D A 113 113 NATAA L A 114 114 NATAA S A 115 115 NATAA A A 116 116 NATAA T A 117 117 NATAA R A 118 118 NATAA R A 119 119 NATAA V A 120 120 NATAA A