# TARGET T0518 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-near-backbone-11-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0518.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 938 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.322 0.094 0.051 0.102 0.087 0.084 0.105 0.064 0.046 0.029 0.016 2 K 0.115 0.091 0.062 0.144 0.141 0.116 0.126 0.076 0.067 0.041 0.022 3 K 0.142 0.133 0.098 0.164 0.126 0.096 0.112 0.054 0.042 0.021 0.012 4 V 0.113 0.070 0.071 0.136 0.125 0.123 0.155 0.081 0.066 0.038 0.021 5 F 0.058 0.051 0.058 0.120 0.117 0.131 0.167 0.103 0.097 0.059 0.041 6 Y 0.020 0.028 0.040 0.097 0.108 0.145 0.210 0.130 0.110 0.070 0.041 7 P 0.025 0.035 0.066 0.105 0.118 0.137 0.185 0.111 0.103 0.071 0.044 8 L 0.005 0.011 0.033 0.050 0.076 0.113 0.190 0.188 0.149 0.112 0.073 9 A 0.003 0.008 0.039 0.045 0.060 0.098 0.180 0.182 0.160 0.142 0.083 10 C 0.001 0.002 0.020 0.013 0.019 0.035 0.107 0.207 0.206 0.230 0.161 11 C 0.001 0.003 0.037 0.018 0.023 0.048 0.138 0.181 0.207 0.215 0.130 12 C 0.001 0.001 0.024 0.008 0.011 0.028 0.099 0.173 0.229 0.248 0.177 13 L 0.001 0.002 0.035 0.010 0.015 0.041 0.139 0.168 0.221 0.234 0.135 14 A 0.001 0.002 0.029 0.007 0.011 0.024 0.096 0.153 0.240 0.257 0.181 15 A 0.001 0.002 0.032 0.009 0.014 0.035 0.131 0.161 0.247 0.221 0.146 16 G 0.001 0.003 0.031 0.009 0.014 0.033 0.125 0.145 0.253 0.217 0.168 17 V 0.001 0.002 0.021 0.008 0.013 0.028 0.115 0.151 0.262 0.208 0.191 18 F 0.001 0.002 0.014 0.006 0.012 0.022 0.096 0.161 0.270 0.210 0.204 19 A 0.002 0.003 0.015 0.008 0.014 0.026 0.101 0.153 0.249 0.229 0.200 20 S 0.003 0.004 0.013 0.011 0.018 0.028 0.104 0.159 0.235 0.222 0.203 21 C 0.005 0.007 0.015 0.019 0.030 0.043 0.133 0.197 0.219 0.183 0.148 22 G 0.012 0.015 0.027 0.041 0.058 0.073 0.174 0.190 0.167 0.149 0.094 23 G 0.020 0.024 0.034 0.070 0.089 0.097 0.192 0.166 0.127 0.111 0.072 24 Q 0.040 0.040 0.041 0.108 0.116 0.126 0.161 0.126 0.103 0.086 0.052 25 K 0.127 0.105 0.081 0.160 0.143 0.108 0.110 0.062 0.045 0.039 0.019 26 K 0.136 0.142 0.092 0.189 0.135 0.096 0.093 0.042 0.034 0.028 0.013 27 A 0.056 0.036 0.043 0.077 0.080 0.112 0.184 0.132 0.114 0.099 0.069 28 N 0.147 0.159 0.172 0.176 0.102 0.064 0.079 0.039 0.029 0.024 0.009 29 A 0.026 0.066 0.082 0.100 0.104 0.146 0.224 0.112 0.070 0.047 0.024 30 Q 0.178 0.136 0.180 0.189 0.120 0.065 0.071 0.032 0.015 0.011 0.004 31 E 0.355 0.114 0.171 0.137 0.079 0.059 0.051 0.020 0.008 0.005 0.002 32 E 0.238 0.231 0.187 0.147 0.078 0.050 0.041 0.015 0.007 0.004 0.002 33 P 0.265 0.121 0.088 0.105 0.086 0.104 0.130 0.055 0.026 0.013 0.007 34 S 0.307 0.133 0.188 0.135 0.088 0.065 0.046 0.020 0.010 0.005 0.002 35 K 0.234 0.163 0.230 0.164 0.084 0.057 0.040 0.014 0.008 0.004 0.002 36 V 0.051 0.043 0.055 0.077 0.093 0.138 0.219 0.141 0.094 0.055 0.034 37 A 0.096 0.093 0.111 0.153 0.137 0.121 0.134 0.060 0.047 0.031 0.016 38 L 0.035 0.043 0.104 0.111 0.107 0.139 0.177 0.102 0.091 0.058 0.034 39 S 0.096 0.105 0.133 0.138 0.109 0.113 0.132 0.064 0.052 0.038 0.020 40 Y 0.036 0.040 0.036 0.079 0.092 0.114 0.205 0.145 0.109 0.084 0.061 41 S 0.100 0.099 0.069 0.129 0.124 0.111 0.128 0.092 0.065 0.048 0.035 42 K 0.338 0.192 0.116 0.162 0.091 0.037 0.031 0.015 0.009 0.006 0.003 43 S 0.268 0.114 0.059 0.150 0.115 0.086 0.096 0.050 0.032 0.018 0.011 44 L 0.030 0.030 0.023 0.062 0.071 0.118 0.182 0.147 0.151 0.111 0.076 45 K 0.202 0.201 0.112 0.180 0.099 0.078 0.069 0.027 0.017 0.010 0.005 46 A 0.066 0.062 0.054 0.090 0.100 0.117 0.172 0.136 0.092 0.066 0.046 47 P 0.330 0.160 0.061 0.114 0.085 0.069 0.068 0.042 0.033 0.024 0.015 48 E 0.368 0.195 0.062 0.137 0.090 0.051 0.046 0.022 0.015 0.010 0.006 49 T 0.192 0.093 0.047 0.100 0.099 0.090 0.112 0.093 0.074 0.054 0.045 50 D 0.215 0.151 0.056 0.145 0.126 0.095 0.095 0.047 0.036 0.021 0.012 51 S 0.220 0.175 0.076 0.143 0.096 0.074 0.086 0.049 0.038 0.026 0.017 52 L 0.074 0.043 0.026 0.086 0.098 0.150 0.198 0.130 0.095 0.061 0.039 53 N 0.337 0.152 0.062 0.171 0.092 0.062 0.055 0.027 0.022 0.013 0.007 54 L 0.028 0.028 0.021 0.061 0.068 0.107 0.171 0.156 0.164 0.115 0.081 55 P 0.111 0.092 0.053 0.116 0.102 0.116 0.148 0.082 0.078 0.061 0.042 56 V 0.030 0.035 0.029 0.069 0.078 0.100 0.166 0.156 0.123 0.119 0.094 57 D 0.148 0.217 0.077 0.165 0.118 0.089 0.076 0.046 0.030 0.021 0.013 58 E 0.430 0.246 0.044 0.113 0.078 0.030 0.026 0.014 0.009 0.006 0.004 59 N 0.567 0.140 0.026 0.080 0.065 0.040 0.035 0.021 0.013 0.008 0.005 60 G 0.137 0.124 0.042 0.178 0.160 0.128 0.104 0.049 0.041 0.025 0.013 61 Y 0.008 0.012 0.015 0.042 0.044 0.066 0.151 0.185 0.193 0.159 0.126 62 I 0.012 0.031 0.035 0.106 0.124 0.165 0.191 0.129 0.107 0.067 0.033 63 T 0.031 0.068 0.083 0.149 0.140 0.126 0.133 0.088 0.081 0.066 0.034 64 I 0.015 0.021 0.025 0.078 0.080 0.101 0.164 0.154 0.148 0.124 0.090 65 F 0.009 0.010 0.010 0.017 0.018 0.035 0.087 0.157 0.224 0.245 0.189 66 D 0.053 0.266 0.089 0.227 0.164 0.070 0.061 0.030 0.018 0.015 0.007 67 G 0.193 0.099 0.035 0.127 0.112 0.110 0.125 0.078 0.061 0.034 0.027 68 E 0.479 0.238 0.043 0.106 0.075 0.021 0.016 0.008 0.007 0.005 0.002 69 T 0.128 0.184 0.031 0.201 0.155 0.088 0.103 0.051 0.034 0.017 0.010 70 F 0.010 0.013 0.008 0.029 0.035 0.068 0.117 0.134 0.206 0.172 0.208 71 N 0.173 0.293 0.101 0.249 0.106 0.040 0.022 0.008 0.004 0.002 0.001 72 G 0.165 0.156 0.075 0.227 0.146 0.091 0.071 0.034 0.020 0.010 0.005 73 W 0.015 0.010 0.008 0.022 0.028 0.038 0.095 0.144 0.208 0.209 0.223 74 R 0.060 0.103 0.058 0.220 0.164 0.142 0.135 0.058 0.035 0.017 0.008 75 G 0.106 0.075 0.118 0.115 0.073 0.080 0.108 0.079 0.101 0.090 0.053 76 Y 0.059 0.061 0.038 0.129 0.129 0.152 0.167 0.096 0.080 0.055 0.034 77 G 0.233 0.151 0.036 0.111 0.084 0.080 0.108 0.069 0.058 0.039 0.029 78 K 0.279 0.182 0.041 0.128 0.117 0.072 0.064 0.042 0.032 0.024 0.017 79 D 0.440 0.183 0.047 0.103 0.077 0.047 0.044 0.025 0.017 0.010 0.007 80 R 0.323 0.153 0.042 0.130 0.094 0.065 0.070 0.044 0.036 0.028 0.015 81 V 0.049 0.047 0.022 0.086 0.079 0.124 0.181 0.142 0.119 0.086 0.065 82 P 0.207 0.202 0.065 0.167 0.119 0.087 0.066 0.035 0.025 0.018 0.009 83 T 0.176 0.121 0.045 0.115 0.098 0.144 0.130 0.067 0.049 0.036 0.021 84 K 0.185 0.175 0.049 0.263 0.151 0.089 0.046 0.017 0.013 0.007 0.004 85 W 0.011 0.007 0.006 0.013 0.022 0.032 0.086 0.208 0.218 0.186 0.211 86 T 0.062 0.262 0.103 0.256 0.194 0.050 0.036 0.016 0.009 0.008 0.003 87 I 0.004 0.005 0.009 0.017 0.015 0.038 0.078 0.116 0.203 0.250 0.267 88 E 0.197 0.278 0.089 0.268 0.108 0.030 0.016 0.006 0.004 0.003 0.001 89 D 0.140 0.174 0.041 0.171 0.158 0.097 0.088 0.052 0.040 0.026 0.014 90 G 0.110 0.081 0.028 0.109 0.125 0.136 0.147 0.083 0.083 0.057 0.040 91 C 0.020 0.053 0.037 0.180 0.180 0.146 0.158 0.085 0.076 0.042 0.024 92 I 0.001 0.003 0.009 0.012 0.013 0.021 0.071 0.146 0.246 0.254 0.223 93 K 0.012 0.040 0.050 0.242 0.270 0.103 0.124 0.062 0.049 0.031 0.016 94 F 0.002 0.006 0.009 0.015 0.014 0.026 0.067 0.112 0.237 0.231 0.281 95 N 0.042 0.070 0.053 0.224 0.215 0.115 0.130 0.055 0.047 0.032 0.017 96 G 0.061 0.051 0.034 0.088 0.086 0.107 0.187 0.150 0.117 0.073 0.045 97 S 0.170 0.183 0.056 0.189 0.149 0.082 0.069 0.042 0.031 0.020 0.009 98 G 0.306 0.166 0.042 0.105 0.083 0.072 0.090 0.057 0.040 0.024 0.013 99 G 0.271 0.169 0.039 0.127 0.112 0.074 0.077 0.055 0.038 0.025 0.014 100 G 0.218 0.143 0.045 0.116 0.110 0.094 0.100 0.069 0.053 0.032 0.020 101 E 0.241 0.182 0.058 0.148 0.125 0.070 0.075 0.045 0.029 0.017 0.009 102 A 0.191 0.103 0.044 0.134 0.109 0.106 0.124 0.076 0.061 0.032 0.020 103 Q 0.156 0.122 0.052 0.140 0.126 0.109 0.119 0.070 0.055 0.032 0.019 104 D 0.193 0.123 0.055 0.172 0.134 0.097 0.109 0.054 0.034 0.019 0.011 105 G 0.223 0.087 0.039 0.093 0.089 0.097 0.122 0.085 0.078 0.052 0.036 106 D 0.212 0.260 0.056 0.167 0.117 0.069 0.057 0.025 0.020 0.012 0.006 107 G 0.232 0.086 0.028 0.108 0.105 0.097 0.119 0.091 0.066 0.043 0.027 108 G 0.037 0.048 0.023 0.080 0.115 0.121 0.175 0.141 0.122 0.091 0.047 109 D 0.026 0.066 0.040 0.197 0.188 0.151 0.160 0.082 0.051 0.025 0.014 110 L 0.005 0.005 0.010 0.015 0.016 0.031 0.100 0.124 0.209 0.257 0.227 111 I 0.011 0.032 0.047 0.142 0.135 0.122 0.169 0.124 0.106 0.071 0.042 112 F 0.002 0.010 0.018 0.027 0.025 0.054 0.121 0.162 0.211 0.204 0.166 113 A 0.029 0.049 0.065 0.257 0.242 0.145 0.117 0.045 0.026 0.018 0.008 114 H 0.332 0.105 0.136 0.137 0.111 0.051 0.056 0.029 0.020 0.016 0.007 115 K 0.068 0.197 0.061 0.255 0.180 0.105 0.078 0.025 0.017 0.009 0.004 116 F 0.008 0.006 0.007 0.014 0.013 0.040 0.095 0.132 0.225 0.213 0.245 117 K 0.216 0.256 0.167 0.229 0.078 0.030 0.014 0.005 0.002 0.002 0.001 118 N 0.096 0.222 0.123 0.269 0.148 0.080 0.035 0.013 0.008 0.004 0.002 119 F 0.007 0.005 0.005 0.011 0.018 0.042 0.114 0.151 0.213 0.214 0.219 120 E 0.028 0.107 0.093 0.313 0.260 0.107 0.055 0.017 0.011 0.006 0.002 121 L 0.001 0.003 0.026 0.015 0.015 0.032 0.071 0.107 0.221 0.263 0.245 122 E 0.009 0.043 0.076 0.302 0.309 0.108 0.083 0.027 0.022 0.013 0.005 123 L 0.001 0.002 0.004 0.005 0.006 0.013 0.046 0.129 0.246 0.277 0.269 124 E 0.015 0.042 0.082 0.356 0.316 0.078 0.056 0.022 0.017 0.013 0.004 125 W 0.003 0.007 0.018 0.021 0.017 0.042 0.112 0.121 0.259 0.230 0.171 126 K 0.018 0.048 0.052 0.187 0.195 0.125 0.164 0.076 0.071 0.044 0.022 127 V 0.021 0.029 0.039 0.068 0.064 0.096 0.193 0.149 0.151 0.111 0.080 128 A 0.124 0.143 0.076 0.203 0.178 0.090 0.081 0.042 0.030 0.019 0.014 129 K 0.394 0.316 0.054 0.112 0.064 0.021 0.020 0.009 0.005 0.003 0.002 130 G 0.460 0.109 0.024 0.095 0.087 0.057 0.066 0.044 0.030 0.017 0.012 131 S 0.075 0.085 0.039 0.119 0.124 0.126 0.153 0.088 0.087 0.064 0.039 132 N 0.030 0.054 0.036 0.106 0.121 0.133 0.208 0.124 0.099 0.052 0.037 133 S 0.007 0.010 0.013 0.024 0.042 0.072 0.185 0.204 0.197 0.140 0.104 134 G 0.005 0.009 0.019 0.035 0.047 0.073 0.151 0.141 0.201 0.179 0.140 135 I 0.001 0.001 0.004 0.006 0.008 0.015 0.059 0.126 0.216 0.246 0.318 136 L 0.002 0.003 0.012 0.022 0.027 0.045 0.104 0.144 0.217 0.218 0.207 137 Y 0.001 0.003 0.012 0.013 0.017 0.032 0.091 0.164 0.218 0.232 0.216 138 L 0.003 0.008 0.022 0.037 0.045 0.072 0.186 0.173 0.181 0.154 0.119 139 A 0.005 0.007 0.016 0.030 0.037 0.068 0.166 0.172 0.195 0.176 0.129 140 Q 0.048 0.068 0.094 0.206 0.212 0.116 0.118 0.064 0.037 0.026 0.011 141 E 0.131 0.112 0.088 0.166 0.149 0.105 0.120 0.059 0.035 0.024 0.011 142 V 0.088 0.080 0.048 0.100 0.089 0.104 0.149 0.105 0.097 0.085 0.055 143 T 0.223 0.158 0.067 0.132 0.101 0.083 0.102 0.057 0.038 0.024 0.014 144 S 0.374 0.183 0.091 0.116 0.070 0.048 0.048 0.030 0.020 0.013 0.008 145 K 0.210 0.141 0.059 0.138 0.126 0.100 0.100 0.056 0.036 0.022 0.013 146 D 0.269 0.134 0.054 0.123 0.100 0.082 0.096 0.056 0.042 0.026 0.018 147 K 0.166 0.121 0.069 0.131 0.126 0.107 0.114 0.068 0.049 0.030 0.020 148 D 0.269 0.180 0.086 0.135 0.098 0.071 0.071 0.040 0.027 0.016 0.009 149 G 0.186 0.085 0.042 0.107 0.104 0.106 0.140 0.091 0.067 0.044 0.028 150 N 0.166 0.103 0.050 0.119 0.114 0.109 0.123 0.078 0.066 0.043 0.029 151 D 0.197 0.119 0.059 0.138 0.113 0.104 0.110 0.062 0.048 0.030 0.019 152 V 0.098 0.051 0.040 0.103 0.095 0.112 0.151 0.115 0.103 0.075 0.056 153 L 0.054 0.038 0.030 0.076 0.079 0.100 0.147 0.144 0.135 0.109 0.089 154 E 0.089 0.084 0.053 0.145 0.119 0.123 0.141 0.090 0.072 0.051 0.033 155 P 0.108 0.062 0.042 0.109 0.091 0.112 0.145 0.101 0.104 0.071 0.056 156 I 0.043 0.027 0.022 0.053 0.054 0.082 0.153 0.142 0.168 0.139 0.117 157 Y 0.058 0.041 0.030 0.089 0.075 0.105 0.167 0.132 0.125 0.096 0.081 158 I 0.027 0.020 0.018 0.036 0.035 0.063 0.118 0.136 0.179 0.186 0.184 159 S 0.081 0.096 0.046 0.138 0.127 0.126 0.131 0.077 0.074 0.059 0.045 160 A 0.148 0.068 0.029 0.081 0.090 0.098 0.124 0.103 0.102 0.083 0.075 161 P 0.032 0.040 0.024 0.085 0.118 0.152 0.168 0.123 0.112 0.092 0.056 162 E 0.011 0.019 0.022 0.070 0.087 0.093 0.147 0.166 0.154 0.127 0.103 163 Y 0.001 0.003 0.006 0.011 0.016 0.030 0.077 0.165 0.215 0.256 0.222 164 Q 0.007 0.026 0.060 0.143 0.147 0.130 0.151 0.121 0.101 0.077 0.038 165 I 0.001 0.004 0.010 0.013 0.014 0.027 0.082 0.145 0.217 0.256 0.230 166 L 0.007 0.010 0.021 0.048 0.053 0.078 0.165 0.167 0.183 0.167 0.102 167 D 0.058 0.085 0.107 0.173 0.151 0.109 0.120 0.077 0.058 0.043 0.019 168 N 0.111 0.121 0.057 0.157 0.143 0.121 0.137 0.066 0.043 0.028 0.016 169 A 0.292 0.117 0.043 0.107 0.092 0.074 0.095 0.062 0.058 0.040 0.020 170 N 0.375 0.243 0.048 0.114 0.076 0.044 0.044 0.023 0.018 0.011 0.006 171 H 0.099 0.094 0.042 0.117 0.108 0.120 0.148 0.102 0.077 0.052 0.039 172 P 0.253 0.152 0.051 0.125 0.102 0.088 0.094 0.057 0.041 0.024 0.014 173 D 0.163 0.174 0.066 0.178 0.144 0.089 0.082 0.044 0.031 0.019 0.011 174 A 0.052 0.030 0.025 0.063 0.071 0.115 0.171 0.152 0.140 0.102 0.078 175 K 0.120 0.118 0.082 0.213 0.156 0.104 0.092 0.046 0.035 0.022 0.011 176 L 0.022 0.031 0.035 0.071 0.073 0.081 0.152 0.179 0.157 0.116 0.082 177 G 0.051 0.048 0.044 0.091 0.088 0.109 0.163 0.119 0.120 0.101 0.066 178 K 0.115 0.122 0.080 0.178 0.138 0.106 0.108 0.057 0.047 0.032 0.019 179 D 0.253 0.158 0.065 0.142 0.112 0.080 0.079 0.046 0.032 0.020 0.013 180 N 0.304 0.132 0.044 0.121 0.103 0.074 0.083 0.050 0.042 0.029 0.017 181 N 0.190 0.118 0.046 0.120 0.106 0.091 0.115 0.077 0.063 0.043 0.029 182 R 0.087 0.074 0.051 0.125 0.112 0.136 0.152 0.099 0.076 0.055 0.032 183 Q 0.153 0.125 0.078 0.159 0.107 0.112 0.106 0.062 0.047 0.032 0.018 184 S 0.049 0.041 0.030 0.088 0.094 0.120 0.163 0.145 0.116 0.091 0.064 185 A 0.148 0.084 0.054 0.116 0.100 0.105 0.121 0.084 0.080 0.065 0.044 186 S 0.071 0.075 0.066 0.156 0.136 0.121 0.129 0.086 0.075 0.053 0.031 187 L 0.022 0.022 0.028 0.050 0.044 0.062 0.126 0.128 0.180 0.178 0.162 188 Y 0.021 0.022 0.024 0.068 0.078 0.111 0.176 0.148 0.146 0.115 0.092 189 D 0.179 0.197 0.133 0.204 0.109 0.059 0.046 0.027 0.021 0.016 0.008 190 M 0.055 0.036 0.029 0.074 0.076 0.108 0.170 0.139 0.131 0.106 0.076 191 I 0.083 0.066 0.034 0.094 0.090 0.104 0.156 0.120 0.111 0.087 0.056 192 P 0.184 0.136 0.076 0.155 0.108 0.095 0.096 0.057 0.045 0.032 0.017 193 A 0.175 0.110 0.076 0.123 0.104 0.103 0.111 0.075 0.058 0.041 0.025 194 V 0.114 0.098 0.042 0.112 0.106 0.104 0.134 0.096 0.083 0.068 0.042 195 P 0.173 0.111 0.044 0.121 0.112 0.115 0.120 0.077 0.059 0.040 0.028 196 Q 0.379 0.230 0.081 0.130 0.076 0.036 0.029 0.017 0.011 0.007 0.004 197 N 0.206 0.110 0.046 0.128 0.116 0.103 0.115 0.072 0.052 0.032 0.019 198 S 0.234 0.114 0.045 0.121 0.110 0.075 0.105 0.068 0.058 0.042 0.026 199 K 0.137 0.112 0.062 0.140 0.112 0.121 0.131 0.071 0.060 0.035 0.019 200 P 0.324 0.230 0.081 0.123 0.069 0.058 0.053 0.024 0.019 0.013 0.006 201 F 0.105 0.065 0.024 0.105 0.117 0.147 0.171 0.116 0.073 0.047 0.029 202 G 0.418 0.153 0.046 0.094 0.076 0.067 0.057 0.034 0.026 0.018 0.011 203 E 0.088 0.136 0.067 0.245 0.175 0.127 0.092 0.033 0.020 0.011 0.005 204 W 0.032 0.024 0.032 0.056 0.065 0.067 0.121 0.151 0.167 0.145 0.139 205 N 0.005 0.012 0.019 0.060 0.076 0.192 0.220 0.155 0.123 0.083 0.055 206 K 0.020 0.090 0.204 0.338 0.161 0.096 0.042 0.017 0.015 0.013 0.005 207 A 0.001 0.003 0.006 0.010 0.020 0.042 0.109 0.281 0.204 0.178 0.145 208 K 0.016 0.065 0.063 0.284 0.242 0.113 0.087 0.050 0.038 0.032 0.009 209 I 0.001 0.001 0.003 0.003 0.003 0.006 0.024 0.057 0.187 0.365 0.352 210 M 0.012 0.052 0.081 0.300 0.298 0.092 0.090 0.034 0.025 0.012 0.005 211 V 0.001 0.003 0.006 0.007 0.005 0.014 0.041 0.063 0.207 0.338 0.314 212 Y 0.016 0.063 0.035 0.218 0.200 0.165 0.157 0.056 0.046 0.026 0.018 213 K 0.179 0.279 0.087 0.175 0.121 0.050 0.045 0.027 0.018 0.011 0.006 214 G 0.283 0.124 0.047 0.160 0.129 0.096 0.078 0.036 0.023 0.016 0.008 215 T 0.076 0.112 0.045 0.190 0.163 0.125 0.123 0.073 0.051 0.028 0.016 216 V 0.003 0.004 0.005 0.012 0.012 0.024 0.074 0.137 0.227 0.265 0.237 217 V 0.029 0.083 0.081 0.274 0.247 0.109 0.090 0.040 0.027 0.014 0.006 218 H 0.006 0.018 0.023 0.032 0.030 0.049 0.096 0.134 0.222 0.207 0.183 219 G 0.056 0.050 0.035 0.143 0.141 0.131 0.166 0.082 0.086 0.066 0.043 220 Q 0.041 0.044 0.030 0.056 0.052 0.069 0.135 0.141 0.158 0.146 0.127 221 N 0.089 0.210 0.059 0.216 0.162 0.092 0.074 0.041 0.027 0.019 0.011 222 D 0.291 0.162 0.040 0.129 0.098 0.069 0.082 0.050 0.038 0.025 0.016 223 E 0.278 0.188 0.046 0.163 0.132 0.074 0.053 0.027 0.020 0.014 0.007 224 N 0.174 0.155 0.048 0.209 0.145 0.115 0.087 0.034 0.019 0.009 0.005 225 V 0.008 0.013 0.015 0.038 0.040 0.055 0.119 0.145 0.193 0.195 0.180 226 L 0.006 0.013 0.020 0.049 0.066 0.105 0.188 0.209 0.152 0.113 0.078 227 E 0.047 0.128 0.224 0.286 0.157 0.061 0.043 0.021 0.015 0.014 0.005 228 Y 0.007 0.007 0.013 0.026 0.034 0.066 0.141 0.179 0.204 0.171 0.152 229 H 0.130 0.115 0.078 0.172 0.133 0.088 0.106 0.057 0.055 0.047 0.020 230 L 0.075 0.081 0.072 0.135 0.111 0.106 0.146 0.094 0.081 0.065 0.034 231 W 0.045 0.070 0.053 0.112 0.114 0.137 0.173 0.115 0.088 0.058 0.036 232 T 0.181 0.183 0.073 0.154 0.125 0.078 0.093 0.046 0.034 0.022 0.011 233 K 0.392 0.147 0.066 0.116 0.086 0.061 0.058 0.033 0.021 0.013 0.008 234 Q 0.259 0.196 0.081 0.166 0.116 0.070 0.057 0.025 0.016 0.011 0.005 235 W 0.039 0.046 0.025 0.068 0.072 0.096 0.193 0.171 0.135 0.090 0.066 236 T 0.112 0.143 0.084 0.158 0.148 0.124 0.114 0.060 0.031 0.018 0.008 237 D 0.416 0.142 0.143 0.142 0.059 0.040 0.029 0.013 0.008 0.005 0.002 238 M 0.035 0.032 0.038 0.107 0.118 0.155 0.197 0.120 0.096 0.063 0.039 239 L 0.016 0.021 0.026 0.049 0.057 0.082 0.166 0.175 0.170 0.139 0.098 240 Q 0.044 0.098 0.168 0.193 0.151 0.118 0.112 0.051 0.033 0.023 0.010 241 A 0.041 0.047 0.100 0.121 0.115 0.122 0.163 0.114 0.085 0.055 0.037 242 S 0.201 0.100 0.078 0.134 0.107 0.098 0.119 0.057 0.052 0.036 0.018 243 K 0.193 0.138 0.072 0.184 0.134 0.099 0.089 0.038 0.027 0.017 0.009 244 F 0.037 0.029 0.024 0.048 0.052 0.076 0.140 0.161 0.161 0.133 0.139 245 S 0.162 0.198 0.074 0.174 0.135 0.080 0.078 0.040 0.028 0.018 0.010 246 E 0.368 0.210 0.079 0.121 0.080 0.040 0.042 0.025 0.017 0.011 0.007 247 D 0.260 0.087 0.037 0.106 0.103 0.109 0.118 0.069 0.054 0.034 0.022 248 K 0.129 0.099 0.042 0.131 0.109 0.117 0.142 0.080 0.073 0.048 0.030 249 W 0.024 0.023 0.019 0.052 0.063 0.092 0.178 0.185 0.163 0.117 0.085 250 P 0.061 0.051 0.048 0.086 0.092 0.116 0.157 0.115 0.110 0.093 0.070 251 L 0.036 0.043 0.039 0.093 0.098 0.119 0.164 0.131 0.123 0.092 0.063 252 A 0.057 0.043 0.035 0.084 0.086 0.097 0.156 0.129 0.130 0.099 0.084 253 F 0.015 0.012 0.014 0.034 0.046 0.068 0.131 0.169 0.181 0.172 0.157 254 E 0.109 0.105 0.088 0.188 0.131 0.107 0.098 0.065 0.052 0.036 0.021 255 L 0.032 0.025 0.030 0.074 0.073 0.096 0.165 0.154 0.147 0.116 0.090 256 L 0.034 0.029 0.025 0.057 0.055 0.076 0.143 0.141 0.169 0.146 0.127 257 N 0.113 0.085 0.055 0.135 0.116 0.117 0.141 0.085 0.071 0.049 0.032 258 N 0.148 0.093 0.061 0.120 0.096 0.108 0.124 0.084 0.076 0.055 0.034 259 C 0.126 0.065 0.031 0.082 0.077 0.096 0.142 0.116 0.112 0.091 0.062 260 G 0.207 0.133 0.033 0.115 0.095 0.095 0.115 0.074 0.062 0.043 0.028 261 G 0.216 0.116 0.037 0.092 0.088 0.100 0.112 0.077 0.073 0.051 0.038 262 E 0.223 0.159 0.053 0.142 0.123 0.089 0.086 0.047 0.035 0.025 0.018 263 N 0.177 0.088 0.034 0.112 0.103 0.091 0.119 0.094 0.073 0.055 0.054 264 H 0.156 0.152 0.048 0.158 0.140 0.104 0.095 0.057 0.041 0.026 0.023 265 E 0.303 0.222 0.058 0.183 0.116 0.050 0.034 0.016 0.010 0.005 0.003 266 G 0.076 0.042 0.023 0.075 0.096 0.129 0.179 0.141 0.119 0.076 0.043 267 F 0.015 0.028 0.021 0.083 0.108 0.127 0.176 0.137 0.137 0.103 0.064 268 I 0.002 0.003 0.004 0.008 0.011 0.021 0.073 0.159 0.235 0.255 0.230 269 G 0.007 0.017 0.026 0.058 0.076 0.080 0.165 0.172 0.167 0.140 0.091 270 L 0.002 0.003 0.007 0.010 0.010 0.015 0.050 0.095 0.199 0.274 0.335 271 Q 0.008 0.008 0.011 0.039 0.046 0.080 0.158 0.163 0.199 0.143 0.146 272 D 0.039 0.046 0.046 0.101 0.105 0.124 0.153 0.128 0.113 0.093 0.052 273 H 0.041 0.059 0.035 0.113 0.119 0.154 0.172 0.131 0.078 0.060 0.038 274 G 0.223 0.131 0.041 0.136 0.106 0.094 0.086 0.064 0.052 0.044 0.022 275 D 0.296 0.238 0.049 0.111 0.098 0.060 0.057 0.033 0.026 0.021 0.011 276 D 0.273 0.214 0.047 0.208 0.130 0.062 0.036 0.015 0.009 0.004 0.002 277 V 0.030 0.014 0.014 0.026 0.029 0.044 0.098 0.104 0.202 0.235 0.204 278 W 0.019 0.068 0.042 0.231 0.225 0.154 0.138 0.060 0.037 0.016 0.009 279 F 0.005 0.012 0.029 0.038 0.032 0.060 0.093 0.092 0.210 0.258 0.171 280 R 0.010 0.029 0.055 0.152 0.179 0.185 0.184 0.091 0.061 0.035 0.019 281 N 0.021 0.083 0.087 0.264 0.170 0.127 0.105 0.059 0.043 0.027 0.014 282 I 0.004 0.003 0.010 0.011 0.015 0.021 0.063 0.130 0.202 0.297 0.244 283 R 0.035 0.141 0.101 0.296 0.278 0.061 0.049 0.021 0.011 0.006 0.002 284 V 0.002 0.005 0.015 0.022 0.012 0.029 0.061 0.051 0.213 0.315 0.274 285 K 0.038 0.045 0.062 0.265 0.374 0.083 0.082 0.024 0.016 0.008 0.004 286 V 0.140 0.462 0.107 0.133 0.079 0.028 0.025 0.012 0.008 0.004 0.002 287 L 0.034 0.022 0.016 0.053 0.055 0.126 0.170 0.135 0.147 0.125 0.117 288 D 0.496 0.249 0.083 0.097 0.038 0.013 0.011 0.006 0.004 0.002 0.001