This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 1 NATAA S A 2 2 NATAA M A 3 3 NATAA E A 4 4 NATAA I A 5 5 NATAA L A 6 6 NATAA Q A 7 7 NATAA V A 8 8 NATAA A A 9 9 NATAA L A 10 10 NATAA H A 11 11 NATAA K A 12 12 NATAA R A 13 13 NATAA D A 14 14 NATAA S A 15 15 NATAA G A 16 16 NATAA E A 17 17 NATAA Q A 18 18 NATAA L A 19 19 NATAA G A 20 20 NATAA I A 21 21 NATAA K A 22 22 NATAA L A 23 23 NATAA V A 24 24 NATAA R A 25 25 NATAA R A 26 26 NATAA T A 27 27 NATAA D A 28 28 NATAA E A 29 29 NATRO P A 30 30 NATAA G A 31 31 NATAA V A 32 32 NATAA F A 33 33 NATAA I A 34 34 NATAA L A 35 35 NATAA D A 36 36 NATAA L A 37 37 NATAA L A 38 38 NATAA E A 39 39 NATAA G A 40 40 NATAA G A 41 41 NATAA L A 42 42 NATAA A A 43 43 NATAA A A 44 44 NATAA Q A 45 45 NATAA D A 46 46 NATAA G A 47 47 NATAA R A 48 48 NATAA L A 49 49 NATAA S A 50 50 NATAA S A 51 51 NATAA N A 52 52 NATAA D A 53 53 NATAA R A 54 54 NATAA V A 55 55 NATAA L A 56 56 NATAA A A 57 57 NATAA I A 58 58 NATAA N A 59 59 NATAA G A 60 60 NATAA H A 61 61 NATAA D A 62 62 NATAA L A 63 63 NATAA K A 64 64 NATAA Y A 65 65 NATAA G A 66 66 NATAA T A 67 67 NATRO P A 68 68 NATAA E A 69 69 NATAA L A 70 70 NATAA A A 71 71 NATAA A A 72 72 NATAA Q A 73 73 NATAA I A 74 74 NATAA I A 75 75 NATAA Q A 76 76 NATAA A A 77 77 NATAA S A 78 78 NATAA G A 79 79 NATAA E A 80 80 NATAA R A 81 81 NATAA V A 82 82 NATAA N A 83 83 NATAA L A 84 84 NATAA T A 85 85 NATAA I A 86 86 NATAA A A 87 87 NATAA R A 88 88 NATRO P A 89 89 NATAA G A 90 90 NATAA K A 91 91 NATRO P A 92 92 NATAA E A 93 93 NATAA I A 94 94 NATAA E A 95 95 NATAA L