This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 1 NATAA M A 2 2 NATAA K A 3 3 NATAA L A 4 4 NATAA S A 5 5 NATAA R A 6 6 NATAA L A 7 7 NATAA V A 8 8 NATRO P A 9 9 NATAA G A 10 10 NATAA V A 11 11 NATRO P A 12 12 NATAA A A 13 13 NATAA R A 14 14 NATAA I A 15 15 NATAA K A 16 16 NATAA R A 17 17 NATAA L A 18 18 NATAA E A 19 19 NATAA V A 20 20 NATAA S A 21 21 NATAA G A 22 22 NATAA E A 23 23 NATAA L A 24 24 NATAA H A 25 25 NATAA E A 26 26 NATAA K A 27 27 NATAA L A 28 28 NATAA V A 29 29 NATAA G A 30 30 NATAA M A 31 31 NATAA G A 32 32 NATAA F A 33 33 NATAA V A 34 34 NATRO P A 35 35 NATAA G A 36 36 NATAA E A 37 37 NATAA E A 38 38 NATAA I A 39 39 NATAA E A 40 40 NATAA I A 41 41 NATAA V A 42 42 NATAA Q A 43 43 NATAA V A 44 44 NATAA A A 45 45 NATRO P A 46 46 NATAA L A 47 47 NATAA G A 48 48 NATAA D A 49 49 NATRO P A 50 50 NATAA I A 51 51 NATAA V A 52 52 NATRO C A 53 53 NATAA K A 54 54 NATAA I A 55 55 NATAA G A 56 56 NATAA N A 57 57 NATAA R A 58 58 NATAA N A 59 59 NATAA I A 60 60 NATAA T A 61 61 NATAA L A 62 62 NATAA R A 63 63 NATAA K A 64 64 NATAA R A 65 65 NATAA E A 66 66 NATAA A A 67 67 NATAA D A 68 68 NATAA L A 69 69 NATAA I A 70 70 NATAA E A 71 71 NATAA V A 72 72 NATAA E A 73 73 NATAA V A 74 74 NATAA V A 75 75 NATAA G A 76 76 NATAA G A 77 77 NATAA E A 78 78 NATAA L A 79 79 NATRO P A 80 80 NATAA L A 81 81 NATAA I A 82 82 NATAA L A 83 83 NATAA A A 84 84 NATAA D A 85 85 NATAA D A 86 86 NATAA G A 87 87 NATAA T A 88 88 NATAA Y A 89 89 NATAA E A 90 90 NATAA I A 91 91 NATAA T A 92 92 NATAA K A 93 93 NATAA L A 94 94 NATAA N A 95 95 NATAA G A 96 96 NATAA G A 97 97 NATAA R A 98 98 NATAA R A 99 99 NATAA F A 100 100 NATAA L A 101 101 NATAA F A 102 102 NATAA R A 103 103 NATAA M A 104 104 NATAA K A 105 105 NATAA N A 106 106 NATAA L A 107 107 NATAA G A 108 108 NATAA I A 109 109 NATAA E A 110 110 NATAA S A 111 111 NATAA G A 112 112 NATAA K A 113 113 NATAA K A 114 114 NATAA I A 115 115 NATAA Q A 116 116 NATAA V A 117 117 NATAA S A 118 118 NATAA G A 119 119 NATAA R A 120 120 NATAA R A 121 121 NATAA Y A 122 122 NATAA Y A 123 123 NATAA I A 124 124 NATAA E A 125 125 NATAA G A 126 126 NATAA R A 127 127 NATAA E A 128 128 NATAA I A 129 129 NATAA D A 130 130 NATAA L A 131 131 NATAA G A 132 132 NATAA Y A 133 133 NATAA G A 134 134 NATAA E A 135 135 NATAA A A 136 136 NATAA T A 137 137 NATAA K A 138 138 NATAA I A 139 139 NATAA W A 140 140 NATAA V A 141 141 NATAA R A 142 142 NATAA R A 143 143 NATAA V