# TARGET TR454 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t2k-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-str4-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 21 (1 str4 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment TR454.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 5079 # Pos AA A B C D E F G H I J K L M P Q R S T U V W 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 D 0.001 0.002 0.010 0.012 0.017 0.017 0.205 0.441 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 0.004 0.097 0.104 0.029 0.046 0.001 2 C 0.001 0.001 0.004 0.004 0.011 0.003 0.025 0.640 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.005 0.132 0.038 0.066 0.064 0.001 3 R 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.004 0.785 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.192 0.004 0.003 0.004 0.001 4 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.980 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.013 0.001 0.001 0.001 0.001 5 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.989 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.001 0.001 0.001 0.001 6 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.979 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.020 0.001 0.001 0.001 0.001 7 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.001 0.001 0.001 0.001 8 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 9 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.991 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.001 0.001 0.001 0.001 10 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.971 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.028 0.001 0.001 0.001 0.001 11 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.972 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.026 0.001 0.001 0.001 0.001 12 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.986 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 0.001 0.001 0.001 0.001 13 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.979 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.014 0.001 0.001 0.001 0.001 14 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.009 0.941 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.037 0.002 0.002 0.001 0.001 15 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.055 0.801 0.041 0.007 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.082 0.003 0.003 0.001 0.001 16 Q 0.001 0.001 0.002 0.003 0.001 0.011 0.173 0.115 0.519 0.075 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.073 0.011 0.006 0.007 0.001 17 K 0.001 0.001 0.001 0.003 0.005 0.010 0.589 0.055 0.021 0.008 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.100 0.049 0.041 0.109 0.001 18 G 0.001 0.001 0.004 0.004 0.006 0.005 0.041 0.032 0.006 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.016 0.051 0.615 0.110 0.098 0.001 19 F 0.003 0.003 0.022 0.010 0.048 0.006 0.036 0.052 0.014 0.004 0.002 0.001 0.003 0.009 0.022 0.079 0.155 0.061 0.254 0.213 0.001 20 Y 0.002 0.005 0.068 0.026 0.026 0.014 0.111 0.086 0.024 0.003 0.005 0.003 0.012 0.024 0.140 0.030 0.155 0.049 0.093 0.122 0.002 21 G 0.002 0.003 0.014 0.012 0.060 0.010 0.272 0.100 0.015 0.001 0.006 0.005 0.010 0.027 0.038 0.065 0.099 0.094 0.097 0.069 0.001 22 V 0.002 0.003 0.068 0.031 0.018 0.008 0.075 0.204 0.008 0.001 0.005 0.005 0.012 0.035 0.152 0.030 0.118 0.071 0.056 0.100 0.001 23 S 0.001 0.002 0.007 0.005 0.064 0.004 0.024 0.358 0.004 0.001 0.001 0.001 0.002 0.007 0.019 0.116 0.036 0.052 0.103 0.193 0.001 24 I 0.001 0.001 0.004 0.004 0.002 0.001 0.003 0.294 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.030 0.004 0.639 0.002 0.004 0.007 0.001 25 R 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.001 0.008 0.963 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.014 0.001 0.001 0.002 0.001 26 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.980 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.001 0.001 0.001 0.001 27 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.987 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.001 0.001 0.001 0.001 28 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.005 0.983 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 29 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.009 0.967 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.014 0.001 0.001 0.001 0.001 30 A 0.001 0.001 0.002 0.004 0.001 0.014 0.126 0.096 0.304 0.401 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.044 0.004 0.002 0.001 0.001 31 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.867 0.017 0.006 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.021 0.009 0.016 0.054 0.001 32 G 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.008 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.918 0.028 0.028 0.001 33 A 0.001 0.001 0.010 0.003 0.031 0.003 0.009 0.018 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.049 0.099 0.085 0.324 0.358 0.001 34 S 0.001 0.001 0.051 0.014 0.018 0.003 0.017 0.047 0.005 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.131 0.024 0.092 0.021 0.233 0.333 0.001 35 I 0.001 0.002 0.026 0.034 0.049 0.003 0.031 0.094 0.004 0.001 0.002 0.002 0.004 0.015 0.049 0.083 0.467 0.023 0.046 0.065 0.001 36 S 0.006 0.008 0.026 0.016 0.027 0.010 0.099 0.518 0.002 0.001 0.002 0.002 0.004 0.032 0.099 0.018 0.070 0.021 0.020 0.019 0.001 37 M 0.018 0.019 0.016 0.016 0.038 0.011 0.043 0.587 0.002 0.001 0.004 0.004 0.006 0.045 0.045 0.029 0.051 0.025 0.026 0.012 0.001 38 I 0.019 0.021 0.026 0.034 0.044 0.007 0.031 0.462 0.004 0.001 0.005 0.004 0.016 0.063 0.076 0.055 0.102 0.009 0.012 0.007 0.002 39 S 0.033 0.048 0.029 0.032 0.041 0.016 0.081 0.437 0.010 0.004 0.006 0.004 0.014 0.028 0.071 0.019 0.083 0.013 0.017 0.011 0.003 40 Y 0.046 0.049 0.034 0.049 0.055 0.017 0.131 0.288 0.024 0.007 0.008 0.005 0.020 0.025 0.034 0.019 0.123 0.023 0.020 0.018 0.004 41 H 0.020 0.027 0.024 0.032 0.095 0.014 0.166 0.110 0.031 0.009 0.006 0.004 0.016 0.019 0.032 0.023 0.222 0.070 0.037 0.041 0.002 42 F 0.007 0.006 0.027 0.040 0.028 0.005 0.105 0.041 0.007 0.005 0.001 0.001 0.002 0.004 0.031 0.015 0.169 0.117 0.238 0.149 0.001 43 G 0.002 0.002 0.015 0.012 0.042 0.006 0.100 0.025 0.002 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.014 0.015 0.395 0.157 0.046 0.160 0.001 44 G 0.001 0.001 0.012 0.006 0.026 0.004 0.146 0.034 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 0.009 0.048 0.136 0.160 0.401 0.001 45 K 0.001 0.001 0.002 0.004 0.004 0.001 0.006 0.025 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.003 0.833 0.012 0.031 0.075 0.001 46 E 0.001 0.001 0.005 0.003 0.006 0.003 0.093 0.668 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.002 0.147 0.018 0.011 0.034 0.001 47 G 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.021 0.892 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.053 0.012 0.007 0.005 0.001 48 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.958 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.035 0.001 0.001 0.001 0.001 49 Y 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.976 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.020 0.001 0.001 0.001 0.001 50 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.989 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.001 0.001 0.001 0.001 51 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 52 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.983 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.013 0.001 0.001 0.001 0.001 53 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.967 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.024 0.001 0.001 0.001 0.001 54 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.940 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.043 0.001 0.001 0.001 0.001 55 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.015 0.941 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.033 0.003 0.001 0.001 0.001 56 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.017 0.924 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.038 0.007 0.004 0.002 0.001 57 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.015 0.888 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.071 0.006 0.006 0.003 0.001 58 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.030 0.876 0.008 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.062 0.005 0.005 0.004 0.001 59 C 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.012 0.079 0.775 0.019 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.068 0.016 0.012 0.009 0.001 60 F 0.001 0.001 0.002 0.003 0.003 0.008 0.077 0.642 0.024 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.155 0.024 0.028 0.021 0.001 61 G 0.001 0.001 0.004 0.003 0.005 0.013 0.093 0.626 0.015 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.003 0.124 0.036 0.030 0.035 0.001 62 Q 0.001 0.001 0.005 0.005 0.009 0.016 0.102 0.558 0.016 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.005 0.143 0.038 0.043 0.049 0.001 63 L 0.001 0.001 0.006 0.006 0.011 0.010 0.079 0.512 0.018 0.003 0.001 0.001 0.001 0.002 0.008 0.007 0.188 0.035 0.052 0.058 0.001 64 D 0.001 0.001 0.008 0.006 0.009 0.011 0.080 0.571 0.010 0.002 0.001 0.001 0.001 0.002 0.008 0.005 0.183 0.021 0.036 0.042 0.001 65 D 0.001 0.001 0.005 0.006 0.011 0.021 0.113 0.583 0.008 0.002 0.001 0.001 0.001 0.002 0.006 0.005 0.163 0.021 0.022 0.025 0.001 66 I 0.001 0.002 0.008 0.008 0.011 0.027 0.145 0.466 0.020 0.006 0.001 0.001 0.002 0.004 0.010 0.005 0.170 0.036 0.046 0.033 0.001 67 R 0.001 0.001 0.009 0.007 0.011 0.026 0.168 0.327 0.012 0.004 0.001 0.001 0.001 0.003 0.011 0.009 0.266 0.029 0.056 0.060 0.001 68 G 0.001 0.001 0.009 0.007 0.017 0.017 0.315 0.120 0.024 0.008 0.001 0.001 0.001 0.003 0.012 0.009 0.172 0.113 0.083 0.090 0.001 69 Q 0.001 0.001 0.009 0.006 0.015 0.012 0.164 0.038 0.018 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.009 0.261 0.057 0.158 0.236 0.001 70 A 0.001 0.001 0.004 0.005 0.006 0.006 0.260 0.021 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.007 0.193 0.109 0.119 0.265 0.001 71 G 0.001 0.001 0.011 0.003 0.018 0.007 0.140 0.024 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.036 0.122 0.301 0.116 0.208 0.001 72 D 0.001 0.001 0.003 0.004 0.001 0.001 0.001 0.010 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.019 0.020 0.007 0.238 0.695 0.001 73 P 0.001 0.001 0.002 0.002 0.007 0.001 0.004 0.137 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.013 0.713 0.022 0.021 0.071 0.001 74 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.024 0.921 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.036 0.003 0.004 0.004 0.001 75 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.979 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.003 0.001 0.001 0.001 76 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.972 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.024 0.001 0.001 0.001 0.001 77 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.985 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 0.001 0.001 0.001 0.001 78 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.985 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.013 0.001 0.001 0.001 0.001 79 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.986 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 0.001 0.001 0.001 0.001 80 Y 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.983 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.013 0.001 0.001 0.001 0.001 81 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.976 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.019 0.001 0.001 0.001 0.001 82 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.967 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.027 0.001 0.001 0.001 0.001 83 W 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.972 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.015 0.002 0.001 0.001 0.001 84 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.012 0.934 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.041 0.003 0.002 0.001 0.001 85 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.015 0.892 0.008 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.072 0.003 0.002 0.001 0.001 86 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.032 0.871 0.011 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.060 0.005 0.004 0.003 0.001 87 R 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.011 0.100 0.654 0.027 0.008 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.132 0.031 0.014 0.009 0.001 88 H 0.001 0.001 0.003 0.003 0.007 0.015 0.123 0.464 0.027 0.009 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.002 0.166 0.062 0.070 0.042 0.001 89 R 0.001 0.001 0.005 0.006 0.004 0.011 0.147 0.183 0.011 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.002 0.465 0.048 0.048 0.059 0.001 90 N 0.001 0.001 0.004 0.003 0.014 0.010 0.410 0.059 0.015 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.005 0.304 0.071 0.031 0.067 0.001 91 N 0.001 0.001 0.004 0.007 0.003 0.001 0.031 0.021 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.005 0.074 0.060 0.390 0.400 0.001 92 P 0.001 0.001 0.002 0.002 0.013 0.001 0.014 0.054 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.007 0.749 0.042 0.025 0.088 0.001 93 Q 0.001 0.001 0.009 0.006 0.007 0.019 0.232 0.503 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.005 0.089 0.039 0.032 0.041 0.001 94 L 0.002 0.003 0.007 0.008 0.021 0.007 0.053 0.595 0.003 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.011 0.009 0.184 0.035 0.036 0.016 0.001 95 L 0.005 0.005 0.015 0.010 0.010 0.004 0.024 0.803 0.003 0.001 0.001 0.001 0.003 0.005 0.019 0.005 0.062 0.008 0.012 0.007 0.001 96 R 0.018 0.013 0.009 0.011 0.013 0.009 0.027 0.790 0.005 0.001 0.002 0.001 0.003 0.006 0.011 0.004 0.047 0.012 0.013 0.005 0.001 97 F 0.015 0.017 0.007 0.013 0.022 0.013 0.044 0.740 0.007 0.002 0.002 0.002 0.007 0.012 0.013 0.006 0.059 0.006 0.006 0.005 0.001 98 Y 0.014 0.020 0.011 0.015 0.018 0.013 0.069 0.634 0.014 0.004 0.003 0.002 0.006 0.014 0.023 0.011 0.075 0.020 0.021 0.012 0.001 99 T 0.011 0.013 0.014 0.017 0.027 0.013 0.056 0.520 0.031 0.005 0.003 0.002 0.007 0.017 0.023 0.025 0.145 0.017 0.027 0.025 0.001 100 S 0.011 0.013 0.012 0.014 0.029 0.026 0.116 0.414 0.051 0.016 0.003 0.002 0.006 0.014 0.024 0.011 0.139 0.035 0.031 0.032 0.001 101 E 0.004 0.005 0.011 0.011 0.021 0.032 0.225 0.234 0.027 0.013 0.002 0.001 0.005 0.008 0.024 0.010 0.235 0.038 0.050 0.043 0.001 102 L 0.003 0.003 0.015 0.018 0.022 0.017 0.333 0.082 0.016 0.013 0.001 0.001 0.003 0.006 0.019 0.014 0.161 0.108 0.093 0.071 0.001 103 T 0.001 0.001 0.017 0.009 0.029 0.010 0.197 0.023 0.012 0.003 0.001 0.001 0.002 0.003 0.016 0.016 0.216 0.124 0.128 0.190 0.001 104 N 0.001 0.001 0.010 0.011 0.012 0.003 0.083 0.008 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.012 0.120 0.082 0.203 0.444 0.001 105 P 0.001 0.001 0.006 0.007 0.026 0.002 0.028 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.026 0.232 0.085 0.141 0.433 0.001 106 T 0.001 0.001 0.005 0.012 0.005 0.001 0.010 0.012 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.019 0.100 0.020 0.236 0.575 0.001 107 P 0.001 0.001 0.004 0.007 0.015 0.004 0.030 0.088 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.013 0.660 0.036 0.035 0.098 0.001 108 C 0.001 0.001 0.011 0.009 0.010 0.019 0.224 0.516 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.009 0.007 0.071 0.043 0.036 0.038 0.001 109 F 0.002 0.002 0.009 0.007 0.018 0.009 0.065 0.628 0.003 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.012 0.005 0.146 0.028 0.035 0.025 0.001 110 A 0.002 0.002 0.011 0.010 0.009 0.006 0.056 0.719 0.003 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.008 0.003 0.134 0.008 0.012 0.012 0.001 111 A 0.002 0.002 0.004 0.004 0.010 0.021 0.140 0.691 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.002 0.070 0.020 0.013 0.009 0.001 112 I 0.001 0.002 0.007 0.009 0.008 0.014 0.171 0.552 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.003 0.131 0.036 0.025 0.024 0.001 113 V 0.001 0.001 0.011 0.007 0.021 0.007 0.087 0.407 0.014 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.013 0.176 0.065 0.070 0.107 0.001 114 S 0.001 0.001 0.004 0.006 0.004 0.002 0.016 0.336 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.004 0.375 0.016 0.076 0.152 0.001 115 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.025 0.622 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.314 0.011 0.005 0.012 0.001 116 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.035 0.910 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.028 0.009 0.008 0.003 0.001 117 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.910 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.067 0.004 0.003 0.002 0.001 118 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.905 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.083 0.001 0.001 0.001 0.001 119 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.974 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.015 0.002 0.001 0.001 0.001 120 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.962 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.033 0.001 0.001 0.001 0.001 121 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.976 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.021 0.001 0.001 0.001 0.001 122 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.987 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.001 0.001 0.001 0.001 123 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.989 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.001 0.001 0.001 0.001 124 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.970 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.026 0.001 0.001 0.001 0.001 125 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.953 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.043 0.001 0.001 0.001 0.001 126 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.989 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.001 0.001 0.001 0.001 127 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.975 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.021 0.001 0.001 0.001 0.001 128 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.937 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.058 0.001 0.001 0.001 0.001 129 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.961 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.031 0.001 0.001 0.001 0.001 130 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.014 0.958 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.015 0.004 0.001 0.001 0.001 131 G 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.017 0.915 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.036 0.009 0.007 0.002 0.001 132 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.033 0.802 0.021 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.114 0.006 0.007 0.003 0.001 133 T 0.001 0.001 0.008 0.008 0.003 0.006 0.121 0.060 0.575 0.100 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.089 0.006 0.008 0.009 0.001 134 R 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.004 0.727 0.015 0.013 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.064 0.026 0.024 0.111 0.001 135 G 0.001 0.001 0.003 0.003 0.004 0.004 0.053 0.011 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.007 0.041 0.728 0.058 0.083 0.001 136 L 0.001 0.001 0.022 0.011 0.033 0.006 0.026 0.021 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.014 0.086 0.148 0.103 0.277 0.241 0.001 137 F 0.001 0.001 0.053 0.011 0.038 0.005 0.031 0.025 0.007 0.001 0.001 0.001 0.003 0.008 0.124 0.051 0.128 0.040 0.205 0.266 0.001 138 R 0.001 0.001 0.031 0.033 0.039 0.005 0.060 0.024 0.005 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.064 0.032 0.143 0.048 0.205 0.298 0.001 139 R 0.001 0.001 0.011 0.013 0.031 0.011 0.135 0.034 0.002 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.032 0.020 0.452 0.054 0.053 0.139 0.001 140 D 0.001 0.001 0.009 0.006 0.016 0.009 0.453 0.044 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.025 0.022 0.054 0.151 0.107 0.097 0.001 141 L 0.001 0.001 0.024 0.013 0.019 0.004 0.030 0.045 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.037 0.065 0.158 0.105 0.163 0.333 0.001 142 H 0.001 0.001 0.005 0.006 0.009 0.001 0.006 0.056 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.032 0.051 0.022 0.156 0.649 0.001 143 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.006 0.141 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.002 0.806 0.007 0.009 0.019 0.001 144 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.016 0.955 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.018 0.002 0.002 0.002 0.001 145 N 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.981 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 0.003 0.001 0.001 0.001 146 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.971 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.027 0.001 0.001 0.001 0.001 147 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.988 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.001 0.001 0.001 0.001 148 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.001 0.001 0.001 0.001 149 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.988 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.001 0.001 0.001 0.001 150 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.977 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.022 0.001 0.001 0.001 0.001 151 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.984 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.014 0.001 0.001 0.001 0.001 152 G 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.971 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.024 0.001 0.001 0.001 0.001 153 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.917 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.071 0.001 0.001 0.001 0.001 154 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.016 0.844 0.007 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.126 0.002 0.001 0.001 0.001 155 N 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.027 0.835 0.007 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.115 0.006 0.003 0.002 0.001 156 Y 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.021 0.877 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.068 0.014 0.005 0.002 0.001 157 F 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.004 0.018 0.869 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.075 0.009 0.008 0.003 0.001 158 F 0.003 0.004 0.002 0.003 0.004 0.006 0.034 0.830 0.014 0.003 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.002 0.069 0.009 0.008 0.004 0.001 159 L 0.007 0.009 0.004 0.008 0.009 0.010 0.067 0.703 0.036 0.007 0.001 0.001 0.002 0.003 0.005 0.003 0.085 0.016 0.014 0.009 0.001 160 S 0.010 0.014 0.009 0.016 0.018 0.014 0.109 0.508 0.058 0.013 0.002 0.001 0.005 0.006 0.008 0.006 0.135 0.028 0.020 0.018 0.001 161 T 0.012 0.015 0.013 0.016 0.031 0.022 0.163 0.356 0.034 0.013 0.002 0.002 0.005 0.006 0.013 0.011 0.144 0.059 0.043 0.037 0.001 162 L 0.006 0.009 0.023 0.026 0.027 0.019 0.149 0.205 0.029 0.011 0.002 0.002 0.005 0.007 0.023 0.013 0.205 0.088 0.080 0.069 0.001 163 A 0.005 0.007 0.022 0.019 0.053 0.013 0.152 0.090 0.023 0.007 0.002 0.001 0.004 0.005 0.018 0.021 0.222 0.090 0.102 0.144 0.001 164 T 0.002 0.002 0.021 0.022 0.026 0.007 0.101 0.038 0.016 0.006 0.001 0.001 0.001 0.003 0.020 0.013 0.257 0.076 0.156 0.230 0.001 165 E 0.001 0.001 0.008 0.009 0.026 0.010 0.157 0.027 0.005 0.002 0.001 0.001 0.001 0.002 0.011 0.012 0.472 0.045 0.051 0.162 0.001 166 G 0.001 0.001 0.015 0.011 0.019 0.016 0.295 0.029 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.018 0.015 0.142 0.153 0.132 0.147 0.001 167 L 0.001 0.001 0.016 0.009 0.051 0.008 0.101 0.018 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.020 0.030 0.147 0.175 0.225 0.188 0.001 168 T 0.001 0.001 0.048 0.013 0.021 0.013 0.079 0.014 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.054 0.013 0.152 0.077 0.172 0.338 0.001 169 S 0.001 0.001 0.014 0.010 0.036 0.006 0.126 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.018 0.042 0.105 0.114 0.215 0.302 0.001 170 H 0.001 0.001 0.018 0.009 0.016 0.001 0.017 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.041 0.049 0.058 0.055 0.235 0.497 0.001 171 S 0.001 0.001 0.003 0.005 0.002 0.001 0.002 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.028 0.065 0.008 0.197 0.683 0.001 172 P 0.001 0.001 0.004 0.005 0.014 0.004 0.046 0.051 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.013 0.051 0.472 0.084 0.057 0.195 0.001 173 D 0.001 0.001 0.009 0.005 0.011 0.016 0.243 0.325 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.021 0.015 0.061 0.066 0.092 0.130 0.001 174 Q 0.001 0.001 0.007 0.007 0.007 0.003 0.033 0.404 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.013 0.009 0.390 0.022 0.041 0.063 0.001 175 D 0.001 0.001 0.003 0.003 0.004 0.002 0.028 0.818 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.003 0.108 0.007 0.008 0.011 0.001 176 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.016 0.945 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.024 0.004 0.002 0.002 0.001 177 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.007 0.965 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.020 0.001 0.001 0.001 0.001 178 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.952 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.034 0.001 0.002 0.001 0.001 179 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.007 0.964 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.020 0.001 0.001 0.001 0.001 180 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.014 0.947 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.020 0.003 0.002 0.001 0.001 181 Q 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.005 0.019 0.907 0.004 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.045 0.005 0.004 0.002 0.001 182 Y 0.003 0.004 0.003 0.007 0.006 0.009 0.046 0.739 0.033 0.013 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.003 0.093 0.013 0.014 0.005 0.001 183 V 0.006 0.007 0.008 0.008 0.010 0.014 0.132 0.499 0.057 0.012 0.001 0.001 0.003 0.006 0.009 0.006 0.161 0.018 0.021 0.018 0.001 184 A 0.011 0.012 0.011 0.015 0.024 0.026 0.187 0.313 0.052 0.013 0.002 0.002 0.005 0.014 0.013 0.013 0.100 0.101 0.044 0.039 0.002 185 I 0.008 0.012 0.014 0.016 0.045 0.016 0.100 0.158 0.022 0.008 0.004 0.002 0.008 0.019 0.028 0.038 0.255 0.089 0.107 0.049 0.002 186 F 0.006 0.009 0.043 0.032 0.031 0.011 0.084 0.084 0.028 0.006 0.004 0.003 0.010 0.025 0.066 0.049 0.168 0.089 0.131 0.118 0.003 187 T 0.007 0.007 0.027 0.021 0.077 0.008 0.080 0.028 0.025 0.003 0.004 0.003 0.007 0.022 0.035 0.050 0.198 0.075 0.153 0.168 0.001 188 R 0.003 0.003 0.018 0.028 0.034 0.005 0.080 0.019 0.003 0.001 0.001 0.002 0.003 0.007 0.036 0.027 0.265 0.062 0.118 0.283 0.001 189 G 0.003 0.004 0.019 0.016 0.059 0.007 0.106 0.024 0.003 0.001 0.002 0.002 0.003 0.005 0.028 0.041 0.207 0.149 0.142 0.180 0.001 190 I 0.002 0.003 0.033 0.032 0.036 0.008 0.076 0.038 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.004 0.043 0.041 0.270 0.041 0.132 0.232 0.001 191 M 0.005 0.007 0.038 0.027 0.092 0.013 0.148 0.062 0.003 0.001 0.003 0.002 0.004 0.006 0.038 0.034 0.127 0.127 0.115 0.147 0.001 192 A 0.008 0.008 0.062 0.057 0.066 0.010 0.095 0.060 0.005 0.002 0.004 0.003 0.007 0.007 0.046 0.030 0.224 0.041 0.117 0.148 0.002