(c) 1992-2000 Regents of the University of California, Santa Cruz
Sequence Alignment and Modeling Software System
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Citations (SAM, SAM-T99, HMMs)

Sequence numbers correspond to the following labels:

    • T0514
                                               10                      
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   6 LS.VVV...L..K.T...A..D.....R..Ks....K..I.....L...R.VLAPLG..VL..L.
   7 LS.VVV...L..K.T...A..D.....R..Ks....K..I.....L...R.VLAPLG..VL..L.
   8 LT.VII...L..K.T...A..D.....Q..Ks....K..L.....M...R.VVAPLG..VL..L.
   9 LT.VII...L..K.T...A..D.....Q..Ks....K..L.....M...R.VVAPLG..VL..L.
  10 LT.VII...L..K.T...A..D.....Q..Ks....K..L.....M...R.VVAPLG..VL..L.
  11 LS.VVV...L..K.T...A..D.....R..Ka....K..I.....L...R.VLAPLG..VL..L.
  12 LS.VVV...L..K.T...A..D.....R..Ka....K..I.....L...R.VLAPLG..VL..L.
  13 LT.VIV...L..K.T...A..D.....Q..Ks....P..L.....M...R.VVAPLG..VL..L.
  14 LS.VVV...L..R.T...A..D.....N..K.....Ae.I.....L...R.VLAPLG..VL..L.
  15 LT.VIV...L..K.T...A..D.....Q..Ks....R..L.....M...R.VVAPLG..VL..L.
  16 LT.VII...L..R.T...A..D.....Q..Ks....R..L.....L...R.VLAPLG..VL..L.
  17 LT.VIV...L..K.T...A..D.....Q..Ks....R..L.....M...R.VVAPLG..VL..L.
  18 LT.VIV...L..K.T...A..D.....Q..Ks....R..L.....M...R.VVAPLG..VL..L.
  19 LS.VVV...L..K.T...A..D.....N..Ka....R..I.....L...R.VLAPLG..VL..L.
  20 LV.VIV...L..K.T...A..D.....G..Ks....R..L.....L...R.VIAPLG..VL..L.
  21 LT.VII...L..K.T...A..D.....Q..Ks....K..L.....M...R.VVAPLG..VL..L.
  22 LS.VII...L..K.T...A..D.....K..Qa....R..I.....L...R.VLAPLG..VL..L.
  23 LT.VII...L..K.T...A..D.....Q..Kn....K..L.....M...R.VVAPLG..VL..L.
  24 LS.VVV...L..K.T...A..D.....N..Ka....R..I.....L...R.VLAPLG..VL..L.
  25 LS.VVV...L..K.T...A..D.....N..Ka....R..I.....L...R.VLAPLG..VL..L.
  26 LS.VVV...L..K.T...A..D.....N..Ka....R..I.....L...R.VLAPLG..VL..L.
  27 LS.VVV...L..K.T...A..D.....N..Ka....R..I.....L...R.VLAPLG..VL..L.
  28 LT.VIV...L..K.T...A..D.....Q..Ks....R..L.....M...R.VVAPLG..VL..L.
  29 LT.VII...L..K.T...A..D.....Q..Ks....K..L.....M...R.VVAPLG..VL..L.
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  36 LV.VIV...L..K.T...A..D.....Nr.G.....Y..L.....L...R.VVAPLG..VL..L.
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  39 AE.FSL...F..R.L...P..E.....Ga.Qav...A..G.....A...T.IIVPLG..TL..L.
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  41 LA.VIV...L..K.T...A..D.....Nr.G.....T..L.....L...R.VVAPLG..IL..L.
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  43 LT.AEL...R..N.V...A..G.....G..K.....V..D.....G...V.LLMPFG..LD..L.
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  48 LV.VIV...L..K.I...A..D.....Nr.G.....Y..L.....L...R.VQAPLG..IL..L.
  49 LV.VIV...L..K.I...A..D.....Nr.G.....Y..L.....L...R.VQAPLG..IL..L.
  50 FA.VSI...L..H.L...A..D.....Gt.G.....T..I.....L...R.ARAPLG..II..L.
  51 AY.AFV...S..T.R...P..A.....E..K.....V..T.....N...E.VSVTMG..YP..L.
  52 AY.AFV...S..T.R...P..A.....E..K.....V..T.....N...E.VSVTMG..YP..L.
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  55 AE.VSL...F..R.I...EqtG.....G..Qav...A..G.....A...T.VIAPLE..TL..L.
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  61 AE.FSI...Y..K.L...P..E.....G..A.....P..V.....VagaT.IAAPLG..TL..L.
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  63 AE.FSV...V..P.L...P..D.....G..Gevv..A..G.....A...T.IVAPLE..TL..L.
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  65 TA.VNL...I..E.I...K..Gki...N..R.....K..I.....F...Q.VTVPIG..RL..I.
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  67 AE.FSL...F..R.L...P..A.....G..Gkat..A..G.....A...T.VVVPLE..TA..L.
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  69 AE.FSL...F..R.L...P..A.....G..Gkat..A..G.....A...T.VVVPLE..TA..L.
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  71 AE.ISM...F..A.L...P..A.....G..Qqaa..A..G.....A...T.IVAPLE..TL..L.
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  74 AE.FSM...F..R.L...E..D.....G..Gvav..A..G.....A...T.VIVPLE..TL..L.
  75 LA.AAI...Y..D.L...K..G.....A..Qgnv..R..V.....A...R.FLLPLG..LL..L.
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  77 LA.AAI...Y..D.L...K..G.....A..Qgna..R..V.....A...R.FLLPLG..LL..L.
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  79 AE.FTI...Y..R.L...P..E.....G..G.....P..V.....IagaT.IAAPLG..TL..L.
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  87 AY.AFI...S..T.R...P..S.....E..K.....V..V.....N...E.VSVMVG..YP..L.
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  89 AY.AFI...S..T.R...P..S.....E..K.....V..V.....N...E.VSVMVG..YP..L.
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  91 AE.FTA...F..R.L...P..E.....G..Gqaa..A..G.....A...T.IVVPLE..TA..L.
  92 AY.AFI...S..T.R...P..A.....E..K.....V..I.....N...E.VSVMIG..YP..L.
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 155 LA.VAV...Y..D.M...K..NaatkqE..V.....K..V.....V...R.FLLPLG..LM..L.
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 184 AE.ISL...F..R.I...D..Q.....Q..Ggqav.A..G.....A...T.VIVPLE..TL..I.
 185 TA.VGL...I..S.V...S..Gki...N..R.....K..L.....L...Q.VSVPTA..RL..V.
 186 TA.VGL...I..S.V...T..Gki...N..R.....K..L.....L...Q.VSVQSA..RL..I.
 187 LA.LAV...Y..D.I...K..G.....E..Dt....R..I.....V...R.LLMPVG..LM..L.
 188 IL.LLV...S..N.R...P..S.....N..N.....V..T.....Q...E.VSFTGG..YP..F.
 189 MR.LSI...A..H.A...G..Dr....E..R.....Y..G.....V...Q.VIVPLG..VL..I.
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 191 IL.LMV...F..F.R...P..S.....A..N.....A..N.....G...Q.VAFTGG..YP..F.
 192 IQ.LFV...F..Y.R...P..D.....N..G.....G..K.....G...Q.VTFTGG..YP..F.
 193 TA.IGL...I..S.I...T..Gkv...N..R.....M..L.....L...Q.VTVPTA..RL..I.
 194 FS.WSL...A..A.A...E..N.....G..K.....P..Y.....M...I.MRIPAV..VG..A.
 195 TA.VGL...I..S.V...S..Gki...N..R.....K..L.....L...Q.VSVPTA..RL..V.
 196 TA.VGL...I..S.V...T..Gki...N..R.....K..L.....L...Q.VSVPTA..RL..I.
 197 LL.FAI...T..K.G...E..Q.....E..G.....P..N.....A...T.LVMPFG..LL..L.
 198 FG.FEL...Q..T.P...A..N.....G..R.....A..E.....G...I.VLMPFG..LA..I.
 199 TV.INL...V..E.V...K..G.....P..Qne...K..R.....I...G.IQVPTG..RF..I.
 200 LA.IEL...S..S.K...T..G.....E..G.....A..T.....G...T.LALPFG..LA..L.
 201 NF.FLV...T..K.R...F..S.....S..P.....V..S.....F...E.PQFMAG..YV..L.
 202 IR.LFV...F..Y.R...P..D.....S..G.....N..K.....G...Q.VTFTGG..YP..F.
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