This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 1 NATAA S A 2 2 NATAA S A 3 3 NATAA L A 4 4 NATAA T A 5 5 NATAA E A 6 6 NATAA T A 7 7 NATAA Y A 8 8 NATAA G A 9 9 NATAA L A 10 10 NATAA W A 11 11 NATAA S A 12 12 NATAA I A 13 13 NATAA N A 14 14 NATRO C A 15 15 NATAA G A 16 16 NATAA I A 17 17 NATAA Q A 18 18 NATAA E A 19 19 NATAA G A 20 20 NATAA K A 21 21 NATAA K A 22 22 NATAA V A 23 23 NATRO C A 24 24 NATAA F A 25 25 NATAA M A 26 26 NATAA H A 27 27 NATAA R A 28 28 NATAA Q A 29 29 NATAA E A 30 30 NATAA V A 31 31 NATAA N A 32 32 NATAA D A 33 33 NATAA Q A 34 34 NATAA N A 35 35 NATAA R A 36 36 NATAA V A 37 37 NATAA V A 38 38 NATAA V A 39 39 NATAA A A 40 40 NATAA M A 41 41 NATAA S A 42 42 NATAA V A 43 43 NATAA V A 44 44 NATAA L A 45 45 NATAA N A 46 46 NATAA A A 47 47 NATAA D A 48 48 NATAA G A 49 49 NATAA V A 50 50 NATAA V A 51 51 NATAA S A 52 52 NATAA G A 53 53 NATAA N A 54 54 NATAA L A 55 55 NATAA T A 56 56 NATAA V A 57 57 NATRO P A 58 58 NATAA F A 59 59 NATAA G A 60 60 NATAA I A 61 61 NATAA L A 62 62 NATAA V A 63 63 NATAA S A 64 64 NATAA K A 65 65 NATRO P A 66 66 NATAA V A 67 67 NATAA R A 68 68 NATAA L A 69 69 NATAA Q A 70 70 NATAA V A 71 71 NATAA D A 72 72 NATAA E A 73 73 NATAA G A 74 74 NATAA K A 75 75 NATAA A A 76 76 NATAA V A 77 77 NATAA I A 78 78 NATAA E A 79 79 NATAA T A 80 80 NATAA G A 81 81 NATAA I A 82 82 NATAA R A 83 83 NATAA T A 84 84 NATRO C A 85 85 NATAA V A 86 86 NATRO P A 87 87 NATAA A A 88 88 NATAA G A 89 89 NATRO C A 90 90 NATAA I A 91 91 NATAA V A 92 92 NATRO P A 93 93 NATAA I A 94 94 NATAA V A 95 95 NATAA F A 96 96 NATAA D A 97 97 NATAA K A 98 98 NATAA N A 99 99 NATAA Y A 100 100 NATAA V A 101 101 NATAA A A 102 102 NATAA A A 103 103 NATAA L A 104 104 NATAA R A 105 105 NATAA A A 106 106 NATAA G A 107 107 NATAA K A 108 108 NATAA H A 109 109 NATAA L A 110 110 NATAA K A 111 111 NATAA L A 112 112 NATAA A A 113 113 NATAA M A 114 114 NATAA T A 115 115 NATAA I A 116 116 NATAA A A 117 117 NATAA A A 118 118 NATRO P A 119 119 NATAA G A 120 120 NATAA E A 121 121 NATRO P A 122 122 NATRO P A 123 123 NATAA L A 124 124 NATAA N A 125 125 NATAA D A 126 126 NATAA L A 127 127 NATAA F A 128 128 NATAA V A 129 129 NATAA Q A 130 130 NATAA L A 131 131 NATAA N A 132 132 NATAA G A 133 133 NATAA F A 134 134 NATAA S A 135 135 NATAA N A 136 136 NATAA A A 137 137 NATAA L A 138 138 NATAA N A 139 139 NATAA R A 140 140 NATAA L A 141 141 NATAA I A 142 142 NATAA A A 143 143 NATAA L A 144 144 NATAA Q A 145 145 NATAA K