# TARGET T0514 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0514.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 84 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 S 0.030 0.008 0.011 0.009 0.026 0.017 0.899 2 S 0.244 0.054 0.041 0.043 0.028 0.091 0.499 3 L 0.368 0.030 0.040 0.044 0.129 0.102 0.288 4 T 0.401 0.022 0.029 0.036 0.109 0.069 0.335 5 E 0.343 0.023 0.025 0.034 0.155 0.057 0.363 6 T 0.338 0.030 0.019 0.021 0.099 0.071 0.421 7 Y 0.283 0.047 0.032 0.016 0.162 0.111 0.350 8 G 0.223 0.014 0.029 0.014 0.277 0.143 0.300 9 L 0.256 0.010 0.072 0.034 0.234 0.155 0.239 10 W 0.599 0.025 0.043 0.035 0.094 0.050 0.154 11 S 0.797 0.014 0.015 0.025 0.024 0.023 0.103 12 I 0.828 0.011 0.014 0.029 0.021 0.024 0.074 13 N 0.814 0.010 0.008 0.021 0.025 0.021 0.101 14 C 0.639 0.019 0.011 0.017 0.052 0.029 0.234 15 G 0.459 0.034 0.011 0.017 0.118 0.042 0.319 16 I 0.205 0.020 0.021 0.024 0.212 0.121 0.397 17 Q 0.063 0.009 0.027 0.029 0.205 0.188 0.480 18 E 0.020 0.005 0.049 0.057 0.225 0.461 0.184 19 G 0.018 0.003 0.048 0.057 0.259 0.360 0.254 20 K 0.075 0.009 0.035 0.119 0.259 0.101 0.402 21 K 0.252 0.032 0.013 0.161 0.116 0.037 0.388 22 V 0.403 0.015 0.011 0.235 0.057 0.023 0.257 23 C 0.597 0.011 0.015 0.192 0.031 0.015 0.139 24 F 0.706 0.010 0.022 0.163 0.021 0.013 0.064 25 M 0.812 0.004 0.019 0.100 0.014 0.014 0.037 26 H 0.837 0.002 0.016 0.086 0.013 0.014 0.032 27 R 0.824 0.003 0.017 0.079 0.014 0.016 0.047 28 Q 0.804 0.005 0.015 0.075 0.027 0.018 0.056 29 E 0.783 0.010 0.010 0.087 0.028 0.021 0.062 30 V 0.622 0.016 0.012 0.116 0.038 0.049 0.147 31 N 0.252 0.010 0.017 0.077 0.120 0.332 0.191 32 D 0.101 0.007 0.025 0.030 0.192 0.471 0.175 33 Q 0.027 0.004 0.015 0.013 0.321 0.557 0.064 34 N 0.048 0.002 0.004 0.001 0.358 0.422 0.165 35 R 0.479 0.009 0.001 0.001 0.105 0.006 0.400 36 V 0.760 0.016 0.001 0.001 0.018 0.001 0.204 37 V 0.951 0.002 0.001 0.001 0.007 0.001 0.039 38 V 0.985 0.002 0.001 0.001 0.002 0.001 0.010 39 A 0.988 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 40 M 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 41 S 0.990 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 42 V 0.970 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.026 43 V 0.932 0.003 0.001 0.001 0.009 0.001 0.055 44 L 0.844 0.042 0.001 0.001 0.019 0.004 0.089 45 N 0.406 0.015 0.008 0.001 0.066 0.050 0.455 46 A 0.045 0.004 0.017 0.001 0.201 0.636 0.096 47 D 0.011 0.001 0.015 0.001 0.262 0.666 0.043 48 G 0.076 0.007 0.005 0.001 0.576 0.091 0.243 49 V 0.281 0.021 0.002 0.001 0.070 0.009 0.617 50 V 0.683 0.016 0.001 0.001 0.035 0.003 0.262 51 S 0.920 0.002 0.001 0.001 0.027 0.001 0.050 52 G 0.978 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.019 53 N 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 54 L 0.989 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 55 T 0.954 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.040 56 V 0.773 0.011 0.001 0.001 0.031 0.003 0.180 57 P 0.423 0.012 0.012 0.003 0.118 0.058 0.374 58 F 0.115 0.013 0.073 0.010 0.170 0.401 0.218 59 G 0.246 0.017 0.098 0.010 0.229 0.210 0.191 60 I 0.432 0.014 0.051 0.007 0.124 0.076 0.296 61 L 0.532 0.057 0.026 0.006 0.117 0.056 0.205 62 V 0.350 0.170 0.007 0.004 0.080 0.016 0.372 63 S 0.099 0.010 0.012 0.001 0.085 0.036 0.757 64 K 0.018 0.002 0.016 0.001 0.190 0.732 0.042 65 P 0.072 0.004 0.022 0.001 0.173 0.655 0.074 66 V 0.613 0.012 0.002 0.001 0.034 0.006 0.332 67 R 0.934 0.008 0.001 0.001 0.006 0.001 0.051 68 L 0.950 0.012 0.001 0.001 0.003 0.001 0.034 69 Q 0.908 0.007 0.001 0.001 0.005 0.002 0.077 70 V 0.732 0.017 0.002 0.001 0.034 0.022 0.191 71 D 0.230 0.011 0.014 0.002 0.173 0.312 0.257 72 E 0.020 0.004 0.021 0.003 0.220 0.672 0.061 73 G 0.021 0.008 0.050 0.006 0.276 0.462 0.177 74 K 0.083 0.025 0.049 0.011 0.297 0.170 0.365 75 A 0.179 0.050 0.057 0.017 0.164 0.146 0.385 76 V 0.178 0.026 0.037 0.018 0.111 0.058 0.573 77 I 0.275 0.024 0.043 0.033 0.136 0.075 0.414 78 E 0.413 0.029 0.027 0.031 0.122 0.090 0.289 79 T 0.447 0.013 0.005 0.015 0.079 0.014 0.427 80 G 0.563 0.011 0.003 0.006 0.066 0.011 0.340 81 I 0.811 0.019 0.004 0.005 0.017 0.007 0.137 82 R 0.844 0.008 0.006 0.004 0.028 0.010 0.099 83 T 0.825 0.008 0.006 0.004 0.046 0.013 0.098 84 C 0.598 0.025 0.007 0.006 0.082 0.028 0.254 85 V 0.237 0.026 0.006 0.005 0.152 0.032 0.542 86 P 0.098 0.005 0.013 0.006 0.367 0.135 0.376 87 A 0.116 0.021 0.024 0.013 0.251 0.452 0.123 88 G 0.331 0.022 0.028 0.017 0.143 0.222 0.238 89 C 0.594 0.013 0.009 0.007 0.052 0.024 0.301 90 I 0.883 0.011 0.004 0.004 0.026 0.012 0.061 91 V 0.898 0.011 0.005 0.004 0.015 0.007 0.061 92 P 0.880 0.013 0.004 0.003 0.016 0.006 0.078 93 I 0.657 0.009 0.006 0.004 0.041 0.009 0.275 94 V 0.405 0.028 0.017 0.004 0.088 0.034 0.424 95 F 0.136 0.076 0.007 0.006 0.267 0.015 0.493 96 D 0.019 0.003 0.001 0.008 0.062 0.004 0.904 97 K 0.001 0.001 0.028 0.922 0.012 0.032 0.006 98 N 0.001 0.001 0.012 0.962 0.005 0.017 0.003 99 Y 0.001 0.001 0.009 0.976 0.003 0.009 0.004 100 V 0.001 0.001 0.002 0.987 0.003 0.005 0.003 101 A 0.004 0.001 0.005 0.962 0.003 0.019 0.006 102 A 0.003 0.001 0.010 0.947 0.005 0.029 0.006 103 L 0.006 0.003 0.021 0.892 0.017 0.045 0.017 104 R 0.011 0.002 0.032 0.721 0.036 0.163 0.035 105 A 0.004 0.002 0.027 0.249 0.032 0.648 0.039 106 G 0.006 0.002 0.017 0.048 0.134 0.580 0.213 107 K 0.048 0.006 0.015 0.013 0.275 0.121 0.522 108 H 0.373 0.009 0.009 0.003 0.269 0.022 0.315 109 L 0.786 0.009 0.001 0.001 0.015 0.003 0.184 110 K 0.961 0.001 0.001 0.001 0.012 0.001 0.025 111 L 0.988 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 112 A 0.986 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.013 113 M 0.973 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.023 114 T 0.913 0.002 0.001 0.001 0.007 0.001 0.076 115 I 0.656 0.013 0.004 0.002 0.033 0.003 0.288 116 A 0.426 0.008 0.016 0.005 0.072 0.018 0.455 117 A 0.197 0.017 0.083 0.012 0.147 0.181 0.364 118 P 0.113 0.023 0.078 0.011 0.295 0.182 0.297 119 G 0.055 0.016 0.066 0.007 0.233 0.078 0.545 120 E 0.032 0.010 0.062 0.006 0.201 0.486 0.203 121 P 0.043 0.007 0.046 0.004 0.295 0.412 0.194 122 P 0.168 0.017 0.010 0.003 0.377 0.030 0.395 123 L 0.434 0.036 0.003 0.001 0.054 0.016 0.455 124 N 0.630 0.013 0.003 0.002 0.055 0.008 0.290 125 D 0.824 0.006 0.002 0.002 0.032 0.005 0.130 126 L 0.912 0.006 0.001 0.003 0.007 0.001 0.070 127 F 0.914 0.002 0.001 0.002 0.005 0.001 0.076 128 V 0.793 0.016 0.002 0.005 0.011 0.002 0.171 129 Q 0.695 0.017 0.005 0.010 0.038 0.013 0.222 130 L 0.243 0.011 0.067 0.087 0.090 0.120 0.382 131 N 0.064 0.011 0.099 0.129 0.262 0.216 0.219 132 G 0.057 0.016 0.071 0.200 0.247 0.145 0.264 133 F 0.015 0.006 0.054 0.724 0.066 0.036 0.100 134 S 0.005 0.002 0.026 0.901 0.019 0.028 0.020 135 N 0.002 0.001 0.031 0.907 0.011 0.035 0.013 136 A 0.001 0.001 0.017 0.944 0.007 0.023 0.009 137 L 0.001 0.001 0.016 0.945 0.008 0.022 0.007 138 N 0.001 0.001 0.013 0.897 0.010 0.068 0.010 139 R 0.001 0.001 0.019 0.843 0.009 0.106 0.022 140 L 0.002 0.008 0.029 0.708 0.033 0.122 0.097 141 I 0.005 0.003 0.057 0.712 0.036 0.137 0.050 142 A 0.008 0.002 0.088 0.612 0.066 0.137 0.088 143 L 0.011 0.008 0.079 0.433 0.117 0.176 0.176 144 Q 0.019 0.021 0.047 0.296 0.005 0.218 0.394 145 K 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.001 0.993