# TARGET T0514 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0514.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 83 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 S 0.025 0.007 0.009 0.007 0.022 0.014 0.916 2 S 0.242 0.055 0.038 0.043 0.025 0.084 0.513 3 L 0.375 0.028 0.040 0.046 0.124 0.099 0.289 4 T 0.413 0.021 0.030 0.039 0.101 0.067 0.329 5 E 0.355 0.022 0.026 0.036 0.146 0.056 0.358 6 T 0.352 0.029 0.020 0.022 0.096 0.072 0.409 7 Y 0.292 0.046 0.033 0.017 0.160 0.109 0.344 8 G 0.229 0.013 0.031 0.015 0.269 0.149 0.294 9 L 0.260 0.009 0.075 0.035 0.230 0.162 0.230 10 W 0.611 0.024 0.042 0.035 0.091 0.049 0.148 11 S 0.805 0.014 0.014 0.024 0.022 0.022 0.099 12 I 0.833 0.010 0.013 0.028 0.020 0.023 0.073 13 N 0.815 0.009 0.007 0.021 0.025 0.020 0.102 14 C 0.639 0.018 0.011 0.016 0.053 0.029 0.234 15 G 0.457 0.034 0.010 0.016 0.119 0.042 0.320 16 I 0.205 0.020 0.020 0.022 0.213 0.119 0.402 17 Q 0.063 0.008 0.026 0.026 0.206 0.192 0.478 18 E 0.020 0.005 0.048 0.050 0.230 0.473 0.174 19 G 0.020 0.003 0.047 0.051 0.271 0.358 0.251 20 K 0.081 0.009 0.033 0.102 0.265 0.097 0.413 21 K 0.273 0.034 0.012 0.140 0.116 0.035 0.391 22 V 0.440 0.016 0.010 0.196 0.056 0.021 0.260 23 C 0.622 0.011 0.015 0.163 0.031 0.014 0.144 24 F 0.726 0.011 0.021 0.143 0.021 0.012 0.066 25 M 0.825 0.004 0.019 0.087 0.014 0.014 0.038 26 H 0.844 0.002 0.017 0.079 0.013 0.014 0.032 27 R 0.834 0.003 0.017 0.071 0.014 0.015 0.046 28 Q 0.817 0.005 0.015 0.066 0.025 0.018 0.054 29 E 0.793 0.010 0.010 0.078 0.026 0.020 0.062 30 V 0.626 0.014 0.013 0.109 0.038 0.051 0.149 31 N 0.264 0.010 0.016 0.074 0.131 0.318 0.186 32 D 0.114 0.008 0.027 0.031 0.201 0.424 0.196 33 Q 0.027 0.004 0.015 0.013 0.320 0.555 0.065 34 N 0.046 0.001 0.005 0.001 0.327 0.471 0.148 35 R 0.509 0.009 0.001 0.001 0.101 0.006 0.374 36 V 0.761 0.016 0.001 0.001 0.017 0.001 0.205 37 V 0.951 0.002 0.001 0.001 0.007 0.001 0.039 38 V 0.985 0.002 0.001 0.001 0.002 0.001 0.010 39 A 0.987 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 40 M 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 41 S 0.990 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 42 V 0.970 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.025 43 V 0.933 0.003 0.001 0.001 0.009 0.001 0.053 44 L 0.841 0.041 0.001 0.001 0.021 0.005 0.090 45 N 0.401 0.015 0.008 0.001 0.071 0.051 0.453 46 A 0.047 0.004 0.018 0.001 0.210 0.617 0.102 47 D 0.013 0.002 0.016 0.001 0.270 0.650 0.048 48 G 0.079 0.007 0.005 0.001 0.576 0.087 0.245 49 V 0.283 0.021 0.002 0.001 0.069 0.009 0.617 50 V 0.684 0.016 0.001 0.001 0.035 0.003 0.261 51 S 0.919 0.002 0.001 0.001 0.027 0.001 0.050 52 G 0.977 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.019 53 N 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 54 L 0.988 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 55 T 0.954 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.040 56 V 0.773 0.011 0.001 0.001 0.031 0.003 0.180 57 P 0.425 0.012 0.013 0.003 0.118 0.059 0.371 58 F 0.115 0.013 0.071 0.010 0.169 0.407 0.215 59 G 0.243 0.017 0.097 0.009 0.229 0.214 0.190 60 I 0.432 0.014 0.050 0.007 0.124 0.076 0.298 61 L 0.534 0.058 0.026 0.006 0.116 0.056 0.205 62 V 0.352 0.172 0.007 0.004 0.079 0.016 0.370 63 S 0.099 0.010 0.012 0.001 0.084 0.036 0.759 64 K 0.019 0.002 0.016 0.001 0.187 0.733 0.042 65 P 0.071 0.004 0.022 0.001 0.169 0.659 0.074 66 V 0.596 0.013 0.002 0.001 0.036 0.006 0.346 67 R 0.929 0.009 0.001 0.001 0.006 0.001 0.055 68 L 0.948 0.013 0.001 0.001 0.003 0.001 0.035 69 Q 0.909 0.007 0.001 0.001 0.005 0.002 0.076 70 V 0.736 0.017 0.002 0.001 0.033 0.022 0.189 71 D 0.234 0.011 0.014 0.003 0.171 0.313 0.255 72 E 0.020 0.004 0.022 0.003 0.220 0.670 0.062 73 G 0.022 0.008 0.051 0.007 0.278 0.456 0.179 74 K 0.085 0.025 0.050 0.012 0.295 0.172 0.361 75 A 0.181 0.050 0.057 0.017 0.162 0.146 0.386 76 V 0.176 0.025 0.035 0.018 0.109 0.055 0.581 77 I 0.276 0.024 0.042 0.033 0.134 0.074 0.417 78 E 0.415 0.028 0.027 0.031 0.122 0.089 0.288 79 T 0.449 0.013 0.005 0.015 0.077 0.014 0.427 80 G 0.567 0.011 0.003 0.006 0.065 0.011 0.337 81 I 0.811 0.019 0.004 0.005 0.017 0.007 0.138 82 R 0.843 0.008 0.006 0.004 0.029 0.010 0.100 83 T 0.824 0.008 0.006 0.004 0.046 0.013 0.098 84 C 0.598 0.025 0.007 0.006 0.082 0.029 0.253 85 V 0.238 0.027 0.006 0.005 0.152 0.033 0.540 86 P 0.098 0.005 0.014 0.006 0.363 0.135 0.379 87 A 0.111 0.021 0.024 0.013 0.250 0.460 0.120 88 G 0.323 0.022 0.028 0.016 0.145 0.228 0.238 89 C 0.588 0.013 0.009 0.007 0.053 0.024 0.306 90 I 0.882 0.011 0.004 0.004 0.026 0.012 0.061 91 V 0.898 0.011 0.005 0.004 0.014 0.007 0.060 92 P 0.882 0.013 0.004 0.003 0.015 0.006 0.077 93 I 0.663 0.009 0.006 0.004 0.040 0.009 0.269 94 V 0.414 0.028 0.017 0.004 0.086 0.033 0.418 95 F 0.140 0.076 0.007 0.006 0.261 0.015 0.495 96 D 0.019 0.003 0.001 0.008 0.063 0.004 0.902 97 K 0.001 0.001 0.030 0.918 0.013 0.033 0.006 98 N 0.001 0.001 0.013 0.960 0.005 0.018 0.003 99 Y 0.001 0.001 0.009 0.975 0.003 0.009 0.004 100 V 0.001 0.001 0.002 0.986 0.003 0.005 0.003 101 A 0.004 0.001 0.005 0.961 0.004 0.019 0.007 102 A 0.003 0.001 0.010 0.944 0.005 0.030 0.006 103 L 0.006 0.004 0.023 0.886 0.017 0.047 0.017 104 R 0.012 0.002 0.035 0.710 0.038 0.168 0.036 105 A 0.005 0.002 0.029 0.251 0.033 0.639 0.041 106 G 0.007 0.002 0.018 0.048 0.137 0.562 0.227 107 K 0.051 0.006 0.015 0.013 0.277 0.119 0.521 108 H 0.390 0.009 0.008 0.003 0.261 0.021 0.308 109 L 0.798 0.009 0.001 0.001 0.014 0.003 0.174 110 K 0.964 0.001 0.001 0.001 0.011 0.001 0.023 111 L 0.988 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 112 A 0.986 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.013 113 M 0.970 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.025 114 T 0.894 0.002 0.001 0.001 0.009 0.001 0.093 115 I 0.590 0.014 0.004 0.002 0.042 0.004 0.344 116 A 0.335 0.008 0.017 0.005 0.086 0.023 0.526 117 A 0.148 0.016 0.092 0.012 0.158 0.210 0.364 118 P 0.084 0.021 0.089 0.012 0.296 0.199 0.299 119 G 0.042 0.016 0.073 0.007 0.231 0.083 0.548 120 E 0.025 0.010 0.062 0.006 0.197 0.509 0.191 121 P 0.036 0.007 0.042 0.003 0.290 0.427 0.195 122 P 0.161 0.019 0.009 0.002 0.369 0.028 0.413 123 L 0.430 0.042 0.003 0.001 0.051 0.016 0.458 124 N 0.610 0.014 0.003 0.002 0.055 0.008 0.309 125 D 0.806 0.006 0.002 0.002 0.036 0.005 0.143 126 L 0.904 0.007 0.001 0.003 0.008 0.001 0.076 127 F 0.906 0.002 0.001 0.003 0.005 0.001 0.083 128 V 0.786 0.016 0.002 0.006 0.011 0.002 0.176 129 Q 0.678 0.018 0.006 0.011 0.043 0.015 0.229 130 L 0.230 0.011 0.069 0.078 0.095 0.126 0.391 131 N 0.057 0.011 0.102 0.106 0.274 0.224 0.225 132 G 0.047 0.015 0.066 0.167 0.283 0.139 0.283 133 F 0.011 0.005 0.048 0.709 0.076 0.033 0.117 134 S 0.002 0.002 0.018 0.915 0.019 0.024 0.020 135 N 0.001 0.001 0.016 0.933 0.010 0.027 0.012 136 A 0.001 0.001 0.006 0.968 0.005 0.014 0.007 137 L 0.001 0.001 0.003 0.977 0.005 0.010 0.004 138 N 0.001 0.001 0.003 0.960 0.005 0.026 0.006 139 R 0.001 0.001 0.004 0.938 0.004 0.045 0.009 140 L 0.001 0.004 0.009 0.878 0.013 0.062 0.033 141 I 0.002 0.001 0.021 0.834 0.018 0.105 0.019 142 A 0.003 0.001 0.041 0.723 0.032 0.153 0.046 143 L 0.006 0.007 0.047 0.504 0.117 0.163 0.157 144 Q 0.013 0.018 0.040 0.357 0.004 0.242 0.325 145 K 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.993