# TARGET T0507 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t2k-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-n_notor2-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 n_notor2 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0507.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 170.093 # Pos AA G H I P A B S F J M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.009 0.001 0.001 0.032 0.012 0.010 0.007 0.001 0.001 0.001 0.927 2 K 0.015 0.002 0.001 0.348 0.104 0.098 0.053 0.001 0.001 0.002 0.376 3 V 0.007 0.001 0.001 0.662 0.073 0.080 0.052 0.001 0.001 0.002 0.122 4 A 0.001 0.001 0.001 0.888 0.024 0.047 0.011 0.001 0.001 0.001 0.026 5 L 0.001 0.001 0.001 0.864 0.020 0.049 0.018 0.001 0.001 0.001 0.047 6 G 0.001 0.001 0.001 0.828 0.014 0.038 0.021 0.001 0.001 0.002 0.097 7 G 0.004 0.001 0.001 0.508 0.028 0.047 0.102 0.001 0.001 0.004 0.306 8 T 0.014 0.001 0.001 0.359 0.018 0.034 0.190 0.001 0.001 0.008 0.376 9 F 0.032 0.001 0.003 0.191 0.028 0.039 0.141 0.001 0.001 0.020 0.545 10 E 0.039 0.002 0.001 0.135 0.044 0.037 0.214 0.001 0.001 0.009 0.519 11 P 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.991 12 L 0.023 0.006 0.001 0.078 0.024 0.116 0.379 0.001 0.001 0.006 0.367 13 H 0.190 0.049 0.002 0.048 0.019 0.044 0.176 0.001 0.001 0.012 0.459 14 E 0.048 0.159 0.001 0.012 0.007 0.012 0.052 0.001 0.001 0.002 0.705 15 G 0.050 0.173 0.002 0.007 0.003 0.007 0.287 0.003 0.001 0.004 0.463 16 H 0.082 0.404 0.005 0.006 0.003 0.007 0.195 0.003 0.001 0.003 0.292 17 K 0.032 0.660 0.003 0.004 0.004 0.011 0.051 0.001 0.001 0.001 0.233 18 K 0.006 0.800 0.001 0.001 0.001 0.001 0.037 0.001 0.001 0.001 0.153 19 L 0.007 0.951 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.001 0.001 0.001 0.032 20 I 0.002 0.994 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 21 D 0.001 0.996 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 22 V 0.002 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 23 A 0.002 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 24 I 0.002 0.995 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 25 K 0.010 0.968 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.001 0.001 0.008 26 L 0.109 0.798 0.007 0.001 0.001 0.001 0.001 0.068 0.001 0.001 0.014 27 G 0.254 0.384 0.012 0.002 0.002 0.002 0.006 0.258 0.001 0.001 0.079 28 G 0.111 0.073 0.201 0.014 0.006 0.004 0.018 0.049 0.001 0.002 0.522 29 R 0.105 0.017 0.089 0.080 0.026 0.012 0.082 0.010 0.001 0.006 0.573 30 D 0.064 0.005 0.009 0.290 0.044 0.027 0.196 0.003 0.001 0.010 0.353 31 I 0.009 0.002 0.003 0.765 0.053 0.047 0.045 0.001 0.001 0.002 0.074 32 T 0.001 0.001 0.001 0.920 0.024 0.029 0.010 0.001 0.001 0.001 0.015 33 I 0.001 0.001 0.001 0.922 0.017 0.027 0.012 0.001 0.001 0.001 0.021 34 G 0.001 0.001 0.001 0.923 0.011 0.032 0.010 0.001 0.001 0.001 0.023 35 V 0.001 0.001 0.001 0.812 0.022 0.048 0.028 0.001 0.001 0.001 0.088 36 T 0.002 0.001 0.001 0.328 0.023 0.056 0.200 0.001 0.001 0.006 0.385 37 S 0.007 0.001 0.002 0.088 0.010 0.026 0.250 0.001 0.001 0.008 0.608 38 D 0.007 0.001 0.001 0.009 0.003 0.004 0.223 0.001 0.001 0.005 0.747 39 R 0.021 0.003 0.001 0.003 0.001 0.002 0.565 0.001 0.001 0.006 0.398 40 M 0.160 0.105 0.001 0.008 0.006 0.010 0.432 0.002 0.001 0.007 0.268 41 A 0.079 0.720 0.002 0.004 0.010 0.014 0.045 0.002 0.001 0.003 0.120 42 R 0.071 0.751 0.004 0.004 0.007 0.009 0.035 0.007 0.001 0.001 0.111 43 A 0.107 0.767 0.004 0.003 0.006 0.009 0.008 0.013 0.001 0.001 0.082 44 R 0.182 0.630 0.006 0.004 0.007 0.009 0.008 0.043 0.001 0.002 0.108 45 I 0.173 0.409 0.055 0.011 0.014 0.018 0.023 0.044 0.001 0.002 0.251 46 R 0.095 0.173 0.048 0.026 0.028 0.038 0.034 0.027 0.001 0.004 0.527 47 S 0.080 0.046 0.023 0.035 0.026 0.041 0.045 0.012 0.001 0.004 0.687 48 V 0.060 0.026 0.023 0.040 0.024 0.043 0.059 0.005 0.001 0.005 0.716 49 L 0.042 0.015 0.013 0.064 0.035 0.055 0.072 0.001 0.001 0.003 0.700 50 P 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.993 51 F 0.023 0.009 0.002 0.053 0.044 0.095 0.088 0.001 0.001 0.003 0.683 52 A 0.021 0.011 0.001 0.015 0.009 0.015 0.043 0.001 0.001 0.001 0.882 53 I 0.058 0.051 0.001 0.022 0.031 0.052 0.080 0.001 0.001 0.002 0.702 54 R 0.065 0.186 0.001 0.013 0.018 0.033 0.157 0.001 0.001 0.004 0.522 55 A 0.146 0.364 0.002 0.008 0.017 0.024 0.112 0.003 0.001 0.003 0.322 56 E 0.091 0.666 0.002 0.003 0.007 0.012 0.037 0.004 0.001 0.002 0.176 57 N 0.084 0.673 0.005 0.003 0.006 0.011 0.027 0.008 0.001 0.002 0.180 58 V 0.088 0.620 0.011 0.004 0.008 0.012 0.028 0.010 0.001 0.002 0.216 59 K 0.079 0.585 0.028 0.010 0.019 0.024 0.033 0.008 0.001 0.003 0.212 60 R 0.045 0.641 0.022 0.012 0.028 0.032 0.024 0.005 0.001 0.002 0.189 61 Y 0.029 0.699 0.013 0.023 0.055 0.056 0.016 0.003 0.001 0.002 0.104 62 V 0.046 0.711 0.005 0.020 0.032 0.044 0.018 0.006 0.001 0.001 0.115 63 M 0.072 0.678 0.004 0.023 0.047 0.065 0.009 0.007 0.001 0.001 0.093 64 R 0.096 0.453 0.008 0.035 0.058 0.081 0.018 0.026 0.001 0.003 0.221 65 K 0.142 0.234 0.024 0.035 0.050 0.073 0.048 0.032 0.001 0.005 0.358 66 Y 0.098 0.112 0.025 0.046 0.046 0.071 0.034 0.014 0.001 0.005 0.550 67 G 0.078 0.020 0.008 0.040 0.059 0.095 0.086 0.018 0.001 0.011 0.585 68 F 0.146 0.012 0.093 0.032 0.026 0.043 0.061 0.003 0.001 0.015 0.567 69 E 0.029 0.007 0.008 0.110 0.066 0.070 0.201 0.001 0.001 0.004 0.503 70 P 0.001 0.001 0.001 0.004 0.002 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.989 71 E 0.014 0.003 0.001 0.299 0.160 0.330 0.047 0.001 0.001 0.003 0.143 72 I 0.035 0.003 0.001 0.087 0.060 0.096 0.038 0.001 0.001 0.001 0.679 73 V 0.010 0.006 0.001 0.312 0.223 0.309 0.022 0.001 0.001 0.003 0.115 74 K 0.006 0.004 0.001 0.066 0.065 0.087 0.035 0.001 0.001 0.001 0.734 75 I 0.026 0.005 0.001 0.142 0.135 0.329 0.053 0.001 0.001 0.002 0.307 76 T 0.027 0.007 0.002 0.078 0.076 0.173 0.126 0.002 0.001 0.011 0.499 77 N 0.070 0.008 0.004 0.036 0.097 0.089 0.132 0.001 0.001 0.011 0.551 78 P 0.002 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.992 79 Y 0.021 0.010 0.002 0.022 0.034 0.093 0.297 0.001 0.001 0.011 0.510 80 G 0.358 0.014 0.004 0.021 0.023 0.037 0.097 0.002 0.001 0.020 0.424 81 K 0.167 0.038 0.009 0.020 0.021 0.031 0.078 0.002 0.001 0.004 0.630 82 T 0.073 0.045 0.009 0.046 0.058 0.101 0.112 0.002 0.001 0.011 0.543 83 L 0.075 0.037 0.003 0.040 0.057 0.085 0.097 0.003 0.001 0.007 0.596 84 D 0.091 0.043 0.004 0.036 0.039 0.064 0.073 0.004 0.001 0.006 0.638 85 V 0.116 0.030 0.008 0.058 0.044 0.057 0.084 0.004 0.001 0.008 0.591 86 D 0.084 0.014 0.002 0.061 0.055 0.076 0.223 0.006 0.001 0.011 0.467 87 F 0.083 0.009 0.028 0.125 0.053 0.059 0.061 0.002 0.001 0.007 0.572 88 E 0.013 0.004 0.002 0.390 0.201 0.100 0.171 0.001 0.001 0.004 0.114 89 Y 0.014 0.003 0.003 0.499 0.054 0.067 0.120 0.001 0.001 0.007 0.232 90 L 0.003 0.001 0.001 0.893 0.026 0.042 0.011 0.001 0.001 0.001 0.023 91 V 0.001 0.002 0.001 0.888 0.018 0.033 0.015 0.001 0.001 0.002 0.041 92 V 0.002 0.001 0.001 0.795 0.019 0.040 0.027 0.001 0.001 0.001 0.114 93 S 0.003 0.002 0.002 0.436 0.051 0.112 0.191 0.001 0.001 0.003 0.200 94 P 0.001 0.001 0.001 0.022 0.002 0.004 0.025 0.001 0.001 0.001 0.945 95 E 0.002 0.001 0.001 0.009 0.001 0.002 0.772 0.001 0.001 0.002 0.210 96 T 0.371 0.004 0.001 0.010 0.001 0.004 0.350 0.001 0.001 0.019 0.240 97 Y 0.365 0.244 0.002 0.015 0.008 0.010 0.049 0.001 0.001 0.006 0.300 98 E 0.047 0.185 0.010 0.009 0.007 0.007 0.137 0.002 0.001 0.003 0.592 99 M 0.085 0.223 0.013 0.012 0.005 0.013 0.169 0.004 0.001 0.006 0.470 100 A 0.077 0.562 0.005 0.006 0.009 0.015 0.049 0.005 0.001 0.003 0.269 101 L 0.057 0.557 0.007 0.007 0.018 0.021 0.053 0.004 0.001 0.002 0.275 102 K 0.024 0.697 0.005 0.003 0.005 0.006 0.040 0.002 0.001 0.001 0.217 103 I 0.021 0.878 0.002 0.002 0.004 0.005 0.013 0.001 0.001 0.001 0.074 104 N 0.004 0.953 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.001 0.001 0.001 0.032 105 Q 0.009 0.924 0.002 0.001 0.002 0.002 0.008 0.002 0.001 0.001 0.051 106 K 0.015 0.950 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.001 0.001 0.001 0.022 107 R 0.003 0.986 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 108 E 0.002 0.986 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 109 E 0.015 0.954 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.010 0.001 0.001 0.011 110 L 0.094 0.845 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.042 0.001 0.001 0.016 111 G 0.597 0.122 0.019 0.001 0.002 0.002 0.003 0.196 0.001 0.002 0.058 112 K 0.042 0.009 0.912 0.001 0.001 0.001 0.003 0.003 0.001 0.001 0.028 113 R 0.022 0.013 0.038 0.048 0.049 0.034 0.135 0.006 0.001 0.004 0.651 114 K 0.004 0.001 0.001 0.017 0.005 0.007 0.009 0.001 0.001 0.001 0.955 115 I 0.024 0.005 0.002 0.271 0.197 0.204 0.067 0.001 0.001 0.002 0.227 116 T 0.012 0.002 0.001 0.520 0.126 0.167 0.054 0.001 0.001 0.002 0.116 117 I 0.007 0.002 0.001 0.410 0.102 0.120 0.029 0.001 0.001 0.001 0.327 118 V 0.001 0.001 0.001 0.610 0.149 0.214 0.008 0.001 0.001 0.001 0.016 119 K 0.001 0.001 0.001 0.326 0.049 0.121 0.029 0.001 0.001 0.001 0.472 120 V 0.001 0.001 0.001 0.457 0.160 0.318 0.013 0.001 0.001 0.001 0.050 121 D 0.001 0.001 0.001 0.468 0.153 0.226 0.024 0.001 0.001 0.004 0.123 122 W 0.009 0.001 0.001 0.209 0.170 0.205 0.032 0.001 0.001 0.001 0.373 123 M 0.011 0.002 0.001 0.350 0.188 0.303 0.035 0.001 0.001 0.002 0.109 124 M 0.007 0.005 0.001 0.067 0.253 0.360 0.071 0.001 0.001 0.007 0.227 125 A 0.029 0.014 0.001 0.092 0.180 0.309 0.057 0.001 0.001 0.003 0.315 126 E 0.024 0.018 0.001 0.033 0.042 0.063 0.163 0.003 0.001 0.007 0.646 127 D 0.075 0.009 0.002 0.017 0.015 0.027 0.132 0.006 0.001 0.022 0.694 128 G 0.426 0.007 0.022 0.012 0.011 0.011 0.070 0.004 0.001 0.069 0.368 129 K 0.249 0.004 0.124 0.017 0.017 0.012 0.311 0.001 0.001 0.020 0.246 130 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 131 I 0.006 0.001 0.001 0.045 0.155 0.555 0.054 0.001 0.001 0.008 0.176 132 S 0.031 0.006 0.001 0.047 0.098 0.179 0.100 0.001 0.001 0.003 0.534 133 S 0.038 0.009 0.001 0.047 0.155 0.230 0.059 0.001 0.001 0.003 0.457 134 T 0.047 0.012 0.001 0.058 0.180 0.168 0.153 0.001 0.001 0.005 0.376 135 R 0.065 0.013 0.001 0.050 0.191 0.216 0.127 0.001 0.001 0.007 0.329 136 I 0.044 0.036 0.002 0.091 0.273 0.347 0.043 0.001 0.001 0.004 0.161 137 K 0.019 0.064 0.002 0.060 0.205 0.353 0.100 0.003 0.001 0.005 0.189 138 R 0.038 0.069 0.004 0.056 0.068 0.168 0.052 0.005 0.001 0.011 0.529 139 G 0.178 0.029 0.007 0.038 0.060 0.058 0.088 0.009 0.001 0.032 0.501 140 E 0.434 0.008 0.089 0.018 0.018 0.018 0.178 0.002 0.001 0.030 0.206 141 I 0.017 0.012 0.014 0.054 0.050 0.091 0.123 0.001 0.001 0.006 0.632 142 D 0.010 0.006 0.001 0.042 0.287 0.422 0.054 0.001 0.001 0.010 0.167 143 R 0.012 0.018 0.005 0.031 0.024 0.052 0.077 0.001 0.001 0.004 0.777 144 Y 0.010 0.009 0.001 0.022 0.031 0.056 0.674 0.001 0.001 0.005 0.191 145 G 0.384 0.014 0.006 0.040 0.033 0.052 0.138 0.002 0.001 0.085 0.247 146 G 0.193 0.055 0.021 0.081 0.065 0.050 0.138 0.002 0.001 0.013 0.381 147 I 0.034 0.026 0.027 0.084 0.069 0.104 0.117 0.001 0.001 0.008 0.529 148 I 0.024 0.034 0.003 0.124 0.183 0.359 0.053 0.001 0.001 0.008 0.212