# TARGET T0507 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0507.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 641 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.107 0.002 0.001 0.003 0.083 0.803 2 K 0.726 0.011 0.001 0.004 0.015 0.243 3 V 0.949 0.003 0.001 0.002 0.005 0.040 4 A 0.963 0.004 0.001 0.002 0.005 0.026 5 L 0.872 0.002 0.001 0.005 0.021 0.099 6 G 0.466 0.004 0.008 0.011 0.136 0.375 7 G 0.158 0.008 0.011 0.018 0.266 0.539 8 T 0.195 0.029 0.011 0.031 0.257 0.477 9 F 0.219 0.084 0.014 0.043 0.226 0.413 10 E 0.090 0.074 0.018 0.060 0.421 0.337 11 P 0.038 0.014 0.068 0.187 0.469 0.224 12 L 0.011 0.010 0.041 0.295 0.366 0.277 13 H 0.003 0.002 0.015 0.843 0.084 0.053 14 E 0.001 0.001 0.004 0.882 0.057 0.056 15 G 0.001 0.001 0.007 0.972 0.013 0.007 16 H 0.001 0.001 0.003 0.989 0.005 0.002 17 K 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 18 K 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 19 L 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 20 I 0.001 0.001 0.001 0.996 0.002 0.001 21 D 0.001 0.001 0.001 0.991 0.005 0.003 22 V 0.001 0.001 0.002 0.994 0.003 0.001 23 A 0.001 0.001 0.007 0.986 0.007 0.001 24 I 0.001 0.001 0.038 0.935 0.023 0.004 25 K 0.001 0.001 0.057 0.820 0.100 0.023 26 L 0.001 0.001 0.079 0.531 0.290 0.099 27 G 0.005 0.007 0.041 0.137 0.497 0.313 28 G 0.021 0.004 0.021 0.008 0.429 0.518 29 R 0.380 0.003 0.014 0.003 0.320 0.280 30 D 0.834 0.002 0.005 0.001 0.061 0.098 31 I 0.986 0.001 0.001 0.001 0.004 0.009 32 T 0.994 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 33 I 0.987 0.001 0.001 0.001 0.002 0.009 34 G 0.954 0.002 0.001 0.002 0.007 0.034 35 V 0.708 0.007 0.002 0.007 0.071 0.205 36 T 0.191 0.011 0.005 0.010 0.176 0.607 37 S 0.015 0.006 0.013 0.011 0.244 0.711 38 D 0.006 0.015 0.190 0.214 0.339 0.237 39 R 0.004 0.006 0.242 0.276 0.321 0.150 40 M 0.004 0.004 0.426 0.293 0.241 0.032 41 A 0.005 0.002 0.309 0.329 0.289 0.067 42 R 0.008 0.006 0.298 0.247 0.343 0.099 43 A 0.020 0.029 0.106 0.081 0.617 0.148 44 R 0.032 0.016 0.026 0.019 0.550 0.358 45 I 0.062 0.016 0.017 0.006 0.460 0.440 46 R 0.129 0.033 0.011 0.005 0.281 0.542 47 S 0.149 0.013 0.006 0.005 0.133 0.694 48 V 0.235 0.027 0.005 0.007 0.094 0.633 49 L 0.194 0.053 0.002 0.005 0.066 0.680 50 P 0.057 0.012 0.001 0.024 0.071 0.834 51 F 0.001 0.001 0.021 0.950 0.016 0.013 52 A 0.001 0.001 0.021 0.952 0.022 0.005 53 I 0.001 0.001 0.020 0.953 0.022 0.004 54 R 0.001 0.001 0.003 0.982 0.007 0.007 55 A 0.001 0.001 0.001 0.990 0.006 0.002 56 E 0.001 0.001 0.002 0.983 0.009 0.004 57 N 0.002 0.001 0.002 0.980 0.010 0.006 58 V 0.002 0.001 0.002 0.979 0.011 0.006 59 K 0.002 0.001 0.004 0.969 0.014 0.011 60 R 0.002 0.001 0.007 0.941 0.025 0.024 61 Y 0.010 0.002 0.012 0.856 0.055 0.065 62 V 0.023 0.004 0.022 0.586 0.156 0.209 63 M 0.048 0.010 0.029 0.319 0.282 0.312 64 R 0.073 0.015 0.014 0.097 0.326 0.475 65 K 0.037 0.003 0.014 0.019 0.566 0.362 66 Y 0.058 0.002 0.064 0.051 0.567 0.257 67 G 0.417 0.019 0.031 0.031 0.309 0.194 68 F 0.712 0.012 0.011 0.018 0.124 0.123 69 E 0.794 0.005 0.002 0.008 0.038 0.152 70 P 0.872 0.012 0.002 0.006 0.023 0.084 71 E 0.797 0.004 0.002 0.007 0.039 0.150 72 I 0.709 0.005 0.003 0.007 0.053 0.222 73 V 0.523 0.020 0.006 0.010 0.108 0.333 74 K 0.395 0.023 0.015 0.015 0.184 0.368 75 I 0.241 0.016 0.025 0.021 0.262 0.436 76 T 0.112 0.018 0.030 0.018 0.366 0.454 77 N 0.083 0.021 0.039 0.024 0.459 0.374 78 P 0.067 0.020 0.060 0.033 0.421 0.398 79 Y 0.091 0.029 0.049 0.023 0.436 0.372 80 G 0.113 0.013 0.040 0.016 0.370 0.449 81 K 0.175 0.019 0.048 0.018 0.349 0.391 82 T 0.262 0.034 0.053 0.018 0.301 0.332 83 L 0.401 0.026 0.036 0.013 0.226 0.300 84 D 0.428 0.021 0.038 0.013 0.307 0.193 85 V 0.159 0.014 0.020 0.012 0.388 0.408 86 D 0.129 0.006 0.009 0.003 0.428 0.425 87 F 0.210 0.004 0.009 0.002 0.460 0.315 88 E 0.500 0.003 0.004 0.001 0.168 0.324 89 Y 0.981 0.003 0.001 0.001 0.005 0.010 90 L 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 91 V 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 92 V 0.959 0.003 0.001 0.001 0.006 0.032 93 S 0.606 0.004 0.004 0.001 0.115 0.270 94 P 0.137 0.005 0.097 0.013 0.496 0.251 95 E 0.089 0.019 0.152 0.018 0.503 0.219 96 T 0.056 0.023 0.123 0.050 0.577 0.170 97 Y 0.016 0.009 0.048 0.069 0.624 0.233 98 E 0.011 0.009 0.042 0.158 0.546 0.235 99 M 0.009 0.005 0.033 0.268 0.432 0.251 100 A 0.011 0.004 0.026 0.724 0.129 0.107 101 L 0.023 0.006 0.018 0.810 0.070 0.074 102 K 0.018 0.003 0.017 0.889 0.029 0.044 103 I 0.008 0.002 0.008 0.958 0.012 0.013 104 N 0.003 0.001 0.005 0.973 0.011 0.007 105 Q 0.002 0.001 0.002 0.983 0.008 0.005 106 K 0.001 0.001 0.002 0.987 0.006 0.003 107 R 0.002 0.001 0.004 0.982 0.009 0.003 108 E 0.001 0.001 0.007 0.975 0.011 0.005 109 E 0.001 0.001 0.009 0.961 0.017 0.011 110 L 0.001 0.001 0.009 0.899 0.029 0.061 111 G 0.002 0.001 0.003 0.036 0.101 0.857 112 K 0.005 0.003 0.002 0.009 0.138 0.842 113 R 0.021 0.008 0.005 0.006 0.186 0.774 114 K 0.088 0.014 0.103 0.020 0.378 0.397 115 I 0.227 0.007 0.120 0.016 0.247 0.383 116 T 0.704 0.007 0.054 0.010 0.077 0.148 117 I 0.906 0.003 0.004 0.004 0.015 0.068 118 V 0.940 0.002 0.001 0.003 0.008 0.047 119 K 0.969 0.002 0.001 0.002 0.004 0.022 120 V 0.950 0.001 0.001 0.004 0.010 0.034 121 D 0.908 0.001 0.003 0.004 0.023 0.061 122 W 0.903 0.002 0.003 0.003 0.032 0.056 123 M 0.895 0.014 0.003 0.002 0.034 0.052 124 M 0.792 0.021 0.005 0.005 0.092 0.085 125 A 0.225 0.012 0.037 0.015 0.621 0.090 126 E 0.034 0.004 0.069 0.021 0.826 0.047 127 D 0.023 0.004 0.077 0.024 0.832 0.040 128 G 0.077 0.008 0.026 0.017 0.727 0.145 129 K 0.338 0.038 0.009 0.014 0.239 0.362 130 P 0.576 0.058 0.005 0.011 0.086 0.263 131 I 0.590 0.033 0.008 0.015 0.092 0.262 132 S 0.411 0.014 0.013 0.027 0.136 0.399 133 S 0.472 0.010 0.030 0.070 0.150 0.268 134 T 0.652 0.011 0.020 0.058 0.107 0.152 135 R 0.720 0.009 0.019 0.046 0.088 0.118 136 I 0.775 0.019 0.015 0.034 0.081 0.076 137 K 0.720 0.014 0.019 0.041 0.118 0.088 138 R 0.349 0.004 0.022 0.040 0.328 0.257 139 G 0.362 0.010 0.009 0.019 0.294 0.305 140 E 0.587 0.031 0.004 0.009 0.147 0.222 141 I 0.591 0.150 0.002 0.011 0.068 0.177 142 D 0.247 0.069 0.005 0.012 0.591 0.077 143 R 0.056 0.007 0.009 0.012 0.857 0.059 144 Y 0.015 0.001 0.003 0.003 0.902 0.076 145 G 0.038 0.028 0.001 0.002 0.756 0.175 146 G 0.031 0.022 0.001 0.002 0.054 0.891 147 I 0.086 0.120 0.004 0.009 0.058 0.723 148 I 0.004 0.004 0.001 0.001 0.018 0.972