# TARGET T0506 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0506.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 157 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.002 0.001 0.002 0.001 0.002 0.002 0.991 2 L 0.087 0.105 0.016 0.016 0.017 0.061 0.698 3 D 0.057 0.033 0.018 0.012 0.327 0.092 0.461 4 V 0.036 0.027 0.037 0.036 0.317 0.128 0.419 5 A 0.033 0.023 0.075 0.049 0.198 0.233 0.389 6 P 0.039 0.020 0.075 0.037 0.165 0.295 0.368 7 P 0.033 0.078 0.074 0.038 0.255 0.147 0.376 8 V 0.026 0.052 0.024 0.036 0.399 0.062 0.401 9 I 0.022 0.037 0.029 0.037 0.197 0.144 0.533 10 T 0.031 0.059 0.033 0.045 0.195 0.121 0.516 11 P 0.025 0.047 0.059 0.059 0.186 0.154 0.470 12 R 0.018 0.018 0.086 0.078 0.164 0.242 0.394 13 G 0.024 0.024 0.101 0.087 0.145 0.174 0.445 14 T 0.040 0.048 0.090 0.087 0.168 0.117 0.450 15 K 0.051 0.033 0.077 0.094 0.174 0.130 0.441 16 I 0.039 0.032 0.071 0.100 0.189 0.129 0.441 17 E 0.031 0.023 0.070 0.084 0.195 0.111 0.486 18 P 0.025 0.011 0.096 0.086 0.127 0.194 0.461 19 S 0.019 0.026 0.091 0.090 0.174 0.153 0.447 20 A 0.017 0.030 0.056 0.073 0.313 0.088 0.424 21 G 0.016 0.012 0.047 0.059 0.174 0.159 0.533 22 A 0.006 0.013 0.043 0.045 0.165 0.107 0.621 23 P 0.003 0.010 0.029 0.064 0.171 0.050 0.674 24 F 0.001 0.004 0.067 0.336 0.153 0.153 0.285 25 E 0.001 0.004 0.048 0.598 0.099 0.131 0.119 26 A 0.001 0.001 0.026 0.859 0.021 0.046 0.046 27 V 0.001 0.001 0.004 0.958 0.008 0.012 0.018 28 R 0.001 0.001 0.001 0.983 0.004 0.005 0.007 29 V 0.001 0.001 0.001 0.992 0.001 0.003 0.003 30 A 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.002 0.001 31 R 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.003 0.001 32 D 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.004 0.001 33 V 0.001 0.001 0.001 0.987 0.001 0.011 0.001 34 L 0.001 0.001 0.001 0.963 0.002 0.029 0.004 35 H 0.001 0.001 0.005 0.815 0.010 0.156 0.013 36 T 0.002 0.002 0.009 0.648 0.034 0.256 0.049 37 S 0.011 0.010 0.011 0.458 0.112 0.148 0.250 38 R 0.044 0.008 0.017 0.376 0.144 0.123 0.288 39 T 0.141 0.007 0.023 0.442 0.167 0.072 0.148 40 A 0.235 0.011 0.033 0.503 0.053 0.048 0.117 41 A 0.329 0.004 0.031 0.483 0.032 0.055 0.066 42 L 0.441 0.004 0.037 0.337 0.040 0.065 0.075 43 A 0.403 0.007 0.051 0.274 0.053 0.077 0.134 44 T 0.367 0.013 0.035 0.136 0.105 0.092 0.251 45 L 0.268 0.029 0.012 0.036 0.203 0.052 0.400 46 D 0.193 0.028 0.011 0.014 0.128 0.034 0.592 47 P 0.086 0.026 0.064 0.029 0.164 0.245 0.387 48 V 0.039 0.014 0.085 0.019 0.172 0.411 0.260 49 S 0.023 0.008 0.070 0.013 0.200 0.593 0.093 50 G 0.029 0.010 0.032 0.006 0.406 0.338 0.179 51 Y 0.076 0.027 0.011 0.005 0.236 0.035 0.611 52 P 0.214 0.080 0.017 0.006 0.160 0.103 0.421 53 Y 0.381 0.038 0.023 0.006 0.104 0.126 0.322 54 T 0.410 0.032 0.023 0.007 0.111 0.038 0.380 55 T 0.509 0.020 0.011 0.007 0.105 0.020 0.327 56 A 0.724 0.014 0.017 0.010 0.054 0.027 0.154 57 T 0.846 0.012 0.005 0.003 0.020 0.006 0.106 58 N 0.766 0.008 0.006 0.004 0.026 0.008 0.182 59 I 0.752 0.025 0.006 0.006 0.036 0.017 0.158 60 G 0.662 0.013 0.006 0.005 0.101 0.029 0.184 61 I 0.591 0.139 0.004 0.004 0.100 0.020 0.141 62 E 0.112 0.030 0.006 0.001 0.039 0.018 0.793 63 P 0.013 0.005 0.014 0.001 0.087 0.799 0.081 64 D 0.004 0.005 0.007 0.001 0.117 0.846 0.020 65 G 0.010 0.003 0.001 0.001 0.782 0.071 0.132 66 T 0.071 0.011 0.001 0.002 0.220 0.013 0.683 67 P 0.639 0.095 0.001 0.001 0.023 0.005 0.235 68 F 0.931 0.006 0.002 0.002 0.013 0.002 0.045 69 F 0.973 0.003 0.002 0.002 0.003 0.001 0.016 70 F 0.933 0.006 0.003 0.004 0.005 0.002 0.047 71 A 0.780 0.010 0.005 0.008 0.024 0.003 0.169 72 A 0.328 0.004 0.014 0.018 0.069 0.012 0.554 73 G 0.025 0.006 0.275 0.221 0.140 0.191 0.142 74 L 0.009 0.004 0.198 0.424 0.138 0.136 0.093 75 T 0.002 0.004 0.091 0.683 0.062 0.069 0.087 76 L 0.002 0.002 0.038 0.805 0.037 0.069 0.047 77 H 0.003 0.002 0.029 0.829 0.017 0.088 0.032 78 A 0.004 0.002 0.018 0.888 0.027 0.034 0.027 79 R 0.002 0.001 0.015 0.940 0.010 0.021 0.012 80 N 0.002 0.001 0.015 0.928 0.009 0.029 0.016 81 M 0.003 0.002 0.051 0.869 0.006 0.052 0.017 82 E 0.006 0.001 0.053 0.667 0.021 0.231 0.020 83 T 0.004 0.001 0.048 0.412 0.033 0.477 0.025 84 D 0.007 0.004 0.015 0.019 0.284 0.070 0.602 85 A 0.007 0.001 0.019 0.006 0.188 0.682 0.097 86 R 0.074 0.003 0.033 0.002 0.237 0.601 0.051 87 I 0.678 0.025 0.004 0.001 0.009 0.004 0.279 88 S 0.974 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.018 89 V 0.991 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 90 T 0.957 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.039 91 L 0.797 0.008 0.001 0.001 0.012 0.002 0.181 92 A 0.414 0.015 0.003 0.001 0.125 0.014 0.428 93 P 0.090 0.027 0.007 0.003 0.413 0.043 0.418 94 F 0.024 0.028 0.019 0.009 0.283 0.084 0.552 95 G 0.009 0.023 0.026 0.006 0.188 0.095 0.653 96 K 0.008 0.011 0.059 0.011 0.307 0.388 0.215 97 G 0.007 0.012 0.057 0.014 0.342 0.332 0.237 98 D 0.006 0.021 0.030 0.014 0.325 0.045 0.559 99 A 0.012 0.022 0.178 0.057 0.153 0.203 0.374 100 L 0.017 0.011 0.210 0.038 0.114 0.445 0.165 101 T 0.029 0.017 0.181 0.035 0.226 0.353 0.159 102 L 0.078 0.020 0.023 0.013 0.352 0.045 0.469 103 P 0.196 0.008 0.013 0.008 0.179 0.033 0.563 104 R 0.689 0.014 0.014 0.005 0.094 0.018 0.165 105 L 0.889 0.013 0.006 0.003 0.011 0.004 0.075 106 T 0.949 0.002 0.004 0.002 0.007 0.004 0.033 107 L 0.963 0.003 0.003 0.001 0.005 0.003 0.022 108 V 0.909 0.002 0.002 0.001 0.009 0.004 0.072 109 G 0.846 0.002 0.002 0.001 0.028 0.006 0.114 110 R 0.891 0.006 0.001 0.001 0.014 0.003 0.084 111 A 0.803 0.009 0.003 0.002 0.019 0.006 0.158 112 D 0.800 0.012 0.003 0.003 0.046 0.008 0.129 113 R 0.614 0.031 0.005 0.005 0.066 0.013 0.265 114 I 0.101 0.015 0.005 0.006 0.112 0.016 0.746 115 G 0.019 0.004 0.003 0.006 0.087 0.023 0.858 116 P 0.002 0.002 0.150 0.199 0.166 0.356 0.126 117 D 0.001 0.002 0.154 0.329 0.139 0.286 0.088 118 E 0.001 0.003 0.125 0.474 0.110 0.119 0.168 119 V 0.001 0.002 0.014 0.827 0.034 0.026 0.095 120 P 0.001 0.001 0.003 0.968 0.007 0.012 0.009 121 L 0.001 0.001 0.001 0.985 0.003 0.007 0.003 122 A 0.001 0.001 0.001 0.990 0.002 0.005 0.003 123 I 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.004 0.001 124 A 0.001 0.001 0.001 0.992 0.001 0.006 0.001 125 R 0.001 0.001 0.001 0.991 0.001 0.006 0.001 126 Y 0.001 0.001 0.001 0.989 0.001 0.007 0.002 127 I 0.001 0.001 0.006 0.972 0.002 0.019 0.002 128 A 0.001 0.001 0.009 0.881 0.004 0.103 0.003 129 R 0.001 0.001 0.012 0.762 0.012 0.203 0.010 130 Y 0.001 0.004 0.012 0.172 0.244 0.050 0.517 131 P 0.001 0.003 0.181 0.210 0.069 0.438 0.099 132 K 0.001 0.002 0.235 0.126 0.069 0.507 0.059 133 A 0.003 0.007 0.450 0.190 0.064 0.098 0.189 134 K 0.009 0.005 0.511 0.224 0.028 0.132 0.092 135 L 0.019 0.003 0.536 0.154 0.032 0.177 0.079 136 Y 0.034 0.030 0.494 0.145 0.044 0.138 0.116 137 L 0.054 0.020 0.115 0.110 0.206 0.159 0.335 138 S 0.071 0.015 0.077 0.036 0.130 0.272 0.400 139 L 0.049 0.014 0.106 0.024 0.244 0.315 0.248 140 P 0.057 0.009 0.053 0.006 0.295 0.314 0.265 141 D 0.134 0.006 0.042 0.005 0.269 0.238 0.306 142 T 0.688 0.020 0.008 0.002 0.057 0.030 0.195 143 R 0.851 0.006 0.003 0.001 0.021 0.006 0.111 144 L 0.938 0.004 0.002 0.001 0.007 0.003 0.045 145 Y 0.949 0.002 0.001 0.001 0.008 0.003 0.036 146 R 0.967 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.025 147 L 0.940 0.002 0.001 0.001 0.004 0.001 0.054 148 R 0.875 0.006 0.001 0.001 0.005 0.001 0.113 149 T 0.760 0.003 0.007 0.002 0.039 0.013 0.177 150 E 0.655 0.004 0.013 0.003 0.231 0.025 0.069 151 G 0.914 0.004 0.007 0.002 0.019 0.005 0.049 152 V 0.959 0.001 0.001 0.001 0.004 0.003 0.031 153 Q 0.982 0.001 0.001 0.001 0.004 0.002 0.010 154 I 0.967 0.003 0.001 0.001 0.005 0.002 0.023 155 N 0.827 0.007 0.001 0.001 0.037 0.007 0.118 156 G 0.534 0.014 0.006 0.003 0.099 0.037 0.307 157 G 0.191 0.012 0.044 0.009 0.175 0.374 0.196 158 P 0.189 0.016 0.042 0.010 0.215 0.373 0.155 159 A 0.208 0.017 0.059 0.024 0.284 0.215 0.193 160 R 0.208 0.030 0.051 0.036 0.185 0.138 0.352 161 N 0.358 0.031 0.037 0.026 0.099 0.105 0.344 162 A 0.493 0.011 0.036 0.031 0.158 0.093 0.178 163 S 0.666 0.030 0.015 0.021 0.078 0.040 0.150 164 N 0.380 0.053 0.003 0.013 0.107 0.010 0.433 165 I 0.127 0.022 0.001 0.006 0.037 0.004 0.804 166 T 0.003 0.001 0.137 0.749 0.021 0.062 0.026 167 P 0.002 0.001 0.261 0.620 0.027 0.073 0.015 168 A 0.002 0.001 0.441 0.475 0.014 0.049 0.018 169 D 0.005 0.005 0.185 0.683 0.022 0.055 0.046 170 L 0.012 0.009 0.143 0.529 0.037 0.208 0.062 171 R 0.016 0.007 0.099 0.429 0.072 0.294 0.084 172 T 0.015 0.009 0.043 0.288 0.263 0.112 0.271 173 D 0.012 0.013 0.030 0.128 0.187 0.065 0.565 174 L 0.005 0.007 0.087 0.253 0.118 0.165 0.365 175 S 0.003 0.004 0.119 0.250 0.100 0.278 0.245 176 G 0.003 0.004 0.114 0.331 0.083 0.268 0.198 177 A 0.005 0.006 0.064 0.478 0.096 0.065 0.286 178 E 0.007 0.008 0.058 0.615 0.079 0.053 0.180 179 E 0.007 0.005 0.056 0.714 0.050 0.063 0.105 180 L 0.003 0.003 0.039 0.809 0.030 0.046 0.069 181 M 0.002 0.001 0.014 0.866 0.029 0.041 0.047 182 A 0.002 0.001 0.008 0.870 0.015 0.064 0.039 183 A 0.001 0.001 0.008 0.843 0.021 0.074 0.052 184 A 0.001 0.001 0.006 0.894 0.015 0.050 0.034 185 E 0.001 0.001 0.005 0.927 0.015 0.035 0.017 186 S 0.001 0.001 0.005 0.946 0.009 0.025 0.013 187 E 0.001 0.001 0.006 0.954 0.007 0.015 0.016 188 A 0.001 0.001 0.008 0.962 0.006 0.014 0.008 189 T 0.001 0.001 0.009 0.928 0.005 0.051 0.005 190 R 0.001 0.001 0.012 0.811 0.008 0.159 0.009 191 L 0.001 0.003 0.021 0.715 0.046 0.159 0.055 192 N 0.001 0.002 0.043 0.672 0.068 0.154 0.061 193 A 0.001 0.001 0.074 0.638 0.076 0.151 0.058 194 I 0.001 0.004 0.085 0.528 0.079 0.192 0.111 195 K 0.001 0.002 0.030 0.756 0.037 0.097 0.077 196 G 0.001 0.001 0.014 0.913 0.020 0.027 0.025 197 E 0.001 0.001 0.004 0.963 0.008 0.016 0.008 198 A 0.001 0.001 0.002 0.979 0.002 0.011 0.005 199 S 0.001 0.001 0.001 0.987 0.002 0.006 0.004 200 R 0.001 0.001 0.001 0.990 0.002 0.005 0.002 201 L 0.001 0.001 0.001 0.990 0.001 0.006 0.002 202 A 0.001 0.001 0.002 0.984 0.002 0.010 0.002 203 V 0.001 0.001 0.004 0.960 0.003 0.026 0.004 204 L 0.002 0.001 0.012 0.870 0.005 0.104 0.006 205 A 0.003 0.001 0.020 0.689 0.021 0.232 0.033 206 G 0.011 0.010 0.047 0.430 0.083 0.251 0.168 207 A 0.019 0.010 0.052 0.174 0.207 0.267 0.271 208 K 0.024 0.015 0.063 0.047 0.215 0.203 0.433 209 T 0.037 0.012 0.050 0.042 0.324 0.187 0.349 210 G 0.080 0.009 0.028 0.017 0.289 0.220 0.358 211 R 0.295 0.011 0.051 0.025 0.226 0.113 0.280 212 W 0.739 0.013 0.009 0.007 0.050 0.015 0.168 213 K 0.914 0.004 0.004 0.003 0.025 0.004 0.047 214 I 0.952 0.004 0.002 0.002 0.004 0.002 0.033 215 T 0.958 0.002 0.001 0.001 0.005 0.002 0.031 216 S 0.905 0.001 0.001 0.001 0.017 0.005 0.070 217 I 0.799 0.026 0.002 0.002 0.035 0.006 0.130 218 D 0.283 0.014 0.005 0.001 0.044 0.013 0.641 219 P 0.078 0.004 0.059 0.005 0.138 0.608 0.108 220 D 0.027 0.004 0.045 0.005 0.122 0.768 0.030 221 G 0.240 0.014 0.038 0.007 0.199 0.277 0.226 222 I 0.445 0.017 0.004 0.003 0.037 0.011 0.483 223 D 0.827 0.010 0.002 0.002 0.055 0.007 0.098 224 L 0.914 0.018 0.003 0.003 0.008 0.005 0.049 225 A 0.872 0.014 0.003 0.004 0.008 0.010 0.089 226 S 0.538 0.014 0.012 0.009 0.067 0.154 0.206 227 A 0.110 0.008 0.016 0.005 0.317 0.353 0.191 228 S 0.050 0.005 0.011 0.006 0.592 0.169 0.167 229 D 0.117 0.012 0.032 0.028 0.242 0.261 0.308 230 L 0.477 0.034 0.019 0.018 0.104 0.059 0.290 231 A 0.710 0.024 0.016 0.017 0.042 0.018 0.173 232 R 0.812 0.015 0.010 0.015 0.024 0.010 0.114 233 L 0.764 0.011 0.013 0.016 0.026 0.009 0.161 234 W 0.708 0.009 0.016 0.017 0.035 0.014 0.202 235 F 0.617 0.025 0.016 0.019 0.063 0.014 0.246 236 A 0.444 0.022 0.026 0.025 0.084 0.022 0.376 237 E 0.259 0.020 0.038 0.033 0.150 0.047 0.454 238 R 0.121 0.019 0.044 0.028 0.143 0.093 0.552 239 V 0.071 0.024 0.045 0.030 0.204 0.103 0.523 240 E 0.033 0.037 0.030 0.027 0.369 0.081 0.422 241 T 0.009 0.013 0.016 0.030 0.251 0.036 0.644 242 L 0.002 0.002 0.090 0.544 0.073 0.084 0.206 243 K 0.001 0.001 0.068 0.815 0.019 0.073 0.023 244 Q 0.001 0.002 0.053 0.873 0.012 0.045 0.015 245 F 0.001 0.001 0.014 0.939 0.010 0.020 0.016 246 E 0.001 0.001 0.003 0.974 0.006 0.009 0.006 247 K 0.001 0.001 0.002 0.980 0.003 0.010 0.004 248 A 0.001 0.001 0.002 0.982 0.001 0.010 0.003 249 L 0.001 0.001 0.003 0.973 0.003 0.015 0.004 250 A 0.001 0.001 0.009 0.950 0.006 0.029 0.004 251 Q 0.001 0.001 0.013 0.908 0.009 0.060 0.008 252 L 0.001 0.001 0.028 0.774 0.014 0.149 0.033 253 L 0.006 0.018 0.035 0.526 0.007 0.246 0.162 254 K 0.001 0.001 0.004 0.036 0.004 0.011 0.944