# TARGET T0501 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t2k-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-near-backbone-11-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0501.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 538 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.048 0.062 0.072 0.088 0.102 0.126 0.193 0.127 0.091 0.060 0.031 2 L 0.037 0.073 0.114 0.184 0.165 0.132 0.127 0.078 0.048 0.027 0.013 3 T 0.052 0.051 0.093 0.073 0.067 0.098 0.184 0.134 0.123 0.087 0.037 4 K 0.041 0.064 0.110 0.224 0.196 0.105 0.111 0.072 0.043 0.021 0.013 5 V 0.022 0.015 0.033 0.031 0.039 0.047 0.117 0.162 0.190 0.197 0.147 6 I 0.012 0.032 0.071 0.174 0.224 0.141 0.142 0.099 0.059 0.030 0.017 7 A 0.007 0.009 0.031 0.025 0.040 0.047 0.157 0.213 0.187 0.177 0.109 8 Q 0.014 0.028 0.163 0.202 0.202 0.146 0.119 0.058 0.037 0.020 0.011 9 A 0.097 0.047 0.146 0.113 0.117 0.096 0.171 0.105 0.056 0.034 0.019 10 H 0.011 0.061 0.093 0.140 0.150 0.126 0.180 0.106 0.071 0.043 0.018 11 I 0.005 0.008 0.018 0.024 0.050 0.101 0.273 0.167 0.168 0.123 0.062 12 D 0.239 0.077 0.464 0.154 0.043 0.012 0.007 0.002 0.001 0.001 0.001 13 H 0.035 0.077 0.185 0.254 0.194 0.118 0.099 0.027 0.007 0.003 0.001 14 F 0.001 0.001 0.003 0.002 0.004 0.007 0.030 0.067 0.210 0.288 0.388 15 T 0.007 0.008 0.034 0.073 0.214 0.263 0.296 0.068 0.024 0.009 0.003 16 K 0.012 0.017 0.921 0.044 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 17 W 0.002 0.003 0.015 0.028 0.054 0.306 0.440 0.088 0.043 0.019 0.003 18 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.009 0.054 0.084 0.265 0.360 0.221 19 E 0.005 0.030 0.675 0.177 0.081 0.021 0.008 0.003 0.001 0.001 0.001 20 R 0.004 0.041 0.736 0.128 0.056 0.022 0.009 0.003 0.001 0.001 0.001 21 A 0.014 0.011 0.019 0.026 0.052 0.086 0.216 0.234 0.142 0.114 0.086 22 D 0.247 0.121 0.106 0.126 0.095 0.080 0.113 0.066 0.027 0.014 0.004 23 K 0.015 0.043 0.324 0.260 0.155 0.089 0.066 0.025 0.012 0.006 0.003 24 I 0.002 0.003 0.017 0.009 0.017 0.041 0.113 0.100 0.212 0.243 0.243 25 V 0.002 0.008 0.014 0.029 0.050 0.099 0.191 0.153 0.207 0.156 0.091 26 I 0.001 0.001 0.007 0.007 0.013 0.026 0.054 0.088 0.205 0.265 0.332 27 V 0.002 0.002 0.010 0.018 0.043 0.042 0.096 0.162 0.192 0.207 0.225 28 S 0.003 0.007 0.019 0.034 0.053 0.066 0.140 0.163 0.209 0.180 0.125 29 H 0.005 0.006 0.013 0.029 0.050 0.053 0.113 0.159 0.201 0.175 0.195 30 V 0.028 0.038 0.046 0.095 0.095 0.117 0.190 0.131 0.122 0.084 0.054 31 S 0.030 0.049 0.067 0.144 0.137 0.141 0.183 0.102 0.072 0.042 0.033 32 P 0.043 0.035 0.054 0.059 0.062 0.083 0.160 0.129 0.148 0.122 0.104 33 D 0.021 0.038 0.061 0.112 0.112 0.113 0.191 0.115 0.115 0.071 0.051 34 G 0.017 0.022 0.041 0.045 0.045 0.061 0.128 0.121 0.192 0.169 0.159 35 D 0.007 0.017 0.030 0.056 0.073 0.102 0.188 0.137 0.170 0.125 0.096 36 A 0.002 0.004 0.015 0.016 0.026 0.028 0.084 0.161 0.201 0.218 0.245 37 I 0.001 0.003 0.015 0.019 0.038 0.036 0.100 0.192 0.213 0.218 0.165 38 G 0.001 0.003 0.015 0.017 0.029 0.027 0.091 0.157 0.231 0.248 0.181 39 S 0.001 0.001 0.006 0.008 0.018 0.019 0.065 0.158 0.230 0.283 0.212 40 S 0.001 0.003 0.011 0.017 0.033 0.053 0.126 0.170 0.231 0.224 0.131 41 L 0.001 0.002 0.019 0.021 0.049 0.036 0.136 0.256 0.184 0.164 0.132 42 G 0.001 0.002 0.013 0.014 0.032 0.028 0.080 0.147 0.203 0.265 0.217 43 L 0.001 0.001 0.002 0.002 0.006 0.010 0.033 0.061 0.209 0.321 0.355 44 Y 0.001 0.003 0.019 0.037 0.091 0.168 0.264 0.141 0.138 0.092 0.045 45 H 0.004 0.012 0.122 0.102 0.128 0.145 0.248 0.120 0.062 0.041 0.016 46 F 0.001 0.002 0.011 0.011 0.016 0.058 0.119 0.083 0.222 0.280 0.196 47 L 0.001 0.001 0.003 0.004 0.009 0.027 0.081 0.069 0.228 0.280 0.296 48 D 0.024 0.067 0.201 0.231 0.201 0.117 0.089 0.035 0.019 0.010 0.005 49 S 0.038 0.124 0.200 0.153 0.122 0.135 0.121 0.050 0.027 0.018 0.011 50 Q 0.088 0.084 0.036 0.098 0.104 0.125 0.184 0.123 0.073 0.048 0.035 51 D 0.655 0.151 0.029 0.058 0.030 0.020 0.023 0.016 0.008 0.006 0.003 52 K 0.110 0.145 0.102 0.208 0.148 0.111 0.080 0.043 0.026 0.017 0.010 53 I 0.081 0.103 0.062 0.148 0.142 0.121 0.120 0.095 0.059 0.048 0.023 54 V 0.011 0.018 0.017 0.045 0.058 0.141 0.215 0.172 0.160 0.118 0.044 55 N 0.029 0.095 0.113 0.252 0.182 0.134 0.094 0.050 0.027 0.015 0.008 56 V 0.006 0.003 0.010 0.013 0.021 0.039 0.078 0.109 0.200 0.269 0.253 57 I 0.014 0.026 0.021 0.076 0.110 0.180 0.201 0.117 0.122 0.089 0.043 58 V 0.005 0.010 0.009 0.017 0.024 0.040 0.098 0.115 0.228 0.227 0.227 59 P 0.151 0.152 0.069 0.205 0.177 0.088 0.077 0.039 0.021 0.012 0.008 60 N 0.601 0.141 0.043 0.086 0.043 0.026 0.028 0.015 0.009 0.005 0.003 61 A 0.289 0.191 0.029 0.146 0.103 0.073 0.067 0.046 0.027 0.017 0.011 62 F 0.023 0.051 0.011 0.044 0.056 0.094 0.144 0.140 0.167 0.149 0.121 63 P 0.232 0.130 0.065 0.175 0.164 0.092 0.069 0.040 0.018 0.010 0.006 64 D 0.305 0.165 0.115 0.177 0.091 0.057 0.045 0.023 0.011 0.006 0.003 65 F 0.011 0.015 0.013 0.046 0.053 0.092 0.157 0.134 0.199 0.178 0.101 66 L 0.007 0.009 0.007 0.030 0.055 0.120 0.199 0.156 0.179 0.157 0.080 67 K 0.050 0.124 0.305 0.277 0.134 0.053 0.027 0.016 0.008 0.004 0.002 68 W 0.026 0.025 0.042 0.082 0.103 0.157 0.226 0.139 0.098 0.067 0.036 69 M 0.010 0.012 0.007 0.020 0.027 0.047 0.115 0.126 0.212 0.216 0.207 70 P 0.220 0.230 0.114 0.196 0.128 0.044 0.033 0.019 0.009 0.004 0.002 71 G 0.316 0.160 0.087 0.144 0.097 0.063 0.060 0.034 0.019 0.012 0.007 72 S 0.168 0.112 0.036 0.103 0.097 0.092 0.133 0.092 0.075 0.055 0.036 73 K 0.223 0.144 0.048 0.151 0.123 0.096 0.098 0.063 0.030 0.016 0.007 74 D 0.104 0.120 0.098 0.211 0.139 0.123 0.097 0.051 0.031 0.018 0.008 75 I 0.012 0.011 0.018 0.035 0.049 0.092 0.172 0.144 0.188 0.169 0.109 76 L 0.024 0.038 0.065 0.145 0.148 0.164 0.173 0.103 0.071 0.051 0.018 77 L 0.010 0.035 0.082 0.093 0.082 0.162 0.169 0.104 0.121 0.102 0.042 78 Y 0.017 0.028 0.031 0.078 0.101 0.146 0.203 0.142 0.119 0.082 0.052 79 D 0.360 0.110 0.082 0.123 0.092 0.058 0.077 0.050 0.026 0.015 0.007 80 R 0.192 0.151 0.095 0.178 0.121 0.085 0.084 0.047 0.025 0.015 0.009 81 Y 0.041 0.067 0.026 0.065 0.077 0.107 0.174 0.138 0.130 0.105 0.071 82 Q 0.346 0.163 0.059 0.131 0.109 0.063 0.067 0.035 0.016 0.008 0.004 83 E 0.430 0.162 0.144 0.140 0.061 0.026 0.019 0.010 0.004 0.002 0.001 84 F 0.042 0.051 0.039 0.092 0.102 0.145 0.191 0.121 0.106 0.074 0.038 85 A 0.044 0.084 0.042 0.105 0.114 0.117 0.180 0.132 0.093 0.061 0.027 86 D 0.114 0.127 0.208 0.221 0.135 0.082 0.060 0.030 0.013 0.007 0.003 87 K 0.212 0.131 0.238 0.199 0.102 0.048 0.038 0.019 0.007 0.004 0.002 88 L 0.063 0.051 0.050 0.106 0.110 0.133 0.194 0.129 0.086 0.055 0.023 89 I 0.041 0.069 0.061 0.093 0.096 0.119 0.171 0.124 0.101 0.086 0.037 90 M 0.048 0.120 0.209 0.213 0.145 0.107 0.083 0.039 0.019 0.012 0.005 91 E 0.168 0.180 0.202 0.210 0.105 0.056 0.044 0.020 0.008 0.004 0.002 92 A 0.046 0.034 0.044 0.081 0.093 0.129 0.226 0.142 0.105 0.067 0.034 93 D 0.022 0.048 0.072 0.145 0.146 0.151 0.191 0.100 0.067 0.039 0.019 94 V 0.001 0.003 0.016 0.019 0.031 0.086 0.176 0.130 0.219 0.194 0.126 95 I 0.001 0.002 0.011 0.013 0.027 0.061 0.148 0.126 0.230 0.211 0.170 96 C 0.001 0.001 0.003 0.003 0.007 0.009 0.036 0.083 0.215 0.314 0.329 97 C 0.001 0.001 0.002 0.003 0.007 0.012 0.032 0.077 0.196 0.340 0.330 98 L 0.001 0.001 0.002 0.003 0.009 0.016 0.041 0.114 0.219 0.302 0.292 99 D 0.002 0.004 0.012 0.029 0.070 0.069 0.159 0.268 0.167 0.141 0.080 100 F 0.003 0.004 0.019 0.026 0.048 0.069 0.156 0.201 0.193 0.176 0.106 101 N 0.022 0.028 0.040 0.082 0.098 0.135 0.218 0.142 0.123 0.073 0.041 102 A 0.064 0.164 0.095 0.170 0.118 0.100 0.152 0.065 0.043 0.021 0.011 103 L 0.057 0.040 0.042 0.090 0.125 0.153 0.219 0.110 0.077 0.049 0.038 104 K 0.421 0.192 0.166 0.124 0.050 0.019 0.015 0.007 0.003 0.002 0.001 105 R 0.035 0.069 0.052 0.127 0.126 0.179 0.199 0.090 0.064 0.038 0.022 106 I 0.011 0.014 0.011 0.016 0.026 0.037 0.090 0.106 0.193 0.215 0.282 107 D 0.212 0.164 0.190 0.214 0.126 0.044 0.029 0.013 0.006 0.003 0.001 108 E 0.155 0.180 0.234 0.204 0.098 0.054 0.040 0.019 0.009 0.005 0.002 109 M 0.058 0.074 0.041 0.116 0.121 0.117 0.174 0.136 0.084 0.052 0.026 110 S 0.216 0.106 0.066 0.131 0.108 0.104 0.130 0.077 0.035 0.018 0.007 111 D 0.089 0.104 0.359 0.245 0.105 0.046 0.028 0.015 0.005 0.003 0.001 112 I 0.020 0.019 0.051 0.073 0.093 0.159 0.247 0.146 0.098 0.067 0.026 113 V 0.019 0.030 0.050 0.074 0.083 0.105 0.185 0.149 0.144 0.109 0.053 114 A 0.034 0.050 0.185 0.168 0.155 0.122 0.131 0.076 0.042 0.026 0.011 115 A 0.073 0.107 0.242 0.179 0.121 0.092 0.089 0.046 0.026 0.017 0.009 116 S 0.127 0.172 0.093 0.147 0.118 0.092 0.111 0.065 0.038 0.023 0.014 117 P 0.465 0.166 0.046 0.092 0.062 0.041 0.051 0.036 0.020 0.013 0.008 118 G 0.358 0.140 0.077 0.138 0.086 0.059 0.057 0.035 0.024 0.017 0.009 119 R 0.065 0.103 0.087 0.155 0.134 0.134 0.145 0.079 0.051 0.031 0.015 120 K 0.027 0.057 0.055 0.135 0.146 0.172 0.173 0.100 0.069 0.043 0.022 121 I 0.008 0.009 0.017 0.023 0.031 0.073 0.144 0.148 0.218 0.208 0.121 122 M 0.010 0.027 0.039 0.112 0.117 0.137 0.180 0.130 0.123 0.083 0.042 123 I 0.004 0.004 0.009 0.013 0.020 0.031 0.071 0.115 0.220 0.263 0.249 124 D 0.013 0.022 0.029 0.079 0.112 0.110 0.157 0.159 0.140 0.111 0.069 125 H 0.010 0.012 0.017 0.038 0.058 0.072 0.143 0.180 0.193 0.164 0.112 126 H 0.027 0.018 0.024 0.057 0.083 0.084 0.152 0.160 0.161 0.129 0.104 127 L 0.069 0.080 0.064 0.127 0.123 0.117 0.165 0.098 0.080 0.051 0.027 128 Y 0.087 0.132 0.058 0.139 0.119 0.107 0.138 0.084 0.066 0.044 0.024 129 P 0.263 0.231 0.048 0.123 0.078 0.067 0.082 0.043 0.032 0.022 0.011 130 E 0.529 0.178 0.052 0.107 0.052 0.030 0.024 0.013 0.008 0.005 0.003 131 D 0.354 0.201 0.061 0.144 0.084 0.060 0.048 0.024 0.012 0.008 0.004 132 F 0.026 0.041 0.022 0.065 0.073 0.119 0.149 0.127 0.154 0.138 0.087 133 C 0.028 0.031 0.022 0.060 0.080 0.138 0.198 0.150 0.138 0.102 0.054 134 R 0.091 0.163 0.170 0.284 0.135 0.062 0.044 0.025 0.014 0.008 0.004 135 I 0.010 0.007 0.012 0.023 0.034 0.064 0.120 0.139 0.205 0.213 0.171 136 T 0.046 0.064 0.035 0.126 0.130 0.124 0.140 0.116 0.101 0.071 0.047 137 I 0.033 0.030 0.029 0.071 0.091 0.109 0.157 0.147 0.143 0.111 0.080 138 S 0.050 0.037 0.033 0.062 0.078 0.092 0.141 0.127 0.147 0.124 0.109 139 H 0.082 0.124 0.051 0.143 0.117 0.093 0.136 0.091 0.078 0.054 0.031 140 P 0.222 0.134 0.056 0.150 0.106 0.084 0.092 0.060 0.047 0.030 0.019 141 E 0.429 0.203 0.055 0.119 0.063 0.040 0.038 0.022 0.016 0.009 0.006 142 I 0.052 0.053 0.029 0.102 0.099 0.123 0.179 0.135 0.108 0.073 0.048 143 S 0.079 0.080 0.062 0.124 0.115 0.122 0.144 0.096 0.082 0.054 0.043 144 S 0.033 0.044 0.065 0.094 0.099 0.097 0.164 0.126 0.132 0.085 0.061 145 T 0.011 0.020 0.035 0.058 0.078 0.059 0.127 0.154 0.184 0.149 0.125 146 S 0.006 0.010 0.015 0.033 0.044 0.066 0.131 0.146 0.216 0.201 0.133 147 E 0.012 0.020 0.045 0.098 0.132 0.117 0.189 0.162 0.107 0.070 0.048 148 L 0.001 0.003 0.010 0.013 0.034 0.024 0.081 0.215 0.193 0.228 0.198 149 V 0.001 0.001 0.004 0.007 0.016 0.017 0.048 0.107 0.228 0.329 0.245 150 F 0.001 0.002 0.009 0.018 0.041 0.095 0.212 0.154 0.221 0.173 0.073 151 R 0.004 0.015 0.125 0.159 0.167 0.144 0.190 0.093 0.058 0.032 0.013 152 L 0.001 0.001 0.008 0.007 0.013 0.030 0.090 0.107 0.225 0.299 0.220 153 I 0.001 0.001 0.003 0.005 0.010 0.031 0.070 0.066 0.236 0.320 0.258 154 C 0.006 0.015 0.086 0.096 0.129 0.174 0.231 0.101 0.084 0.056 0.023 155 R 0.005 0.024 0.122 0.096 0.097 0.213 0.211 0.089 0.069 0.054 0.021 156 M 0.008 0.012 0.016 0.025 0.035 0.108 0.216 0.145 0.189 0.147 0.099 157 G 0.375 0.161 0.065 0.128 0.082 0.049 0.062 0.039 0.020 0.012 0.007 158 Y 0.078 0.111 0.085 0.138 0.118 0.127 0.141 0.083 0.056 0.039 0.024 159 F 0.123 0.152 0.064 0.144 0.137 0.121 0.121 0.069 0.035 0.023 0.012 160 S 0.417 0.148 0.068 0.113 0.075 0.056 0.059 0.036 0.016 0.008 0.004 161 D 0.315 0.226 0.091 0.172 0.093 0.042 0.034 0.016 0.006 0.003 0.002 162 I 0.023 0.015 0.010 0.019 0.030 0.042 0.096 0.120 0.202 0.230 0.213 163 S 0.085 0.367 0.103 0.191 0.113 0.060 0.042 0.020 0.010 0.006 0.002 164 K 0.175 0.183 0.155 0.219 0.125 0.069 0.038 0.020 0.010 0.005 0.003 165 E 0.659 0.130 0.042 0.074 0.038 0.020 0.019 0.011 0.003 0.002 0.001 166 G 0.039 0.058 0.035 0.146 0.132 0.131 0.180 0.117 0.088 0.051 0.024 167 A 0.003 0.005 0.009 0.018 0.032 0.072 0.136 0.151 0.205 0.207 0.162 168 E 0.013 0.061 0.195 0.262 0.201 0.118 0.086 0.033 0.019 0.008 0.004 169 C 0.002 0.003 0.021 0.020 0.033 0.051 0.134 0.159 0.197 0.195 0.184 170 I 0.001 0.002 0.005 0.010 0.020 0.044 0.091 0.102 0.232 0.252 0.241 171 Y 0.001 0.002 0.008 0.015 0.028 0.042 0.103 0.128 0.230 0.247 0.196 172 T 0.001 0.002 0.010 0.012 0.026 0.047 0.095 0.141 0.221 0.241 0.205 173 G 0.004 0.011 0.021 0.045 0.068 0.076 0.174 0.175 0.189 0.152 0.085 174 M 0.002 0.003 0.006 0.010 0.015 0.022 0.061 0.118 0.217 0.263 0.284 175 M 0.007 0.010 0.014 0.042 0.080 0.104 0.160 0.182 0.162 0.136 0.103 176 T 0.018 0.022 0.038 0.058 0.070 0.077 0.138 0.152 0.169 0.152 0.105 177 D 0.010 0.018 0.023 0.051 0.083 0.103 0.197 0.168 0.146 0.114 0.087 178 T 0.040 0.049 0.043 0.084 0.085 0.093 0.130 0.109 0.149 0.125 0.092 179 G 0.251 0.129 0.069 0.141 0.102 0.084 0.109 0.051 0.035 0.019 0.011 180 G 0.120 0.121 0.066 0.189 0.142 0.107 0.113 0.061 0.041 0.026 0.016 181 F 0.024 0.015 0.012 0.023 0.032 0.053 0.102 0.122 0.190 0.222 0.204 182 T 0.092 0.238 0.089 0.244 0.150 0.071 0.052 0.030 0.017 0.010 0.006 183 Y 0.022 0.023 0.020 0.045 0.064 0.097 0.165 0.156 0.162 0.141 0.106 184 N 0.342 0.199 0.079 0.160 0.089 0.047 0.039 0.021 0.013 0.007 0.004 185 S 0.346 0.178 0.053 0.159 0.089 0.058 0.057 0.029 0.016 0.009 0.005 186 N 0.111 0.079 0.025 0.058 0.060 0.068 0.098 0.097 0.138 0.144 0.121 187 N 0.115 0.163 0.038 0.146 0.135 0.114 0.126 0.070 0.049 0.030 0.014 188 R 0.245 0.131 0.105 0.187 0.113 0.079 0.061 0.037 0.022 0.013 0.007 189 E 0.123 0.131 0.062 0.189 0.149 0.117 0.114 0.061 0.029 0.016 0.008 190 I 0.004 0.012 0.009 0.033 0.050 0.072 0.138 0.169 0.210 0.179 0.124 191 Y 0.007 0.007 0.013 0.037 0.076 0.139 0.211 0.156 0.155 0.121 0.077 192 F 0.025 0.042 0.191 0.238 0.177 0.117 0.106 0.051 0.027 0.018 0.008 193 I 0.001 0.002 0.007 0.012 0.024 0.075 0.147 0.118 0.227 0.241 0.145 194 I 0.001 0.001 0.001 0.003 0.009 0.020 0.055 0.083 0.239 0.289 0.299 195 S 0.014 0.018 0.130 0.155 0.182 0.158 0.175 0.084 0.048 0.025 0.010 196 E 0.014 0.035 0.230 0.241 0.176 0.137 0.114 0.033 0.013 0.006 0.003 197 L 0.001 0.001 0.003 0.003 0.005 0.014 0.039 0.067 0.198 0.291 0.378 198 L 0.003 0.005 0.008 0.026 0.059 0.110 0.250 0.170 0.166 0.136 0.067 199 S 0.019 0.105 0.516 0.207 0.079 0.038 0.018 0.008 0.005 0.003 0.001 200 K 0.033 0.036 0.071 0.102 0.133 0.235 0.235 0.092 0.037 0.018 0.008 201 G 0.452 0.139 0.042 0.085 0.049 0.039 0.072 0.053 0.035 0.022 0.011 202 I 0.023 0.012 0.010 0.023 0.036 0.074 0.154 0.140 0.187 0.184 0.157 203 D 0.043 0.373 0.185 0.189 0.112 0.044 0.026 0.014 0.007 0.005 0.002 204 K 0.120 0.116 0.061 0.145 0.153 0.144 0.142 0.070 0.030 0.014 0.006 205 D 0.810 0.070 0.030 0.037 0.017 0.011 0.013 0.007 0.003 0.001 0.001 206 D 0.121 0.112 0.071 0.264 0.165 0.100 0.099 0.040 0.017 0.007 0.004 207 I 0.003 0.005 0.007 0.010 0.017 0.029 0.059 0.088 0.214 0.285 0.283 208 Y 0.006 0.020 0.042 0.097 0.157 0.198 0.244 0.112 0.069 0.042 0.013 209 R 0.016 0.048 0.510 0.216 0.092 0.055 0.033 0.016 0.008 0.004 0.001 210 K 0.022 0.029 0.097 0.140 0.150 0.213 0.197 0.086 0.036 0.020 0.009 211 V 0.010 0.014 0.019 0.029 0.034 0.060 0.146 0.167 0.214 0.202 0.105 212 Y 0.017 0.023 0.038 0.068 0.098 0.159 0.250 0.139 0.103 0.078 0.027 213 N 0.110 0.134 0.398 0.193 0.086 0.036 0.025 0.010 0.005 0.002 0.001 214 T 0.217 0.190 0.160 0.166 0.099 0.060 0.062 0.028 0.010 0.005 0.002 215 Y 0.055 0.058 0.023 0.048 0.060 0.105 0.186 0.145 0.140 0.113 0.067 216 S 0.245 0.393 0.091 0.129 0.066 0.032 0.024 0.012 0.005 0.003 0.001 217 E 0.365 0.099 0.104 0.155 0.115 0.064 0.051 0.026 0.011 0.006 0.003 218 S 0.374 0.160 0.099 0.117 0.073 0.052 0.066 0.034 0.014 0.008 0.003 219 R 0.012 0.029 0.037 0.136 0.140 0.187 0.211 0.116 0.078 0.042 0.012 220 L 0.007 0.009 0.037 0.035 0.048 0.122 0.201 0.159 0.159 0.153 0.069 221 R 0.007 0.042 0.267 0.287 0.188 0.103 0.059 0.026 0.012 0.006 0.003 222 L 0.002 0.006 0.027 0.018 0.031 0.062 0.133 0.156 0.192 0.229 0.143 223 M 0.004 0.010 0.019 0.053 0.094 0.151 0.215 0.152 0.148 0.101 0.050 224 G 0.224 0.079 0.158 0.152 0.100 0.077 0.101 0.056 0.030 0.017 0.007 225 Y 0.032 0.030 0.086 0.133 0.147 0.194 0.205 0.085 0.047 0.027 0.014 226 V 0.005 0.014 0.019 0.025 0.036 0.052 0.132 0.140 0.211 0.198 0.170 227 L 0.005 0.006 0.013 0.031 0.070 0.123 0.208 0.156 0.159 0.139 0.092 228 S 0.058 0.139 0.369 0.208 0.109 0.051 0.035 0.016 0.008 0.004 0.002 229 N 0.042 0.056 0.085 0.205 0.172 0.137 0.159 0.080 0.036 0.019 0.009 230 M 0.013 0.008 0.009 0.014 0.021 0.054 0.130 0.129 0.214 0.239 0.170 231 K 0.071 0.160 0.196 0.288 0.161 0.062 0.034 0.016 0.007 0.003 0.002 232 V 0.016 0.017 0.055 0.047 0.065 0.112 0.161 0.136 0.149 0.146 0.096 233 Y 0.018 0.035 0.033 0.069 0.087 0.127 0.205 0.134 0.130 0.101 0.060 234 K 0.192 0.184 0.131 0.179 0.107 0.067 0.069 0.036 0.019 0.010 0.004 235 D 0.243 0.154 0.117 0.201 0.114 0.064 0.050 0.029 0.014 0.009 0.005 236 Y 0.074 0.058 0.031 0.081 0.085 0.120 0.184 0.134 0.106 0.083 0.044 237 N 0.114 0.122 0.057 0.169 0.148 0.118 0.123 0.076 0.039 0.021 0.012 238 S 0.025 0.025 0.046 0.078 0.098 0.131 0.168 0.135 0.125 0.098 0.071 239 A 0.008 0.016 0.026 0.047 0.065 0.097 0.174 0.140 0.183 0.146 0.097 240 L 0.004 0.010 0.015 0.042 0.064 0.084 0.146 0.138 0.199 0.165 0.132 241 I 0.004 0.005 0.011 0.020 0.035 0.057 0.102 0.134 0.209 0.209 0.213 242 S 0.018 0.025 0.042 0.117 0.167 0.127 0.176 0.128 0.095 0.060 0.044 243 L 0.003 0.003 0.008 0.013 0.026 0.031 0.081 0.139 0.208 0.223 0.263 244 T 0.015 0.041 0.047 0.101 0.125 0.126 0.178 0.114 0.118 0.084 0.051 245 K 0.081 0.096 0.118 0.192 0.149 0.112 0.130 0.057 0.037 0.018 0.010 246 E 0.340 0.153 0.126 0.161 0.089 0.051 0.044 0.020 0.009 0.005 0.003 247 E 0.115 0.167 0.090 0.156 0.107 0.094 0.128 0.068 0.039 0.025 0.011 248 Q 0.090 0.075 0.054 0.118 0.123 0.125 0.151 0.109 0.072 0.056 0.028 249 G 0.199 0.186 0.195 0.177 0.092 0.060 0.046 0.024 0.012 0.007 0.003 250 K 0.052 0.119 0.178 0.233 0.142 0.104 0.085 0.047 0.023 0.013 0.005 251 F 0.030 0.020 0.024 0.039 0.056 0.114 0.194 0.158 0.162 0.128 0.074 252 D 0.168 0.194 0.162 0.235 0.120 0.050 0.035 0.019 0.009 0.004 0.002 253 Y 0.028 0.015 0.031 0.043 0.058 0.094 0.160 0.148 0.167 0.154 0.103 254 I 0.053 0.115 0.062 0.135 0.127 0.119 0.157 0.095 0.067 0.048 0.023 255 K 0.131 0.160 0.112 0.202 0.143 0.094 0.076 0.042 0.023 0.012 0.006 256 G 0.528 0.105 0.056 0.096 0.066 0.044 0.046 0.030 0.014 0.009 0.005 257 D 0.095 0.130 0.037 0.141 0.111 0.109 0.143 0.092 0.071 0.047 0.024 258 S 0.030 0.048 0.017 0.046 0.064 0.089 0.143 0.135 0.163 0.148 0.118 259 E 0.216 0.126 0.091 0.202 0.157 0.087 0.059 0.032 0.016 0.009 0.005 260 G 0.201 0.114 0.098 0.173 0.110 0.088 0.106 0.054 0.031 0.017 0.007 261 F 0.004 0.008 0.008 0.027 0.038 0.063 0.113 0.120 0.222 0.196 0.201 262 V 0.003 0.004 0.005 0.016 0.032 0.053 0.107 0.137 0.212 0.222 0.207 263 N 0.029 0.072 0.191 0.235 0.175 0.104 0.072 0.049 0.036 0.025 0.013 264 I 0.009 0.013 0.022 0.057 0.104 0.138 0.248 0.188 0.109 0.070 0.041 265 P 0.019 0.017 0.015 0.037 0.040 0.046 0.083 0.114 0.194 0.234 0.202 266 L 0.035 0.025 0.024 0.067 0.099 0.150 0.220 0.142 0.120 0.077 0.040 267 S 0.076 0.144 0.111 0.241 0.159 0.087 0.083 0.045 0.029 0.016 0.009 268 I 0.007 0.010 0.009 0.016 0.026 0.046 0.097 0.096 0.178 0.218 0.298 269 K 0.148 0.202 0.082 0.217 0.157 0.075 0.062 0.030 0.015 0.008 0.004 270 N 0.126 0.119 0.080 0.214 0.135 0.106 0.102 0.050 0.034 0.021 0.012 271 V 0.002 0.003 0.005 0.010 0.017 0.041 0.083 0.092 0.203 0.231 0.313 272 C 0.007 0.034 0.034 0.136 0.181 0.164 0.210 0.106 0.069 0.039 0.019 273 F 0.001 0.001 0.004 0.004 0.009 0.020 0.050 0.082 0.225 0.295 0.311 274 S 0.001 0.001 0.003 0.007 0.019 0.035 0.079 0.110 0.213 0.250 0.284 275 C 0.001 0.001 0.002 0.004 0.009 0.013 0.040 0.086 0.221 0.302 0.321 276 F 0.001 0.001 0.005 0.011 0.033 0.044 0.096 0.155 0.199 0.232 0.224 277 L 0.001 0.001 0.003 0.006 0.013 0.023 0.055 0.106 0.237 0.304 0.251 278 R 0.006 0.009 0.021 0.061 0.101 0.139 0.255 0.154 0.128 0.083 0.043 279 E 0.012 0.026 0.068 0.096 0.111 0.149 0.231 0.129 0.094 0.056 0.028 280 D 0.036 0.071 0.056 0.095 0.091 0.170 0.232 0.095 0.078 0.051 0.025 281 T 0.204 0.409 0.090 0.123 0.061 0.035 0.038 0.018 0.011 0.007 0.005 282 E 0.529 0.252 0.036 0.075 0.043 0.024 0.021 0.010 0.005 0.003 0.002 283 K 0.736 0.161 0.023 0.042 0.017 0.008 0.006 0.003 0.002 0.001 0.001 284 K 0.243 0.243 0.057 0.153 0.103 0.083 0.063 0.032 0.013 0.007 0.003 285 M 0.107 0.113 0.065 0.185 0.164 0.125 0.095 0.072 0.038 0.024 0.012 286 I 0.008 0.011 0.018 0.027 0.039 0.113 0.209 0.172 0.183 0.152 0.067 287 K 0.010 0.072 0.145 0.336 0.214 0.107 0.059 0.030 0.015 0.007 0.003 288 I 0.002 0.001 0.005 0.005 0.008 0.019 0.053 0.098 0.218 0.302 0.290 289 S 0.014 0.041 0.041 0.188 0.242 0.152 0.136 0.093 0.050 0.026 0.017 290 L 0.005 0.003 0.008 0.009 0.014 0.018 0.052 0.102 0.205 0.260 0.324 291 R 0.017 0.024 0.036 0.125 0.215 0.156 0.166 0.117 0.067 0.043 0.033 292 S 0.032 0.047 0.041 0.055 0.055 0.066 0.144 0.128 0.181 0.152 0.098 293 V 0.112 0.114 0.047 0.201 0.170 0.110 0.104 0.060 0.040 0.024 0.018 294 G 0.376 0.165 0.052 0.100 0.062 0.054 0.073 0.046 0.037 0.024 0.012 295 K 0.217 0.207 0.061 0.208 0.116 0.075 0.056 0.028 0.017 0.010 0.006 296 F 0.048 0.028 0.017 0.038 0.050 0.093 0.140 0.127 0.167 0.154 0.137 297 P 0.155 0.203 0.066 0.196 0.147 0.083 0.069 0.039 0.021 0.013 0.007 298 C 0.018 0.027 0.019 0.046 0.064 0.080 0.138 0.143 0.179 0.162 0.124 299 N 0.068 0.062 0.037 0.136 0.155 0.141 0.162 0.103 0.068 0.046 0.023 300 R 0.118 0.093 0.109 0.230 0.135 0.108 0.099 0.053 0.031 0.017 0.007 301 L 0.013 0.017 0.022 0.069 0.095 0.168 0.235 0.142 0.116 0.075 0.048 302 A 0.002 0.004 0.007 0.013 0.019 0.021 0.051 0.080 0.202 0.260 0.341 303 A 0.002 0.003 0.012 0.027 0.056 0.113 0.168 0.129 0.189 0.191 0.110 304 E 0.012 0.040 0.174 0.187 0.146 0.153 0.132 0.060 0.052 0.032 0.014 305 F 0.005 0.011 0.027 0.058 0.079 0.135 0.227 0.162 0.132 0.099 0.065 306 F 0.003 0.005 0.007 0.011 0.015 0.039 0.083 0.099 0.229 0.264 0.246 307 N 0.041 0.057 0.055 0.130 0.133 0.121 0.162 0.110 0.094 0.058 0.039 308 G 0.025 0.022 0.033 0.052 0.062 0.093 0.149 0.135 0.165 0.146 0.118 309 G 0.023 0.030 0.023 0.061 0.083 0.100 0.168 0.153 0.146 0.117 0.096 310 G 0.012 0.016 0.016 0.035 0.047 0.056 0.108 0.146 0.187 0.194 0.185 311 H 0.005 0.008 0.011 0.031 0.056 0.063 0.109 0.156 0.194 0.187 0.182 312 L 0.014 0.018 0.021 0.058 0.077 0.088 0.154 0.167 0.174 0.139 0.090 313 N 0.012 0.021 0.026 0.086 0.117 0.123 0.217 0.151 0.120 0.073 0.055 314 A 0.004 0.006 0.013 0.020 0.030 0.034 0.065 0.099 0.175 0.242 0.311 315 S 0.005 0.008 0.012 0.026 0.047 0.080 0.155 0.157 0.220 0.181 0.110 316 G 0.049 0.058 0.046 0.151 0.139 0.106 0.141 0.089 0.100 0.064 0.057 317 G 0.005 0.003 0.006 0.008 0.013 0.018 0.045 0.078 0.179 0.214 0.431 318 E 0.040 0.085 0.054 0.227 0.246 0.116 0.109 0.060 0.035 0.017 0.011 319 F 0.004 0.007 0.008 0.012 0.020 0.026 0.070 0.113 0.194 0.220 0.326 320 Y 0.102 0.144 0.081 0.231 0.202 0.097 0.073 0.034 0.019 0.010 0.007 321 G 0.516 0.126 0.065 0.100 0.055 0.038 0.050 0.023 0.015 0.008 0.004 322 T 0.131 0.211 0.058 0.148 0.107 0.110 0.101 0.049 0.041 0.027 0.016 323 M 0.093 0.199 0.048 0.115 0.101 0.101 0.154 0.081 0.059 0.033 0.016 324 E 0.545 0.114 0.095 0.110 0.061 0.034 0.026 0.010 0.004 0.002 0.001 325 E 0.289 0.146 0.266 0.169 0.069 0.029 0.021 0.008 0.002 0.001 0.001 326 A 0.019 0.032 0.057 0.117 0.131 0.145 0.218 0.140 0.079 0.047 0.014 327 V 0.005 0.012 0.039 0.047 0.069 0.146 0.293 0.170 0.117 0.083 0.019 328 K 0.006 0.025 0.733 0.148 0.054 0.021 0.009 0.003 0.001 0.001 0.001 329 V 0.013 0.031 0.529 0.168 0.110 0.068 0.051 0.022 0.005 0.003 0.001 330 F 0.004 0.010 0.043 0.032 0.050 0.103 0.233 0.201 0.164 0.119 0.040 331 E 0.023 0.023 0.114 0.084 0.117 0.149 0.274 0.126 0.055 0.028 0.007 332 Q 0.020 0.018 0.781 0.103 0.043 0.017 0.011 0.004 0.001 0.001 0.001 333 A 0.021 0.042 0.385 0.144 0.118 0.110 0.129 0.035 0.010 0.004 0.001 334 L 0.003 0.004 0.016 0.012 0.020 0.046 0.155 0.164 0.247 0.220 0.113 335 E 0.025 0.045 0.252 0.156 0.152 0.117 0.147 0.062 0.025 0.015 0.004 336 K 0.009 0.031 0.767 0.129 0.042 0.013 0.006 0.002 0.001 0.001 0.001 337 Y 0.036 0.047 0.140 0.076 0.092 0.174 0.249 0.106 0.045 0.026 0.010 338 K 0.080 0.115 0.092 0.117 0.109 0.096 0.160 0.117 0.064 0.034 0.016 339 P 0.445 0.122 0.161 0.098 0.060 0.033 0.043 0.022 0.009 0.005 0.002 340 L 0.205 0.174 0.315 0.173 0.067 0.029 0.022 0.008 0.004 0.002 0.001 341 L 0.145 0.146 0.127 0.136 0.110 0.098 0.122 0.065 0.030 0.014 0.006 342 K 0.255 0.271 0.132 0.144 0.083 0.044 0.037 0.021 0.008 0.004 0.002 343 E 0.136 0.090 0.112 0.130 0.127 0.099 0.135 0.093 0.042 0.023 0.012