# TARGET T0501 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-near-backbone-11-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0501.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1807 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.292 0.125 0.075 0.124 0.104 0.087 0.088 0.045 0.031 0.020 0.009 2 L 0.083 0.099 0.063 0.157 0.141 0.118 0.131 0.081 0.064 0.044 0.021 3 T 0.021 0.031 0.032 0.048 0.050 0.076 0.177 0.161 0.178 0.135 0.092 4 K 0.083 0.108 0.119 0.247 0.200 0.102 0.077 0.032 0.019 0.010 0.004 5 V 0.189 0.089 0.163 0.152 0.095 0.084 0.098 0.050 0.039 0.026 0.014 6 I 0.012 0.043 0.049 0.158 0.151 0.159 0.214 0.082 0.070 0.044 0.018 7 A 0.002 0.004 0.011 0.012 0.017 0.039 0.135 0.174 0.242 0.193 0.171 8 Q 0.038 0.032 0.263 0.267 0.207 0.105 0.056 0.017 0.008 0.006 0.001 9 A 0.023 0.037 0.291 0.248 0.166 0.109 0.079 0.025 0.012 0.007 0.002 10 H 0.001 0.005 0.012 0.013 0.015 0.033 0.138 0.186 0.248 0.215 0.135 11 I 0.001 0.002 0.013 0.014 0.026 0.089 0.247 0.234 0.180 0.126 0.068 12 D 0.082 0.028 0.773 0.086 0.015 0.009 0.004 0.002 0.001 0.001 0.001 13 H 0.001 0.008 0.046 0.115 0.169 0.281 0.278 0.068 0.023 0.008 0.002 14 F 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.002 0.015 0.042 0.188 0.356 0.393 15 T 0.001 0.003 0.035 0.075 0.164 0.360 0.278 0.052 0.020 0.010 0.003 16 K 0.010 0.016 0.889 0.062 0.012 0.007 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 17 W 0.001 0.004 0.008 0.015 0.030 0.096 0.324 0.288 0.133 0.071 0.032 18 F 0.002 0.002 0.007 0.004 0.004 0.009 0.053 0.118 0.221 0.318 0.263 19 E 0.028 0.037 0.450 0.212 0.145 0.069 0.035 0.013 0.005 0.005 0.002 20 R 0.029 0.101 0.458 0.181 0.085 0.080 0.046 0.010 0.006 0.003 0.002 21 A 0.079 0.030 0.026 0.059 0.083 0.108 0.227 0.140 0.113 0.078 0.058 22 D 0.206 0.159 0.100 0.159 0.108 0.104 0.089 0.034 0.022 0.013 0.006 23 K 0.019 0.047 0.137 0.202 0.195 0.175 0.118 0.054 0.033 0.013 0.008 24 I 0.001 0.002 0.005 0.004 0.008 0.019 0.080 0.189 0.260 0.230 0.201 25 V 0.002 0.007 0.013 0.021 0.036 0.062 0.169 0.177 0.203 0.187 0.121 26 I 0.001 0.001 0.004 0.002 0.003 0.005 0.024 0.089 0.197 0.310 0.365 27 V 0.001 0.002 0.007 0.008 0.012 0.021 0.080 0.129 0.207 0.259 0.272 28 S 0.003 0.003 0.007 0.012 0.016 0.024 0.078 0.109 0.195 0.224 0.329 29 H 0.006 0.008 0.010 0.036 0.057 0.080 0.154 0.173 0.172 0.127 0.178 30 V 0.022 0.023 0.023 0.091 0.115 0.152 0.196 0.145 0.108 0.070 0.054 31 S 0.094 0.079 0.054 0.159 0.155 0.121 0.131 0.082 0.056 0.040 0.028 32 P 0.038 0.030 0.029 0.066 0.078 0.093 0.150 0.133 0.131 0.136 0.117 33 D 0.068 0.066 0.041 0.088 0.097 0.110 0.161 0.096 0.113 0.086 0.074 34 G 0.006 0.005 0.009 0.008 0.012 0.020 0.081 0.114 0.206 0.249 0.291 35 D 0.006 0.007 0.015 0.013 0.025 0.033 0.127 0.135 0.206 0.214 0.218 36 A 0.003 0.003 0.009 0.006 0.011 0.015 0.068 0.108 0.180 0.230 0.366 37 I 0.004 0.004 0.019 0.012 0.022 0.030 0.096 0.108 0.182 0.243 0.282 38 G 0.002 0.003 0.014 0.009 0.020 0.028 0.088 0.128 0.195 0.214 0.298 39 S 0.002 0.002 0.015 0.009 0.021 0.029 0.097 0.127 0.222 0.238 0.236 40 S 0.004 0.005 0.031 0.019 0.037 0.059 0.169 0.162 0.196 0.181 0.139 41 L 0.006 0.008 0.053 0.037 0.052 0.080 0.193 0.186 0.170 0.117 0.099 42 G 0.002 0.002 0.023 0.011 0.012 0.029 0.090 0.078 0.207 0.265 0.281 43 L 0.001 0.001 0.007 0.004 0.004 0.009 0.044 0.047 0.202 0.192 0.491 44 Y 0.002 0.003 0.024 0.030 0.040 0.141 0.263 0.177 0.170 0.078 0.072 45 H 0.002 0.007 0.077 0.057 0.065 0.143 0.287 0.186 0.095 0.053 0.029 46 F 0.001 0.001 0.009 0.004 0.003 0.008 0.052 0.105 0.195 0.283 0.339 47 L 0.003 0.003 0.021 0.020 0.015 0.046 0.143 0.147 0.212 0.210 0.178 48 D 0.014 0.026 0.221 0.218 0.213 0.118 0.097 0.048 0.023 0.016 0.006 49 S 0.029 0.059 0.088 0.096 0.095 0.170 0.247 0.097 0.057 0.040 0.021 50 Q 0.125 0.057 0.045 0.087 0.064 0.086 0.160 0.109 0.110 0.096 0.060 51 D 0.577 0.179 0.051 0.061 0.035 0.024 0.028 0.018 0.013 0.009 0.006 52 K 0.129 0.140 0.092 0.193 0.123 0.120 0.089 0.045 0.033 0.021 0.014 53 I 0.197 0.127 0.059 0.156 0.121 0.098 0.094 0.054 0.044 0.029 0.021 54 V 0.007 0.011 0.010 0.031 0.045 0.096 0.156 0.202 0.179 0.144 0.119 55 N 0.067 0.120 0.107 0.228 0.158 0.127 0.089 0.039 0.031 0.021 0.011 56 V 0.003 0.004 0.008 0.010 0.012 0.020 0.062 0.135 0.203 0.277 0.265 57 I 0.018 0.029 0.030 0.066 0.067 0.082 0.144 0.155 0.158 0.156 0.096 58 V 0.007 0.013 0.018 0.030 0.027 0.044 0.103 0.127 0.177 0.246 0.208 59 P 0.030 0.040 0.032 0.106 0.125 0.131 0.171 0.119 0.107 0.079 0.061 60 N 0.283 0.145 0.069 0.136 0.111 0.063 0.066 0.041 0.038 0.031 0.017 61 A 0.113 0.120 0.037 0.151 0.138 0.124 0.128 0.072 0.055 0.039 0.023 62 F 0.023 0.030 0.017 0.052 0.054 0.079 0.143 0.158 0.162 0.150 0.134 63 P 0.221 0.235 0.074 0.176 0.116 0.070 0.052 0.027 0.015 0.009 0.005 64 D 0.462 0.213 0.083 0.112 0.054 0.030 0.021 0.011 0.007 0.005 0.002 65 F 0.142 0.089 0.035 0.149 0.139 0.129 0.131 0.070 0.056 0.036 0.023 66 L 0.016 0.016 0.013 0.038 0.048 0.083 0.162 0.165 0.189 0.144 0.126 67 K 0.119 0.187 0.181 0.234 0.132 0.065 0.043 0.019 0.011 0.007 0.002 68 W 0.036 0.044 0.065 0.095 0.091 0.111 0.170 0.140 0.114 0.084 0.052 69 M 0.031 0.036 0.025 0.070 0.081 0.104 0.177 0.145 0.143 0.113 0.076 70 P 0.245 0.213 0.093 0.148 0.093 0.069 0.062 0.032 0.022 0.015 0.007 71 G 0.291 0.154 0.093 0.160 0.106 0.071 0.057 0.030 0.019 0.012 0.006 72 S 0.074 0.056 0.031 0.085 0.094 0.105 0.156 0.121 0.120 0.093 0.064 73 K 0.088 0.111 0.051 0.150 0.143 0.129 0.144 0.080 0.054 0.033 0.017 74 D 0.186 0.145 0.135 0.188 0.122 0.076 0.066 0.035 0.025 0.016 0.007 75 I 0.025 0.023 0.039 0.080 0.089 0.113 0.178 0.149 0.137 0.099 0.069 76 L 0.036 0.048 0.061 0.120 0.108 0.110 0.182 0.118 0.106 0.073 0.039 77 L 0.020 0.047 0.076 0.108 0.104 0.126 0.196 0.117 0.097 0.074 0.035 78 Y 0.026 0.029 0.065 0.101 0.118 0.147 0.203 0.129 0.091 0.059 0.031 79 D 0.284 0.108 0.155 0.150 0.088 0.064 0.066 0.034 0.024 0.019 0.008 80 R 0.086 0.129 0.088 0.158 0.128 0.122 0.144 0.063 0.041 0.028 0.013 81 Y 0.025 0.035 0.028 0.046 0.062 0.098 0.202 0.195 0.142 0.099 0.069 82 Q 0.288 0.134 0.185 0.161 0.085 0.059 0.044 0.023 0.011 0.008 0.002 83 E 0.335 0.109 0.243 0.162 0.064 0.040 0.026 0.011 0.005 0.003 0.001 84 F 0.039 0.055 0.048 0.077 0.078 0.127 0.212 0.135 0.105 0.078 0.046 85 A 0.029 0.042 0.050 0.086 0.101 0.166 0.234 0.126 0.085 0.053 0.028 86 D 0.220 0.094 0.362 0.147 0.064 0.048 0.033 0.015 0.009 0.006 0.002 87 K 0.105 0.093 0.213 0.190 0.124 0.120 0.090 0.030 0.019 0.011 0.004 88 L 0.054 0.051 0.039 0.069 0.069 0.112 0.210 0.135 0.121 0.082 0.057 89 I 0.025 0.032 0.051 0.079 0.101 0.148 0.203 0.130 0.097 0.072 0.062 90 M 0.149 0.118 0.293 0.173 0.085 0.068 0.053 0.025 0.017 0.013 0.008 91 E 0.168 0.181 0.144 0.235 0.132 0.065 0.046 0.014 0.009 0.005 0.003 92 A 0.026 0.015 0.014 0.040 0.060 0.086 0.163 0.191 0.163 0.112 0.130 93 D 0.039 0.091 0.089 0.197 0.196 0.165 0.121 0.041 0.032 0.020 0.009 94 V 0.003 0.011 0.039 0.042 0.058 0.105 0.206 0.190 0.163 0.106 0.076 95 I 0.001 0.001 0.004 0.004 0.008 0.014 0.067 0.181 0.245 0.251 0.225 96 C 0.001 0.001 0.004 0.003 0.006 0.011 0.054 0.149 0.232 0.296 0.244 97 C 0.001 0.001 0.005 0.003 0.004 0.008 0.033 0.073 0.176 0.321 0.375 98 L 0.001 0.001 0.004 0.004 0.008 0.015 0.057 0.106 0.217 0.281 0.306 99 D 0.003 0.005 0.008 0.018 0.036 0.046 0.128 0.205 0.212 0.182 0.157 100 F 0.010 0.013 0.016 0.044 0.069 0.078 0.163 0.171 0.169 0.160 0.107 101 N 0.032 0.043 0.039 0.088 0.113 0.123 0.173 0.138 0.107 0.087 0.057 102 A 0.055 0.091 0.051 0.141 0.141 0.127 0.151 0.091 0.069 0.052 0.031 103 L 0.043 0.033 0.030 0.103 0.125 0.168 0.165 0.115 0.090 0.076 0.050 104 K 0.392 0.147 0.147 0.158 0.074 0.030 0.020 0.010 0.009 0.008 0.004 105 R 0.040 0.081 0.047 0.122 0.115 0.143 0.179 0.103 0.077 0.060 0.034 106 I 0.005 0.010 0.012 0.020 0.025 0.049 0.117 0.149 0.193 0.218 0.202 107 D 0.235 0.144 0.183 0.207 0.110 0.056 0.036 0.014 0.007 0.005 0.002 108 E 0.283 0.189 0.224 0.163 0.070 0.034 0.021 0.008 0.005 0.003 0.001 109 M 0.026 0.043 0.023 0.065 0.075 0.105 0.207 0.144 0.149 0.100 0.062 110 S 0.006 0.010 0.014 0.038 0.061 0.151 0.255 0.185 0.140 0.088 0.052 111 D 0.091 0.082 0.503 0.208 0.056 0.032 0.015 0.006 0.003 0.003 0.001 112 I 0.005 0.016 0.064 0.109 0.122 0.174 0.234 0.135 0.079 0.039 0.023 113 V 0.001 0.002 0.005 0.006 0.007 0.012 0.058 0.116 0.227 0.285 0.281 114 A 0.007 0.021 0.130 0.185 0.217 0.177 0.153 0.051 0.029 0.021 0.007 115 A 0.028 0.049 0.427 0.190 0.128 0.070 0.057 0.022 0.015 0.010 0.005 116 S 0.088 0.067 0.050 0.096 0.102 0.152 0.223 0.089 0.065 0.042 0.026 117 P 0.561 0.199 0.031 0.072 0.042 0.026 0.031 0.016 0.011 0.007 0.005 118 G 0.348 0.144 0.046 0.117 0.092 0.066 0.066 0.043 0.036 0.022 0.020 119 R 0.157 0.183 0.063 0.175 0.152 0.093 0.083 0.040 0.029 0.015 0.009 120 K 0.055 0.055 0.025 0.101 0.116 0.149 0.199 0.121 0.095 0.048 0.037 121 I 0.004 0.007 0.007 0.017 0.030 0.057 0.130 0.176 0.232 0.182 0.158 122 M 0.004 0.008 0.010 0.022 0.030 0.046 0.120 0.168 0.202 0.194 0.198 123 I 0.001 0.002 0.004 0.005 0.006 0.010 0.038 0.098 0.197 0.321 0.319 124 D 0.004 0.006 0.010 0.023 0.033 0.044 0.105 0.179 0.200 0.201 0.195 125 H 0.007 0.010 0.012 0.035 0.046 0.057 0.140 0.166 0.198 0.183 0.144 126 H 0.015 0.016 0.015 0.053 0.070 0.092 0.160 0.159 0.177 0.143 0.099 127 L 0.052 0.056 0.036 0.122 0.139 0.146 0.164 0.112 0.084 0.055 0.034 128 Y 0.046 0.064 0.032 0.103 0.104 0.135 0.154 0.119 0.098 0.091 0.055 129 P 0.202 0.177 0.053 0.161 0.137 0.088 0.071 0.044 0.029 0.023 0.016 130 E 0.609 0.202 0.038 0.067 0.035 0.016 0.012 0.008 0.006 0.005 0.003 131 D 0.325 0.150 0.041 0.132 0.105 0.085 0.070 0.036 0.027 0.018 0.011 132 F 0.100 0.085 0.037 0.119 0.115 0.095 0.129 0.098 0.090 0.069 0.062 133 C 0.028 0.034 0.024 0.075 0.085 0.149 0.201 0.139 0.124 0.083 0.058 134 R 0.165 0.207 0.110 0.254 0.130 0.058 0.038 0.017 0.012 0.007 0.003 135 I 0.015 0.011 0.009 0.026 0.031 0.052 0.114 0.166 0.221 0.186 0.169 136 T 0.045 0.057 0.027 0.111 0.111 0.121 0.159 0.105 0.115 0.090 0.060 137 I 0.017 0.032 0.029 0.066 0.056 0.079 0.141 0.129 0.165 0.158 0.129 138 S 0.019 0.021 0.024 0.053 0.060 0.086 0.156 0.150 0.163 0.130 0.139 139 H 0.121 0.158 0.058 0.165 0.150 0.078 0.094 0.059 0.043 0.037 0.038 140 P 0.184 0.098 0.027 0.139 0.112 0.105 0.117 0.076 0.062 0.042 0.037 141 E 0.363 0.230 0.049 0.163 0.108 0.038 0.022 0.011 0.009 0.006 0.003 142 I 0.020 0.016 0.010 0.038 0.049 0.078 0.155 0.187 0.175 0.154 0.118 143 S 0.055 0.088 0.044 0.138 0.144 0.163 0.164 0.072 0.058 0.045 0.029 144 S 0.002 0.006 0.010 0.015 0.022 0.037 0.109 0.193 0.204 0.228 0.173 145 T 0.003 0.005 0.014 0.011 0.017 0.027 0.082 0.117 0.195 0.287 0.241 146 S 0.001 0.001 0.005 0.006 0.009 0.019 0.067 0.112 0.192 0.302 0.287 147 E 0.012 0.026 0.079 0.158 0.178 0.152 0.164 0.105 0.063 0.041 0.023 148 L 0.001 0.002 0.012 0.014 0.019 0.040 0.115 0.133 0.211 0.249 0.204 149 V 0.001 0.001 0.004 0.003 0.003 0.006 0.031 0.035 0.201 0.234 0.484 150 F 0.001 0.001 0.010 0.013 0.017 0.080 0.200 0.143 0.240 0.148 0.147 151 R 0.001 0.005 0.080 0.103 0.172 0.193 0.246 0.125 0.048 0.018 0.008 152 L 0.001 0.001 0.014 0.008 0.009 0.024 0.140 0.212 0.230 0.222 0.140 153 I 0.001 0.001 0.008 0.005 0.003 0.007 0.041 0.045 0.196 0.294 0.400 154 C 0.001 0.004 0.047 0.055 0.065 0.148 0.257 0.156 0.139 0.071 0.057 155 R 0.003 0.013 0.118 0.139 0.204 0.179 0.204 0.078 0.038 0.016 0.008 156 M 0.008 0.008 0.029 0.026 0.030 0.064 0.229 0.208 0.174 0.146 0.079 157 G 0.211 0.092 0.095 0.109 0.063 0.065 0.114 0.079 0.077 0.064 0.031 158 Y 0.063 0.061 0.067 0.114 0.085 0.128 0.176 0.113 0.091 0.064 0.040 159 F 0.056 0.096 0.060 0.159 0.127 0.133 0.147 0.081 0.074 0.041 0.026 160 S 0.127 0.087 0.041 0.086 0.107 0.126 0.173 0.098 0.076 0.052 0.027 161 D 0.340 0.286 0.084 0.139 0.065 0.034 0.026 0.011 0.007 0.005 0.003 162 I 0.010 0.012 0.007 0.021 0.024 0.055 0.128 0.200 0.192 0.170 0.181 163 S 0.118 0.313 0.076 0.203 0.142 0.048 0.048 0.022 0.014 0.010 0.005 164 K 0.323 0.201 0.075 0.142 0.106 0.066 0.047 0.020 0.010 0.006 0.005 165 E 0.286 0.185 0.083 0.222 0.110 0.067 0.029 0.008 0.005 0.003 0.001 166 G 0.015 0.017 0.019 0.066 0.091 0.083 0.168 0.193 0.159 0.101 0.086 167 A 0.001 0.003 0.009 0.017 0.036 0.060 0.146 0.229 0.191 0.190 0.117 168 E 0.003 0.023 0.148 0.247 0.248 0.150 0.112 0.037 0.018 0.009 0.003 169 C 0.001 0.001 0.010 0.004 0.006 0.016 0.066 0.123 0.238 0.282 0.254 170 I 0.001 0.001 0.004 0.004 0.005 0.012 0.067 0.099 0.264 0.256 0.288 171 Y 0.001 0.002 0.009 0.009 0.017 0.044 0.137 0.239 0.260 0.156 0.127 172 T 0.001 0.002 0.016 0.010 0.016 0.045 0.138 0.148 0.237 0.220 0.166 173 G 0.001 0.001 0.004 0.004 0.005 0.009 0.049 0.095 0.245 0.272 0.314 174 M 0.001 0.002 0.004 0.008 0.014 0.026 0.087 0.176 0.257 0.209 0.215 175 M 0.003 0.007 0.014 0.022 0.036 0.056 0.130 0.182 0.209 0.183 0.158 176 T 0.006 0.009 0.017 0.026 0.036 0.054 0.150 0.185 0.203 0.185 0.128 177 D 0.013 0.013 0.016 0.047 0.058 0.081 0.172 0.195 0.166 0.137 0.100 178 T 0.027 0.033 0.026 0.076 0.082 0.113 0.147 0.144 0.140 0.123 0.089 179 G 0.105 0.094 0.049 0.126 0.138 0.133 0.127 0.084 0.061 0.051 0.031 180 G 0.181 0.131 0.055 0.194 0.160 0.090 0.073 0.042 0.032 0.025 0.016 181 F 0.033 0.018 0.014 0.032 0.034 0.051 0.085 0.115 0.187 0.214 0.219 182 T 0.134 0.303 0.077 0.209 0.134 0.056 0.040 0.019 0.013 0.010 0.005 183 Y 0.063 0.056 0.032 0.088 0.081 0.104 0.145 0.136 0.126 0.097 0.071 184 N 0.281 0.156 0.066 0.158 0.119 0.076 0.061 0.029 0.026 0.019 0.009 185 S 0.251 0.237 0.067 0.173 0.108 0.058 0.055 0.023 0.015 0.009 0.004 186 N 0.075 0.046 0.024 0.063 0.064 0.082 0.147 0.141 0.147 0.116 0.094 187 N 0.075 0.101 0.053 0.156 0.164 0.135 0.141 0.069 0.053 0.034 0.019 188 R 0.271 0.198 0.124 0.173 0.093 0.052 0.043 0.021 0.013 0.008 0.004 189 E 0.078 0.061 0.048 0.164 0.156 0.186 0.153 0.069 0.048 0.026 0.012 190 I 0.007 0.009 0.015 0.030 0.044 0.054 0.132 0.168 0.216 0.186 0.140 191 Y 0.004 0.009 0.029 0.059 0.085 0.167 0.227 0.153 0.119 0.102 0.047 192 F 0.007 0.026 0.205 0.210 0.181 0.121 0.117 0.069 0.033 0.022 0.008 193 I 0.001 0.001 0.006 0.004 0.006 0.015 0.073 0.158 0.242 0.287 0.207 194 I 0.001 0.001 0.007 0.007 0.009 0.023 0.105 0.127 0.245 0.264 0.211 195 S 0.009 0.013 0.215 0.210 0.165 0.150 0.118 0.051 0.034 0.027 0.008 196 E 0.002 0.008 0.070 0.127 0.178 0.232 0.258 0.070 0.035 0.013 0.006 197 L 0.001 0.001 0.004 0.002 0.002 0.004 0.027 0.065 0.191 0.326 0.378 198 L 0.005 0.007 0.027 0.048 0.050 0.146 0.314 0.164 0.127 0.069 0.043 199 S 0.023 0.052 0.468 0.205 0.104 0.060 0.039 0.023 0.013 0.008 0.004 200 K 0.025 0.032 0.046 0.092 0.149 0.210 0.286 0.086 0.044 0.023 0.008 201 G 0.439 0.102 0.054 0.080 0.049 0.047 0.080 0.044 0.047 0.037 0.021 202 I 0.040 0.033 0.025 0.048 0.058 0.089 0.172 0.171 0.151 0.121 0.093 203 D 0.094 0.402 0.149 0.126 0.070 0.044 0.049 0.026 0.020 0.014 0.007 204 K 0.080 0.086 0.028 0.094 0.133 0.148 0.189 0.128 0.060 0.034 0.021 205 D 0.796 0.083 0.040 0.038 0.014 0.010 0.007 0.004 0.003 0.003 0.001 206 D 0.029 0.050 0.039 0.244 0.247 0.187 0.128 0.047 0.018 0.008 0.003 207 I 0.001 0.002 0.005 0.005 0.006 0.010 0.052 0.089 0.222 0.281 0.326 208 Y 0.001 0.004 0.021 0.060 0.114 0.231 0.299 0.123 0.083 0.041 0.022 209 R 0.011 0.031 0.551 0.201 0.091 0.050 0.031 0.015 0.010 0.007 0.002 210 K 0.003 0.007 0.033 0.060 0.091 0.163 0.307 0.159 0.095 0.054 0.026 211 V 0.004 0.006 0.016 0.013 0.011 0.021 0.093 0.149 0.238 0.253 0.194 212 Y 0.007 0.020 0.075 0.106 0.120 0.159 0.219 0.126 0.085 0.060 0.024 213 N 0.038 0.058 0.297 0.163 0.150 0.099 0.098 0.044 0.028 0.018 0.007 214 T 0.245 0.160 0.133 0.161 0.111 0.065 0.072 0.025 0.015 0.010 0.003 215 Y 0.106 0.074 0.029 0.059 0.062 0.100 0.191 0.153 0.108 0.073 0.044 216 S 0.172 0.322 0.099 0.119 0.078 0.056 0.069 0.037 0.024 0.017 0.007 217 E 0.347 0.163 0.118 0.131 0.081 0.068 0.051 0.025 0.009 0.004 0.002 218 S 0.468 0.136 0.133 0.123 0.046 0.042 0.028 0.012 0.006 0.004 0.001 219 R 0.013 0.026 0.034 0.110 0.139 0.182 0.233 0.106 0.084 0.047 0.026 220 L 0.007 0.010 0.047 0.049 0.077 0.126 0.215 0.167 0.137 0.097 0.067 221 R 0.011 0.028 0.403 0.259 0.192 0.059 0.031 0.009 0.004 0.003 0.001 222 L 0.001 0.006 0.060 0.023 0.022 0.057 0.150 0.178 0.211 0.180 0.112 223 M 0.002 0.005 0.024 0.036 0.058 0.100 0.265 0.189 0.155 0.117 0.048 224 G 0.082 0.047 0.475 0.178 0.083 0.052 0.042 0.017 0.012 0.009 0.002 225 Y 0.007 0.021 0.143 0.162 0.169 0.197 0.185 0.058 0.033 0.016 0.007 226 V 0.002 0.004 0.011 0.007 0.006 0.015 0.083 0.111 0.253 0.295 0.213 227 L 0.005 0.013 0.061 0.100 0.159 0.192 0.251 0.110 0.061 0.033 0.015 228 S 0.050 0.061 0.653 0.122 0.051 0.028 0.017 0.008 0.005 0.003 0.001 229 N 0.027 0.054 0.103 0.174 0.161 0.186 0.210 0.042 0.025 0.013 0.004 230 M 0.006 0.005 0.010 0.014 0.018 0.039 0.137 0.207 0.236 0.177 0.152 231 K 0.054 0.060 0.324 0.223 0.165 0.074 0.055 0.022 0.012 0.009 0.002 232 V 0.011 0.048 0.378 0.165 0.133 0.090 0.093 0.036 0.025 0.016 0.006 233 Y 0.005 0.011 0.026 0.029 0.040 0.089 0.235 0.196 0.172 0.118 0.078 234 K 0.133 0.101 0.226 0.177 0.138 0.075 0.079 0.034 0.019 0.014 0.004 235 D 0.180 0.143 0.294 0.171 0.095 0.051 0.037 0.015 0.008 0.005 0.002 236 Y 0.160 0.093 0.072 0.118 0.107 0.139 0.155 0.067 0.047 0.027 0.014 237 N 0.211 0.139 0.079 0.137 0.114 0.090 0.108 0.051 0.040 0.021 0.010 238 S 0.043 0.057 0.102 0.135 0.142 0.147 0.149 0.089 0.069 0.041 0.026 239 A 0.038 0.058 0.112 0.164 0.151 0.151 0.154 0.074 0.053 0.030 0.014 240 L 0.007 0.019 0.043 0.076 0.087 0.112 0.189 0.171 0.144 0.093 0.059 241 I 0.003 0.007 0.024 0.029 0.033 0.058 0.139 0.173 0.204 0.197 0.133 242 S 0.012 0.026 0.110 0.131 0.119 0.109 0.156 0.108 0.100 0.086 0.045 243 L 0.007 0.018 0.061 0.069 0.078 0.104 0.176 0.170 0.139 0.115 0.063 244 T 0.033 0.054 0.080 0.114 0.101 0.115 0.177 0.105 0.097 0.086 0.038 245 K 0.048 0.049 0.057 0.115 0.122 0.131 0.183 0.125 0.082 0.059 0.029 246 E 0.306 0.157 0.133 0.162 0.088 0.055 0.043 0.024 0.016 0.012 0.005 247 E 0.124 0.092 0.069 0.138 0.116 0.119 0.140 0.078 0.060 0.041 0.023 248 Q 0.063 0.062 0.043 0.078 0.073 0.093 0.151 0.125 0.130 0.106 0.077 249 G 0.198 0.156 0.111 0.162 0.110 0.090 0.080 0.038 0.028 0.018 0.009 250 K 0.145 0.144 0.114 0.192 0.138 0.092 0.080 0.040 0.028 0.018 0.010 251 F 0.101 0.055 0.035 0.086 0.094 0.124 0.169 0.112 0.106 0.068 0.050 252 D 0.230 0.195 0.082 0.186 0.128 0.066 0.056 0.024 0.017 0.010 0.005 253 Y 0.028 0.029 0.034 0.062 0.057 0.077 0.141 0.155 0.166 0.143 0.108 254 I 0.053 0.067 0.048 0.118 0.115 0.131 0.167 0.106 0.089 0.064 0.042 255 K 0.182 0.215 0.100 0.193 0.121 0.066 0.055 0.027 0.020 0.013 0.007 256 G 0.340 0.109 0.047 0.095 0.088 0.086 0.094 0.057 0.039 0.027 0.018 257 D 0.102 0.126 0.045 0.159 0.146 0.113 0.115 0.067 0.059 0.045 0.023 258 S 0.022 0.020 0.016 0.045 0.050 0.075 0.148 0.174 0.181 0.141 0.128 259 E 0.133 0.154 0.105 0.222 0.166 0.090 0.064 0.028 0.020 0.013 0.006 260 G 0.044 0.061 0.056 0.156 0.147 0.134 0.160 0.098 0.076 0.042 0.024 261 F 0.006 0.010 0.013 0.026 0.028 0.040 0.105 0.130 0.207 0.224 0.210 262 V 0.004 0.006 0.015 0.036 0.037 0.087 0.181 0.171 0.193 0.152 0.118 263 N 0.037 0.077 0.213 0.227 0.155 0.093 0.077 0.047 0.035 0.027 0.011 264 I 0.015 0.027 0.035 0.090 0.105 0.168 0.249 0.131 0.092 0.058 0.030 265 P 0.028 0.022 0.026 0.052 0.043 0.057 0.132 0.120 0.195 0.178 0.146 266 L 0.030 0.039 0.045 0.086 0.106 0.146 0.197 0.139 0.102 0.071 0.040 267 S 0.067 0.207 0.191 0.237 0.116 0.075 0.053 0.021 0.016 0.011 0.006 268 I 0.014 0.016 0.014 0.041 0.059 0.095 0.175 0.197 0.149 0.107 0.133 269 K 0.355 0.230 0.083 0.162 0.079 0.034 0.027 0.013 0.008 0.006 0.003 270 N 0.294 0.179 0.093 0.227 0.112 0.048 0.027 0.009 0.005 0.003 0.002 271 V 0.005 0.005 0.008 0.016 0.020 0.043 0.095 0.138 0.214 0.205 0.251 272 C 0.021 0.054 0.045 0.165 0.185 0.186 0.185 0.058 0.054 0.031 0.016 273 F 0.002 0.009 0.030 0.031 0.050 0.086 0.160 0.186 0.202 0.148 0.096 274 S 0.002 0.004 0.017 0.021 0.031 0.070 0.152 0.160 0.189 0.210 0.144 275 C 0.001 0.001 0.003 0.004 0.006 0.011 0.043 0.165 0.202 0.279 0.285 276 F 0.001 0.002 0.008 0.009 0.011 0.018 0.056 0.153 0.203 0.305 0.234 277 L 0.001 0.002 0.008 0.009 0.009 0.021 0.079 0.112 0.211 0.288 0.261 278 R 0.003 0.009 0.016 0.040 0.048 0.105 0.237 0.169 0.189 0.115 0.071 279 E 0.029 0.045 0.044 0.119 0.155 0.143 0.195 0.110 0.077 0.058 0.025 280 D 0.061 0.075 0.037 0.116 0.134 0.132 0.188 0.112 0.069 0.048 0.029 281 T 0.224 0.340 0.056 0.116 0.084 0.046 0.050 0.032 0.022 0.019 0.011 282 E 0.465 0.352 0.035 0.076 0.036 0.013 0.012 0.006 0.003 0.002 0.001 283 K 0.556 0.164 0.032 0.090 0.065 0.040 0.027 0.015 0.007 0.004 0.003 284 K 0.352 0.194 0.059 0.183 0.089 0.058 0.038 0.013 0.007 0.004 0.002 285 M 0.037 0.053 0.033 0.162 0.186 0.196 0.176 0.082 0.045 0.017 0.011 286 I 0.002 0.003 0.008 0.010 0.017 0.039 0.101 0.158 0.228 0.230 0.204 287 K 0.007 0.031 0.081 0.179 0.215 0.170 0.144 0.065 0.052 0.039 0.017 288 I 0.001 0.003 0.012 0.009 0.013 0.019 0.059 0.169 0.238 0.256 0.221 289 S 0.009 0.016 0.028 0.065 0.073 0.083 0.155 0.131 0.166 0.174 0.101 290 L 0.003 0.004 0.008 0.011 0.012 0.021 0.069 0.127 0.218 0.267 0.258 291 R 0.017 0.034 0.039 0.138 0.156 0.135 0.151 0.117 0.099 0.073 0.040 292 S 0.020 0.020 0.022 0.049 0.046 0.089 0.163 0.132 0.175 0.156 0.127 293 V 0.095 0.165 0.044 0.193 0.163 0.101 0.099 0.054 0.041 0.027 0.017 294 G 0.331 0.169 0.037 0.107 0.085 0.081 0.077 0.044 0.033 0.022 0.013 295 K 0.247 0.193 0.044 0.221 0.166 0.063 0.034 0.014 0.010 0.006 0.003 296 F 0.065 0.030 0.017 0.038 0.037 0.053 0.114 0.137 0.171 0.166 0.172 297 P 0.040 0.201 0.042 0.268 0.247 0.096 0.064 0.021 0.013 0.006 0.002 298 C 0.002 0.003 0.004 0.005 0.006 0.010 0.048 0.098 0.244 0.274 0.307 299 N 0.013 0.024 0.031 0.156 0.192 0.245 0.200 0.056 0.041 0.030 0.011 300 R 0.033 0.068 0.205 0.354 0.149 0.078 0.061 0.027 0.014 0.008 0.003 301 L 0.001 0.001 0.002 0.005 0.007 0.018 0.083 0.169 0.233 0.218 0.265 302 A 0.001 0.001 0.011 0.009 0.011 0.023 0.111 0.107 0.210 0.224 0.292 303 A 0.001 0.005 0.234 0.225 0.255 0.142 0.086 0.026 0.013 0.009 0.003 304 E 0.005 0.010 0.171 0.190 0.266 0.190 0.136 0.020 0.008 0.003 0.001 305 F 0.003 0.003 0.009 0.006 0.006 0.014 0.075 0.183 0.217 0.264 0.221 306 F 0.043 0.035 0.024 0.045 0.042 0.125 0.240 0.167 0.128 0.094 0.057 307 N 0.266 0.185 0.242 0.137 0.058 0.029 0.025 0.016 0.018 0.015 0.009 308 G 0.061 0.036 0.024 0.043 0.057 0.106 0.201 0.158 0.134 0.096 0.083 309 G 0.158 0.082 0.021 0.053 0.054 0.059 0.112 0.094 0.121 0.121 0.124 310 G 0.021 0.017 0.014 0.028 0.032 0.046 0.096 0.108 0.170 0.180 0.288 311 H 0.014 0.019 0.035 0.067 0.092 0.103 0.152 0.132 0.136 0.112 0.139 312 L 0.019 0.027 0.031 0.083 0.099 0.135 0.186 0.123 0.131 0.088 0.077 313 N 0.017 0.019 0.026 0.080 0.091 0.147 0.183 0.131 0.136 0.094 0.075 314 A 0.003 0.004 0.007 0.010 0.014 0.023 0.052 0.115 0.185 0.274 0.312 315 S 0.004 0.009 0.012 0.021 0.025 0.044 0.098 0.185 0.200 0.228 0.176 316 G 0.016 0.030 0.042 0.069 0.061 0.070 0.124 0.117 0.151 0.181 0.138 317 G 0.010 0.006 0.009 0.016 0.022 0.034 0.117 0.140 0.197 0.228 0.221 318 E 0.073 0.123 0.043 0.192 0.166 0.102 0.108 0.068 0.063 0.039 0.023 319 F 0.006 0.008 0.005 0.016 0.018 0.047 0.096 0.110 0.202 0.255 0.237 320 Y 0.123 0.169 0.053 0.285 0.223 0.067 0.044 0.017 0.009 0.006 0.003 321 G 0.394 0.159 0.054 0.091 0.077 0.041 0.053 0.043 0.035 0.029 0.024 322 T 0.076 0.629 0.039 0.106 0.072 0.030 0.026 0.008 0.008 0.006 0.002 323 M 0.014 0.021 0.008 0.034 0.053 0.121 0.260 0.245 0.126 0.066 0.051 324 E 0.806 0.052 0.079 0.045 0.008 0.005 0.003 0.002 0.001 0.001 0.001 325 E 0.023 0.055 0.082 0.427 0.227 0.114 0.052 0.015 0.003 0.001 0.001 326 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.031 0.051 0.222 0.326 0.362 327 V 0.001 0.001 0.015 0.041 0.107 0.306 0.392 0.070 0.045 0.014 0.008 328 K 0.007 0.007 0.948 0.030 0.004 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 329 V 0.001 0.002 0.022 0.035 0.069 0.264 0.464 0.096 0.031 0.014 0.004 330 F 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.014 0.080 0.205 0.345 0.352 331 E 0.001 0.003 0.134 0.126 0.284 0.250 0.152 0.030 0.010 0.009 0.001 332 Q 0.003 0.006 0.915 0.052 0.014 0.007 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 333 A 0.001 0.003 0.013 0.012 0.021 0.083 0.361 0.234 0.149 0.088 0.037 334 L 0.001 0.001 0.006 0.002 0.003 0.008 0.058 0.136 0.219 0.297 0.269 335 E 0.009 0.013 0.650 0.145 0.099 0.047 0.021 0.008 0.003 0.004 0.001 336 K 0.012 0.034 0.595 0.168 0.113 0.050 0.021 0.004 0.001 0.001 0.001 337 Y 0.006 0.012 0.015 0.016 0.020 0.059 0.217 0.217 0.191 0.167 0.080 338 K 0.145 0.076 0.052 0.066 0.079 0.156 0.228 0.105 0.053 0.029 0.011 339 P 0.539 0.127 0.286 0.038 0.006 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 340 L 0.047 0.040 0.044 0.079 0.073 0.171 0.216 0.119 0.098 0.069 0.045 341 L 0.106 0.125 0.039 0.086 0.098 0.094 0.141 0.101 0.092 0.070 0.049 342 K 0.312 0.345 0.152 0.105 0.053 0.018 0.009 0.004 0.002 0.001 0.001 343 E 0.347 0.106 0.190 0.114 0.083 0.066 0.045 0.024 0.013 0.008 0.004