# TARGET T0501 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t04-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-near-backbone-11-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0501.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1757 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.257 0.135 0.089 0.124 0.101 0.081 0.091 0.054 0.034 0.021 0.012 2 L 0.047 0.062 0.048 0.109 0.113 0.109 0.179 0.124 0.103 0.065 0.040 3 T 0.064 0.051 0.051 0.076 0.089 0.112 0.194 0.122 0.114 0.081 0.044 4 K 0.158 0.132 0.228 0.228 0.132 0.058 0.036 0.014 0.007 0.003 0.002 5 V 0.074 0.118 0.155 0.179 0.141 0.102 0.113 0.060 0.029 0.018 0.009 6 I 0.008 0.009 0.015 0.043 0.074 0.110 0.209 0.190 0.163 0.123 0.055 7 A 0.094 0.136 0.244 0.180 0.102 0.088 0.093 0.034 0.017 0.009 0.002 8 Q 0.014 0.037 0.394 0.272 0.149 0.079 0.035 0.011 0.005 0.003 0.001 9 A 0.042 0.020 0.071 0.045 0.072 0.112 0.217 0.174 0.105 0.091 0.050 10 H 0.009 0.088 0.101 0.171 0.162 0.122 0.159 0.094 0.053 0.030 0.009 11 I 0.002 0.002 0.016 0.014 0.040 0.118 0.279 0.183 0.161 0.125 0.061 12 D 0.136 0.056 0.623 0.140 0.034 0.007 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 13 H 0.008 0.021 0.069 0.125 0.160 0.223 0.279 0.077 0.025 0.009 0.004 14 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.010 0.033 0.166 0.265 0.522 15 T 0.004 0.005 0.037 0.071 0.211 0.255 0.317 0.067 0.023 0.008 0.003 16 K 0.003 0.012 0.926 0.050 0.008 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 17 W 0.001 0.001 0.010 0.014 0.033 0.216 0.441 0.136 0.087 0.049 0.012 18 F 0.002 0.002 0.003 0.004 0.007 0.021 0.114 0.142 0.278 0.296 0.131 19 E 0.006 0.036 0.675 0.169 0.073 0.027 0.010 0.003 0.001 0.001 0.001 20 R 0.007 0.047 0.636 0.147 0.087 0.046 0.021 0.006 0.002 0.001 0.001 21 A 0.057 0.038 0.050 0.061 0.087 0.119 0.223 0.185 0.089 0.059 0.033 22 D 0.163 0.115 0.123 0.140 0.107 0.099 0.126 0.068 0.033 0.018 0.007 23 K 0.017 0.047 0.249 0.226 0.175 0.109 0.094 0.039 0.023 0.013 0.007 24 I 0.002 0.004 0.018 0.011 0.019 0.045 0.129 0.124 0.226 0.244 0.179 25 V 0.002 0.011 0.020 0.044 0.063 0.122 0.215 0.159 0.175 0.124 0.064 26 I 0.001 0.001 0.006 0.005 0.009 0.017 0.051 0.107 0.206 0.269 0.328 27 V 0.002 0.002 0.010 0.016 0.032 0.037 0.097 0.183 0.200 0.210 0.212 28 S 0.002 0.004 0.013 0.019 0.026 0.039 0.098 0.134 0.234 0.236 0.197 29 H 0.003 0.004 0.011 0.025 0.043 0.059 0.123 0.163 0.209 0.174 0.189 30 V 0.024 0.038 0.052 0.101 0.102 0.129 0.202 0.124 0.112 0.071 0.046 31 S 0.016 0.030 0.057 0.122 0.136 0.146 0.207 0.115 0.081 0.048 0.041 32 P 0.027 0.029 0.050 0.058 0.063 0.093 0.186 0.128 0.152 0.119 0.094 33 D 0.011 0.028 0.046 0.101 0.109 0.117 0.218 0.118 0.120 0.074 0.058 34 G 0.003 0.007 0.020 0.018 0.022 0.035 0.088 0.100 0.212 0.227 0.267 35 D 0.002 0.008 0.018 0.036 0.058 0.081 0.177 0.151 0.186 0.156 0.127 36 A 0.001 0.002 0.012 0.011 0.018 0.023 0.083 0.160 0.214 0.243 0.234 37 I 0.001 0.001 0.008 0.010 0.018 0.023 0.079 0.167 0.222 0.254 0.217 38 G 0.001 0.001 0.007 0.007 0.011 0.013 0.053 0.125 0.231 0.300 0.253 39 S 0.001 0.001 0.005 0.007 0.015 0.019 0.067 0.169 0.229 0.281 0.207 40 S 0.001 0.001 0.009 0.011 0.020 0.033 0.099 0.179 0.237 0.251 0.161 41 L 0.001 0.002 0.017 0.019 0.036 0.031 0.130 0.266 0.190 0.174 0.134 42 G 0.001 0.001 0.013 0.013 0.023 0.023 0.080 0.163 0.208 0.265 0.211 43 L 0.001 0.001 0.003 0.003 0.007 0.014 0.045 0.083 0.226 0.319 0.301 44 Y 0.001 0.002 0.015 0.026 0.059 0.120 0.246 0.170 0.171 0.127 0.063 45 H 0.003 0.008 0.091 0.086 0.111 0.131 0.256 0.143 0.085 0.061 0.026 46 F 0.001 0.001 0.010 0.008 0.011 0.040 0.102 0.086 0.234 0.303 0.203 47 L 0.001 0.001 0.004 0.007 0.013 0.049 0.138 0.100 0.247 0.257 0.183 48 D 0.020 0.051 0.166 0.189 0.168 0.155 0.137 0.051 0.034 0.020 0.009 49 S 0.024 0.095 0.158 0.143 0.126 0.166 0.145 0.061 0.037 0.028 0.017 50 Q 0.068 0.075 0.029 0.074 0.086 0.116 0.190 0.136 0.097 0.074 0.055 51 D 0.584 0.171 0.030 0.069 0.041 0.028 0.030 0.021 0.012 0.009 0.005 52 K 0.183 0.170 0.089 0.185 0.126 0.098 0.069 0.035 0.022 0.014 0.008 53 I 0.142 0.166 0.058 0.176 0.139 0.103 0.088 0.059 0.033 0.023 0.013 54 V 0.009 0.011 0.008 0.024 0.038 0.085 0.155 0.169 0.212 0.176 0.114 55 N 0.045 0.113 0.092 0.250 0.193 0.118 0.088 0.048 0.028 0.015 0.010 56 V 0.004 0.003 0.010 0.014 0.022 0.043 0.087 0.114 0.209 0.260 0.233 57 I 0.010 0.016 0.017 0.053 0.076 0.142 0.185 0.135 0.157 0.133 0.074 58 V 0.005 0.011 0.012 0.028 0.035 0.058 0.128 0.145 0.224 0.208 0.145 59 P 0.044 0.043 0.033 0.109 0.133 0.133 0.160 0.118 0.099 0.073 0.055 60 N 0.316 0.117 0.060 0.129 0.092 0.073 0.088 0.051 0.038 0.023 0.012 61 A 0.151 0.133 0.037 0.161 0.130 0.112 0.110 0.071 0.046 0.030 0.019 62 F 0.020 0.041 0.010 0.031 0.039 0.066 0.122 0.124 0.180 0.190 0.175 63 P 0.266 0.184 0.047 0.167 0.141 0.072 0.056 0.032 0.018 0.011 0.007 64 D 0.463 0.161 0.071 0.127 0.066 0.041 0.031 0.018 0.011 0.007 0.004 65 F 0.052 0.055 0.026 0.114 0.106 0.131 0.163 0.113 0.109 0.086 0.044 66 L 0.007 0.009 0.005 0.021 0.034 0.087 0.154 0.145 0.215 0.199 0.125 67 K 0.072 0.124 0.145 0.249 0.173 0.097 0.063 0.037 0.022 0.013 0.007 68 W 0.024 0.018 0.033 0.051 0.063 0.118 0.182 0.142 0.155 0.132 0.082 69 M 0.023 0.028 0.017 0.057 0.068 0.087 0.154 0.146 0.166 0.140 0.115 70 P 0.170 0.131 0.057 0.146 0.130 0.090 0.106 0.074 0.049 0.030 0.018 71 G 0.285 0.135 0.068 0.151 0.111 0.073 0.069 0.045 0.029 0.019 0.014 72 S 0.161 0.119 0.044 0.119 0.106 0.089 0.117 0.088 0.068 0.052 0.038 73 K 0.133 0.103 0.036 0.127 0.133 0.114 0.129 0.096 0.064 0.040 0.025 74 D 0.202 0.135 0.065 0.149 0.115 0.090 0.095 0.061 0.043 0.027 0.017 75 I 0.041 0.028 0.031 0.072 0.082 0.103 0.163 0.132 0.146 0.121 0.082 76 L 0.056 0.062 0.049 0.125 0.125 0.131 0.153 0.105 0.092 0.066 0.035 77 L 0.024 0.067 0.061 0.121 0.114 0.126 0.153 0.111 0.103 0.075 0.045 78 Y 0.035 0.029 0.032 0.081 0.113 0.135 0.192 0.140 0.111 0.075 0.055 79 D 0.377 0.104 0.087 0.127 0.094 0.060 0.067 0.039 0.023 0.013 0.007 80 R 0.059 0.095 0.062 0.167 0.147 0.131 0.156 0.084 0.052 0.032 0.015 81 Y 0.011 0.015 0.011 0.025 0.039 0.072 0.161 0.144 0.208 0.195 0.119 82 Q 0.207 0.137 0.149 0.203 0.132 0.072 0.058 0.023 0.012 0.005 0.002 83 E 0.105 0.124 0.293 0.243 0.119 0.056 0.033 0.014 0.006 0.004 0.002 84 F 0.006 0.010 0.013 0.021 0.036 0.083 0.159 0.153 0.205 0.195 0.119 85 A 0.030 0.056 0.046 0.111 0.131 0.146 0.217 0.126 0.075 0.047 0.016 86 D 0.081 0.083 0.379 0.223 0.107 0.062 0.037 0.015 0.007 0.004 0.001 87 K 0.126 0.098 0.217 0.207 0.139 0.092 0.074 0.028 0.011 0.006 0.003 88 L 0.023 0.021 0.026 0.046 0.062 0.083 0.179 0.185 0.171 0.128 0.077 89 I 0.021 0.038 0.053 0.072 0.097 0.141 0.209 0.137 0.099 0.093 0.041 90 M 0.038 0.121 0.348 0.234 0.123 0.069 0.038 0.014 0.008 0.005 0.002 91 E 0.297 0.206 0.122 0.175 0.090 0.046 0.038 0.015 0.005 0.003 0.002 92 A 0.031 0.019 0.018 0.033 0.046 0.063 0.144 0.136 0.197 0.166 0.148 93 D 0.042 0.081 0.074 0.196 0.187 0.133 0.138 0.073 0.042 0.024 0.012 94 V 0.001 0.005 0.023 0.033 0.048 0.121 0.207 0.132 0.191 0.153 0.084 95 I 0.001 0.002 0.007 0.008 0.016 0.037 0.118 0.126 0.236 0.215 0.233 96 C 0.001 0.001 0.003 0.005 0.010 0.014 0.056 0.120 0.239 0.296 0.255 97 C 0.001 0.001 0.002 0.003 0.006 0.012 0.033 0.075 0.204 0.329 0.335 98 L 0.001 0.001 0.002 0.004 0.010 0.018 0.053 0.137 0.228 0.281 0.266 99 D 0.002 0.004 0.011 0.025 0.043 0.055 0.132 0.230 0.200 0.187 0.111 100 F 0.002 0.003 0.015 0.024 0.039 0.064 0.152 0.206 0.200 0.174 0.120 101 N 0.024 0.028 0.046 0.092 0.096 0.129 0.190 0.140 0.125 0.082 0.047 102 A 0.029 0.071 0.063 0.127 0.125 0.128 0.205 0.107 0.077 0.044 0.024 103 L 0.024 0.026 0.031 0.072 0.111 0.142 0.222 0.134 0.105 0.076 0.055 104 K 0.243 0.120 0.188 0.170 0.103 0.060 0.059 0.028 0.015 0.010 0.005 105 R 0.045 0.094 0.083 0.164 0.143 0.177 0.159 0.060 0.039 0.023 0.013 106 I 0.006 0.013 0.011 0.014 0.021 0.030 0.080 0.107 0.195 0.218 0.306 107 D 0.203 0.091 0.088 0.169 0.174 0.098 0.096 0.042 0.022 0.012 0.006 108 E 0.277 0.185 0.239 0.187 0.064 0.024 0.012 0.006 0.003 0.002 0.001 109 M 0.015 0.037 0.025 0.078 0.103 0.138 0.208 0.154 0.117 0.082 0.043 110 S 0.011 0.012 0.009 0.030 0.063 0.119 0.229 0.182 0.163 0.113 0.068 111 D 0.077 0.087 0.450 0.226 0.098 0.033 0.017 0.008 0.003 0.002 0.001 112 I 0.008 0.012 0.056 0.088 0.096 0.232 0.281 0.100 0.070 0.044 0.013 113 V 0.001 0.001 0.003 0.004 0.006 0.014 0.048 0.077 0.236 0.292 0.319 114 A 0.020 0.034 0.100 0.165 0.214 0.147 0.160 0.085 0.042 0.024 0.010 115 A 0.022 0.080 0.417 0.176 0.103 0.084 0.053 0.025 0.018 0.015 0.008 116 S 0.054 0.068 0.046 0.098 0.117 0.152 0.195 0.115 0.073 0.048 0.034 117 P 0.583 0.184 0.025 0.066 0.037 0.024 0.031 0.023 0.014 0.008 0.005 118 G 0.202 0.081 0.048 0.111 0.102 0.091 0.112 0.080 0.073 0.055 0.045 119 R 0.094 0.137 0.085 0.183 0.155 0.107 0.109 0.059 0.036 0.023 0.013 120 K 0.014 0.030 0.027 0.086 0.115 0.171 0.210 0.126 0.110 0.070 0.041 121 I 0.005 0.007 0.012 0.020 0.029 0.058 0.127 0.144 0.220 0.216 0.161 122 M 0.002 0.007 0.011 0.041 0.054 0.089 0.160 0.149 0.202 0.176 0.108 123 I 0.001 0.001 0.003 0.005 0.008 0.016 0.041 0.078 0.214 0.305 0.327 124 D 0.004 0.008 0.015 0.044 0.070 0.085 0.153 0.178 0.182 0.160 0.100 125 H 0.004 0.006 0.012 0.027 0.038 0.061 0.128 0.168 0.216 0.207 0.133 126 H 0.016 0.013 0.018 0.044 0.060 0.086 0.157 0.160 0.182 0.146 0.117 127 L 0.054 0.073 0.053 0.128 0.124 0.126 0.169 0.108 0.082 0.053 0.030 128 Y 0.058 0.080 0.042 0.100 0.101 0.109 0.160 0.118 0.102 0.078 0.051 129 P 0.278 0.219 0.050 0.130 0.086 0.067 0.072 0.038 0.028 0.020 0.012 130 E 0.484 0.185 0.052 0.111 0.062 0.037 0.031 0.017 0.011 0.007 0.005 131 D 0.350 0.179 0.047 0.128 0.089 0.069 0.060 0.034 0.022 0.014 0.008 132 F 0.049 0.064 0.024 0.077 0.079 0.109 0.152 0.126 0.131 0.115 0.074 133 C 0.067 0.075 0.040 0.108 0.113 0.132 0.154 0.112 0.093 0.067 0.039 134 R 0.178 0.185 0.107 0.221 0.122 0.067 0.051 0.032 0.020 0.012 0.006 135 I 0.043 0.027 0.023 0.062 0.074 0.102 0.154 0.143 0.155 0.132 0.087 136 T 0.075 0.076 0.036 0.123 0.116 0.113 0.138 0.112 0.096 0.071 0.046 137 I 0.037 0.037 0.031 0.078 0.091 0.112 0.152 0.134 0.138 0.112 0.078 138 S 0.048 0.035 0.028 0.055 0.067 0.083 0.141 0.135 0.158 0.135 0.114 139 H 0.097 0.149 0.058 0.172 0.130 0.097 0.110 0.068 0.055 0.039 0.025 140 P 0.191 0.118 0.051 0.147 0.119 0.093 0.103 0.069 0.052 0.033 0.023 141 E 0.382 0.213 0.051 0.131 0.075 0.049 0.041 0.024 0.017 0.011 0.007 142 I 0.038 0.043 0.024 0.087 0.096 0.111 0.176 0.143 0.129 0.089 0.065 143 S 0.075 0.085 0.057 0.142 0.135 0.139 0.141 0.080 0.066 0.043 0.038 144 S 0.008 0.012 0.023 0.033 0.048 0.060 0.139 0.151 0.211 0.157 0.158 145 T 0.006 0.014 0.025 0.055 0.084 0.055 0.127 0.163 0.176 0.145 0.151 146 S 0.001 0.001 0.004 0.007 0.011 0.017 0.050 0.105 0.222 0.281 0.301 147 E 0.011 0.027 0.057 0.152 0.179 0.138 0.162 0.107 0.081 0.048 0.038 148 L 0.001 0.002 0.008 0.012 0.029 0.016 0.071 0.236 0.173 0.198 0.254 149 V 0.001 0.001 0.002 0.005 0.011 0.013 0.037 0.098 0.207 0.337 0.289 150 F 0.001 0.001 0.004 0.008 0.022 0.062 0.177 0.144 0.249 0.225 0.107 151 R 0.002 0.011 0.135 0.175 0.172 0.149 0.166 0.082 0.059 0.034 0.014 152 L 0.001 0.001 0.009 0.008 0.013 0.039 0.136 0.120 0.236 0.274 0.164 153 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.008 0.024 0.031 0.205 0.337 0.391 154 C 0.003 0.007 0.035 0.055 0.102 0.177 0.269 0.126 0.112 0.079 0.035 155 R 0.004 0.018 0.133 0.105 0.100 0.188 0.184 0.093 0.078 0.070 0.026 156 M 0.003 0.006 0.009 0.018 0.027 0.101 0.219 0.158 0.194 0.164 0.100 157 G 0.143 0.089 0.043 0.120 0.105 0.100 0.146 0.109 0.068 0.048 0.030 158 Y 0.056 0.071 0.079 0.138 0.133 0.138 0.140 0.096 0.068 0.048 0.034 159 F 0.039 0.082 0.043 0.093 0.112 0.144 0.175 0.115 0.081 0.069 0.047 160 S 0.182 0.095 0.041 0.100 0.111 0.106 0.148 0.096 0.062 0.035 0.025 161 D 0.600 0.182 0.044 0.090 0.041 0.017 0.014 0.007 0.003 0.002 0.001 162 I 0.021 0.017 0.009 0.020 0.027 0.045 0.092 0.101 0.204 0.240 0.224 163 S 0.099 0.320 0.049 0.181 0.136 0.082 0.063 0.033 0.019 0.012 0.006 164 K 0.218 0.179 0.099 0.204 0.125 0.083 0.044 0.024 0.013 0.008 0.005 165 E 0.429 0.156 0.055 0.130 0.087 0.052 0.046 0.026 0.009 0.005 0.003 166 G 0.016 0.029 0.016 0.084 0.098 0.119 0.180 0.146 0.142 0.108 0.060 167 A 0.002 0.003 0.006 0.016 0.032 0.080 0.154 0.150 0.212 0.194 0.150 168 E 0.011 0.053 0.156 0.265 0.203 0.128 0.108 0.037 0.024 0.010 0.006 169 C 0.001 0.001 0.006 0.005 0.010 0.020 0.068 0.093 0.214 0.234 0.350 170 I 0.001 0.001 0.002 0.004 0.009 0.020 0.052 0.074 0.214 0.261 0.362 171 Y 0.001 0.001 0.006 0.012 0.024 0.043 0.115 0.137 0.238 0.243 0.181 172 T 0.001 0.001 0.009 0.011 0.024 0.041 0.110 0.174 0.217 0.234 0.178 173 G 0.001 0.002 0.005 0.009 0.014 0.026 0.077 0.132 0.240 0.298 0.197 174 M 0.001 0.001 0.003 0.006 0.011 0.020 0.060 0.129 0.233 0.273 0.262 175 M 0.003 0.005 0.012 0.031 0.054 0.074 0.142 0.208 0.182 0.163 0.127 176 T 0.003 0.004 0.017 0.020 0.030 0.039 0.092 0.160 0.203 0.233 0.199 177 D 0.004 0.008 0.016 0.031 0.047 0.089 0.182 0.159 0.189 0.160 0.115 178 T 0.024 0.043 0.048 0.094 0.099 0.106 0.158 0.119 0.135 0.096 0.078 179 G 0.177 0.099 0.068 0.132 0.123 0.111 0.137 0.065 0.046 0.025 0.017 180 G 0.183 0.139 0.068 0.171 0.118 0.083 0.103 0.055 0.037 0.025 0.016 181 F 0.041 0.031 0.020 0.047 0.058 0.094 0.152 0.131 0.155 0.158 0.114 182 T 0.132 0.268 0.083 0.203 0.129 0.071 0.051 0.028 0.017 0.011 0.007 183 Y 0.053 0.056 0.038 0.091 0.105 0.128 0.161 0.128 0.103 0.085 0.053 184 N 0.256 0.126 0.056 0.128 0.100 0.089 0.099 0.059 0.044 0.029 0.015 185 S 0.273 0.204 0.059 0.183 0.101 0.062 0.056 0.029 0.017 0.010 0.005 186 N 0.059 0.048 0.022 0.039 0.046 0.061 0.106 0.111 0.171 0.180 0.159 187 N 0.151 0.176 0.047 0.170 0.144 0.099 0.097 0.051 0.034 0.020 0.011 188 R 0.309 0.163 0.098 0.179 0.097 0.057 0.042 0.026 0.015 0.010 0.005 189 E 0.103 0.097 0.039 0.150 0.151 0.139 0.139 0.088 0.048 0.030 0.016 190 I 0.012 0.026 0.015 0.059 0.075 0.101 0.165 0.167 0.168 0.141 0.071 191 Y 0.012 0.012 0.024 0.061 0.098 0.179 0.228 0.137 0.120 0.085 0.045 192 F 0.027 0.046 0.139 0.201 0.164 0.136 0.137 0.069 0.040 0.028 0.012 193 I 0.001 0.001 0.004 0.006 0.010 0.036 0.089 0.093 0.254 0.312 0.194 194 I 0.001 0.001 0.002 0.006 0.015 0.037 0.096 0.118 0.243 0.260 0.223 195 S 0.043 0.054 0.220 0.233 0.165 0.105 0.087 0.045 0.028 0.015 0.006 196 E 0.016 0.025 0.070 0.162 0.176 0.202 0.214 0.075 0.034 0.015 0.009 197 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.017 0.042 0.163 0.267 0.501 198 L 0.007 0.008 0.011 0.046 0.101 0.141 0.249 0.171 0.126 0.086 0.053 199 S 0.036 0.152 0.372 0.200 0.094 0.060 0.036 0.018 0.015 0.011 0.006 200 K 0.040 0.039 0.034 0.103 0.147 0.189 0.231 0.110 0.057 0.031 0.021 201 G 0.666 0.109 0.024 0.047 0.026 0.020 0.033 0.028 0.022 0.017 0.008 202 I 0.067 0.047 0.025 0.091 0.098 0.157 0.189 0.116 0.100 0.071 0.040 203 D 0.061 0.358 0.090 0.131 0.095 0.075 0.067 0.044 0.033 0.028 0.015 204 K 0.087 0.086 0.033 0.123 0.161 0.167 0.172 0.089 0.047 0.023 0.013 205 D 0.836 0.069 0.033 0.032 0.012 0.006 0.006 0.003 0.001 0.001 0.001 206 D 0.067 0.070 0.043 0.221 0.182 0.151 0.151 0.060 0.031 0.015 0.008 207 I 0.002 0.005 0.006 0.009 0.016 0.020 0.051 0.100 0.217 0.275 0.300 208 Y 0.003 0.009 0.023 0.069 0.139 0.216 0.261 0.128 0.082 0.053 0.018 209 R 0.011 0.046 0.558 0.216 0.087 0.042 0.021 0.009 0.005 0.003 0.001 210 K 0.007 0.009 0.035 0.068 0.101 0.232 0.281 0.127 0.073 0.048 0.019 211 V 0.003 0.004 0.007 0.009 0.012 0.029 0.088 0.117 0.256 0.297 0.179 212 Y 0.012 0.026 0.050 0.089 0.114 0.163 0.243 0.123 0.091 0.066 0.022 213 N 0.077 0.095 0.333 0.191 0.117 0.079 0.061 0.022 0.014 0.008 0.003 214 T 0.298 0.199 0.139 0.155 0.085 0.050 0.044 0.019 0.007 0.004 0.002 215 Y 0.046 0.057 0.021 0.044 0.054 0.108 0.194 0.153 0.141 0.117 0.065 216 S 0.189 0.348 0.086 0.151 0.091 0.053 0.042 0.021 0.010 0.005 0.003 217 E 0.511 0.101 0.099 0.120 0.076 0.039 0.030 0.013 0.005 0.003 0.001 218 S 0.331 0.189 0.132 0.146 0.081 0.046 0.042 0.019 0.007 0.004 0.002 219 R 0.010 0.020 0.025 0.086 0.106 0.170 0.240 0.150 0.108 0.067 0.018 220 L 0.015 0.016 0.068 0.069 0.085 0.176 0.242 0.136 0.095 0.073 0.024 221 R 0.008 0.055 0.442 0.276 0.130 0.053 0.022 0.008 0.003 0.002 0.001 222 L 0.002 0.007 0.030 0.019 0.035 0.072 0.166 0.179 0.184 0.199 0.107 223 M 0.005 0.008 0.016 0.043 0.085 0.157 0.255 0.162 0.140 0.089 0.040 224 G 0.232 0.088 0.368 0.167 0.071 0.030 0.025 0.011 0.005 0.002 0.001 225 Y 0.018 0.019 0.089 0.118 0.141 0.215 0.244 0.081 0.043 0.022 0.011 226 V 0.002 0.003 0.008 0.006 0.010 0.018 0.068 0.101 0.240 0.264 0.282 227 L 0.008 0.012 0.041 0.072 0.136 0.192 0.265 0.126 0.078 0.049 0.020 228 S 0.027 0.093 0.586 0.168 0.069 0.032 0.015 0.005 0.003 0.002 0.001 229 N 0.039 0.049 0.078 0.143 0.151 0.152 0.207 0.105 0.044 0.023 0.010 230 M 0.057 0.025 0.025 0.042 0.051 0.098 0.222 0.163 0.151 0.114 0.052 231 K 0.100 0.153 0.328 0.236 0.107 0.039 0.021 0.009 0.004 0.002 0.001 232 V 0.024 0.029 0.145 0.116 0.121 0.159 0.186 0.101 0.059 0.045 0.015 233 Y 0.020 0.036 0.055 0.063 0.070 0.152 0.251 0.130 0.110 0.084 0.029 234 K 0.088 0.162 0.251 0.222 0.122 0.068 0.048 0.022 0.011 0.005 0.002 235 D 0.196 0.134 0.190 0.159 0.107 0.072 0.067 0.039 0.017 0.012 0.006 236 Y 0.107 0.085 0.060 0.105 0.101 0.121 0.175 0.105 0.072 0.048 0.021 237 N 0.302 0.212 0.102 0.147 0.087 0.055 0.048 0.025 0.012 0.006 0.003 238 S 0.126 0.082 0.113 0.157 0.144 0.119 0.114 0.069 0.039 0.024 0.015 239 A 0.082 0.083 0.081 0.123 0.121 0.113 0.163 0.105 0.067 0.042 0.021 240 L 0.013 0.020 0.034 0.069 0.092 0.134 0.199 0.146 0.140 0.102 0.053 241 I 0.028 0.036 0.097 0.110 0.119 0.148 0.178 0.113 0.086 0.056 0.029 242 S 0.047 0.069 0.143 0.216 0.169 0.116 0.117 0.059 0.035 0.018 0.011 243 L 0.008 0.006 0.016 0.018 0.032 0.049 0.130 0.164 0.207 0.194 0.176 244 T 0.049 0.087 0.104 0.177 0.158 0.113 0.132 0.074 0.053 0.034 0.016 245 K 0.089 0.092 0.189 0.198 0.144 0.100 0.093 0.045 0.027 0.015 0.008 246 E 0.197 0.131 0.146 0.172 0.125 0.085 0.074 0.036 0.018 0.010 0.005 247 E 0.099 0.139 0.083 0.139 0.106 0.100 0.143 0.086 0.054 0.034 0.015 248 Q 0.098 0.072 0.075 0.127 0.129 0.126 0.147 0.095 0.064 0.045 0.023 249 G 0.230 0.180 0.205 0.175 0.088 0.050 0.036 0.018 0.010 0.006 0.002 250 K 0.061 0.095 0.124 0.191 0.143 0.125 0.119 0.066 0.040 0.025 0.010 251 F 0.038 0.028 0.028 0.050 0.066 0.118 0.198 0.155 0.145 0.114 0.060 252 D 0.136 0.165 0.161 0.231 0.129 0.069 0.050 0.029 0.016 0.009 0.004 253 Y 0.046 0.026 0.048 0.070 0.083 0.120 0.180 0.144 0.125 0.099 0.057 254 I 0.059 0.085 0.048 0.102 0.097 0.110 0.164 0.116 0.098 0.076 0.046 255 K 0.124 0.135 0.080 0.170 0.147 0.107 0.104 0.060 0.038 0.022 0.013 256 G 0.508 0.128 0.055 0.096 0.065 0.043 0.043 0.028 0.016 0.010 0.007 257 D 0.174 0.144 0.037 0.133 0.107 0.088 0.111 0.077 0.061 0.042 0.026 258 S 0.086 0.086 0.024 0.074 0.085 0.091 0.138 0.122 0.121 0.102 0.072 259 E 0.168 0.123 0.066 0.188 0.155 0.111 0.080 0.048 0.031 0.019 0.012 260 G 0.136 0.096 0.068 0.148 0.122 0.110 0.133 0.082 0.055 0.033 0.017 261 F 0.006 0.012 0.010 0.036 0.050 0.068 0.127 0.141 0.208 0.176 0.167 262 V 0.003 0.004 0.005 0.015 0.027 0.042 0.094 0.134 0.220 0.229 0.227 263 N 0.039 0.072 0.122 0.208 0.174 0.120 0.097 0.061 0.052 0.036 0.020 264 I 0.011 0.012 0.020 0.052 0.084 0.117 0.214 0.184 0.140 0.098 0.068 265 P 0.021 0.019 0.019 0.043 0.047 0.052 0.101 0.125 0.194 0.211 0.169 266 L 0.019 0.016 0.019 0.054 0.079 0.124 0.216 0.151 0.149 0.109 0.063 267 S 0.075 0.162 0.139 0.210 0.134 0.088 0.074 0.043 0.037 0.025 0.014 268 I 0.025 0.031 0.025 0.067 0.092 0.132 0.205 0.136 0.121 0.098 0.067 269 K 0.278 0.180 0.075 0.156 0.098 0.068 0.064 0.035 0.023 0.015 0.008 270 N 0.128 0.150 0.075 0.210 0.134 0.105 0.098 0.045 0.028 0.017 0.010 271 V 0.010 0.012 0.013 0.027 0.043 0.073 0.128 0.118 0.185 0.199 0.193 272 C 0.027 0.057 0.047 0.142 0.164 0.131 0.168 0.110 0.075 0.055 0.024 273 F 0.002 0.006 0.013 0.032 0.049 0.122 0.195 0.149 0.191 0.171 0.070 274 S 0.001 0.003 0.005 0.014 0.023 0.049 0.111 0.135 0.229 0.236 0.194 275 C 0.001 0.001 0.003 0.008 0.015 0.031 0.090 0.140 0.241 0.250 0.221 276 F 0.001 0.001 0.004 0.007 0.013 0.019 0.051 0.097 0.195 0.267 0.346 277 L 0.001 0.001 0.002 0.004 0.008 0.018 0.046 0.079 0.226 0.324 0.293 278 R 0.003 0.007 0.011 0.037 0.067 0.144 0.246 0.147 0.170 0.114 0.053 279 E 0.034 0.057 0.078 0.152 0.136 0.144 0.184 0.096 0.064 0.036 0.019 280 D 0.069 0.120 0.057 0.118 0.098 0.159 0.191 0.078 0.055 0.038 0.018 281 T 0.279 0.330 0.042 0.111 0.066 0.050 0.055 0.029 0.018 0.013 0.008 282 E 0.507 0.308 0.028 0.074 0.034 0.020 0.014 0.008 0.004 0.002 0.001 283 K 0.531 0.174 0.043 0.104 0.062 0.036 0.023 0.013 0.007 0.005 0.003 284 K 0.203 0.189 0.071 0.174 0.122 0.097 0.075 0.040 0.016 0.009 0.004 285 M 0.016 0.032 0.031 0.108 0.131 0.176 0.179 0.127 0.099 0.066 0.034 286 I 0.002 0.004 0.009 0.010 0.017 0.051 0.126 0.135 0.234 0.243 0.170 287 K 0.006 0.036 0.098 0.274 0.240 0.142 0.094 0.050 0.032 0.018 0.010 288 I 0.002 0.002 0.008 0.007 0.011 0.024 0.067 0.110 0.230 0.292 0.248 289 S 0.006 0.015 0.016 0.091 0.143 0.139 0.191 0.166 0.111 0.068 0.054 290 L 0.004 0.003 0.006 0.007 0.010 0.016 0.048 0.098 0.211 0.282 0.314 291 R 0.015 0.022 0.035 0.114 0.173 0.156 0.181 0.124 0.080 0.056 0.044 292 S 0.019 0.040 0.034 0.053 0.058 0.074 0.151 0.141 0.176 0.152 0.102 293 V 0.098 0.106 0.035 0.161 0.161 0.126 0.122 0.074 0.052 0.038 0.027 294 G 0.346 0.204 0.054 0.117 0.075 0.057 0.065 0.036 0.024 0.014 0.007 295 K 0.199 0.166 0.049 0.220 0.144 0.097 0.066 0.029 0.016 0.009 0.005 296 F 0.024 0.011 0.010 0.015 0.021 0.039 0.087 0.109 0.195 0.223 0.267 297 P 0.031 0.142 0.039 0.259 0.249 0.119 0.086 0.042 0.018 0.009 0.006 298 C 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.007 0.021 0.050 0.178 0.267 0.469 299 N 0.012 0.014 0.027 0.134 0.242 0.209 0.196 0.090 0.043 0.021 0.012 300 R 0.020 0.041 0.160 0.255 0.160 0.124 0.130 0.054 0.031 0.018 0.007 301 L 0.001 0.001 0.002 0.003 0.005 0.023 0.055 0.062 0.224 0.273 0.352 302 A 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.010 0.037 0.062 0.222 0.312 0.350 303 A 0.005 0.017 0.177 0.183 0.185 0.162 0.131 0.058 0.043 0.029 0.010 304 E 0.005 0.024 0.156 0.165 0.145 0.216 0.164 0.056 0.036 0.020 0.011 305 F 0.001 0.002 0.003 0.005 0.008 0.025 0.069 0.108 0.212 0.249 0.317 306 F 0.014 0.017 0.014 0.040 0.063 0.094 0.185 0.175 0.166 0.131 0.101 307 N 0.060 0.081 0.151 0.181 0.143 0.108 0.104 0.064 0.050 0.033 0.022 308 G 0.037 0.027 0.033 0.055 0.069 0.103 0.183 0.140 0.140 0.118 0.095 309 G 0.036 0.040 0.018 0.062 0.070 0.091 0.159 0.154 0.152 0.123 0.094 310 G 0.017 0.022 0.019 0.044 0.057 0.069 0.119 0.147 0.172 0.171 0.163 311 H 0.005 0.008 0.012 0.036 0.061 0.072 0.126 0.172 0.183 0.173 0.151 312 L 0.014 0.019 0.021 0.061 0.081 0.093 0.164 0.169 0.165 0.131 0.082 313 N 0.011 0.019 0.024 0.081 0.108 0.120 0.214 0.148 0.128 0.082 0.064 314 A 0.003 0.004 0.009 0.016 0.024 0.033 0.065 0.094 0.184 0.247 0.322 315 S 0.004 0.006 0.009 0.019 0.031 0.054 0.125 0.144 0.244 0.216 0.148 316 G 0.037 0.049 0.040 0.140 0.143 0.108 0.149 0.100 0.104 0.067 0.063 317 G 0.005 0.003 0.006 0.007 0.011 0.016 0.045 0.083 0.188 0.223 0.413 318 E 0.045 0.106 0.052 0.233 0.227 0.118 0.100 0.055 0.034 0.017 0.013 319 F 0.006 0.008 0.009 0.015 0.025 0.027 0.082 0.147 0.190 0.198 0.294 320 Y 0.130 0.147 0.073 0.217 0.184 0.103 0.072 0.033 0.020 0.012 0.008 321 G 0.502 0.109 0.055 0.109 0.071 0.049 0.055 0.025 0.015 0.008 0.004 322 T 0.071 0.452 0.045 0.142 0.090 0.076 0.062 0.028 0.017 0.011 0.006 323 M 0.019 0.036 0.012 0.043 0.081 0.125 0.233 0.145 0.152 0.088 0.065 324 E 0.922 0.026 0.027 0.017 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 325 E 0.044 0.097 0.176 0.367 0.181 0.079 0.043 0.009 0.003 0.001 0.001 326 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.004 0.020 0.061 0.212 0.310 0.388 327 V 0.001 0.001 0.009 0.032 0.123 0.307 0.371 0.096 0.038 0.018 0.004 328 K 0.001 0.003 0.968 0.025 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 329 V 0.001 0.002 0.020 0.041 0.084 0.370 0.374 0.079 0.019 0.009 0.002 330 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.015 0.050 0.249 0.350 0.334 331 E 0.006 0.007 0.190 0.131 0.268 0.201 0.157 0.030 0.007 0.002 0.001 332 Q 0.001 0.003 0.960 0.028 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 333 A 0.001 0.002 0.015 0.014 0.032 0.221 0.479 0.128 0.068 0.032 0.007 334 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.007 0.052 0.089 0.266 0.356 0.226 335 E 0.003 0.017 0.731 0.149 0.069 0.021 0.007 0.002 0.001 0.001 0.001 336 K 0.006 0.024 0.730 0.127 0.068 0.029 0.012 0.003 0.001 0.001 0.001 337 Y 0.013 0.016 0.026 0.021 0.037 0.085 0.227 0.228 0.151 0.116 0.080 338 K 0.127 0.083 0.059 0.100 0.119 0.120 0.183 0.111 0.055 0.030 0.013 339 P 0.334 0.145 0.314 0.136 0.046 0.012 0.007 0.003 0.001 0.001 0.001 340 L 0.141 0.060 0.087 0.081 0.091 0.098 0.199 0.102 0.072 0.044 0.025 341 L 0.103 0.165 0.060 0.106 0.091 0.107 0.166 0.088 0.061 0.037 0.016 342 K 0.163 0.299 0.200 0.194 0.082 0.033 0.015 0.007 0.004 0.002 0.001 343 E 0.491 0.131 0.086 0.108 0.073 0.039 0.036 0.021 0.008 0.004 0.002