# TARGET T0497 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0497.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 152 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.001 0.001 0.002 0.006 0.004 0.005 0.980 2 A 0.010 0.019 0.010 0.052 0.017 0.037 0.856 3 D 0.004 0.008 0.013 0.081 0.128 0.059 0.707 4 P 0.001 0.001 0.035 0.541 0.130 0.106 0.185 5 K 0.001 0.001 0.024 0.754 0.062 0.097 0.061 6 E 0.001 0.001 0.020 0.857 0.027 0.046 0.047 7 L 0.001 0.001 0.008 0.917 0.010 0.026 0.037 8 Q 0.001 0.001 0.002 0.968 0.007 0.012 0.010 9 D 0.001 0.001 0.001 0.981 0.004 0.007 0.006 10 K 0.001 0.001 0.001 0.985 0.002 0.008 0.005 11 F 0.001 0.001 0.001 0.989 0.001 0.006 0.003 12 W 0.001 0.001 0.002 0.990 0.001 0.005 0.001 13 K 0.001 0.001 0.002 0.983 0.001 0.014 0.001 14 A 0.001 0.001 0.004 0.964 0.001 0.027 0.003 15 L 0.001 0.002 0.024 0.889 0.007 0.062 0.015 16 K 0.001 0.001 0.042 0.360 0.018 0.571 0.007 17 S 0.002 0.002 0.035 0.085 0.046 0.788 0.042 18 D 0.013 0.004 0.002 0.004 0.205 0.016 0.756 19 R 0.075 0.001 0.001 0.001 0.678 0.015 0.230 20 T 0.944 0.009 0.001 0.001 0.015 0.002 0.029 21 V 0.989 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 22 M 0.996 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 23 L 0.987 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 24 G 0.914 0.001 0.001 0.001 0.010 0.001 0.073 25 L 0.763 0.007 0.002 0.001 0.033 0.003 0.192 26 D 0.582 0.072 0.005 0.001 0.071 0.014 0.255 27 G 0.236 0.020 0.015 0.002 0.071 0.069 0.587 28 V 0.048 0.008 0.016 0.002 0.213 0.598 0.115 29 E 0.013 0.004 0.012 0.001 0.303 0.597 0.070 30 D 0.031 0.009 0.003 0.002 0.683 0.044 0.227 31 G 0.104 0.071 0.006 0.008 0.115 0.032 0.664 32 H 0.270 0.091 0.050 0.041 0.094 0.101 0.353 33 A 0.212 0.022 0.091 0.080 0.116 0.130 0.350 34 R 0.196 0.025 0.085 0.104 0.201 0.089 0.299 35 P 0.199 0.024 0.040 0.112 0.165 0.044 0.416 36 M 0.230 0.019 0.059 0.089 0.078 0.072 0.453 37 T 0.312 0.028 0.109 0.099 0.077 0.098 0.277 38 A 0.293 0.020 0.144 0.080 0.105 0.068 0.291 39 Q 0.263 0.013 0.181 0.100 0.066 0.075 0.301 40 I 0.287 0.021 0.097 0.098 0.068 0.063 0.367 41 E 0.239 0.024 0.069 0.072 0.053 0.050 0.493 42 G 0.204 0.022 0.069 0.084 0.102 0.114 0.406 43 D 0.095 0.013 0.084 0.066 0.176 0.285 0.281 44 S 0.044 0.005 0.049 0.029 0.225 0.536 0.113 45 G 0.052 0.004 0.020 0.008 0.259 0.506 0.153 46 G 0.231 0.007 0.006 0.002 0.320 0.081 0.352 47 P 0.721 0.014 0.002 0.001 0.023 0.007 0.232 48 I 0.937 0.005 0.001 0.001 0.006 0.002 0.049 49 W 0.970 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.023 50 F 0.965 0.002 0.001 0.001 0.004 0.001 0.026 51 F 0.889 0.007 0.001 0.001 0.012 0.002 0.089 52 T 0.549 0.020 0.001 0.002 0.057 0.008 0.364 53 S 0.114 0.014 0.022 0.015 0.283 0.113 0.440 54 K 0.015 0.008 0.058 0.044 0.250 0.472 0.153 55 D 0.005 0.005 0.071 0.116 0.235 0.425 0.143 56 N 0.004 0.005 0.028 0.392 0.266 0.113 0.193 57 A 0.004 0.006 0.029 0.658 0.063 0.124 0.115 58 L 0.005 0.008 0.026 0.790 0.035 0.065 0.071 59 I 0.008 0.004 0.023 0.871 0.019 0.029 0.045 60 A 0.006 0.001 0.031 0.908 0.012 0.024 0.018 61 M 0.007 0.001 0.032 0.911 0.009 0.025 0.016 62 L 0.004 0.003 0.057 0.891 0.007 0.023 0.015 63 G 0.007 0.001 0.039 0.813 0.015 0.112 0.013 64 Q 0.005 0.002 0.035 0.531 0.027 0.374 0.026 65 G 0.008 0.003 0.012 0.030 0.240 0.067 0.639 66 R 0.013 0.003 0.021 0.009 0.302 0.406 0.245 67 R 0.092 0.003 0.022 0.003 0.324 0.427 0.130 68 V 0.670 0.013 0.003 0.001 0.022 0.005 0.287 69 I 0.966 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.026 70 G 0.990 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 71 A 0.982 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.016 72 F 0.971 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.023 73 S 0.872 0.004 0.001 0.001 0.019 0.002 0.103 74 S 0.399 0.009 0.003 0.001 0.075 0.014 0.499 75 K 0.031 0.003 0.056 0.003 0.182 0.663 0.062 76 G 0.015 0.003 0.089 0.002 0.145 0.707 0.038 77 H 0.062 0.004 0.086 0.002 0.239 0.481 0.125 78 D 0.201 0.009 0.021 0.001 0.268 0.204 0.296 79 L 0.619 0.011 0.004 0.001 0.126 0.020 0.220 80 F 0.932 0.011 0.001 0.001 0.011 0.003 0.043 81 A 0.975 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.020 82 S 0.984 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.011 83 I 0.966 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.028 84 S 0.931 0.001 0.001 0.001 0.015 0.011 0.042 85 G 0.877 0.003 0.001 0.001 0.042 0.010 0.067 86 S 0.891 0.004 0.001 0.001 0.023 0.002 0.079 87 L 0.914 0.004 0.001 0.001 0.007 0.001 0.074 88 R 0.964 0.003 0.001 0.001 0.011 0.001 0.021 89 E 0.950 0.006 0.001 0.001 0.005 0.002 0.036 90 D 0.869 0.004 0.002 0.002 0.027 0.012 0.085 91 T 0.487 0.024 0.002 0.006 0.175 0.017 0.289 92 D 0.053 0.005 0.001 0.011 0.099 0.009 0.821 93 P 0.002 0.001 0.066 0.789 0.036 0.079 0.028 94 A 0.001 0.001 0.053 0.873 0.021 0.044 0.007 95 V 0.001 0.001 0.069 0.882 0.010 0.030 0.008 96 V 0.001 0.001 0.031 0.924 0.008 0.023 0.011 97 D 0.002 0.001 0.045 0.861 0.011 0.071 0.009 98 R 0.004 0.001 0.069 0.673 0.012 0.229 0.012 99 L 0.004 0.005 0.071 0.471 0.029 0.380 0.039 100 W 0.013 0.022 0.055 0.335 0.158 0.196 0.221 101 N 0.010 0.005 0.038 0.197 0.136 0.042 0.573 102 P 0.003 0.002 0.179 0.681 0.029 0.068 0.038 103 Y 0.003 0.002 0.245 0.602 0.022 0.099 0.026 104 V 0.005 0.003 0.266 0.612 0.023 0.058 0.034 105 A 0.011 0.002 0.281 0.562 0.018 0.079 0.047 106 A 0.015 0.002 0.289 0.363 0.026 0.271 0.034 107 W 0.024 0.009 0.246 0.343 0.070 0.238 0.069 108 Y 0.041 0.030 0.119 0.070 0.236 0.071 0.434 109 E 0.012 0.008 0.163 0.032 0.088 0.621 0.076 110 G 0.015 0.006 0.121 0.013 0.079 0.699 0.068 111 G 0.038 0.015 0.115 0.004 0.099 0.056 0.673 112 K 0.018 0.008 0.078 0.004 0.063 0.739 0.090 113 D 0.006 0.005 0.054 0.002 0.071 0.818 0.044 114 D 0.015 0.022 0.045 0.001 0.180 0.036 0.701 115 P 0.003 0.004 0.037 0.001 0.047 0.886 0.022 116 K 0.003 0.001 0.015 0.001 0.022 0.956 0.004 117 L 0.438 0.036 0.009 0.001 0.028 0.015 0.473 118 A 0.927 0.007 0.001 0.001 0.003 0.001 0.063 119 L 0.990 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.006 120 L 0.994 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 121 R 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 122 L 0.971 0.002 0.001 0.001 0.002 0.001 0.025 123 D 0.635 0.004 0.001 0.001 0.009 0.001 0.350 124 A 0.079 0.002 0.187 0.012 0.152 0.513 0.055 125 D 0.025 0.003 0.242 0.010 0.179 0.525 0.016 126 H 0.216 0.009 0.313 0.014 0.102 0.200 0.146 127 A 0.721 0.008 0.009 0.005 0.019 0.025 0.212 128 Q 0.917 0.008 0.002 0.003 0.017 0.009 0.043 129 I 0.960 0.005 0.001 0.002 0.007 0.003 0.024 130 W 0.911 0.006 0.002 0.005 0.012 0.005 0.059 131 L 0.722 0.016 0.004 0.006 0.053 0.019 0.180 132 N 0.210 0.004 0.007 0.009 0.221 0.196 0.354 133 G 0.038 0.003 0.008 0.009 0.360 0.370 0.211 134 S 0.015 0.003 0.018 0.042 0.420 0.355 0.148 135 S 0.078 0.016 0.012 0.134 0.289 0.112 0.359 136 L 0.061 0.013 0.017 0.755 0.038 0.031 0.085 137 L 0.046 0.005 0.006 0.884 0.012 0.010 0.038 138 A 0.058 0.003 0.007 0.899 0.006 0.009 0.018 139 G 0.048 0.001 0.005 0.921 0.006 0.009 0.010 140 I 0.088 0.001 0.007 0.876 0.007 0.007 0.015 141 K 0.086 0.001 0.010 0.866 0.017 0.007 0.013 142 V 0.095 0.001 0.013 0.846 0.015 0.014 0.016 143 L 0.049 0.002 0.029 0.816 0.018 0.050 0.036 144 L 0.056 0.003 0.022 0.557 0.040 0.262 0.059 145 G 0.028 0.007 0.022 0.194 0.003 0.479 0.268 146 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997