# TARGET T0496 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0496.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 20.5976 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.016 0.002 0.016 0.036 0.075 0.114 0.016 0.724 2 N 0.030 0.005 0.020 0.050 0.092 0.101 0.040 0.662 3 T 0.049 0.028 0.027 0.060 0.085 0.122 0.048 0.580 4 P 0.028 0.030 0.044 0.057 0.085 0.112 0.056 0.588 5 V 0.032 0.054 0.046 0.072 0.055 0.090 0.056 0.596 6 S 0.098 0.364 0.032 0.033 0.039 0.049 0.126 0.259 7 V 0.082 0.468 0.019 0.015 0.020 0.040 0.074 0.280 8 N 0.039 0.604 0.013 0.021 0.018 0.034 0.084 0.187 9 E 0.014 0.795 0.005 0.005 0.006 0.018 0.041 0.115 10 K 0.015 0.906 0.001 0.002 0.003 0.007 0.042 0.024 11 K 0.006 0.927 0.001 0.002 0.002 0.004 0.042 0.016 12 D 0.002 0.947 0.001 0.002 0.004 0.004 0.026 0.014 13 F 0.001 0.968 0.002 0.001 0.002 0.002 0.019 0.005 14 V 0.005 0.925 0.003 0.003 0.003 0.002 0.053 0.005 15 K 0.013 0.331 0.015 0.008 0.008 0.008 0.594 0.023 16 W 0.017 0.436 0.035 0.014 0.013 0.020 0.404 0.060 17 F 0.140 0.433 0.072 0.019 0.030 0.049 0.098 0.159 18 L 0.145 0.090 0.060 0.025 0.024 0.078 0.106 0.471 19 N 0.053 0.113 0.014 0.010 0.017 0.077 0.031 0.686 20 N 0.047 0.082 0.020 0.010 0.021 0.097 0.029 0.693 21 Y 0.044 0.099 0.036 0.054 0.035 0.145 0.045 0.542 22 Q 0.070 0.099 0.038 0.036 0.037 0.077 0.077 0.566 23 L 0.078 0.079 0.040 0.020 0.018 0.083 0.074 0.609 24 K 0.123 0.170 0.024 0.022 0.018 0.049 0.246 0.348 25 Q 0.071 0.386 0.006 0.006 0.010 0.036 0.059 0.427 26 R 0.013 0.516 0.010 0.011 0.023 0.063 0.069 0.294 27 E 0.003 0.813 0.008 0.020 0.031 0.016 0.038 0.072 28 C 0.004 0.868 0.005 0.010 0.025 0.008 0.057 0.024 29 V 0.003 0.626 0.024 0.036 0.030 0.008 0.254 0.019 30 W 0.003 0.833 0.020 0.031 0.033 0.003 0.069 0.008 31 I 0.007 0.898 0.025 0.009 0.014 0.004 0.030 0.012 32 L 0.018 0.716 0.091 0.026 0.026 0.010 0.082 0.031 33 N 0.053 0.266 0.111 0.043 0.037 0.028 0.377 0.085 34 Y 0.071 0.245 0.059 0.011 0.014 0.051 0.382 0.167 35 L 0.180 0.313 0.053 0.015 0.019 0.072 0.104 0.243 36 M 0.045 0.133 0.019 0.011 0.011 0.094 0.047 0.640 37 S 0.015 0.414 0.006 0.002 0.004 0.047 0.040 0.472 38 H 0.049 0.814 0.004 0.002 0.002 0.016 0.045 0.068 39 D 0.080 0.623 0.015 0.008 0.005 0.040 0.115 0.115 40 Q 0.094 0.429 0.035 0.011 0.010 0.049 0.142 0.230 41 L 0.433 0.209 0.028 0.008 0.012 0.040 0.078 0.192 42 M 0.236 0.055 0.023 0.007 0.013 0.085 0.102 0.480 43 H 0.011 0.024 0.010 0.007 0.013 0.070 0.020 0.844 44 K 0.014 0.048 0.035 0.017 0.053 0.134 0.031 0.668 45 V 0.031 0.112 0.071 0.067 0.080 0.134 0.051 0.454 46 H 0.019 0.086 0.313 0.126 0.145 0.068 0.061 0.181 47 F 0.044 0.251 0.139 0.063 0.079 0.045 0.085 0.293 48 V 0.152 0.245 0.159 0.084 0.052 0.034 0.124 0.149 49 E 0.115 0.077 0.122 0.059 0.052 0.061 0.088 0.425 50 H 0.234 0.053 0.022 0.018 0.026 0.056 0.075 0.517 51 A 0.143 0.015 0.018 0.023 0.020 0.069 0.063 0.649 52 K 0.012 0.006 0.012 0.025 0.050 0.131 0.039 0.725 53 Y 0.009 0.003 0.007 0.008 0.013 0.070 0.021 0.869 54 C 0.266 0.028 0.016 0.035 0.024 0.134 0.077 0.420 55 P 0.062 0.032 0.020 0.013 0.027 0.101 0.047 0.697 56 R 0.015 0.029 0.116 0.040 0.196 0.136 0.051 0.419 57 G 0.004 0.017 0.223 0.080 0.266 0.049 0.146 0.216 58 L 0.003 0.024 0.244 0.321 0.242 0.026 0.060 0.081 59 V 0.004 0.017 0.374 0.189 0.262 0.019 0.064 0.071 60 M 0.008 0.018 0.297 0.236 0.225 0.031 0.079 0.106 61 S 0.108 0.053 0.208 0.150 0.178 0.047 0.099 0.157 62 A 0.081 0.027 0.073 0.087 0.129 0.085 0.095 0.422 63 N 0.023 0.012 0.057 0.067 0.126 0.094 0.058 0.564 64 C 0.125 0.011 0.024 0.049 0.075 0.086 0.088 0.542 65 V 0.119 0.011 0.017 0.047 0.037 0.112 0.060 0.598 66 K 0.020 0.009 0.009 0.015 0.034 0.089 0.011 0.813 67 D 0.024 0.013 0.008 0.010 0.022 0.068 0.016 0.840 68 T 0.070 0.095 0.028 0.107 0.075 0.108 0.064 0.453 69 P 0.060 0.152 0.036 0.045 0.092 0.085 0.046 0.484 70 F 0.074 0.151 0.042 0.108 0.143 0.060 0.065 0.358 71 H 0.025 0.067 0.100 0.196 0.211 0.058 0.081 0.263 72 F 0.016 0.030 0.108 0.099 0.173 0.077 0.159 0.337 73 F 0.156 0.045 0.130 0.114 0.108 0.065 0.164 0.219 74 K 0.309 0.034 0.029 0.027 0.038 0.062 0.056 0.445 75 Q 0.022 0.005 0.015 0.010 0.032 0.085 0.048 0.783 76 N 0.010 0.006 0.051 0.040 0.112 0.135 0.183 0.463 77 V 0.011 0.011 0.062 0.103 0.132 0.125 0.074 0.484 78 M 0.027 0.024 0.074 0.068 0.068 0.108 0.029 0.601 79 T 0.021 0.081 0.078 0.059 0.064 0.100 0.071 0.526 80 T 0.042 0.180 0.041 0.015 0.019 0.094 0.064 0.546 81 D 0.108 0.407 0.010 0.008 0.005 0.026 0.354 0.083 82 A 0.041 0.633 0.005 0.003 0.003 0.021 0.216 0.078 83 E 0.036 0.712 0.005 0.004 0.008 0.024 0.108 0.103 84 K 0.024 0.670 0.010 0.018 0.022 0.039 0.076 0.141 85 S 0.046 0.729 0.009 0.007 0.023 0.043 0.039 0.103 86 F 0.058 0.598 0.022 0.018 0.034 0.040 0.101 0.129 87 H 0.083 0.346 0.039 0.046 0.071 0.064 0.076 0.275 88 D 0.088 0.070 0.090 0.063 0.112 0.083 0.246 0.248 89 I 0.117 0.048 0.057 0.064 0.068 0.122 0.081 0.442 90 R 0.023 0.008 0.068 0.097 0.125 0.085 0.028 0.565 91 L 0.005 0.002 0.008 0.010 0.014 0.081 0.014 0.866 92 N 0.253 0.021 0.031 0.055 0.038 0.098 0.167 0.338 93 R 0.284 0.008 0.005 0.006 0.010 0.081 0.022 0.585 94 D 0.266 0.016 0.005 0.004 0.008 0.057 0.032 0.613 95 E 0.047 0.016 0.024 0.025 0.073 0.220 0.034 0.561 96 D 0.003 0.005 0.041 0.030 0.160 0.117 0.043 0.601 97 I 0.002 0.006 0.157 0.233 0.406 0.039 0.047 0.109 98 Y 0.001 0.003 0.139 0.232 0.401 0.020 0.077 0.128 99 I 0.001 0.003 0.160 0.492 0.292 0.007 0.020 0.025 100 Q 0.003 0.005 0.274 0.193 0.401 0.015 0.021 0.087 101 L 0.003 0.004 0.225 0.354 0.307 0.018 0.027 0.062 102 N 0.011 0.020 0.197 0.190 0.271 0.047 0.106 0.157 103 F 0.089 0.070 0.088 0.116 0.149 0.072 0.172 0.243 104 K 0.220 0.094 0.024 0.037 0.040 0.084 0.065 0.436 105 S 0.087 0.054 0.016 0.013 0.016 0.065 0.244 0.504 106 S 0.075 0.167 0.011 0.007 0.011 0.112 0.074 0.544 107 F 0.047 0.090 0.013 0.011 0.013 0.136 0.090 0.600 108 Q 0.038 0.328 0.007 0.006 0.006 0.079 0.053 0.482 109 N 0.072 0.817 0.001 0.001 0.002 0.011 0.046 0.051 110 A 0.024 0.785 0.008 0.004 0.005 0.027 0.047 0.100 111 N 0.012 0.816 0.013 0.008 0.016 0.016 0.054 0.066 112 Y 0.026 0.872 0.010 0.004 0.006 0.010 0.041 0.030 113 V 0.052 0.711 0.034 0.015 0.021 0.021 0.077 0.070 114 A 0.054 0.309 0.115 0.056 0.053 0.051 0.109 0.253 115 V 0.096 0.101 0.095 0.036 0.059 0.084 0.176 0.353 116 L 0.432 0.045 0.056 0.026 0.026 0.074 0.106 0.235 117 E 0.026 0.009 0.017 0.017 0.024 0.091 0.028 0.789 118 E 0.011 0.003 0.003 0.002 0.003 0.044 0.005 0.930 119 N 0.434 0.028 0.009 0.015 0.010 0.088 0.069 0.348 120 P 0.041 0.016 0.011 0.009 0.012 0.160 0.022 0.730 121 Y 0.031 0.014 0.009 0.003 0.008 0.071 0.015 0.849 122 L 0.182 0.096 0.016 0.025 0.018 0.121 0.044 0.500 123 P 0.077 0.123 0.017 0.012 0.021 0.092 0.046 0.611 124 K 0.093 0.198 0.020 0.019 0.039 0.083 0.050 0.499 125 H 0.064 0.146 0.038 0.039 0.056 0.090 0.179 0.388 126 I 0.047 0.264 0.034 0.046 0.052 0.084 0.084 0.389 127 E 0.061 0.307 0.030 0.039 0.057 0.078 0.057 0.371 128 V 0.056 0.290 0.020 0.019 0.022 0.076 0.074 0.443 129 N 0.077 0.654 0.007 0.007 0.009 0.028 0.077 0.142 130 E 0.036 0.780 0.003 0.004 0.004 0.019 0.032 0.123 131 K 0.009 0.910 0.001 0.001 0.002 0.008 0.017 0.051 132 D 0.006 0.970 0.001 0.001 0.001 0.002 0.013 0.008 133 R 0.005 0.963 0.001 0.001 0.001 0.002 0.021 0.008 134 L 0.007 0.920 0.003 0.001 0.001 0.003 0.049 0.015 135 L 0.015 0.950 0.003 0.001 0.001 0.002 0.024 0.005 136 A 0.014 0.958 0.001 0.001 0.001 0.001 0.017 0.008 137 E 0.012 0.925 0.004 0.001 0.001 0.003 0.027 0.030 138 R 0.016 0.897 0.004 0.001 0.001 0.008 0.025 0.049 139 F 0.052 0.323 0.022 0.001 0.001 0.023 0.512 0.067 140 L 0.044 0.634 0.007 0.001 0.001 0.016 0.232 0.067 141 E 0.062 0.724 0.003 0.001 0.001 0.014 0.039 0.158 142 E 0.023 0.328 0.015 0.002 0.002 0.047 0.305 0.278 143 S 0.015 0.554 0.014 0.002 0.003 0.047 0.245 0.120 144 V 0.030 0.853 0.004 0.001 0.001 0.015 0.024 0.073 145 F 0.009 0.921 0.004 0.001 0.001 0.009 0.015 0.041 146 S 0.007 0.924 0.003 0.001 0.001 0.007 0.029 0.029 147 F 0.006 0.953 0.002 0.001 0.001 0.003 0.026 0.009 148 R 0.006 0.968 0.001 0.001 0.001 0.001 0.019 0.004 149 R 0.005 0.946 0.002 0.001 0.001 0.001 0.041 0.005 150 E 0.003 0.978 0.002 0.001 0.001 0.001 0.011 0.006 151 R 0.034 0.776 0.030 0.001 0.001 0.007 0.125 0.027 152 L 0.076 0.729 0.006 0.001 0.001 0.009 0.146 0.033 153 L 0.125 0.444 0.008 0.001 0.001 0.014 0.303 0.106 154 K 0.012 0.734 0.003 0.001 0.001 0.018 0.034 0.197 155 Q 0.010 0.802 0.007 0.001 0.001 0.021 0.018 0.140 156 I 0.045 0.787 0.010 0.001 0.001 0.016 0.094 0.047 157 D 0.043 0.898 0.011 0.001 0.001 0.003 0.032 0.011 158 E 0.068 0.860 0.009 0.001 0.001 0.005 0.011 0.046 159 A 0.214 0.312 0.172 0.002 0.001 0.032 0.117 0.150 160 L 0.181 0.254 0.058 0.002 0.001 0.050 0.121 0.332 161 D 0.253 0.217 0.010 0.001 0.001 0.036 0.024 0.460 162 K 0.025 0.170 0.012 0.001 0.001 0.082 0.019 0.690 163 Q 0.012 0.195 0.005 0.001 0.001 0.058 0.050 0.680 164 D 0.022 0.957 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.008 165 K 0.006 0.981 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.007 166 E 0.005 0.964 0.003 0.001 0.001 0.002 0.008 0.017 167 A 0.016 0.943 0.001 0.001 0.001 0.004 0.022 0.013 168 F 0.012 0.158 0.004 0.001 0.001 0.005 0.808 0.012 169 H 0.004 0.719 0.001 0.001 0.001 0.006 0.247 0.020 170 R 0.002 0.947 0.001 0.001 0.001 0.004 0.009 0.035 171 L 0.004 0.953 0.002 0.001 0.001 0.005 0.018 0.017 172 T 0.024 0.894 0.005 0.001 0.001 0.003 0.066 0.007 173 A 0.034 0.903 0.005 0.001 0.001 0.005 0.017 0.034 174 E 0.141 0.623 0.027 0.003 0.004 0.021 0.073 0.108 175 L 0.263 0.121 0.043 0.005 0.004 0.057 0.291 0.216 176 K 0.059 0.065 0.018 0.008 0.007 0.062 0.081 0.701 177 M 0.021 0.019 0.012 0.002 0.004 0.059 0.029 0.856 178 L 0.052 0.031 0.026 0.018 0.017 0.180 0.082 0.594