This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 1 NATAA M A 2 2 NATRO P A 3 3 NATAA M A 4 4 NATAA T A 5 5 NATAA L A 6 6 NATAA D A 7 7 NATAA L A 8 8 NATAA Q A 9 9 NATRO P A 10 10 NATAA G A 11 11 NATAA Q A 12 12 NATAA R A 13 13 NATAA L A 14 14 NATAA A A 15 15 NATAA R A 16 16 NATAA G A 17 17 NATAA V A 18 18 NATAA A A 19 19 NATAA R A 20 20 NATAA H A 21 21 NATAA L A 22 22 NATAA R A 23 23 NATAA A A 24 24 NATAA H A 25 25 NATAA G A 26 26 NATAA F A 27 27 NATAA V A 28 28 NATAA S A 29 29 NATAA V A 30 30 NATAA E A 31 31 NATAA E A 32 32 NATAA F A 33 33 NATAA V A 34 34 NATRO P A 35 35 NATAA A A 36 36 NATAA R A 37 37 NATAA G A 38 38 NATAA L A 39 39 NATAA R A 40 40 NATAA V A 41 41 NATAA D A 42 42 NATAA V A 43 43 NATAA M A 44 44 NATAA G A 45 45 NATAA L A 46 46 NATAA G A 47 47 NATRO P A 48 48 NATAA K A 49 49 NATAA G A 50 50 NATAA E A 51 51 NATAA I A 52 52 NATAA W A 53 53 NATAA V A 54 54 NATAA I A 55 55 NATAA E A 56 56 NATRO C A 57 57 NATAA K A 58 58 NATAA S A 59 59 NATAA S A 60 60 NATAA R A 61 61 NATAA A A 62 62 NATAA D A 63 63 NATAA F A 64 64 NATAA Q A 65 65 NATAA A A 66 66 NATAA D A 67 67 NATAA A A 68 68 NATAA K A 69 69 NATAA W A 70 70 NATAA Q A 71 71 NATAA G A 72 72 NATAA Y A 73 73 NATAA L A 74 74 NATAA E A 75 75 NATAA W A 76 76 NATRO C A 77 77 NATAA D A 78 78 NATAA R A 79 79 NATAA Y A 80 80 NATAA F A 81 81 NATAA W A 82 82 NATAA A A 83 83 NATAA V A 84 84 NATAA D A 85 85 NATAA M A 86 86 NATAA E A 87 87 NATAA F A 88 88 NATRO P A 89 89 NATAA A A 90 90 NATAA E A 91 91 NATAA L A 92 92 NATAA L A 93 93 NATRO P A 94 94 NATAA A A 95 95 NATAA E A 96 96 NATAA S A 97 97 NATAA G A 98 98 NATAA L A 99 99 NATAA L A 100 100 NATAA I A 101 101 NATAA A A 102 102 NATAA D A 103 103 NATAA A A 104 104 NATAA Y A 105 105 NATAA D A 106 106 NATAA A A 107 107 NATAA E A 108 108 NATAA I A 109 109 NATAA V A 110 110 NATAA R A 111 111 NATAA M A 112 112 NATAA A A 113 113 NATRO P A 114 114 NATAA E A 115 115 NATAA Q A 116 116 NATAA K A 117 117 NATAA L A 118 118 NATAA A A 119 119 NATRO P A 120 120 NATAA A A 121 121 NATAA R A 122 122 NATAA R A 123 123 NATAA K A 124 124 NATAA V A 125 125 NATAA L A 126 126 NATAA I A 127 127 NATAA Q A 128 128 NATAA K A 129 129 NATAA F A 130 130 NATAA A A 131 131 NATAA T A 132 132 NATAA H A 133 133 NATAA A A 134 134 NATAA A A 135 135 NATAA R A 136 136 NATAA R A 137 137 NATAA L A 138 138 NATAA Q A 139 139 NATAA A A 140 140 NATAA L A 141 141 NATAA R A 142 142 NATAA D A 143 143 NATRO P A 144 144 NATAA E A 145 145 NATAA G A 146 146 NATAA H A 147 147 NATAA G A 148 148 NATAA I A 149 149 NATAA F A 150 150 NATAA E A 151 151 NATAA M A 152 152 NATRO P A 153 153 NATAA M A 154 154 NATAA T A 155 155 NATAA L A 156 156 NATAA D A 157 157 NATAA L A 158 158 NATAA Q A 159 159 NATRO P A 160 160 NATAA G A 161 161 NATAA Q A 162 162 NATAA R A 163 163 NATAA L A 164 164 NATAA A A 165 165 NATAA R A 166 166 NATAA G A 167 167 NATAA V A 168 168 NATAA A A 169 169 NATAA R A 170 170 NATAA H A 171 171 NATAA L A 172 172 NATAA R A 173 173 NATAA A A 174 174 NATAA H A 175 175 NATAA G A 176 176 NATAA F A 177 177 NATAA V A 178 178 NATAA S A 179 179 NATAA V A 180 180 NATAA E A 181 181 NATAA E A 182 182 NATAA F A 183 183 NATAA V A 184 184 NATRO P A 185 185 NATAA A A 186 186 NATAA R A 187 187 NATAA G A 188 188 NATAA L A 189 189 NATAA R A 190 190 NATAA V A 191 191 NATAA D A 192 192 NATAA V A 193 193 NATAA M A 194 194 NATAA G A 195 195 NATAA L A 196 196 NATAA G A 197 197 NATRO P A 198 198 NATAA K A 199 199 NATAA G A 200 200 NATAA E A 201 201 NATAA I A 202 202 NATAA W A 203 203 NATAA V A 204 204 NATAA I A 205 205 NATAA E A 206 206 NATRO C A 207 207 NATAA K A 208 208 NATAA S A 209 209 NATAA S A 210 210 NATAA R A 211 211 NATAA A A 212 212 NATAA D A 213 213 NATAA F A 214 214 NATAA Q A 215 215 NATAA A A 216 216 NATAA D A 217 217 NATAA A A 218 218 NATAA K A 219 219 NATAA W A 220 220 NATAA Q A 221 221 NATAA G A 222 222 NATAA Y A 223 223 NATAA L A 224 224 NATAA E A 225 225 NATAA W A 226 226 NATRO C A 227 227 NATAA D A 228 228 NATAA R A 229 229 NATAA Y A 230 230 NATAA F A 231 231 NATAA W A 232 232 NATAA A A 233 233 NATAA V A 234 234 NATAA D A 235 235 NATAA M A 236 236 NATAA E A 237 237 NATAA F A 238 238 NATRO P A 239 239 NATAA A A 240 240 NATAA E A 241 241 NATAA L A 242 242 NATAA L A 243 243 NATRO P A 244 244 NATAA A A 245 245 NATAA E A 246 246 NATAA S A 247 247 NATAA G A 248 248 NATAA L A 249 249 NATAA L A 250 250 NATAA I A 251 251 NATAA A A 252 252 NATAA D A 253 253 NATAA A A 254 254 NATAA Y A 255 255 NATAA D A 256 256 NATAA A A 257 257 NATAA E A 258 258 NATAA I A 259 259 NATAA V A 260 260 NATAA R A 261 261 NATAA M A 262 262 NATAA A A 263 263 NATRO P A 264 264 NATAA E A 265 265 NATAA Q A 266 266 NATAA K A 267 267 NATAA L A 268 268 NATAA A A 269 269 NATRO P A 270 270 NATAA A A 271 271 NATAA R A 272 272 NATAA R A 273 273 NATAA K A 274 274 NATAA V A 275 275 NATAA L A 276 276 NATAA I A 277 277 NATAA Q A 278 278 NATAA K A 279 279 NATAA F A 280 280 NATAA A A 281 281 NATAA T A 282 282 NATAA H A 283 283 NATAA A A 284 284 NATAA A A 285 285 NATAA R A 286 286 NATAA R A 287 287 NATAA L A 288 288 NATAA Q A 289 289 NATAA A A 290 290 NATAA L A 291 291 NATAA R A 292 292 NATAA D A 293 293 NATRO P A 294 294 NATAA E A 295 295 NATAA G A 296 296 NATAA H A 297 297 NATAA G A 298 298 NATAA I A 299 299 NATAA F A 300 300 NATAA E