Citations (SAM, SAM-T99, HMMs)
10 20 | | 1 ....M...P...M...T...L....D....L....Q...P...G..Q.R.....LAR.G..VARH 2 ....M...E...T...G...-....-....L....M...P...G..Q.V.....LAR.G..VCRH 3 ....M...P...D...D...L....D....Isav.R...P...G..Q.L.....LAR.G..VCRH 4 ....M...P...M...T...L....D....L....Q...P...G..Q.R.....LAR.G..VARH 5 ....M...S...S...G...F....V....Spal.Q...P...G..Q.R.....LAR.G..VCRH 6 s...L...P...Dsg.L...A....P....L....L...P...G..Q.R.....LAR.G..VCRH 7 mt..L...Q...S...D...P....V....L....M...P...G..Q.L.....LAR.G..VCRH 8 ....M...P...D...D...H....Dtnr.L....M...P...G..Q.L.....LAR.G..VSRA 9 edp.L...S...D...G...R....Q....S....E...T...A..L.K.....VWR.G..AARL 10 t...L...P...Dsg.L...A....A....L....A...P...G..Q.R.....LAR.G..VCRH 11 ....M...IlprD...L...R....Q....S....E...T...A..L.N.....IAR.G..TQRL 12 ....M...IlprD...L...R....Q....S....E...T...A..L.N.....IAR.G..TQRL 13 t...V...P...Dsg.L...A....P....L....L...P...G..Q.R.....LAR.G..VCRH 14 ....Mme.T...D...I...K....Q....F....Q...P...G..Q.L.....LAR.G..VMRH 15 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qtd.L...M...T...A...P....T....L....Q...P...G..Q.L.....IAR.G..VTRQ 30 ....IavpP...D...R...R....Q....S....E...T...A..L.L.....IAR.G..TSRL 31 iv..Lp..P...D...R...R....Q....S....P...T...A..L.N.....IQR.G..VRRL 32 iv..Lp..P...D...R...R....Q....S....P...I...A..L.N.....IQR.G..VRRL 33 ....Mda.E...K...T...C....F....V....P...R...G..P.L.....LAR.G..VSRL 34 ....L...SlpvD...R...R....Q....S....P...I...A..L.E.....VRR.G..VRRL 35 ....LvppP...D...R...R....Q....S....E...T...A..L.A.....IAR.G..TGRF 36 thp.L...S...D...G...R....Q....S....E...N...A..L.L.....VRR.G..VQRL 37 thp.L...S...D...G...R....Q....S....E...N...A..L.L.....VRR.G..VQRL 38 ....Md..F...G...T...D....Q....Ml...Q...P...G..Q.V.....LAR.G..VCRH 39 ....-...I...D...G...R....Q....S....D...R...A..M.M.....VRR.G..TQIL 40 nnp.L...I...D...G...R....Q....S....D...R...A..M.M.....VRR.G..TQIL 41 nnp.L...I...D...G...R....Q....S....D...R...A..M.M.....VRR.G..TQIL 42 ....-...Q...S...N...P....TpkghL....Q...P...G..Q.M.....LAR.G..VSRH 43 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L.RS..H..DF...V.....SVE...E....L.T...P.....T..S..G....L.....R.... 9 L.RQ..L..DF...A.....CLP...E....V.T...L.....A..S..A....R.....R.... 10 L.RG..L..DF...V.....SVV...E....L.V...P.....T..P..G....L.....R.... 11 L.RS..L..GF...A.....CVS...E....L.P...L.....P..S..G....R.....R.... 12 L.RS..L..GF...A.....CVS...E....L.P...L.....P..S..G....R.....R.... 13 L.RS..H..DF...V.....SVV...E....L.V...P.....A..P..G....L.....R.... 14 L.AD..L..GF...A.....CVE...E....L.V...P.....T..R..G....L.....R.... 15 L.RS..L..GF...A.....CVS...E....L.P...L.....P..S..G....R.....R.... 16 M.AA..L..GF...V.....TVE...E....F.V...P.....A..R..G....L.....R.... 17 M.AA..L..GF...V.....TVE...E....F.V...P.....A..R..G....L.....R.... 18 L.RS..L..GF...A.....SLE...E....F.V...P.....T..R..G....L.....R.... 19 L.RS..L..GF...A.....CVS...E....L.P...L.....P..S..G....R.....R.... 20 L.SL..H..DF...A.....CVE...E....F.V...P.....A..R..G....L.....R.... 21 L.RS..L..DF...A.....CVE...E....F.T...P.....D..R..G....L.....R.... 22 L.RS..L..GF...A.....CVS...E....L.P...L.....P..S..G....R.....R.... 23 L.AS..L..GF...S.....CVA...E....L.P...L.....P..S..G....G.....R.... 24 L.RQ..L..DF...S.....PLE...E....F.V...P.....E..R..G....K.....R.... 25 L.LG..H..DF...A.....CIE...E....F.T...P.....E..R..G....K.....R.... 26 L.AE..M..GC...V.....SLP...E....F.S...L.....A..N..G....R.....R.... 27 L.AA..L..GF...A.....SVE...E....L.V...P.....T..R..G....L.....R.... 28 L.RG..H..GF...A.....SVE...E....F.V...P.....E..R..G....K.....R.... 29 L.AA..L..GF...A.....SVE...E....L.V...P.....T..R..G....L.....R.... 30 L.RA..L..GF...A.....CVS...E....L.P...L.....P..S..G....R.....R.... 31 L.AE..M..GC...V.....SLP...E....F.S...L.....A..N..G....R.....R.... 32 L.AE..M..GC...V.....SLP...E....F.S...L.....A..N..G....R.....R.... 33 L.AS..H..GM...V.....TVE...E....L.V...P.....S..R..G....L.....R.... 34 F.AE..L..GH...V.....TIP...E....F.T...L.....A..N..G....R.....R.... 35 L.RS..L..GF...C.....CVS...E....L.P...L.....P..S..G....R.....R.... 36 F.LA..M..GL...A.....TLP...E....L.S...L.....A..S..G....R.....R.... 37 F.LA..M..GL...A.....TLP...E....L.S...L.....A..S..G....R.....R.... 38 L.RS..H..DF...D.....SIV...E....F.V...P.....E..R..G....R.....R.... 39 L.HE..M..RH...A.....VLP...E....L.P...L.....A..S..G....R.....R.... 40 L.HE..M..RH...A.....VLP...E....L.P...L.....A..S..G....R.....R.... 41 L.HE..M..RH...A.....VLP...E....L.P...L.....A..S..G....R.....R.... 42 L.HA..L..GF...A.....SLQ...E....F.V...P.....T..R..G....L.....R.... 43 L.RG..Y..DF...D.....SIV...E....F.V...P.....E..R..G....R.....R.... 44 L.AS..H..GL...V.....TIE...E....L.V...P.....S..R..G....L.....R.... 45 L.RS..L..GF...A.....CLS...E....L.S...L.....P..S..G....R.....R.... 46 L.HE..M..RH...S.....VLP...E....L.P...L.....A..S..G....R.....R.... 47 L.RA..H..DF...V.....TLE...E....F.T...P.....E..R..G....K.....R.... 48 L.RS..M..GF...A.....ALE...E....F.V...P.....Q..R..G....L.....R.... 49 L.HE..M..RH...A.....VLP...E....L.P...L.....A..S..G....R.....R.... 50 L.HE..M..RH...A.....VLP...E....L.P...L.....A..S..G....R.....R.... 51 F.LA..M..GL...A.....TLP...E....L.S...L.....A..S..G....R.....R.... 52 F.LE..M..GL...A.....TLP...E....L.P...L.....A..S..G....R.....R.... 53 L.HA..L..GF...S.....CVG...E....L.P...L.....P..S..G....R.....R.... 54 L.HA..H..GF...A.....VVS...E....L.S...L.....A..S..G....R.....R.... 55 F.SE..M..GC...V.....TLP...E....F.S...L.....V..N..G....R.....R.... 56 L.ME..L..RH...A.....ALP...E....L.T...L.....A..S..G....R.....R.... 57 L.RS..L..GF...A.....CLS...E....L.S...L.....P..S..G....R.....R.... 58 L.HE..M..RH...A.....VLP...E....L.P...L.....A..S..G....R.....R.... 59 L.RA..L..QF...S.....TVT...E....L.P...L.....L..S..G....R.....R.... 60 L.RS..L..GF...S.....CIS...E....L.P...L.....P..S..G....R.....R.... 61 L.TQ..M..GA...V.....VLP...E....L.S...L.....A..T..G....R.....R.... 62 L.RS..L..GF...A.....TVS...E....L.P...L.....P..S..G....R.....R.... 63 F.AE..L..GH...V.....TIP...E....F.T...L.....A..N..G....R.....R.... 64 L.AS..H..DF...W.....CLE...E....F.V...P.....A..R..G....L.....R.... 65 L.ME..L..RH...A.....ALP...E....L.T...L.....A..S..G....R.....R.... 66 L.RS..L..GF...A.....TIS...E....L.P...L.....P..S..G....R.....R.... 67 L.HE..M..RH...A.....VLP...E....L.P...L.....A..S..G....R.....R.... 68 L.MA..M..GA...H.....VLP...E....L.S...L.....A..T..G....R.....R.... 69 L.RR..L..NF...S.....SVT...E....L.P...L.....L..S..G....R.....R.... 70 M.LA..R..KV...S.....LLP...E....M.A...L.....A..S..G....R.....R.... 71 F.SD..L..RL...S.....MVP...E....I.A...L.....A..S..G....R.....R.... 72 L.AQ..M..GY...A.....AVT...E....F.S...L.....A..T..G....R.....R.... 73 L.AA..H..GQ...A.....GLP...E....V.S...L.....A..S..G....R.....R.... 74 L.AL..A..GL...A.....GIP...E....F.A...L.....V..S..G....R.....R.... 75 L.AG..L..GH...A.....ALP...E....F.V...P.....T..G..G....L.....R.... 76 M.IA..H..RV...S.....LLP...E....M.P...L.....K..S..G....R.....R.... 77 M.GE..M..GY...Y.....GVT...E....M.T...L.....A..N..N....R.....R.... 78 F.AR..N..DI...W.....CLP...E....M.P...L.....R..G..G....R.....R.... 79 F.AR..N..DV...W.....LLP...E....M.P...L.....R..N..G....R.....R.... 80 F.AR..N..DI...W.....CLP...E....M.P...L.....R..S..G....R.....R.... 81 F.LQ..A..EL...T.....PLP...E....V.P...L.....G..N..G....R.....R.... 82 F.AQ..Q..GL...V.....AIP...E....V.T...L.....P..N..G....R.....R.... 83 L.WH..M..GY...S.....AIP...E....F.I...L.....P..D..G....R.....R.... 84 F.AR..N..DI...W.....CVE...E....I.A...L.....K..N..G....R.....R.... 85 L.VS..L..GY...A.....PLA...E....V.T...L.....P..N..G....R.....R.... 86 F.FR..H..DM...S.....GIL...E....V.P...L.....P..N..G....R.....R.... 87 L.VD..L..GY...A.....PLA...E....V.T...L.....P..N..G....R.....R.... 88 L.MD..L..GI...T.....AIA...E....F.T...L.....P..C..G....R.....R.... 89 C.GQ..M..GW...A.....ALH...E....L.V...L.....P..D..G....R.....R.... 90 M.ME..G..GY...A.....ILT...E....M.R...L.....P..N..G....L.....R.... 91 F.ED..L..GC...A.....VVT...E....F.T...L.....A..N..G....R.....R.... 92 C.RT..I..NW...A.....AIN...E....F.A...L.....P..Aa.G....R.....R.... 93 C.AM..L..GW...A.....ALH...E....V.P...L.....P..N..G....R.....R.... 94 R.RH..Y..RCg..I.....ILS...E....Q.Y...C.....A..T..G....E.....V.... 95 -.--..-..--...-.....---...-....-.-...-.....-..-..-....-.....-.... 96 C.FH..D..RF...I.....AVT...-....-.-...-.....S..T..G....E.....Q.... 97 C.FH..D..RF...V.....AVT...-....-.-...-.....S..T..G....E.....Q.... 98 L.RG..As.NR...L.....IWT...D....M.Q...L.....GpsG..S....P.....R.... 99 L.YS..K..GY...V.....VGF...E....V.T...L.....P..N..G....R.....R.... 100 L.RN..N..GF...K.....VVF...SdrfhA.W...T.....A..C..G....E.....H.... 101 L.NN..T..SCg..I.....AVK...E....I.S...A.....V..S..N....T.....Nei.. 102 T.AK..Q..GV...F.....GCF...E....V.T...I.....G..Wf.Ge...E.....R.... 103 R.RQ..-..GFg..V.....VAT...E....IsV...T.....G..C..R....E.....Q.... 104 W.IH..K..RYt..A.....IIP...N....C.Y...T.....K..W..D....N.....E.... 105 V.RE..Rt.QR...I.....VWT...N....M.Q...L.....GpaG..S....P.....R.... 106 PeFQ..K..RYd..L.....IVP...N....C.Y...T.....L..Y..D....N.....E.... 107 F.AE..M..GC...V.....TLP...E....F.S...L.....A..N..G....R.....R.... 108 K.RA..G..DD...I.....FAT...E....L.S...M.....S..Gr.D....R.....R.... 109 N.NG..P..GCq..V.....ALT...E....VgG...L.....Y..G..G....E.....R.... 110 N.NG..P..GCq..V.....ALT...E....VgG...L.....Y..G..G....E.....R.... 111 K.RE..-..GFs..V.....VAT...E....L.V...T.....S..G..T....R.....Eq... 112 -.--..M..GV...F.....GCF...E....V.T...I.....GfnG..N....E.....R.... 113 I.RR..M..GFp..V.....VAT...E....L.R...A.....W..G..S....R.....Ee... 114 K.RE..-..GFs..V.....VAT...E....L.V...T.....S..G..T....R.....Eq... 115 L.QK..K..YC...P.....IVP...N....C.F...Y.....R..W..D....L.....E.... 116 G.AP..Lp.GG...I.....FLP...E....V.G...W.....N..GvsG....G.....G.... 117 L.TK..K..RY...A.....VVY...Eag..V.V...R.....R..G..R....R.....R.... 118 L.KQ..Q..GFg..V.....VAT...E....L.V...A.....A..Gi.T....E.....Q.... 119 -.--..-..--...-.....--M...Q....L.G...P.....A..G..S....P.....R.... 120 T.CN..Q..GV...F.....GCF...E....V.T...I.....G..Wf.Gk...E.....R.... 121 T.LE..VwaRL...P.....ATP...E....H.S...S.....R..W..Ki...C.....K.... 122 T.NK..M..GV...F.....GCF...E....V.T...I.....G..Wf.Gk...E.....R.... 123 C.RE..A..GT...M.....AVE...E....V.T...M.....P..N..D....A.....Gi... 124 R.W-..V..RA...E.....HVK...D....S.Tg..Y.....A..D..G....R.....Ri... 125 D.EP..T..DM...M.....FMP...R....A.E...T.....P..E..GhkysR.....R.... 126 G.LS..L..RA...W.....VTTpqaD....Q.PadaV.....P..D..G....R.....Wqmam 127 L.RD..Q..GR...V.....TWE...N....I.E...LlvdleT..G..G....Rqai..R.... 128 L.QD..Q..GR...V.....TWT...N....I.E...LlvdrdA..G..G....Rqai..R.... 129 W.QE..Q..GA...T.....VVE...E....V.T...M.....P..D..D....R.....Gi... 130 N.RP..I..AW...L.....LAK...E....I.Q...A.....Pq.S..S....R.....R.... 131 W.QE..Q..GA...T.....VVE...E....V.T...M.....P..D..D....R.....Gi... 132 Y.SE..P..EW...A.....ILF...E....V.G...D.....A..T..G....A.....Rhtrf 133 C.IE..Q..GG...L.....VVE...E....V.T...M.....P..D..D....Q.....Gi... 134 C.FH..D..RF...I.....AVT...-....-.-...-.....S..T..G....E.....Q.... 135 V.DP..R..GAn..T.....LIP...E....A.E...I.....R..W..G....Vgs7vyR.... 136 -.ND..P..RV...Y.....MAA...E....V.T...F.....D..Y..G....Tsaav.R.... 137 S.AEd.W..QI...N.....PAI...D....M.K...T.....V..E..S....E.....Q.... 138 -.--..-..--...-.....---...-....-.-...-.....-..NivN....H.....E.... 139 L.EEryH..KI...R.....IIE...E....K.Q...M.....G..R..S....-.....R.... 140 C.LE..Q..GA...Y.....VVE...E....V.A...M.....P..A..D....K.....Gi... 141 P.AG..L..GA...T.....FIP...E....L.F...V.....D..Gf.S....R.....R.... 142 -.--..-..--...-.....---...-....-.-...-.....-..-..-....W.....E.... 143 -.--..-..--...-.....---...-....-.-...-.....-..R..M....A.....R.... 144 W.EN..I..QFknlM.....ASE...D....L.K...T.....S..G..G....Epy8hvR.... 145 L.LK..Qe.GTd..V.....VFF...E....Y.T...F.....H..F..G....R.....Rr... 146 R.AQ..L..PP...A.....GVG...E....K.V...R.....W..C..M....V.....R.... 147 -.--..-..--...-.....---...-....-.-...-.....-..-..-....Ria...R.... 148 L.LE..K..QM...VtpedlVIN...E....F.T...Y.....G..Tf.S....R.....R.... 149 F.KS..-..EY...K.....LVE...E....L.S...I.....S..D..K....Ra....R.... 150 -.--..-..--...-.....---...-....-.-...-.....-..-..-....-.....-.... 151 -.--..-..--...-.....---...-....-.-...-.....-..-..-....-.....-.... 152 -.--..-..--...-.....---...-....-.-...-.....-..C..M....A.....R.... 153 H.AK..Q..GV...F.....GAF...E....V.T...I.....G..Wf.G....K.....Ei... 154 -.--..-..--...-.....---...-....-.-...-.....-..-..-....-.....-.... 155 H.AK..Q..GT...F.....GAF...E....V.T...I.....G..Wf.G....K.....Ei... 156 F.RE..LwpDA...R.....IIH...E....M.N...V.....E..H..Gs...S.....R.... 157 -.--..-..--...-.....---...-....-.-...-.....K..K..R....L.....R.... 158 T.LA..R..KC...V.....VLV...D....N.C...S.....W..T..G....H.....E.... 159 -.--..-..--...-.....---...-....-.S...I.....W..-..-....H.....E.... 160 -.--..-..--...-.....---...-....-.-...-.....-..-..-....-.....-.... 161 -.--..-..--...-.....---...-....-.-...-.....-..-..-....-.....-.... 0 50 60 | | | 1 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